研究人员揭示超级增强子动态甲基化调控转录异质性
CpG DNA甲基化早在70年代就被提出是一种用来控制基因表达的DNA化学修饰，而我们对DNA甲基化在基因组不同区域的具体功能，在疾病、发育过程中所扮演的具体角色，以及控制基因表达的详细机理，直到今天并没有全面详细的认知。 2019年8月15日，美国Whitehead研究所Rudolf Jaenisch联合其他课题组在Molecular Cell上发表文章Dynamic Enhancer DNA Methylation as Basis for Transcriptional and Cellular Heterogeneity of ESCs。 研究人员选择了Sox2和miR290-295的超级增强子作为研究对象。这两个基因的超级增强子对于保持多能性有重要作用，而且其T-DMR在测序数据中显示低水平甲基化。在Castaneous x 129 F1的mESC中（两套基因组之前含大量SNP,便于区分不同allele），研究......阅读全文
研究人员揭示超级增强子动态甲基化调控转录异质性
CpG DNA甲基化早在70年代就被提出是一种用来控制基因表达的DNA化学修饰，而我们对DNA甲基化在基因组不同区域的具体功能，在疾病、发育过程中所扮演的具体角色，以及控制基因表达的详细机理，直到今天并没有全面详细的认知。 2019年8月15日，美国Whitehead研究所Rudolf Jae
研究发现小鼠和人类树突细胞异质性的转录基础
近日，美国纪念斯隆-凯特琳癌症中心等科研机构的科研人员在Cell上发表了题为“Transcriptional Basis of Mouse and Human Dendritic Cell Heterogeneity”的文章，发现小鼠和人类树突细胞异质性的转录基础。 树突细胞（dendriti
一种简单有效的降低－RNA－3＇端异质性的转录方法
实验材料 8umol L 顶链 8umol L 底链5＇末端 2 个核苻酸进行甲氧基修饰试剂、试剂盒 20X 缓冲液 NTP 混合物 lmol LNaOH 聚乙二醇 8000 0.5mol LMgCl2 1mol L 谷氨酸钠 T7RNA 聚合酶 载样缓冲液实验步骤 一材料与设备1)8umol/L
一种简单有效的降低－RNA－3＇端异质性的转录方法
实验材料 8umol L 顶链 8umol L 底链 5＇末端 2 个核苻酸进行甲氧基修饰 试剂、试剂盒
3.2－一种简单有效的降低－RNA－3＇端异质性的转录方法
在 2 个 5'端的核苷酸进行核糖基 C2＇-甲氧基修饰。用修饰过的引物 PCR 扩增得到的 DNA 仍可降低 N+l 活性，由于 PCR 可以产生几个 kb 的长模板，因此可以制备少异质性的 RNA实验材料8umol L 顶链8umol L 底链5＇末端 2 个核苻酸进行甲氧基修饰试剂、试
Nat－Med：恶性胶质瘤表观遗传学分析取得突破
胶质瘤的特点之一就是广泛的遗传学和转录学异质性，但是迄今为止科学家们对表观遗传学在脑胶质瘤疾病进展过程中发挥的作用知之甚少。为此，来自澳大利亚科学院等机构的研究人员使用通过国家患者登记表选择的高度注释的临床队列的数据对原发和对应复发脑胶质瘤的全基因组DNA甲基化图谱进行了描述，相关研究成果与近日
Nat－Med：恶性胶质瘤表观遗传学分析取得突破
胶质瘤的特点之一就是广泛的遗传学和转录学异质性，但是迄今为止科学家们对表观遗传学在脑胶质瘤疾病进展过程中发挥的作用知之甚少。为此，来自澳大利亚科学院等机构的研究人员使用通过国家患者登记表选择的高度注释的临床队列的数据对原发和对应复发脑胶质瘤的全基因组DNA甲基化图谱进行了描述，相关研究成果与近日
单细胞测序新技术：同时分析转录组和甲基化组
单细胞转录组和甲基化组分析已经成为了单细胞研究的强大工具。然而，在单细胞中揭示DNA甲基化与基因表达的直接关联还比较困难。这是因为细胞之间存在较大的差异，又不能同时检测一个细胞的转录组和甲基化组。加州大学范国平教授和同济大学薛志刚教授领导团队解决了这个问题。他们在Genome Biology杂志上发
研究揭示RNA甲基化调控Rloop形成及转录终止机制
R-loop是一种由RNA：DNA杂合链和单链DNA组成的特殊核酸结构，在原核和真核生物的基因组中分布广泛且普遍存在。R-loop在很多关键的生物学过程中发挥重要功能，包括染色质修饰、转录调控、DNA损伤修复以及基因组稳定性等，但其如何被精确调控的机制尚不清楚。m6A修饰作为信使RNA上丰度最高
Cell子刊:－人类诱导多能干细胞内在基因组特性
人诱导多能干细胞(Human induced pluripotent stem cells, hipsCs)因其表观异质性而表现出不同的分化潜能，除了印迹和X染色体等研究充分的成分/染色体外，其分化程度/属性尚不清楚。在这里，作者展示了7个不同种系潜力的hipsC株系表现出明显的表观基因组异质性
单细胞测序这样的高通量技术的优势具体体现在哪里
单细胞全基因组测序主要应用于肿瘤发生机制及胚胎发育研究。单细胞转录组分析可以在全基因组范围内挖掘基因调节网络，尤其适用于存在高度异质性的干细胞及胚胎发育早期的细胞群体。2017年6月16日，北京大学生命科学学院生物动态光学成像中心汤富酬课题组在《Cell Research》杂志在线发表了题为“Sin
单细胞测序这样的高通量技术的优势具体体现在哪里
单细胞全基因组测序主要应用于肿瘤发生机制及胚胎发育研究。单细胞转录组分析可以在全基因组范围内挖掘基因调节网络，尤其适用于存在高度异质性的干细胞及胚胎发育早期的细胞群体。2017年6月16日，北京大学生命科学学院生物动态光学成像中心汤富酬课题组在《Cell Research》杂志在线发表了题为“Sin
单细胞测序这样的高通量技术的优势
单细胞全基因组测序主要应用于肿瘤发生机制及胚胎发育研究。单细胞转录组分析可以在全基因组范围内挖掘基因调节网络，尤其适用于存在高度异质性的干细胞及胚胎发育早期的细胞群体。2017年6月16日，北京大学生命科学学院生物动态光学成像中心汤富酬课题组在《Cell Research》杂志在线发表了题为“Sin
单细胞测序这样的高通量技术的优势具体体现在哪里
单细胞全基因组测序主要应用于肿瘤发生机制及胚胎发育研究。单细胞转录组分析可以在全基因组范围内挖掘基因调节网络，尤其适用于存在高度异质性的干细胞及胚胎发育早期的细胞群体。2017年6月16日，北京大学生命科学学院生物动态光学成像中心汤富酬课题组在《Cell Research》杂志在线发表了题为“Sin
Cell－Res重点论文：单细胞表观多组学测序技术最新突破
2017年6月16日，北京大学生命科学学院生物动态光学成像中心汤富酬课题组在《Cell Research》杂志在线发表了题为“Single-cell multi-omics sequencing of mouse early embryos and embryonic stem cells”的研
Cell－Res重点论文：单细胞表观多组学测序技术最新突破
2017年6月16日，北京大学生命科学学院生物动态光学成像中心汤富酬课题组在《Cell Research》杂志在线发表了题为“Single-cell multi-omics sequencing of mouse early embryos and embryonic stem cells”的研
突破性单细胞表观基因组与转录组分析新技术
由英国及比利时的研究人员开发出的一种新方法，使得在单细胞中同时研究表观基因组及转录组成为可能。发布在《自然方法》（Nature Methods）上的实验方案，可帮助科学家们精确描绘出DNA甲基化改变与基因表达之间的关系。 近年来单细胞测序技术发展迅速，被广泛用于研究细胞间的基因表达谱（转录组）
单细胞测序新技术：同时分析单个细胞的转录组和甲基...
单细胞测序新技术：同时分析单个细胞的转录组和甲基化组 单细胞转录组和甲基化组分析已经成为了单细胞研究的强大工具。然而，由于细胞之间存在较大的差异，又不能同时检测一个细胞的转录组和甲基化组，在单细胞中揭示DNA甲基化与基因表达的直接关联还比较困难。 近日，加州大学范国平教授和同济大学薛志刚教授
基因组所等RNA甲基化表观转录组学研究获进展
2014年1月，中国科学院北京基因组研究所基因组变异与精准生物医学实验室“百人计划”研究员杨运桂研究组，与中国科学院动物研究所“百人计划”研究员刘峰研究组合作开展的“m6A甲基转移酶复合物鉴定”研究，发现了WTAP(wilms'tumour 1-associating protein)
异质性的简介
、heteroplasmy: the presence of more than one type of mRNA in the mitochondria of a single individual.（heteroplasmy:存在一种以上的mRNA线粒体的个体。）等位基因异质性是指某一遗传病
系统性异质性：一种理解肿瘤异质性的综合性方法
D.C. Wang, X. Wang于2016年8月发表在Semin Cell Dev Biol上的文章：Systems heterogeneity: An integrative way to understand cancer heterogeneity首次阐述了系统性异质性这一概念，为人们
同济大学发布单细胞测序新技术
单细胞转录组和甲基化组分析已经成为了单细胞研究的强大工具。然而，在单细胞中揭示DNA甲基化与基因表达的直接关联还比较困难。这是因为细胞之间存在较大的差异，又不能同时检测一个细胞的转录组和甲基化组。 加州大学范国平教授和同济大学薛志刚教授领导团队解决了这个问题。他们在五月五日的Geno
北大团队发展最新单细胞多重组学测序技术
单细胞三重组学测序技术（scTrio-seq）单细胞中三种组学之间的对应关系癌症中两个细胞亚群的DNA拷贝数差异 2016年2月23日，《细胞研究》（Cell Research）杂志在线发表了北京大学生命科学学院生物动态光学成像中心汤富酬研究组、黄岩谊研究组和首都医科大学附属北京世纪坛医院暨北京大
北大汤富酬课题组发表单细胞表观多组学测序技术新成果
2017年6月16日，北京大学生命科学学院生物动态光学成像中心汤富酬课题组在《Cell Research》杂志在线发表了题为“Single-cell multi-omics sequencing of mouse early embryos and embryonic stem cells”的研
甲基化与lncRNA：表观遗传学与转录组学研究的完美结合
2017年国自然申请的热点什么？circRNA，lncRNA，外泌体。除了这些大家耳熟能详的香馍馍之外，现在很多小伙伴们开始了新的玩法，通过多平台联用，将不同层面的东西结合起来，比如，表观遗传与非编码RNA的结合，就是一个很好的例证。 研究背景 肺癌是一种常见的恶性肿瘤，特别在中国，
甲基化与lncRNA：表观遗传学与转录组学研究的完美结合
2017年国自然申请的热点什么？circRNA，lncRNA，外泌体。除了这些大家耳熟能详的香馍馍之外，现在很多小伙伴们开始了新的玩法，通过多平台联用，将不同层面的东西结合起来，比如，表观遗传与非编码RNA的结合，就是一个很好的例证。研究背景肺癌是一种常见的恶性肿瘤，特别在中国，由于环境的污染，肺癌
利用ssDRIPseqRNA揭示甲基化调控Rloop形成及转录终止机制
R-loop是一种由RNA:DNA杂合链和单链DNA组成的特殊核酸结构，在原核和真核生物的基因组中分布广泛且普遍存在。R-loop在很多关键的生物学过程中发挥重要功能，包括染色质修饰、转录调控、DNA损伤修复以及基因组稳定性等，但其如何被精确调控的机制尚不清楚。m6A修饰作为信使RNA上丰度最高
干细胞惊人异质性
干细胞能够无限增殖，也能分化和发育为数百种不同细胞和身体组织的任何种类，这种多能性使得干细胞具有巨大的生物医学工程学潜力。然而直到现在人们都难以确定整个细胞变化状态过程干细胞发育调控的复杂性。利用强大的新型单细胞遗传分析技术，揭示出多能干细胞的变化远比以前所认识的要多得多。使得研究人员朝着某天能够将
《自然》特刊：癌症异质性
从2012走进2013年，我们已经有了关于不同癌症类型长长的遗传突变列表，也拥有不断推陈出新的纳米靶向药物，还有诊断和癌症预后的新成像方法，也许能应用到临床的小分子干扰RNA，和新型生物药物，以及更接近于人体疾病的小鼠模型。 在过去一年里，癌症的异质性，或者说是癌症的可塑性研究取得了不少成
如何诊断肿瘤异质性？
肿瘤的准确诊断和精准治疗依据单一肿瘤标本活检是不全面的，因其代表不了整块肿瘤。并且病理医师对肿瘤样品取材时，常关注晚期及最坏的瘤组织，而对最具进展性、侵袭性区域则可能漏检。 同样由于免疫标记物在肿瘤中异质性表达，所以以免疫组化为基础的检查更可能导致对病情了解不全面。 随着对肿瘤异质性的深入研