蒋华良研究组合作发表最新PNAS文章：蛋白互作界面预测
来自中科院上海药物研究所，美国莱斯大学的研究人员报道了最新研究成果，在可药性蛋白质-蛋白质相互作用（PPI）界面预测与识别计算方法发展方面取得重要进展。这一研究成果公布在《美国国家科学院院刊》（PNAS）杂志上，文章的通讯作者是上海药物研究所蒋华良研究员，以及莱斯大学José N. Onuchic博士。蒋华良研究组主要从事药物设计、药物新靶标的发现、药物靶标构象变化与药理功能关系等研究，曾在Nature等多份期刊上发表重要成果。蛋白质-蛋白质相互作用在细胞命运决定、信号转导等重要生命过程中起重要作用，也是疾病发生和发展的重要环节。因此，蛋白质-蛋白质相互作用界面已经成为新药发现的重要靶标。然而，蛋白质界面具有作用面积大、相对平坦等特点，不利于药物分子、特别是小分子药物结合，使得基于蛋白质-蛋白质界面的药物设计面临严峻挑战。因此，发展蛋白质-蛋白质界面预测理论计算方法及其相应的药物设计方法，用于细胞信号通路研究和靶向蛋白质-蛋白质......阅读全文
蒋华良研究组合作发表最新PNAS文章：蛋白互作界面预测
来自中科院上海药物研究所，美国莱斯大学的研究人员报道了最新研究成果，在可药性蛋白质-蛋白质相互作用（PPI）界面预测与识别计算方法发展方面取得重要进展。这一研究成果公布在《美国国家科学院院刊》（PNAS）杂志上，文章的通讯作者是上海药物研究所蒋华良研究员，以及莱斯大学José N. Onuchic博
化学生物学助力新药研究模式转变
专家们认为，这些研究不仅为肿瘤、炎症等生物学基础研究提供了小分子化合物工具，也将推动疾病治疗领域创新药物的发现。 “基于化学小分子探针的信号转导过程研究”重大研究计划（以下简称“重大计划”）是国家自然科学基金委员会在“十一五”期间启动的第一个重大计划，也是化学生物学领域第一个重大计划。 在
上海药物所蒋华良院士荣获“安捷伦思想领袖奖”
分析测试百科网讯 2019年9月19日，安捷伦思想领袖奖颁奖典礼暨创新药物研发研讨会在中科院上海药物研究所隆重举行。迄今为止，全球范围内已有46位科研人员获得这个奖项。安捷伦将第47个“安捷伦思想领袖奖”颁发给中国科学院上海药物研究所蒋华良院士，以表彰蒋华良院士在原创药物研发以及糖类药物研究领域
蒋华良等离子通道结构功能研究与药物设计获进展
GPCR和激酶等靶标存在较为明确的内源性配体结合口袋，其激动剂类药物一般是作用于该口袋，在一定程度上取代(模仿)内源性激动剂的功能。针对 GPCR和激酶开展的基于结构的药物设计已有很多成功案例。与这些受体和激酶不同，电压门控通道是被电压激活，没有明确的常规内源性配体结合口袋。确证激动剂的作用
《中国科学报》药物设计新方法可预测药效
3月5日，《中国科学报》记者撰文，介绍了我校课题组与美国Rice大学José N.Onuchic课题组合作,在药物设计理论计算新方法发展研究中获得重要成果的情况，全文转载如下： 本报讯(记者黄辛)近日，中科院上海药物研究所蒋华良课题组、华东理工大学李洪林课题组和美国Rice大学José
蒋华良，李洪林等PNAS获研究新技术
来自华东理工大学，大连理工大学，中科院上海药物研究所等处的研究人员发表了题为“Free energy landscape for the binding process of Huperzine A to acetylcholinesterase”的文章，研发出了配体-受体结合自由能全景
上海药物所研究员蒋华良解读2013年诺贝尔奖
为深入解读2013年诺贝尔奖的成就对当前自然学科发展的贡献，激发公众对科学的兴趣和关注，鼓励更多科研人员发挥探索和创新精神，上海市科协于12月5日至12月10日在上海科学会堂二楼卢浮宫举办了三场报告会，由相关领域的科研一线科学家分别解读2013年诺贝尔“物理学奖”、“生理学奖”和“化学
蛋白质蛋白质相互作用理论预测和药物设计新法获进展
11月29日，《美国国家科学院院刊》（PNAS）在线发表了中国科学院上海药物研究所蒋华良课题组和美国莱斯大学（Rice University）José N. Onuchic 课题组合作的论文Elucidating the druggable interface of protein-protei
上海药物所蛋白质折叠计算模拟研究取得进展
在生物体系中，蛋白质通过折叠成特定的三维结构发挥功能。这种折叠过程可能受到不同因素的影响，如配体结合、聚合状态等。充分理解蛋白质折叠过程对于药物分子设计、蛋白质突变所导致致病机理的预测、深入了解细胞功能以及进化都至关重要。大规模计算机模拟有潜力从原子水平捕捉整个蛋白系统的动态过程，但是
中科院上海药物所等单位确证肾癌治疗新靶点
中科院上海药物所蒋华良课题组、杨财广课题组及北京基因组所刘江课题组在一项合作研究中确证了肾癌治疗新靶点SPOP。9月12日，相关成果在线发表于《癌症细胞》杂志。 以索拉非尼和舒尼替尼为代表的靶向抗肿瘤药物是晚期肾癌的一线治疗药物，但对转移性肾癌的疗效十分有限，并且容易产生耐药。因此，当前亟待发
研究人员创建精准N糖蛋白质组学分析方法
复旦大学化学系教授杨芃原团队、中科院计算技术研究所研究员贺思敏团队、国家蛋白质科学中心（上海）研究员黄超兰团队合作，创建了基于质谱的高通量糖基化肽段分析方法，为精准N糖蛋白质组学提供了新技术。9月5日，相关研究成果发表于《自然—通讯》。 糖基化是最复杂的蛋白后修饰之一。与其他蛋白后修饰相比
上海药物所计算机靶标预测及发现技术研究取得新进展
中科院上海药物所蒋华良课题组与华东理工大学药学院李洪林课题组合作，继反向对接方法——TarFisDock后，该研究团队构建了药效团靶标库—PharmTargetDB（包含7000余个重要靶标结构的信息和药效团模型，涵盖了349种生物功能和110种临床适应症）。通过药效团匹配方法，课
中科院上海药物所等单位抗菌感染靶标确证研究获进展
中科院上海药物所杨财广课题组、蒋华良课题组与美国芝加哥大学合作，针对耐药金黄色葡萄球菌转肽酶SrtA发展了小分子抑制剂，并探索了小分子的作用机制及其治疗耐药菌感染小鼠的效果。相关成果日前在线发表于美国《国家科学院院刊》。 芝加哥大学Olaf Schneewind课题组长期研究发现，转肽酶Srt
中国科学家最新Science获艾滋病研究突破
来自中国科学院上海药物研究所，美国Scripps研究所等处的研究人员发表了题为“Structure of the CCR5 Chemokine Receptor–HIV Entry Inhibitor Maraviroc Complex”的文章，解析了CCR5蛋白质分子的高分辨率三维结构
上海药物所表观遗传分子机制合作研究取得新进展
中科院上海药物研究所蒋华良课题组与美国芝加哥大学化学系何川课题组合作，针对胸腺嘧啶DNA糖苷化酶及细菌转录因子AgrA在表观遗传与转录调控中的作用开展研究，取得了良好进展。研究论文分别于2012年2月及2012年5月在线发表在Nature Chemical Biology和PNA
人工智能将成药物研发关键工具
“AI（人工智能）技术应用于药物研发已经引起研究院所和制药行业高度重视，AI开始赋能药物研发的靶标发现和确证、药物先导化合物的发现和优化、药物药代和毒性评价等各个阶段，将成为未来药物研发的关键核心技术之一。”7月12日，中国科学院院士、中国科学院上海药物研究所研究员蒋华良在2022《理解未来》科
上海药物所在抗菌感染靶标确证合作研究中取得进展
中国科学院上海药物研究所杨财广课题组、蒋华良课题组与美国芝加哥大学微生物学系Olaf Schneewind课题组合作，针对耐药金黄色葡萄球菌转肽酶SrtA发展小分子抑制剂，探索小分子的作用机制以及治疗耐药菌感染小鼠的效果，取得较好进展。研究论文于9月2日在线发表在美国科学院院刊Proceedin
方案12－通过阵列检测来研究蛋白质小分子相互作用
实验材料用于标记的小牛血清白蛋目标小分子载有蛋白质阵列的玻片试剂、试剂盒单功能活性染料Cy-3或Cy-5磷酸盐缓冲溶液含有 500mmol L甘氨酸的 PBS二琥珀酰亚胺戊二酸（DSG)NN’-二琥珀酰亚胺碳酸盐硫代琥珀酰亚胺酯含 0.01g ml小牛血清白蛋白（BSA)的 PBST仪器、耗材荧光玻
中外科学家开辟抗肿瘤药物研发新方向
铜离子是人体内的“危险分子”，绝大多数情况下都必须有伴侣蛋白陪护，而不少肿瘤少了铜离子就会生长停滞。中科院上海药物研究所蒋华良课题组与芝加哥大学何川课题组、艾默里大学陈靖课题组合作，经过三年多研究发现，细胞内有多种铜离子伴侣蛋白，只要控制住它们的行动，就可让肺癌、血液病、胰腺癌、乳腺癌等恶性肿瘤
类似Google的蛋白功能搜索引擎研究进展
细胞通过成千上万控制其生长和分化的蛋白相互协作而发挥功能，关键蛋白功能失常常会导致疾病。目前已经有许多关于探索所有人类蛋白功能的大规模研究项目。最近，de Recherches Cliniques de Montréal (IRCM)研究所Benoit Coulombe博士率领的研究小组新发展了一套
Cell提出一个新“组学”：蛋白质代谢小分子互动组学
科学家们提出了一个新的“组学”——一个处理蛋白质和小分子之间相互作用的互动组学（protein-metabolite interactomics）。此前系统生物学家专注于基因组学或蛋白质组学，现在他们日益发现了蛋白质-代谢小分子之间相互作用的重要性。 基因组学针对的是生物体基因的系统分析，而蛋
张丽华：搭建蛋白质组学研究平台
分析测试百科网讯 自然科学研究，原则上应该是理性思辨能力更强的男性占优；而从屠呦呦获得了诺贝尔奖可以推断，女性从事科学研究同样可以做得出色。在分析化学领域，有这样一位女性。她曾荣获2015年“中国青年女科学家奖”；在和男性同台竞争的舞台上，她2014年入选了中组部“万人计划”； 2017年获得了
蛋白质相互作用组研究获进展
蛋白质相互作用组是指蛋白质之间的基本相互作用，对于大多数物种而言，其在很大程度上都是未知的。因而，研究探索膜蛋白潜在的相互作用组必然是一项极具挑战性的工作。 美国斯坦福大学卡耐基科学研究所Jones等研究人员，使用构建好的分裂泛素化酵母试验系统，从拟南芥中筛选鉴定出超过3000个膜蛋白之间的相
Nature：中国科学家揭示SARSCoV2主要蛋白酶的结构
一种新的冠状病毒(SARS-CoV-2)被鉴定为COVID-19病毒，它是引起2020年初COVID-19全球大流行的罪魁祸首。但是目前还没有针对性的治疗方法，且有效的治疗选择仍然非常有限。 为了快速发现用于临床的先导化合物，来自上海科技大学的饶子和/杨海涛课题组与上海药物所的蒋华良课题组及其
研究人员开发定量蛋白质组学数据的下游分析工具
原文地址：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/9/507985.shtm
上海药物所小分子调控核酸去甲基化研究取得阶段进展
中科院上海药物研究所杨财广课题组与蒋华良课题组合作，基于mRNA中N6位甲基化修饰的腺嘌呤(N6-methyladenosine, m6A)去甲基化酶FTO结构开展小分子调控研究，首次获得了对核酸去甲基化酶，例如FTO具有酶活和细胞活性的小分子抑制剂。论文于10月11日在线发表于《美国化学会
09候选院士最新PLoS－Biology文章
摘要： 记者报道，09候选院士中科院上海生科院上海药物研究所蒋华良课题组和神经科学研究所徐天乐课题组在《PLoS Biology》上联合发表了关于离子通道门控机制研究的论文(PLoS Biology, 2009, 7: e1000151)，Inherent Dynamics of the Aci
血栓形成关键受体三维结构被揭示
中科院上海药物所赵强研究组与美国国立卫生研究院等机构合作，揭示了血栓形成过程中关键受体——嘌呤能受体P2Y12R的三维结构。5月1日，两篇独立的研究论文同时发表于《自然》杂志。据悉，这是中国科研人员极其罕见地在顶级学术期刊上“背靠背”同期发表科研论文，第一作者为药物所的张凯华和张进。 据介绍，
上海药物所靶标发现技术取得突破
中科院上海药物所蒋华良研究员与大连理工大学力学系王希诚教授合作，针对寻找药物作用新靶标的需求，带领博士后李洪林和高振霆等，发展了以活性小分子为探针、搜寻潜在结合蛋白质的“反向分子对接”方法，相关结果发表在Nucl. Acids Res. (2006, 34, W219-224)，并建立了相应的公共网
蒋华良院士团队开发可解释性深度神经网络分子表征模型
近日，上海科技大学免疫化学研究所特聘教授蒋华良院士团队在《Journal of Medicinal Chemistry》发表封面文章“Pushingthe Boundaries of Molecular Representation for Drug Discovery with the Gra