清华学者揭示新的mRNA翻译终止机制

2016年12月1日,清华大学生命科学学院、结构生物学高精尖创新中心高宁课题组和合作者在《Nature》在线发表题为Mechanistic insights into the alternative translation termination by ArfA and RF2的研究论文。该论文报道了大肠杆菌中non-stop mRNA在核糖体上的翻译终止状态复合物的高分辨冷冻电镜结构,并揭示了ArfA在non-stop mRNA翻译终止过程中的作用机制。 核糖体上的蛋白翻译是一个非常复杂的过程,包括翻译起始、延伸和终止等多步严密调控的步骤。在细菌中,当蛋白翻译进行到mRNA上的终止密码子时,翻译终止因子RF1或RF2可以直接识别终止密码子,结合到核糖体上的活性中心,催化释放共价偶联在肽酰tRNA 3’末端上的新生肽链,这个过程受RF1/RF2上保守的催化活性基序Gly-Gly-Gln(GGQ)序列的调控。在细胞中,由于......阅读全文

SD序列的翻译影响

  一般来说,mRNA与核糖体的结合程度越强,翻译的起始效率就越大,而这种结合程度主要取决于SD序列与16S rRNA的碱基互补性,其中以GGAG 4个碱基序列尤为重要。其中,大肠杆菌的SD序列为AGGAGGU。对多数基因而言,这4个碱基中任何一个换成C或T,均会导致翻译效率大幅度降低。SD序列与起

mRNA的转运和翻译

mRNA的转运真核生物和原核生物之间的另一个区别是mRNA的转运。由于真核转录和翻译是在不同的细胞器内进行的,真核mRNA必须从细胞核输出到细胞质。 这一过程可能受不同信号通路的调节。成熟的mRNA通过其加工的修饰被识别,在结合帽结合蛋白CBP20和CBP80及转录/输出复合物(TREX)后通过核孔

翻译水平上的调控

蛋白质合成翻译阶段的基因调控有三个方面:① 蛋白质合成起始速率的调控;② MRNA的识别;③ 激素等外界因素的影响。蛋白质合成起始反应中要涉及到核糖体、mRNA蛋白质合成起始因子可溶性蛋白及tRNA,这些结构和谐统一才能完成蛋白质的生物合成。mRNA则起着重要的调控功能。真核生物mRNA的“扫描模式

关于翻译的过程介绍

  翻译过程需要的原料:mRNA、tRNA、21种氨基酸、能量、酶、核糖体。  翻译的过程大致可分作三个阶段:起始、延长、终止。翻译主要在细胞质内的核糖体中进行,氨基酸分子在氨基酰-tRNA合成酶的催化作用下与特定的转运RNA结合并被带到核糖体上。生成的多肽链(即氨基酸链)需要通过正确折叠形成蛋白质

蛋白质合成翻译阶段的基因调控介绍

  蛋白质合成翻译阶段的基因调控有三个方面:  ① 蛋白质合成起始速率的调控;  ② MRNA的识别;  ③ 激素等外界因素的影响。蛋白质合成起始反应中要涉及到核糖体、mRNA蛋白质合成起始因子可溶性蛋白及tRNA,这些结构和谐统一才能完成蛋白质的生物合成。mRNA则起着重要的调控功能。  真核生物

典型CASE分享-蛋白产品常见翻译后修饰(PTM)

翻译后修饰(PTM)是指蛋白质在翻译后发生的化学修饰。抗体在生产、贮存及临床使用过程中,均可能产生各类翻译后修饰变异体。翻译后修饰可能导致抗体所带的电荷乃至结构发生变化,从而影响其与抗原及Fc受体的亲和力,进而影响抗体药物的活性等关键质量属性。因此,对抗体药物的各类翻译后修饰进行表征和工艺控制是有必

人工智能“自学”做翻译

  得益于神经网络——从人脑获得灵感的计算机算式——的发展,自动化的语言翻译已经存在了相当长一段时间。但训练这些网络需要海量数据:数以千万计的逐句翻译,以展示人类如何做这项工作。现在,两篇新论文表明神经网络可以在无需平行文本的情况下学习翻译——这一令人震惊的进展或让人们获得许多不同语言的文献记录。 

ZL文献翻译有了“利器”

   长期以来,机器翻译一直是一个世界性研究难点和热点。近日,一款翻译质量可媲美人类译员的新一代人工智能产品——科专笑飞人工智能机器翻译系统(以下简称科专笑飞)一亮相就引起了业界关注。其BLEU值(国际上评价机器翻译质量的一种经典方法)已经超越谷歌公司等多家行业巨头。目前有超过1500名ZL审查员、

基因翻译后调控的过程

翻译后修饰(PTM)是对蛋白质的共价修饰。像RNA剪接一样,它们有助于使蛋白质组更加丰富多样。这些修饰通常由酶催化。此外,诸如氨基酸侧链残基的共价添加这样的修饰过程通常可以被其它酶逆转。但蛋白水解酶对蛋白质骨架的水解切割是不可逆转的 。PTM在细胞中发挥着许多重要作用。例如,磷酸化主要涉及激活和失活

异源翻译系统的定义

中文名称异源翻译系统英文名称heterologous translational system定  义将基因或信使核糖核酸(mRNA)转移到非自身的宿主表达系统中进行蛋白质的翻译合成,该宿主表达系统即为异源翻译系统。应用学科生物化学与分子生物学(一级学科),方法与技术(二级学科)

无细胞翻译系统的组成

无细胞系统要包含以下成分:核糖体、各种tRNA、各种氨酰-tRNA合成酶、蛋白质合成需要的起始因子和延伸因子以及终止释放因子、GTP、ATP、20种基本的氨基酸。

壮文智能翻译软件发布

  11月29日电 (记者刘佳华)28日,由中国民族语文翻译局自主研发的汉壮/壮汉智能翻译系统、壮文语音识别系统、壮文智能语音翻译软件、壮文语音输入法等软件在广西南宁发布。  这些软件可以提高壮汉文字互译、实时语音翻译、查询校对、古籍整理等工作的效率和质量,均可登录中国民族语文翻译局官方网站下载安装

基因翻译的调控办法

任何体内的生物反应都必须在调控的作用下,才有意义。翻译的调控是十分精密复杂的。在原核生物里翻译调控的基本单位不是单个的mRNA而是mRNA中的单个阅读框。以ATP合成酶为例,在原核生物里,该酶包含A、B、C、D、E、F、G、H等多个亚基,其基因拷贝均为一份,在转录时转录到同一个mRNA上。而实际每个

简述真核细胞翻译起始过程

  A. 核糖体的前期准备  (1)eIF1,3,5围绕E位点结合至小亚基,eIF1A围绕A位点结合至小亚基;  (2)eIF2·GTP在胞质中结合Met-tRNA形成三原复合物;  (3)三原复合物进一步结合到小亚基复合物(小亚基以及eIF1,1A,3,5)中小亚基P位点上形成43S复合物;  B

原核细胞翻译的调控介绍

  在整体上,原核细胞可通过改变核糖体结合位点(RBS)序列或者在RBS邻域制造二级结构来阻止小亚基和mRNA的结合进而阻止翻译的起始。一方面由于RBS序列固定,改变其序列将会造成所有mRNA停止翻译。另一方面由于改变序列并非快速准确的调控方法,针对单个转录本,原核细胞倾向于采取以下几种方式进行调控

真核细胞翻译的调控介绍

  值得注意的是,虽然在原核生物细胞内,翻译的起始过程依然有IF1、IF2、IF3三类因子的参与(真正耗能的步骤是IF2介导的起始tRNA入位和大亚基招募),但原核细胞几乎没有以这些蛋白因子为靶点进行的调控模式。在真核细胞内,由于大量翻译起始因子的参与,大量对于翻译的调控也是以这些蛋白因子为靶点进行

相分离调控蛋白翻译与生物节律的分子机制

  清华大学生命科学学院吝易团队与杨雪瑞团队合作揭示了细胞利用相分离对蛋白质翻译进行精细的时空调控,从而维持昼夜节律周期的分子机制。相关成果以“区室化周期性蛋白质翻译精确调控生物节律(Circadian clocks are modulated by compartmentalized oscill

翻译后修饰蛋白质的定性和定量实验

蛋白质翻译后修饰 (PTM) 在细胞生物调节中发挥着基本作用。PTM 是 mRNA 翻译后蛋白质的酶促共价化学修饰。蛋白质化学修饰非常重要,因为它们会潜在地改变蛋白质的物理或化学性质、组成、活性、细胞定位或稳定性。实际上,在氨基酸或蛋白质的 N 端或 C 端加入或移除化学基团会导致大部分蛋白质发生变

关于翻译后修饰的蛋白质的基本介绍

  前体蛋白是没有活性的,常常要进行一个系列的翻译后加工,才能成为具有功能的成熟蛋白。加工的类型是多种多样的,一般分为以下几种:N-端fMet或Met的切除、二硫键的形成、化学修饰和剪切。当合成蛋白质时,20种不同的氨基酸会组合成为蛋白质。蛋白质的翻译后蛋白质其他的生物化学官能团(如醋酸盐、磷酸盐、

一种调控蛋白质翻译的新方式

  Sci Adv | RAS信号通路在肿瘤细胞中一种调控蛋白质翻译的新方式  蛋白质翻译是肿瘤发生、发展的关键过程。许多致癌信号通路针对性作用于蛋白质翻译的起始阶段,以满足癌细胞中合成代谢增强的需求。  近日,来自美国康奈尔大学Shu-Bing Qian(钱书兵)课题组在Science Advan

研究揭示蛋白质翻译调控衰老新机制

近日,中国科学院广州生物医药与健康研究院研究员王涛课题组和研究员王杰课题组合作,研究揭示了甲基转移样蛋白-1和WD重复结构域4(METTL1/WDR4)介导转运RNA(tRNA)的N7-甲基鸟苷(m7G)修饰对于维持衰老过程中蛋白质组稳态的重要作用,研究结果阐明了tRNA修饰对于衰老的调控作用。相关

研究揭示蛋白质翻译调控衰老新机制

  日,中国科学院广州生物医药与健康研究院研究员王涛课题组和研究员王杰课题组合作,研究揭示了甲基转移样蛋白-1和WD重复结构域4(METTL1/WDR4)介导转运RNA(tRNA)的N7-甲基鸟苷(m7G)修饰对于维持衰老过程中蛋白质组稳态的重要作用,研究结果阐明了tRNA修饰对于衰老的调控作用。相

翻译后修饰蛋白质的定性和定量实验

翻译后修饰蛋白质的定性和定量实验             实验步骤 一、引言 蛋 白 质 翻 译 后 修 饰 (P T

中外学者合作Cell子刊解析蛋白翻译后修饰

  来自密西根大学,中科院上海药物研究所,芝加哥大学等处的研究人员发表了题为“SIRT5-Mediated Lysine Desuccinylation Impacts Diverse Metabolic Pathways”的文章,首次在哺乳动物细胞中对去乙酰化调控酶Sirt5调控的琥珀酰底

翻译后修饰蛋白质的定性和定量实验(一)

一、引言蛋 白 质 翻 译 后 修 饰 (P T M ) 在 细 胞 生 物 调 节 中 发 挥 着 基 本 作 用 。 P T M 是 m R N A 翻译 后 蛋 白 质 的 酶 促 共 价 化 学 修 饰 。蛋 白 质 化 学 修 饰 非 常 重 要 ,因 为 它 们 会 潜 在 地

翻译后修饰蛋白质的定性和定量实验(二)

二、用 于 鉴 定 P T M 的富 集 技 术2.1 磷酸化丝氨酸、苏氨酸、酪氨酸残基的可逆磷酸化也许是研究最为深人的 PT M 。蛋白质磷酸化信号网络介导细胞对与不同的应激因子、生长因子、细胞因子以及细胞间相互作用作出响应。憐酸化还影响多种细胞进程,如增殖、凋亡 、迁移 、转录和蛋白

翻译后修饰蛋白质的定性和定量实验(三)

2.2 糖基化糖 基 化 是 一 种 常 见 的 P T M , 并 且 已 经 证 明 能 够 影 响 酶 的 活 性 、蛋 白 质 定 位 、稳 定 性 、信 号 转 导 、细 胞 黏 附 和 蛋 白 质 相 互 作 用 (Spiro, 2002k 目 前 已 经 发 现 在 肿 瘤 恶

翻译后修饰蛋白质的定性和定量实验(四)

三、蛋白质的硝化修饰酪氨酸、色氨酸、甲硫氨酸、半胱氨酸侧链的硝化与亚硝化作用构成了蛋白质硝化PT M 的主要部分。这些加成反应由发育、氧化应激及衰老过程中产生的活性氮介导。活性氮的增加是由一氧化氮和活性氧的过度反应或调控紊乱造成的(Yeo et al.,2008)。活性氮和活性氧能够靶向于D

翻译后修饰蛋白质的定性和定量实验3

三、蛋白质的硝化修饰酪氨酸、色氨酸、甲硫氨酸、半胱氨酸侧链的硝化与亚硝化作用构成了蛋白质硝化PT M 的主要部分。这些加成反应由发育、氧化应激及衰老过程中产生的活性氮介导。活性氮的增加是由一氧化氮和活性氧的过度反应或调控紊乱造成的(Yeo et al.,2008)。活性氮和活性氧能够靶向于DNA、脂

翻译后修饰蛋白质的定性和定量实验4

五、质 谱 分 析质谱仪器的多种设计和配置都支持蛋白质组的动态性质及其相关 P T M 的研究工作 。对 鉴 定 PTM 而言,质谱仪的最重要的两个特征(feature) 就是其质量准确度和分辨率 。与蛋白质鉴定不同 (其通常是基于鉴定同一蛋白质中的多个独立肽段)P T M 必须通过单独的 MS/M