中国学者最新NatureGenetics文章:破译又一关键基因组
生物通报道:来自中国水产科学研究院黄海水产研究所等处的研究人员发表了题为“The genome and transcriptome of Japanese flounder provide insights into flatfish asymmetry”的文章,破译了日本牙鲆(Japanese flounder)的基因组与转录组,为解释比目鱼的不对称性提供了新的观点。 这一研究成果公布在12月5日的Nature Genetics杂志上,文章的通讯作者分别是黄海水产研究所陈松林(Songlin Chen)研究员,王清印(Qingyin Wang),以及德国维尔茨堡大学的Manfred Schartl,上海海洋大学的Deborah M Power。陈松林研究员现任中国水产科学研究院水产生物技术领域首席科学家,黄海水产研究所二级研究员,水产基因组和细胞工程研究室主任,兼任中国水产学会水产生物技术专业委员会主任,山东省泰山学者特......阅读全文
Nature公布小麦基因组
利物浦大学、加州大学戴维斯分校等9所研究机构合作对小麦基因组进行了测序,他们的研究将于十一月二十九日在Nature杂志上发表,有望帮助人们增加小麦产量,培育更适应环境变化的品种。 到2050年,世界人口预计会从七十亿增加到九十亿,在可用耕地越来越少的情况下,要满足全球对粮食持续增长的需求,
Nature:基因组的“气味”
问问你身边的十个人,他们是如何寻找自己的伴侣的,也许你会得到十份不同的答案。不过也许他们都错了,一项最新的研究指出,嗅觉系统具有超乎想象的敏感性,能精确鉴别遗传上的相关性,这表明这种能力能为同类识别,伴侣选择,以及其它社会相互联系类型提供必要的信息。 许多方面的动物行为都需要了解
什么是基因组作图?
中文名称基因组作图英文名称genome mapping;genomic mapping定 义确定界标或基因在构成基因组的各条染色体上的位置,以及染色体上各个界标或基因之间的相对距离,绘制遗传连锁图或物理图。应用学科生物化学与分子生物学(一级学科),方法与技术(二级学科)
基因组大小如何确定?
基因组大小是一个拷贝的单倍体基因组中DNA碱基对的总数。基因组大小与原核生物和低等真核生物的形态复杂性呈正相关。然而,在软体动物和上述所有其它高等真核生物之后,这种相关性已不再存在 ,主要是因为重复DNA的缘故。
线粒体基因组的简介
线粒体是真核细胞的一种细胞器,有它自己的基因组,编码细胞器的一些蛋白质。除了少数低等真核生物的线粒体基因组是线状DNA分子外(如纤毛原生动物Tetrahymena pyniform和Paramecium aurelia以及绿藻Clam ydoomonas rein—hardtia 等),一般都是
线粒体基因组的简介
线粒体是真核细胞的一种细胞器,有它自己的基因组,编码细胞器的一些蛋白质。除了少数低等真核生物的线粒体基因组是线状DNA分子外(如纤毛原生动物Tetrahymena pyniform和Paramecium aurelia以及绿藻Clam ydoomonas rein—hardtia 等),一般都是
叶绿体基因组的概念
采用高盐、低pH值法提取雷蒙德氏棉叶绿体DNA;通过物理剪切法获得随机断裂的DNA片段;剪切片段末端、补平修饰后与pCC1FOS载体连接;用噬菌体包装蛋白包装重组DNA,侵染大肠杆菌EPI300,构建了雷蒙德氏棉叶绿体基因组文库。对于叶绿体DNA剪切,以1 mL注射器中等速度吸打18次为最佳参数。
基因组DNA的提取
第一节 概 述DNA的提取通常用于构建文库、Southern杂交(包括RFLP)及PCR分离基因等。利用DNA较长的特性,可以将其与细胞器或质粒等小分子DNA分离。加入一定量的异丙醇或乙醇,的大分子DNA即沉淀形成纤维状絮团飘浮其中,可用玻棒将其取出,而小分子DNA则只形成颗粒状沉淀附于壁上及底部,
什么是基因组进化?
基因组不仅仅是生物体基因的总和,基因组还含有其它可以考虑特定基因及其产物的特征。复制在基因组的塑造过程中起了重要作用。复制的范围包括短串联重复序列的延伸、基因簇的复制、整个染色体甚至整个基因组的复制。这种复制可能是创造遗传新性状的基础。
细胞核基因组
每条染色体含1个DNA分子,1个细胞的全部遗传信息(基因)都编码在线状的DNA分子上。由于每个体细胞中有2套染色体(2n),故所含的DNA是由两个基因组(genome)构成。每个单倍体基因组约含3.2×109bp.人类基因的平均长度为1~1.5kb,所以基因组以足以编码1.5×106蛋白质,但实
转基因组的定义
将一个生物或细胞的整个基因组转移到另一个细胞或物种里的转基因技术,包括,细胞核移植、动物克隆技术和人工合成基因组的合成生物学等领域。
功能基因组的定义
表达一定功能的全部基因所组成的DNA序列,包括编码基因和调控基因。
基因组重排的定义
基因组重排将重组的对象从单个基因扩展到整个基因组,可以在更为广泛的范围内对菌种的目的性状进行优化组合。
前基因组的概念
中文名称前基因组英文名称pregenome定 义某些病毒基因组DNA进入细胞核后,在宿主RNA聚合酶作用下产生的一条作为遗传信息载体的信使核糖核酸(mRNA)。可以通过逆转录形成双链的病毒基因组DNA。应用学科生物化学与分子生物学(一级学科),核酸与基因(二级学科)
揭秘基因组“暗物质”
原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2024/1/516832.shtm非编码核糖核酸(以下简称非编码RNA)在生命活动调控的各个方面发挥着重要作用。研究非编码RNA对了解生命调控的本质不可或缺,是当前生命科学研究前沿热点。2014年,国家自然科学基金重大
表观基因组的概念
中文名称表观基因组英文名称epigenome定 义全基因组的甲基化图谱。应用学科遗传学(一级学科),基因组学(二级学科)
基因组大小如何决定?
基因组大小是一个拷贝的单倍体基因组中DNA碱基对的总数。基因组大小与原核生物和低等真核生物的形态复杂性呈正相关。然而,在软体动物和上述所有其它高等真核生物之后,这种相关性已不再存在,主要是因为重复DNA的缘故。
基因组作图的定义
中文名称基因组作图英文名称genome mapping;genomic mapping定 义确定界标或基因在构成基因组的各条染色体上的位置,以及染色体上各个界标或基因之间的相对距离,绘制遗传连锁图或物理图。应用学科生物化学与分子生物学(一级学科),方法与技术(二级学科)
基因组DNA的提取
基因组DNA的提取概 述 基因组DNA的提取通常用于构建基因组文库、Southern杂交(包括RFLP)及PCR分离基因等。利用基因组DNA较长的特性,可以将其与细胞器或质粒等小分子DNA分离。加入一定量的异丙醇或乙醇,基因组的大分子DNA即沉淀形成纤维状絮团飘浮其中, 可用玻棒将其取出,而小分
认识泛基因组测序
什么是泛基因组?2005年,Tettelin等人提出了微生物泛基因组概念(pangenome,pan源自希腊语‘παν’,全部的意思),泛基因组即某一物种全部基因的总称。2009 年,Li等人首次采用新全基因组组装方法对多个人类个体基因组进行拼接,发现了个体独有的DNA序列和功能基因,并首次提出了“
基因组测序仪简介
基因组测序仪是一种用于生物学领域的分析仪器,于2012年12月19日启用。 技术指标 个体化基因组测序仪主机/ION TORRENT主机。 主要功能 样品处理、快速的运行时间以分析单个或多个样品 支持多重文库,从而实现最大的效率和经济性 可在必要时禁用个别测序通道,以节约试剂用量。
核基因组的概念
核基因组是指真核生物细胞核染色体所包含的的全部遗传信息即碱基对,有别于诸如叶绿体和线粒体的质体基因组,以及黏粒及质粒等其他基因组存在形式。
基因组重排的定义
基因组重排将重组的对象从单个基因扩展到整个基因组,可以在更为广泛的范围内对菌种的目的性状进行优化组合。
镶嵌基因组的定义
中文名称镶嵌基因组英文名称mosaic genome定 义由不同生物基因组的DNA序列经过重新组合而形成的一套杂合的生物体基因。应用学科生物化学与分子生物学(一级学科),核酸与基因(二级学科)
基因组重排的原理
1998年Maxygen公司的Stemmer等人提出了一种新的分子育种方法——全基因组重排技术,这种技术是分子定向进化在全基因组水平上的延伸,它将重组的对象从单个基因扩展到整个基因组-,因此可以在更为广泛的范围内对菌种的目的性状进行优化组合。基因组重排技术主要在传统诱变的基础上与原生质体融合相结合进
基因组改变如何实现?
生物体所有细胞都源自同一个单细胞,因此它们应该具有相同的基因组。但是,在某些情况下,细胞间会出现差异。细胞分裂期间的DNA复制和环境诱变剂的作用都可导致体细胞发生突变。在某些情况下,这种突变会导致癌症,因为它们会导致细胞更快地分裂并侵入周围组织。 在减数分裂期间,二倍体细胞分裂两次以产生单倍体生殖细
基因组DNA的定义
中文名称基因组DNA英文名称genomic DNA定 义组成生物基因组的所有DNA。应用学科生物化学与分子生物学(一级学科),核酸与基因(二级学科)
PNAS:睡眠紊乱改变人类转录组
根据发表在1月20日《美国科学院院刊》(PNAS)上的一项研究,在遵循28小时睡眠-觉醒周期(sleep-wake cycle )的人类志愿者体内按标准昼夜节律周期表达的基因大为减少。那些显示异常表达周期的基因与转录和翻译相关,表明打乱睡眠的常规是造成轮班工作和时差生理效应的一个主要原因。
如何进行转录组数据分析
首先您做的事芯片呢?还是转录组测序呢? 芯片我不是太了解,可能是封闭系统,目前看对于发现新转录本不是很有利。 若是做转录组测序,首先去除 序列,然后片段重叠。然后将将每一个read 到基因组,取得GO值,功能注释,转录水平评估,功能富集及pathway分析,若对新发现的转录本感兴趣还可以做转录本的功
“泛转录组”首次用于RNA测序分析
近日发表在《自然·方法》杂志上的一篇新论文中,美国加利福尼亚大学圣克鲁斯分校(UCSC)的研究人员介绍了有史以来第一种使用“泛转录组”分析全基因组RNA测序数据的方法。 分析一个人的基因表达需要将他的RNA图谱映射到一个标准参照物,以深入了解基因在多大程度上“开启”并在体内发挥功能。但当参照物不