张启发院士今年第3篇PNAS:控制水稻光敏雄性不育的基因

近年来,陆续有研究发现了非编码RNAs在调节生物学过程中的作用。phasiRNA(phased small-interfering RNAs)是非编码RNA中发现的最新成员,目前对于其生物学功能我们还知之甚少。12月13日,《美国国家科学院院刊》(PNAS)在线刊发了华中农业大学题为“PMS1T, producing phased small-interfering RNAs, regulates photoperiod-sensitive male sterility in rice”的研究论文。该研究克隆到了水稻控制光敏雄性核不育的基因pms1,并对其功能进行了解析。范优荣(Yourong Fan)博士为本文的第一作者,张启发(Qifa Zhang)院士为通讯作者。 phasiRNAs是一类特殊的小RNA,是在来自前体RNA的转录本的21或24-nt间隔产生的。phasiRNAs存在于各种各样的生物体中。在动物中,一类......阅读全文

张启发院士Nature子刊发表水稻基因组成果

  9月13日,在Nature旗下的开放获取杂志《Scientific Data》发表的一项研究中,来自华中农业大学和美国亚利桑那州大学的研究人员,用PacBio的long read测序数据和Illumina双末端测序数据,构建了两个籼稻参考基因组。  我国著名的植物遗传和分子生物学家,华中农业大学

张启发院士倡导这种“硬核”操作

  7篇PNAS论文都带中文署名!  自2015年起,发在美国《国家科学院院刊》(PNAS)上的7篇论文都带有中文署名!这样的硬核操作,来自中国科学院院士、华中农业大学教授张启发带领的研究组。  该研究组最近一篇同样操作的论文在PNAS上发表后引发关注,因为这样的署名方式对于国内课题组来说并不常见。

张启发院士等人PNAS发表水稻新成果

  生物通报道:虫害是全球范围内降低农作物产量和质量的一个主要限制。寄主植物抗性通常是控制害虫的一个关键策略,但是经常被新出现的昆虫种群所克服。在自然界中,植物已经发展出了各种策略用于可持续的防御。近期,来自武汉大学和华中科技大学的研究人员,分离出了一个抗褐飞虱基因BPH9,并表明该基因位点的等位基

迄今最全面的非编码基因组图谱问世

  生命科学    非编码 DNA 延伸段在发育和基因调控中发挥着关键作用。2 月 3 日发表在《自然》(Nature)上的一项新研究称,来自美国麻省理工学院(MIT)的研究团队发表了迄今为止最全面的非编码基因组图谱,EpiMap(Epigenome Integration across Multi

华人学者Cancer-Cell:首张人类癌症非编码RNA综合图谱

  随着对重要但知之甚少的基因组部分——“DNA暗物质”的认识日渐增加,从根本上改变了科学家们研究疾病的方式。人类基因组中包含有大约2万个蛋白质编码基因(占总数的不到2%),而70%的基因组被转录为非编码RNA。但当前仍尚未系统地调查过这些称作为长链非编码RNAs (lncRNAs)的片段以及它们发

基因组所发表长非编码RNA分类问题综述文章

  近日,中国科学院北京基因组研究所基因组科学与信息重点实验室的“百人计划”研究员章张及其团队,与沙特阿卜杜拉国王科技大学(King Abdullah University of Science and Technology)开展科研合作,对长非编码RNA的分类问题进行了系统综述,相关论文在RN

袁隆平张启发两院士联手研究转基因水稻

袁隆平与张启发 华农科研人员一直食用转基因大米   昨日,记者从华中农大获悉,该校张启发院士团队与湖南国家杂交稻工程技术研究中心袁隆平院士团队将加强合作,共同研究转基因水稻。在日前两个团队的合作交流会上,袁隆平还称,为了消除公众对转基因抗虫稻米安全性顾虑的问题,他愿意作为第一个志愿者来吃

张启发院士发表权威期刊综述:杂交的遗传优势

  来自华中农业大学,亚利桑那大学的研究人员发表了题为“Heterosis in elite hybrid rice: speculation on the genetic and biochemical mechanisms”的综述性文章,提出了一种基因表达与蛋白质量控制的新假说,并指出未

Nature子刊:非编码RNA癌症药物基因组图谱新突破

  近日,匹兹堡大学药物遗传研究中心的杨达和张敏课题组借力于一种名为弹性网络回归(Elastic Net regression)的机器学习模型,从1,001个肿瘤细胞系的高通量长非编码RNA表达谱(long noncoding RNAs, lncRNAs)与265种抗癌药物敏感性数据中,挖掘出了27

基因组密码被解锁:深度学习模型破解非编码区奥秘

人类基因组中超98%的遗传变异位于非编码区,这些变异通过调控染色质可及性、三维构象、剪接加工等多种分子机制影响基因表达,最终导致疾病发生。由于调控机制的复杂性和细胞类型特异性,目前解读非编码变异的分子效应仍是重大挑战。现有深度学习模型在预测功能基因组特征时,往往在输入序列长度与预测分辨率之间难以兼顾

张启发院士:交规式学术不端惩治体系值得推广

   “今年4月,国际期刊《肿瘤生物学》集中撤稿107篇中国论文,数量之多令人触目惊心。”9月3日,在华中农业大学2017级研究生新生入学第一课的课堂上,中国科学院院士、华中农业大学学术委员会主任张启发唏嘘不已。  按照华中农业大学的惯例,从2016年起,新入学研究生的第一堂课不讲书本知识,而是由该

张启发院士获国际“杰出作物科学家奖”

    近日在巴西结束的第六届国际作物科学大会(the International Society of Crop Science Congress)传来消息,华中农业大学生科院院长张启发院士获“杰出作物科学家奖”。据悉,该奖项授予在全球范围内享有卓越声誉的作物科学家,此次共有3名科学家获得此项殊荣

张启发院士谈科学道德:把科学当成使命来做

   “我们为什么要做科学?为什么要做学术?这真是一个很难回答的问题。一种说法是,做科学研究是为了认识世界,改造世界。这是一种高品位的说法,也是我们应该追求的。然而,另一种说法却是,做科学研究是为了发文章、毕业、找工作。估计在座的学生中得出后一个答案是大多数人,得出前一个答案的是少数人。”  9月1

张启发院士今年第3篇PNAS:控制水稻光敏雄性不育的基因

  近年来,陆续有研究发现了非编码RNAs在调节生物学过程中的作用。phasiRNA(phased small-interfering RNAs)是非编码RNA中发现的最新成员,目前对于其生物学功能我们还知之甚少。12月13日,《美国国家科学院院刊》(PNAS)在线刊发了华中农业大学题为“PMS1T

非编码区的定义

基因是由成千上万个核苷酸对组成。组成基因的核苷酸序列可以分为不同区段。在基因表达的过程中,不同区段所起的作用不同。能够转录为相应信使RNA,进而指导蛋白质合成(也就是能编码蛋白质)的区段叫做编码区。不能编码蛋白质的区段叫做非编码区。非编码区位于编码区前后,同属于一个基因,控制基因的表达和强弱 。

非编码区的作用

非编码区虽然不能编码蛋白质,但对于遗传信息表达是不可缺少的。在它上面有调控遗传信息表达的核苷酸序列,是有遗传效应的。比如RNA聚合酶结合位点。非编码区对目的基因是不可缺少的。非编码区上有与RNA聚合酶的结合位点,具有调控作用。基因非编码区的碱基的插入、缺失和替代也属于基因突变事件,尽管大多数的研究是

NAR:人类基因组中或含有超过20%的非编码基因

  近日,一项刊登在国际杂志Nucleic Acids Research上的研究报告中,来自美国国家癌症研究中心的科学家们通过研究发现,高达20%的编码基因可能根本就无法进行编码,因为这些基因具有非编码或伪基因(即过时的编码基因)的特征,由此导致的人类基因组的缩小或许会对生物医学领域产生重要的影响,

人类癌症基因组非编码区域中鉴别出关键的致癌突变

  近日,一项刊登在国际杂志Nature上的研究报告中,来自加拿大安大略省癌症研究所的科学家们通过研究在人类癌症基因组中的大量非编码区域(也被称之为人类癌症DNA的“暗物质”)中发现了一种新型的致癌突变;这种突变或能作为一种新型潜在的治疗靶点,帮助科学家们开发治疗多种类型癌症的新型疗法,包括脑癌、肝

Cell惊人发现:谁说非编码RNA不编码?

  来自德克萨斯大学西南医学中心的Eric Olson和同事们在分析梳理肌肉特异性的长链非编码RNAs(lncRNAs)以了解它们的功能时,发现了一种在骨骼肌中特异性表达的lncRNA。尽管这一RNA以往被归类为是非编码RNA,它的序列中包含的一小段却看上去好像一个编码区域。这一研究发现发布在《细胞

PNAS:下一代测序助力张启发研究“转基因水稻”

  水稻是世界上最重要的粮食作物之一,与玉米、小麦、土豆被称为“世界四大主粮”。在过去的50年里水稻尤其是籼稻(indica )的改良取得了一些里程碑式的成果。其中一项重大的突破是在上世纪的五六十年代中国及国际水稻研究所(IRRI)开发出了一系列半矮杆水稻品种,促成了水稻的“绿色革命”。  此后,半

北京基因组所合作开发完成长非编码RNA数据库

  长非编码RNA(Long non-coding RNA, lncRNA)是近年来国际研究的新热点,与人类癌症、神经系统等疾病发生密切相关,在疾病诊疗方面表现出了潜在的重大应用价值。虽然长非编码RNA表达量相对较低,但由于其在转录、基因组印记、翻译、可变剪切、转录后表达调控、蛋白运输与定位等过程的

简述非编码RNA的成熟

  多数生物体中的非编码基因(ncRNA)被转录为需要进一步加工的前体。核糖体RNA(rRNA)通常被转录为含有一个或多个rRNA的前体rRNA,前体rRNA后来在特定位点被大约150种不同的snoRNA切割和修饰。转移RNA(tRNA)的5'和3'端序列分别被RNase P和tRN

非编码序列的定义

中文名称非编码序列英文名称non-coding sequence定  义基因中不具有编码功能的序列。如真核生物基因的内含子、启动子等。应用学科生物化学与分子生物学(一级学科),基因表达与调控(二级学科)

非编码序列的概念

中文名称非编码序列英文名称non-coding sequence定  义基因中不具有编码功能的序列。如真核生物基因的内含子、启动子等。应用学科生物化学与分子生物学(一级学科),基因表达与调控(二级学科)

天津大学张雷团队:受耐寒植物启发的抗冻水凝胶!

  近年来,由于柔性电子器件在软体机器人、柔性储能设备、可穿戴设备等领域被广泛应用,受到越来越多的关注。其中,导电水凝胶在该领域具有巨大的应用潜力,因为导电水凝胶的聚合物网络赋予了它们类似固体的性质和可调节的机械性能,并且分散的水分子赋予了其离子迁移性。  但是,当温度降低到冰点以下时,传统的导电水

《基因组研究》:首张猫基因组草图绘就

猫是研究人类失明和艾滋病模型之一,因此测序结果大有用处 一只名为“肉桂”(Cinnamon)的4岁雌性阿比西尼亚猫有幸成为第一只完成基因组测序草图的猫。它也因此加入了包括狗、小鼠、大鼠以及黑猩猩等在内的基因组“俱乐部”。相关论文11月1日在线发表于《基因组研究》(Genome Research)杂

我国发现一类新型长非编码RNA-基因组“暗物质”不断“正名”

  国际著名学术期刊Molecular Cell近日在线发表了中国科学院上海生命科学研究院生物化学与细胞生物学研究所陈玲玲研究组关于长非编码RNA的最新进展。该研究发现,一类新型长非编码RNA,或与小胖威利综合征的发生发展密切相关。  人类基因组中存在大量被称为基因组“暗物质”的非编码序列,包括基因

稀土是张“牌”,但非“王炸”

  近期,中美贸易摩擦持续升级。有消息称,稀土是中国一个强大的“秘密武器”,假如中国禁止对美国的稀土出口,将实现贸易战中的“一击致命”。  作为“秘密武器”,稀土的威力有多大?中国又该如何发展和利用这一重要的战略资源?在以“新兴关键矿产”为主题的香山科学会议中,专家们纷纷表示,不应过度炒作稀土资源,

张启发院士:让全谷黑米香飘万户千家

原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2024/3/519280.shtm黑米在中国历史上存在了几千年。《诗经》里提到了有关黑米的烟火气,在陕西洋县县志记载中也将黑米列为洋县“四种优质奇米”之冠。中国的黑米品种资源分布比较广泛,但生产和消费量都比较低。

细胞化学词汇非编码小RNA

中文名称:非编码小RNA英文名称:small non-messenger RNA;snmRNA定  义:细胞中一大类由几十核苷酸到几百核苷酸组成的、不编码蛋白质的RNA。本身或与蛋白质结合形成的复合体有生物学功能。如核小RNA、核仁小RNA、微RNA、干扰小RNA、时序小RNA等。应用学科:生物化学