江苏疾控首次鉴定一种新型环状单链DNA病毒

该病毒是我中心病原所对今年9月27日江苏出入境检验检疫局送检的一例从新加坡回国的发热病人咽拭子样本进行病原体检测后所得。病原所实验室人员通过对送检样本用高通量测序技术检测发现其中含有一种新型环状单链DNA病毒片段,后根据高通量测序reads序列设计特异引物,对病人咽拭子样本进行PCR扩增,产物经过sanger测序、序列组装,于10月26日获得该病毒全长基因序列3018 nt。 该病毒基因组含2种主要开放读码框(ORFs),分别编码复制酶蛋白Rep和衣壳蛋白Cap;有2个基因间隔区,其中大的间隔区含有环状病毒特征性茎环结构。与该病毒最相似的为猪粪相关的环状病毒5(porcine stool-associated circular virus 5 (PoSCV5) , isolate CP3),编码蛋白氨基酸序列相似性约为43%和50%,进化分析揭示这2种编码蛋白分别与环状病毒科及未分类的环状单链DNA病毒聚为一类,疑似为一种......阅读全文

M13噬菌体单链DNA的制备

实验方法原理 M13 噬菌体单链 DNA 是从感染细胞分泌至周围培养液中的病毒颗粒中制备的,首先在高盐存在下,丝状病毒被聚乙二醇(PEG) 沉淀浓缩,然后用酚抽提释放单链 DNA,最后乙醇沉淀收集单链 DNA。实验材料 M13 单链噬菌体载体感染 M13 噬菌体的大肠杆菌培养物未感染的大肠杆菌的培养

M13噬菌体单链DNA的制备

M13 噬菌体单链 DNA 是从感染细胞分泌至周围培养液中的病毒颗粒中制备的,首先在高盐存在下,丝状病毒被聚乙二醇(PEG) 沉淀浓缩,然后用酚抽提释放单链 DNA,最后乙醇沉淀收集单链 DNA。本实验来源「分子克隆实验指南第三版」黄培堂等译。实验方法原理M13 噬菌体单链 DNA 是从感染细胞分泌

用噬菌粒载体制备单链DNA

            实验方法原理 噬菌粒巧妙地组合了质粒和丝状噬菌体的特征。除了基本特征外,这些质粒通常是高拷贝数的,并带有一个修饰后的丝状噬菌体的主要基因间区。这个区域 ( 野生型为 508 bp)不表达蛋白,但含有全部的顺式作用序列,该作用是病毒 DNA

M13噬菌体单链DNA的制备

            实验方法原理 M13 噬菌体单链 DNA 是从感染细胞分泌至周围培养液中的病毒颗粒中制备的,首先在高盐存在下,丝状病毒被聚乙二醇(PEG) 沉淀浓缩,然后用酚抽提释放单链 DNA,最后乙醇沉淀收集单链 DNA。

国家疾控局:五个“更加”推动疾控事业高质量发展

3月9日十四届全国人大二次会议民生主题记者会在京召开。会上,国家疾病预防控制局局长王贺胜表示,国家疾控局成立以来,推进系统重塑、理顺体制机制、明确功能定位、提升专业能力。具体来说,实现了五个“更加”:一是监测预警更加灵敏。从健全制度机制、拓展监测渠道、规范评估预警、提升专业能力等方面持续发力,建立健

环状DNA的结构特点

超螺旋,DNA双螺旋本身进一步盘绕称超螺旋,超螺旋有正超螺旋和负超螺旋两种。当盘旋方向与DNA双螺旋方向相同时,其超螺旋结构为正超螺旋,反之则为负超螺旋,负超螺旋的存在对于转录和复制都是必要的。

细胞化学词汇环状DNA

中文名称:环状DNA分       类:环状单链DNA和环状双链环状DNA也有两种,环状单链DNA和环状双链,一般存在于病毒、细菌和真核生物的线粒体和叶绿体中, 环状DNA一般比线性DNA结合更紧密更稳定,储存的遗传信息更多(重复序列)。原核生物的拟核是大型环状DNA。定       义:超螺旋,D

免疫学实验抗单链DNA(ssDNA)抗体介绍

  抗单链DNA(ssDNA)抗体介绍:  抗ssDNA是抗DNA抗体中临床意义和重要性都不如抗dsDNA的一种,DNA是一个大分子的复合物,由两条核苷酸链形成的双螺旋结构。加热时碱基间的氢键断裂,DNA变性产生ssDNA。抗ssDNA的反应位点主要是ssDNA上的嘌呤和嘧啶构成的碱基。  抗单链D

寡核苷酸指导的单链-DNA-诱变实验

实验材料 适用于转化的大肠杆菌菌株 用于转化的大肠杆菌 TG1 感受态菌试剂、试剂盒 ATPPE1缓冲液PE2 缓冲液噬菌体 T4 DNA 连接酶噬菌体 T4 多核苷酸激酶大肠杆菌 DNA 聚合酶ⅠKlenow 片段M13 噬菌体通用测序引物含 4 种 dNTP 的 dNTP 溶液诱变的 M

寡核苷酸指导的单链-DNA-诱变实验

本文介绍了由 Zoller 和 Smith 的双引物技术(1984,1987) 结合 Kunkel 的诱变体产量富集方法(1985) 构成的经典方案。本方案中使用的单链 DNA 模板含有较高的尿嘧啶残基,因为它们是从生长于 dut 和 ung 基因突变大肠菌中的 M13 噬菌体中制备的(见方案 1)

寡核苷酸指导的单链-DNA-诱变实验

            实验材料 适用于转化的大肠杆菌菌株 用于转化的大肠杆菌 TG1 感受态菌 试剂、试剂盒 ATP

研究发现全新DNA单链磷硫酰化修饰系统

DNA单链磷硫酰化修饰-感应修饰限制系统的工作机理  近日,武汉大学药学院教授王连荣课题组在《自然·微生物学》在线发表了细菌DNA磷硫酰化领域的最新研究成果,首次揭示了一套全新的磷硫酰化限制-修饰系统——DNA单链磷硫酰化修饰Ssp系统,并解析了感应基因组修饰抗噬菌体系统的分子机制。  细菌磷硫酰化

临床化验单详解抗双链DNA抗体介绍

抗双链DNA抗体介绍: 抗双链DNA抗体(抗ds DNA)是抗DNA抗体中的一种。其反应位点位于DNA脱氧核糖磷酸框架上。抗ds DNA主要出现于SLE患者的血清中,对SLE患者的组织器官损伤有致病作用。在SLE患者血循环中,大分子的DNA浓度显著高于正常人,DNA还可与多种器官的微血管结构包括肾小

黑龙江疾控260万采购基因测序仪,是否重演中国疾控乱象

  分析测试百科网讯 近日,黑龙江省疾病预防控制中心为应对新冠肺炎疫情,发布公告将采购新型冠状病毒测序设备一台。此次招标采购高通量基因测序仪1台,预算260万元。联想到4月3日晚间,华大智造质疑中国疾控采购公平性,那么这次黑龙江疾控的采购能否公正、客观?本网将持续关注。以下为本次招标详情:  中昌招

制备DNA测序模板实验——制备单链M13噬菌体DNA

本实验包含了用于制备适用于双脱氧测序的模板及适用于末端标记和化学测序的DNA的实验方案。所有用于双脱氧测序的双链模板在与引物退火前必须变性,在一般应用上,碱变性在测序中的效果比热变性好。实验材料大肠杆菌试剂、试剂盒LBTEM13聚乙二醇容易让顶层琼脂乙酸钠乙醇仪器、耗材巴斯德吸管试管离心机实验步骤1

单链和双链M13噬菌体DNA的大规模制备

实验方法原理 这个方案主要用于制备大量 M13 噬菌体的双链 DNA,因在实验室中 M13 噬菌体经常被用作克隆载体,以及在某些特殊用途时需要制备大量的单链噬菌体 DNA,如当一个特定的重组体被多次用于制备反射性标记探针或构建大量定点突变体时。实验材料 大肠杆菌 F' 菌株M13 噬菌体原液

单链和双链M13噬菌体DNA的大规模制备

            实验方法原理 这个方案主要用于制备大量 M13 噬菌体的双链 DNA,因在实验室中 M13 噬菌体经常被用作克隆载体,以及在某些特殊用途时需要制备大量的单链噬菌体 DNA,如当一个特定的重组体被多次用于制备反射性标记探针或构建大量定点突变体时

单链和双链M13噬菌体DNA的大规模制备

这个方案主要用于制备大量 M13 噬菌体的双链 DNA,因在实验室中 M13 噬菌体经常被用作克隆载体,以及在某些特殊用途时需要制备大量的单链噬菌体 DNA,如当一个特定的重组体被多次用于制备反射性标记探针或构建大量定点突变体时。本实验来源「分子克隆实验指南第三版」黄培堂等译。实验方法原理这个方案主

上海疾控强调消毒“6不要”

  5月23日上午10:00,上海市政府新闻办公室组织召开上海市新冠肺炎疫情防控工作第192场新闻发布会。市卫生健康委副主任赵丹丹、黄浦区副区长林竞君、市房屋管理局副局长林伟斌、市大数据中心副主任朱俊伟、市疾控中心传染病防治所消毒与感染控制科主任医师田靓出席,介绍有关情况,并回答记者提问。市政府新闻

国家疾控局最新发布,省、市、县疾控检验科仪器配置清单

序号仪器设备名称省级市级县级A 类B 类A 类B 类A 类B 类227实验动物独立通风笼具饲养系统√228生物安全柜检漏设备√229尘埃粒子计数器√230全自动尿碘检测装置√√√231红外分光光谱仪√232荧光分光光度计√√233测汞仪√√√234锌卟啉测定仪√√235旋光测定仪√√√236折光仪√

抗单链(变性)DNA抗体检测的临床意义

  抗ssDNA的测定结果缺乏疾病特异性,除SLE患者有较高检出率(50%~60%)外,其他风湿病如混合性结缔组织病(MCTD)、药物诱导的狼疮、硬皮病、皮肌炎、干燥综合征,类风湿性关节炎等也都有10%~70%的检出率。当抗dsDNA阴性而SLE的诊断尚未明确时,高滴度抗ssDNA的存在对诊断也有参

Science:重大进展!开发出单链DNA/RNA折纸术

  DNA折纸术科学家们正在梦想着各种各样的比人的头发小一千倍的形状,并希望这些形状有朝一日引发计算、电子学和医学变革。  如今,在一项新的研究中,来自美国亚利桑那州立大学和哈佛大学的研究人员在DNA纳米技术上取得一项重大的新进展。他们开发出的一种被称作单链折纸术(single-stranded o

单链DNA测序技术助力获取游离核酸多组学数据

游离DNA(cfDNA)是指游离在细胞外的DNA,存在于血浆、血清或尿液等体液中。cfDNA的片段组学特征可用于微创、实时、动态地监测生理和病理状态,在肿瘤早筛与复发监测、母婴健康、器官移植、感染疾病等领域具有广阔的应用前景。高通量测序技术是表征cfDNA片段组学特征的主要手段,其中,双链DNA文库

碘化物缓冲液提取噬菌体单链DNA

碘化物缓冲液: 10 mM Tris-HCl (pH 8.0), 1 mM EDTA, 4 M NaCl。室温避光贮存。不知道这里面哪个是需要避光的?我怎么没有提出DNA来,不知道是为什么?用的是NEB手册上写的方法。1. 按上述方法进行噬菌斑扩增,在第一步离心后,将500 µl含噬菌体上清转入一新

抗单链DNA(ssDNA)抗体检测的临床意义

  抗ssDNA的测定结果缺乏疾病特异性,除SLE患者有较高检出率(50%~60%)外,其他风湿病如混合性结缔组织病(mixel connective tissue disease,MCTD)、药物诱导的狼疮、硬皮病、皮肌炎、干燥综合征,类风湿性关节炎等也都有10%~70%的检出率。当抗dsDNA阴

临床化学检查方法介绍抗单链DNA(ssDNA)抗体介绍

抗单链DNA(ssDNA)抗体介绍:  抗ssDNA是抗DNA抗体中临床意义和重要性都不如抗dsDNA的一种,DNA是一个大分子的复合物,由两条核苷酸链形成的双螺旋结构。加热时碱基间的氢键断裂,DNA变性产生ssDNA。抗ssDNA的反应位点主要是ssDNA上的嘌呤和嘧啶构成的碱基。抗单链DNA(s

HiDEFseq技术揭示了单链DNA突变的起源

突变是构成DNA密码的分子“字母”的变化,DNA密码是所有活细胞的蓝图。其中一些变化可能影响不大,但其他变化可能导致疾病,包括癌症。现在,一项新的研究引入了一种原创技术HiDEF-seq,该技术可以准确检测突变之前DNA密码中的早期分子变化。该研究的作者说,他们的技术 - 发夹双链增强保真测序 -

江苏疾控部门通报:近期冬季流感已变异为甲型H1N1

  中新网南京2月26日电(记者 申冉)26日,江苏省疾病预防控制中心(下文简称江苏省疾控中心)向社会通报近期冬季流感“变异”情况。据通报,今年的冬季流感主要流行型别已经由B型Yamagata系转变为甲型H1N1,且来势汹汹,提醒民众注意预防。   据江苏省疾控中心通报:根据近期该省流感监测结果显

防控埃博拉-疾控提升三个能力

  截至目前,中国疾控中心已经检测20多例标本,均已排除埃博拉病毒,其中约有一半是疟原虫核酸。中国疾控中心病毒所所长李德新告诉科技日报记者,我国疾控部门一直关注、重视埃博拉疫情进展,口岸成为重要防线,遇有可疑病毒标本及时送检,截至目前,中国疾控病毒所尚未检出一例埃博拉病毒阳性。  密切关注 监测能力

环状DNA的类型和分布

环状DNA也有两种,环状单链DNA和环状双链,一般存在于病毒、细菌和真核生物的线粒体和叶绿体中, 环状DNA一般比线性DNA结合更紧密更稳定,储存的遗传信息更多(重复序列)。原核生物的拟核是大型环状DNA。