上海交大MCP最新成果:首个全覆盖登革病毒蛋白质芯片

作为RNA病毒中的一种,登革病毒每年感染数千万人,其遗传信息高度可变,目前缺乏有效的疫苗、药物及研究工具。近期来自上海交通大学系统生物医学研究院,广东省CDC病原微生物研究所的研究人员发表了题为“Rapid production of virus protein microarray using Protein microArray fabrication through GEne Synthesis (PAGES)”的文章,报道了全球第一款全覆盖登革病毒蛋白质芯片。 这一研究成果公布在12月13日的国际蛋白质组学领域权威期刊Molecular & Cellular Proteomics (MCP)杂志上。文章的通讯作者是上海交通大学系统生物医学研究院陶生策研究员。陶生策研究员主要研究方向为蛋白质芯片的构建和应用研究、系统生物序高通量技术研发以及蛋白质翻译后修饰(糖基化,乙酰化),获得过多项ZL授权。 系统地了解......阅读全文

病毒RNA提取实验

实验方法原理 大多植物病毒RNA 为单链RNA ,并且其极性与mRNA 极性相同,植物病毒RNA 提取较为简单,一般使用酚氯仿即可获得满意结果。实验材料 TMV病毒液试剂、试剂盒 TE-饱和酚:氯仿氯仿NaAc乙醇TE缓冲液双菌水仪器、耗材 冷冻台式离心机低温真空干燥仪电泳仪电泳槽实验步骤 一、实验

植物病毒RNA提取

大多植物病毒RNA为单链RNA,并且其极性与mRNA极性相同,植物病毒RNA提取较为简单,一般使用酚氯仿即可获得满意结果。   一、材料   提纯TMV病毒液(10mg/ml)。   二、设备   冷冻台式离心机,低温真空干燥仪,电泳仪,电泳槽。   三、试剂   TE-饱和酚:氯仿(1:1),氯仿

RNA病毒类型介绍

病毒的核酸包括双链DNA(dsDNA)、单链DNA(ssDNA)、双链RNA(dsRNA)、正单链RNA(+ssRNA)、负单链RNA(-ssRNA)五种不同类型。病毒颗粒中的组成成分有简有繁,有的用颗粒自带专门用于病毒复制的核酸酶,有的则无。有些RNA病毒的RNA并不仅有一个分子,如流感病毒有8条

Cell-Research:研究发现病毒RNA与宿主蛋白质互作网络

  RNA病毒是一类以RNA为遗传物质的病毒。许多RNA病毒可以感染人类并引起疾病,比如冠状病毒(如新冠病毒,SARS-CoV-2)、黄病毒属(如寨卡病毒,ZIKV;登革热病毒,DENV)、丝状病毒(如埃博拉病毒,EBOV)以及流感病毒(Influenza virus)等。由RNA病毒引起的疾病,比

RNA病毒与类病毒的区别

相同点:1. 都侵入宿主细胞。2. 借助宿主细胞增殖机制完成自身增殖。不同点:1. 类病毒没有蛋白质衣壳包裹,是一类小分子RNA。2. 被类病毒感染的组织并不会包含病毒颗粒。3. 类病毒自身不编码任何蛋白质。4. 在感染的宿主细胞中直接复制,更不经过逆转录步骤整合到宿主细胞的染色体上。

dna病毒和rna病毒的区分

这两种病毒的遗传物质是不一样的,DNA病毒以DNA作为遗传物质,而RNA病毒以RNA作为遗传物质,其次这两种病毒的结构也是不一样的,DNA病毒一般是双螺旋结构的,而RNA病毒一般是单链结构的,除此之外,RNA病毒的复制过程要比DNA病毒的更复杂一些,因此在治疗上多半也是更困难一点,比如由艾滋病毒引起

类病毒与RNA病毒的区别

相同点:1. 都侵入宿主细胞。2. 借助宿主细胞增殖机制完成自身增殖。不同点:1. 类病毒没有蛋白质衣壳包裹,是一类小分子RNA。2. 被类病毒感染的组织并不会包含病毒颗粒。3. 类病毒自身不编码任何蛋白质。4. 在感染的宿主细胞中直接复制,更不经过逆转录步骤整合到宿主细胞的染色体上。

HIV是DNA病毒还是RNA病毒

RNA病毒HIV:人类免疫缺陷病毒直径约120纳米,大致呈球形。病毒外膜是类脂包膜,来自宿主细胞,并嵌有病毒的蛋白gp120与gp41;gp41是跨膜蛋白,gp120位于表面,并与gp41通过非共价作用结合。向内是由蛋白p17形成的球形基质,以及蛋白p24形成的半锥形衣壳,衣壳在电镜下呈高电子密度。

单核RNA测序的芯片现已上市

  高通量的单核RNA测序方法——DroNc-Seq才刚刚在《Nature Methods》上发表。一转眼,相应的芯片已经上市。Dolomite Bio公司针对DroNc-Seq推出一款新的芯片,可实现高通量的单核RNA-Seq分析。   DroNc-Seq方法在Broad研究所的张锋(Feng

蛋白质芯片技术固体芯片的构建方法

常用的材质有玻片、硅、云母及各种膜片等。理想的载体表面是渗透滤膜(如硝酸纤维素膜)或包被了不同试剂(如多聚赖氨酸)的载玻片。外形可制成各种不同的形状。Lin,SR等人引采用APTS-BS3技术增强芯片与蛋白质的结合。

蛋白质芯片的特点

⒈ 直接用粗生物样品(血清、尿、体液)进行分析⒉ 同时快速发现多个生物标记物⒊ 小量样品⒋ 高通量的验证能力⒌ 发现低丰度蛋白质⒍ 测定疏水蛋白质: 与“双相电泳加飞行质谱”相比,除了有相似功能外,并可增加测定疏水蛋白质⒎ 在同一系统中集发现和检测为一体 特异性高 利用单克隆抗体芯片,可鉴定未知抗原

什么是蛋白质芯片?

蛋白质芯片是一种高通量的蛋白功能分析技术,可用于蛋白质表达谱分析,研究蛋白质与蛋白质的相互作用,甚至DNA-蛋白质、RNA-蛋白质的相互作用,筛选药物作用的蛋白靶点等。

蛋白质芯片技术特点

⒈ 直接用粗生物样品(血清、尿、体液)进行分析⒉ 同时快速发现多个生物标记物⒊ 小量样品⒋ 高通量的验证能力⒌ 发现低丰度蛋白质⒍ 测定疏水蛋白质: 与“双相电泳加飞行质谱”相比,除了有相似功能外,并可增加测定疏水蛋白质⒎ 在同一系统中集发现和检测为一体 特异性高 利用单克隆抗体芯片,可鉴定未知抗原

蛋白质芯片的原理

蛋白芯片技术的研究对象是蛋白质,其原理是对固相载体进行特殊的化学处理,再将已知的蛋白分子产物固定其上(如酶、抗原、抗体、受体、配体、细胞因子等),根据这些生物分子的特性,捕获能与之特异性结合的待测蛋白(存在于血清、血浆、淋巴、间质液、尿液、渗出液、细胞溶解液、分泌液等),经洗涤、纯化,再进行确认和生

蛋白质芯片的种类

蛋白芯片主要有三类:蛋白质微阵列、微孔板蛋白质芯片、三维凝胶块芯片等。

蛋白质芯片的制备

固体芯片的构建常用的材质有玻片、硅、云母及各种膜片等。理想的载体表面是渗透滤膜(如硝酸纤维素膜)或包被了不同试剂(如多聚赖氨酸)的载玻片。外形可制成各种不同的形状。Lin,SR等人引采用APTS-BS3技术增强芯片与蛋白质的结合。探针的制备低密度蛋白质芯片的探针包括特定的抗原、抗体、酶、吸水或疏水物

蛋白质芯片技术简介

由于利用了DNA与互补的DNA或RNA结合的典型性质, DNA 芯片在短时间内就取得了成功. 然而, 已经有关于mRNA 和蛋白质之间数量关系上的争论, 而且实际上在细胞中参与各种不同反应的都是蛋白质. 因此, 如果能制造出蛋白质芯片而不是DNA芯片, 而且如果蛋白质表达强度和键合物能被发现, 就有

程功揭示登革病毒传播关键因素-提出抗登革热阻断策略

  登革热是目前世界上传播流行最为广泛的病毒性传染病之一。登革病毒由蚊虫携带并且传播给人。目前,全世界范围内已有100多个国家及地区出现登革热的感染流行。据世界卫生组织(WHO)估计,全世界大约由25亿人生活在受登革热感染威胁的区域,每年有3.9亿人被登革病毒感染或重复感染,有50-100万人入院治

研究发现牛虻可能是登革病毒一种新的传播媒介

  近日,广东省农业科学院动物卫生研究所与佛山科学技术学院合作,首次在牛虻中检测到1型登革病毒(DENV1),发现牛虻可能是登革病毒的一种新的传播媒。相关研究论文发表于Journal of Infection。戚南山为该论文第一作者,邵建伟、孙铭飞为共同通讯作者。  登革病毒为黄病毒科黄病毒属,是一

Cell子刊:研究发现病毒RNA与宿主蛋白质互作网络

   RNA病毒是一类以RNA为遗传物质的病毒。许多RNA病毒可以感染人类并引起疾病,比如冠状病毒(如新冠病毒,SARS-CoV-2)、黄病毒属(如寨卡病毒,ZIKV;登革热病毒,DENV)、丝状病毒(如埃博拉病毒,EBOV)以及流感病毒(Influenza virus)等。由RNA病毒引起的疾病,

病毒RNA的复制介绍

  病毒RNA进入宿主细胞后,可进行复制,即在RNA指导的RNA聚合酶催化进行RNA合成反应。  RNA复制酶催化的合成反应是以RNA为模板,由5′向3′方向进行RNA链的合成。RNA复制酶缺乏校对功能的内切酶活性,因此RNA复制的错误率较高,RNA复制酶只是特异地对病毒的RNA起作用,而宿主细胞的

流感病毒-RNA-提取

            试剂、试剂盒 10×RSB 溶液  10%SDS  蛋白酶 K  lOXLiCI 溶液  RSB 饱和的酚  氯仿

乙型脑炎病毒-RNA-提取

            试剂、试剂盒 酚 氯仿 异戊醇  乙醚  KAc  乙醇  DEPC 处理水  TBE 缓冲

甲型肝炎病毒-RNA-提取

            试剂、试剂盒 TSES 缓冲液 TSES 缓冲液饱和酚 氯仿 辛醇 乙酸钾 乙醇 缓冲液 A lmol L

流感病毒-RNA-提取

试剂、试剂盒 10×RSB 溶液 10%SDS 蛋白酶 K lOXLiCI 溶液 RSB 饱和的酚 氯仿 异戊醇 2mol L 乙酸钠 无水乙醇 TSE 溶液 LiCl 缓冲液平衡酚 TSE 饱和酚 4mol LLiCL实验步骤 一 材料与设备1. 酚提法1)10×RSB 溶液:O.Olmol/LT

常见的RNA病毒介绍

常见的RNA病毒有:艾滋病病毒(为逆转录病毒),丙型肝炎病毒,乙型脑炎病毒,全部流感病毒,鼻病毒,脊髓灰质炎病毒,柯萨奇病毒,登革热病毒,轮状病毒,烟草花叶病毒,SARS 病毒,MERS病毒,埃博拉病毒(Ebola virus),马尔堡病毒,一小部分噬菌体(大部分噬菌体都是DNA病毒)、新型冠状病毒

RNA病毒类型提取方法

试剂准备1、 TROzlo试剂、氯仿、75%乙醇(0.1% DEPC配制)。2、 塑料器皿需用0.1% DEPC水浸泡。3、 0.1%DEPC水:100ml dd水中加入DEPC0.1ml,充分振荡,37℃孵育12h以上,121℃高压灭菌20min,于4℃保存。操作步骤1、 样品处理(1) 组织:5

RNA病毒怎么合成mRNA

和DNA和成mRNA一样的,RNA聚合酶可以完成这一过程,只不过特殊的单股RNA病毒分为正链mRNA(即mRNA和原RNA一样)和负链mRNA(和原RNA互补)。

乙型脑炎病毒-RNA-提取

试剂、试剂盒 酚氯仿 异戊醇 乙醚 KAc 乙醇 DEPC 处理水 TBE 缓冲液 上样液 KCI。仪器、耗材 透析袋实验步骤 一 材料与设备1) 酚:氯仿:异戊醇 (25:24:1),2) 乙醚3)2.5mol/LKAc4) 乙醇5)DEPC 处理水6)TBE 缓冲液7〕上样液:40% 甘油,0.

甲型肝炎病毒-RNA-提取

试剂、试剂盒 TSES 缓冲液TSES 缓冲液饱和酚氯仿辛醇乙酸钾乙醇缓冲液 Almol LNaH2P04 缓冲液氯胺 T 溶液Na125I5 mmol LNa2S2O5lOOmmol LKINET 缓冲液酵母 tRNA蔗糖纤维素柱平衡液三重蒸馏水0.1mol LNaOH5 mmol L