Cell子刊:研究发现病毒RNA与宿主蛋白质互作网络

RNA病毒是一类以RNA为遗传物质的病毒。许多RNA病毒可以感染人类并引起疾病,比如冠状病毒(如新冠病毒,SARS-CoV-2)、黄病毒属(如寨卡病毒,ZIKV;登革热病毒,DENV)、丝状病毒(如埃博拉病毒,EBOV)以及流感病毒(Influenza virus)等。由RNA病毒引起的疾病,比如目前全球范围内流行的COVID-19疫情,严重威胁。 RNA病毒是一类以RNA为遗传物质的病毒。许多RNA病毒可以感染人类并引起疾病,比如冠状病毒(如新冠病毒,SARS-CoV-2)、黄病毒属(如寨卡病毒,ZIKV;登革热病毒,DENV)、丝状病毒(如埃博拉病毒,EBOV)以及流感病毒(Influenza virus)等。由RNA病毒引起的疾病,比如目前全球范围内流行的COVID-19疫情,严重威胁人类的生命和健康,阻碍了人们的正常生活和社会经济发展。解析病毒-宿主的相互作用机制,对于理解病毒的感染、致病机制,以及研发抗病毒药物......阅读全文

TRIzol法同时提取RNA、DNA、蛋白质

TRIzol试剂适用于从细胞和组织中快速分离RNA。TRIzol试剂有多组分分离作用,与其他方法如硫氰酸胍/酚法、酚/SDS法、盐酸胍法、硫氰酸胍法等相比,最大特点是可同时分离一个样品的RNA\DNA\蛋白质.TRIzol使样品匀浆化,细胞裂解,溶解细胞内含物,同时因含有RNase抑制剂可保持RNA

TRIzol法同时提取RNA、DNA、蛋白质

TRIzol试剂适用于从细胞和组织中快速分离RNA。TRIzol试剂有多组分分离作用,与其他方法如硫氰酸胍/酚法、酚/SDS法、盐酸胍法、硫氰酸胍法等相比,最大特点是可同时分离一个样品的RNA\DNA\蛋白质.TRIzol使样品匀浆化,细胞裂解,溶解细胞内含物,同时因含有RNase抑制剂可保持RNA

TRIzol法同时提取RNA、DNA、蛋白质3

DNA污染:A. 样品匀浆时加的试剂量太少。B.样品中含有有机溶剂(如乙醇,DMSO等),强缓冲液或碱性溶液。蛋白聚糖和多糖污染:沉淀RNA的过程中作以下改进可去除这些污染,步骤7中,每使用1ml TRIzol在水相中加0.25ml异丙醇和0.25ml高盐溶液(0.8M柠檬酸钠和1.2MNaCl)混

《Nature》RNA调节蛋白质合成的隐藏信号

  RNA以A、U、C和G等基本核苷酸在细胞的蛋白质加工厂中指挥蛋白质生产。为了制造蛋白质,机器的一端先锁定在RNA上,然后扫描整条RNA,直到AUG字符串后停止扫描,AUG是将遗传密码翻译成蛋白质的开始信号。  在巡查第一个AUG位点时,蛋白质制造机器经常会遇到一个与AUG不同的字符串(如AUA)

TRIzol法同时提取RNA、DNA、蛋白质(一)

TRIzol试剂适用于从细胞和组织中快速分离RNA。TRIzol试剂有多组分分离作用,与其他方法如硫氰酸胍/酚法、酚/SDS法、盐酸胍法、硫氰酸胍法等相比,最大特点是可同时分离一个样品的RNA\DNA\蛋白质.TRIzol使样品匀浆化,细胞裂解,溶解细胞内含物,同时因含有RNase抑制剂可保持RNA

TRIzol法同时提取RNA、DNA、蛋白质2

5. 2-8℃10000×g离心15分钟。样品分为三层:底层为黄色有机相,上层为无色水相和一个中间层。RNA主要在水相中,水相体积约为所用TRIzol试剂的60℅。6. 把水相转移到新管中,如要分离DNA和蛋白质可保留有机相,进一步操作见后。用异丙醇沉淀水相中的RNA。每使用1mlTRIzol加入0

RNA-蛋白质的相互作用2

叶绿体mRNA3’末端的体外加工l      RNA加工反应1.在1.5ml微量离心管中加入下列反应液:缓冲液IVT(20×)                            0.5μl叶绿体蛋白提取物(20μg)                      Lμl缓冲液E           

RNA-蛋白质的相互作用1

叶绿体RNA的体外加工与紫外交联分析RNARNA的合成l      DNA模板的线性化1.根据供应商的指导用合适的限制酶酶解含有DNA模板(如亚克隆在转录载体如pBluescript®(Stratagene)上的菠菜叶绿体psbA基因)的质粒(Schuster and Gruissem1991)。2

TRIzol法同时提取RNA、DNA、蛋白质4

注意事项:1. DNA在中间层和有机相中时可在2~8℃保存过夜。2.DNA沉淀在75%乙醇中2~8℃可保存几个月。3.DNA在8mM NaOH溶液中4℃可放置过夜,如长期保存需用HEPES调节pH至7~8并且加EDTA至1mM,可置于4℃或-20℃长期保存。常见问题分析:得率低:A.样品匀浆和裂解的

TRIzol法同时提取RNA、DNA、蛋白质(二)

DNA的分离准备试剂:乙醇0.1M柠檬酸钠(含10%乙醇)、 75%乙醇、8mM NaOH操作步骤:1. 样品加氯仿分层后,移去上层水相,用乙醇沉淀中间层和有机相中的DNA。每使用1mlTRIzol加0.3ml无水乙醇混匀,室温放置3分钟,2~8℃不超过2000×g离心5分钟。2. 移去上清,(如需

RNA蛋白质印迹法的技术应用

中文名称RNA-蛋白质印迹法英文名称Northwestern blotting定  义将经过电泳分离的蛋白质转移到膜上再与某种特异的RNA探针杂交,是研究蛋白质与RNA特异结合的技术。应用学科生物化学与分子生物学(一级学科),方法与技术(二级学科)

研究蛋白质RNA相互作用的新工具

  近日,赛默飞世尔科技全新推出了一款Pierce Magnetic RNA-Protein Pull-Down Kit,让研究人员能够以末端标记的RNA作为诱饵,轻松富集蛋白质-RNA的相互作用。与抗体捕获相比,这种方法的优势在于脱硫生物素化的目标RNA能够直接富集RBP(或复合物)。  蛋白

酵母蛋白质和-RNA-的制备(稀碱法)

实验概要本实验介绍了从酵母中分离制备蛋白质和 RNA 的原理和方法。实验原理酵母细胞富含蛋白质和核酸。用稀碱液(0.2% 的氢氧化钠)处理酵母使细胞裂解,离心收集上清液,得到酵母核蛋白抽提液。用盐酸调节抽提液 pH 至 3.0 (核蛋白的等电点),核蛋白溶解度下降大量沉出,离心收集沉淀物为酵母蛋白质

提取的DNA中含有蛋白质和RNA污染

提取的时候饱和酚,氯仿需要定量,这些可以去蛋白。去除RNA污染,RNA酶活性,定量。凝胶电泳,试剂最好是即用型的,因为有些东西放久了会长菌。然后是染料的热稳定性和灵敏度。

C/D-RNA蛋白质复合物催化RNA核糖甲基化的结构机理

上海光源用户研究发现C/D RNA蛋白质复合物催化RNA核糖甲基化的结构机理  1月27日,北京生命科学研究所叶克穷实验室在《自然》杂志发表了题为Structural basis for site-specific ribose methylation by box C/D RNA

凝胶阻滞实验分析RNA蛋白质作用常数实验

凝胶阻滞实验(gel reiardadon assay,又称为 mobthty shift assay)方法简单、灵敏,可以定量的特性使它在研究转录和基因调控中广泛的应用。目前通常用于 RNA ( 或 DNA ) 结合蛋白的纯化,确定一种已知或可能的 RNA 结合蛋白所识别的序列,建立反应常数(如亲

RNA翻译与蛋白质折叠之间的微妙舞蹈

  在蛋白质的合成过程中,RNA翻译会影响蛋白质的折叠,而蛋白质折叠也会影响RNA的翻译。  在过去的十年里,我们对细胞内蛋白质合成方式的认知取得了快速的增长,其中包括蛋白质合成的各个基本步骤:转运RNA(transfer RNA, tRNA)是如何高保真、高速率地对信使RNA(messenger

凝胶阻滞实验分析RNA蛋白质作用常数实验

            实验方法原理 凝胶阻滞实验(gel reiardadon assay,又称为 mobthty shift assay)方法简单、灵敏,可以定量的特性使它在研究转录和基因调控中广泛的应用。目前通常用于 RNA ( 或 DNA ) 结合蛋

凝胶阻滞实验分析RNA蛋白质作用常数实验

实验方法原理 凝胶阻滞实验(gel reiardadon assay,又称为 mobthty shift assay)方法简单、灵敏,可以定量的特性使它在研究转录和基因调控中广泛的应用。目前通常用于 RNA ( 或 DNA ) 结合蛋白的纯化,确定一种已知或可能的 RNA 结合蛋白所识别

蛋白质和脂质,RNA都可以糖基化

  众所周知,糖基化是在各种酶的作用下将糖添加到蛋白质或脂质中的过程。这个过程开始于内质网,结束于高尔基体。例如,糖在糖基转移酶的作用下转移到蛋白质上,与蛋白质上的氨基酸残基形成糖苷键,最终形成糖蛋白。最近,一项名为“Small RNAs are modified with N-glycans an

Cell-Research:研究发现病毒RNA与宿主蛋白质互作网络

  RNA病毒是一类以RNA为遗传物质的病毒。许多RNA病毒可以感染人类并引起疾病,比如冠状病毒(如新冠病毒,SARS-CoV-2)、黄病毒属(如寨卡病毒,ZIKV;登革热病毒,DENV)、丝状病毒(如埃博拉病毒,EBOV)以及流感病毒(Influenza virus)等。由RNA病毒引起的疾病,比

在蛋白质合成中涉及到主要的RNA是哪些?

1、信使RNA(mRNA)功能:携带着决定氨基酸排列顺序的信息,在蛋白质合成过程中起模板作用。2、转运RNA(tRNA)功能:转运特定的氨基酸,识别信使RNA上的遗传信息。3、核糖体RNA(rRNA)功能:是组成核糖体的成分。核糖体是蛋白质合成的场所。不同的组织细胞具有不同的生理功能,是因为它们表达

Cell子刊:研究发现病毒RNA与宿主蛋白质互作网络

   RNA病毒是一类以RNA为遗传物质的病毒。许多RNA病毒可以感染人类并引起疾病,比如冠状病毒(如新冠病毒,SARS-CoV-2)、黄病毒属(如寨卡病毒,ZIKV;登革热病毒,DENV)、丝状病毒(如埃博拉病毒,EBOV)以及流感病毒(Influenza virus)等。由RNA病毒引起的疾病,

如何分离DNA蛋白质复合体与RNA蛋白质复合体的混合物

可以借助一些多组分抽提试剂,比如TRIzol可以将RNA/DNA/蛋白质分开。经TRIzol处理后,RNA位于上层水相中,DNA处于中间层,蛋白质则在下层。可分别取出水相用异丙醇沉淀回收RNA;用乙醇沉淀中间层回收DNA;用异丙醇沉淀有机相回收蛋白质。

我国科学家首次解析病毒RNA与宿主蛋白质互作网络

  以流感为代表的由RNA病毒引发的疾病严重威胁人类健康,甚至影响社会经济发展。RNA作为RNA病毒的遗传物质,在致病过程中发挥着关键作用,但很少有研究报道病毒RNA与宿主蛋白间的相互作用。近期,我国科学家首次解析了多种病毒RNA与宿主蛋白质互作的关系网络,研究成果发表在《Cell Research

直接RNA测序、串联质谱法揭示新冠转录组和蛋白质组特征

此前,南开大学高山、阮吉寿等在中国预印本ChinaXiv网站发表论文,称新冠病毒S蛋白可能存在Furin蛋白酶切位点。近日,发表在预印本网站bioRxiv上的一篇论文使用直接RNA测序和串联质谱法表明了SARS-CoV-2的转录组和蛋白质组的特征,揭示了细胞通道在去除了疑似Furin 蛋白酶切位点的

服了!一种新药打尽所有癌症相关DNA、RNA和蛋白质

  今年癌症研究成果格外引人注目,各领域英雄大显神通,早前几个月我们刚报道过:Benjamin F. Cravatt蛋白质组学研究组与辉瑞公司历时多年研制而成的肺癌小分子抑制剂;Marcus Peter课题组发现的人体天然存在的广谱癌症杀手siRNAs;欧竞雄肝癌研究课题组报道的能绕开肿瘤耐药的自噬

我国科学家首次解析病毒RNA与宿主蛋白质互作网络

  以流感为代表的由RNA病毒引发的疾病严重威胁人类健康,甚至影响社会经济发展。RNA作为RNA病毒的遗传物质,在致病过程中发挥着关键作用,但很少有研究报道病毒RNA与宿主蛋白间的相互作用。近期,我国科学家首次解析了多种病毒RNA与宿主蛋白质互作的关系网络,研究成果发表在《Cell Research

多聚腺苷酸聚合酶的本质是蛋白质还是RNA

不对,多聚腺苷酸聚合酶是mRNA转录后加工过程用来加多聚腺苷酸尾巴的,既不需要摸板也不要引物,还有RNA聚合酶不需要引物

我国科学家首次解析病毒RNA与宿主蛋白质互作网络

  以流感为代表的由RNA病毒引发的疾病严重威胁人类健康,甚至影响社会经济发展。RNA作为RNA病毒的遗传物质,在致病过程中发挥着关键作用,但很少有研究报道病毒RNA与宿主蛋白间的相互作用。近期,我国科学家首次解析了多种病毒RNA与宿主蛋白质互作的关系网络,研究成果发表在《Cell Research