我国建成全球第四个综合基因组权威数据库
近日，中国科学院北京基因组研究所生命与健康大数据中心团队题为“The BIG Data Center： from deposition to integration to translation”（北京基因组研究所生命与健康大数据中心：从存储到整合、再到转化）的研究论文被国际学术期刊《核酸研究》（Nucleic Acids Research）在线发表。这是我国首次以数据中心为模式整体发布我国生命组学数据资源建设情况，标志着我国建设综合性基因组数据资源获得国际同行认可。 北京基因组研究所有关人员表示，此前，国际上被认可的生物组学数据中心主要有美国的NCBI、欧洲的EBI及日本的DDBJ，要想在国际期刊发表论文，需要先将自己的原始数据提交到这三个官方指定的数据库中。“中国的生物组学数据产量约占全球的40%，是数据产出大国，却没有能够被国际认可的数据库系统，不得不将自己宝贵的数据资源交给他人代管。” 该数据库成为国际上第四个被......阅读全文
自然资源部地质矿产科学数据中心成立
4月6日，自然资源部地质矿产科学数据中心在中国地质调查局发展研究中心（全国地质资料馆）正式成立。为贯彻落实党中央、国务院对科学数据管理的要求，进一步加强和规范自然资源科学数据管理，促进开放共享，自然资源部着力构建科学数据管理运行机制，在自然资源领域推动建设一批科学数据中心。部地质矿产科学数据中心的主
WDCM亚洲微生物数据资源管理与应用培训班
5月27日至6月12日，由中科院国际合作局“发展中国家科技培训班”项目支持，世界微生物数据中心（WDCM）、世界菌种保藏中心联合会（WFCC）、联合国教科文组织（UNESCO）、亚洲微生物资源保藏和可持续利用联盟（ACM）、亚洲资源中心研究网络（ANRRC）、中科院应用
光明日报：学术资源数据库“独家协议”伤害了谁
由于学术资源数据库与学术期刊签署“独家协议”，为了查阅一个特定的学术期刊，读者往往只能去购买那个特定的数据库。难题随之而来：各个数据库分割了同一领域的学术期刊，各个都有自己的“独家”，财力有限，该买谁? 读者来信 “独家协议”不利于学术交流 网络的普及与发展，为科学研究学术资源
SDG中心向联合国赠送7套全球水资源数据产品
原文地址：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/3/496794.shtm3月22日至24日，联合国2023年水事会议在美国纽约联合国总部召开。纽约当地时间22日上午，会议开幕式当天，第77届联合国大会主席克勒希在其办公室会见了可持续发展大数据国际研究中心（
我国畜禽饲料资源数据库建设启动－建立信息共享平台
近日，由中国农业科学院北京畜牧兽医研究所主持承担的科技基础性工作专项重点项目“我国主要畜禽饲料资源及其矿物元素含量与分布调查”在京正式启动。 畜牧业是我国农业农村经济的支柱产业，饲料是畜牧业生产赖以发展的物质基础。改革开放以来，我国饲料工业快速发展，已成为世界第一大饲料生产国，但饲料资源短缺、
国土资源部发布2013年最新统计数据
2月11日，国土资源部发布2013年有关统计数据，2013年我国建设用地供应、城市地价、地质勘查、矿业权出让和地质灾害防治等各方面工作有序推进，为科学发展和生态文明提供了坚实支撑。与此同时，数据显示，国土资源开发利用也受到来自经济社会各方因素的带动和制约。 土地供应——增速回落，结构合理，
2016年一季度国土资源主要统计数据
一、国有建设用地供应情况 全国国有建设用地供应9.47万公顷，同比下降0.2%。其中，工矿仓储用地2.47万公顷，同比下降2.7%；房地产用地2.36万公顷，同比下降4.4%；基础设施等其他用地供应4.64万公顷，同比增长3.7%。 二、主要监测城市地价情况 一季度末，全国105个主要监测
袁贵仁：向教育科研系统充分开放教育数据资源
教育部部长袁贵仁在1月31日召开的全国教育科研工作会议上表示，要向教育科研机构和人员充分开放教育数据资源，为教育科研提供便利条件。他同时表示，做学问要反对“只见树木、不见森林”的哗众取宠，反对生吞活剥的照搬照抄。 袁贵仁认为，教育科研最重要、最困难，同时也是最急迫的。为此，要切实加大对教育
一步一步教你使用NCBI数据库资源2
6 基因组信息6.1 数据库6.1.1 Entrez GenomeEntrez Genome数据库收录了850多种微生物、3100多种病毒以及1600多种真核生物细胞器的完整基因组数据以及将近50种动物、绿色植物和真菌的700多条染色体信息，总共收录有6200多条序列，其中有882条是去年新增的序列
天津工生所等基因组数据整合研究获系列进展
随着人类基因组计划(Human genome project, HGP)和高通量生物芯片技术的成功研发，人们广泛利用高通量全基因组生物芯片的技术手段，采用全基因组关联研究（Genome-Wide Association Studies, GWAS）的方法筛选复杂疾病易感多态（Single Nuc
北京基因组所开发表观组关联分析数据库
近日，由中国科学院北京基因组研究所国家基因组科学数据中心开发的人类表观组关联分析数据库EWAS Data Hub正式上线。该项研究成果以EWAS Data Hub: a resource of DNA methylation array data and metadata 为题在国际学术期刊《核
中国聋病基因组计划启动－建立中国聋病大数据
日前，“中国聋病基因组计划项目研讨会”在深圳举办。中国人民解放军总医院耳鼻咽喉研究所所长王秋菊在会上指出，先天性耳聋是公认的最常见的出生缺陷之一，不仅严重影响患者生活质量，且治疗与康复训练成本昂贵，我国作为世界人口大国，所面临的聋病问题尤为突出。在我国开展“中国聋病基因组计划”研究旨在深度揭示聋
油菜害虫研究新突破：西北斑芫菁基因组数据发布
近日，中国农业科学院油料所(以下简称油料所）油料基因工程与转基因安全评价创新团队发布了油菜害虫西北斑芫菁染色体水平高质量基因组数据，明确该害虫含10条染色体和11687个蛋白编码基因，为研发害虫绿色防控新方法奠定了理论基础。相关成果发表在《科学数据》（Scientific Data）上。西北斑芫菁染
解读美材料基因组计划：数据共享乃大势所趋
MGI于2011年6月启动，旨在将应用于能源、交通和安全等领域的先进材料的开发时间和资金成本减半。 美国的材料基因组计划(MGI)启动至今已有两年，5位专家日前在《自然》杂志撰文，指出材料科学家应该如何在该计划中实施工作。 Sally Tinkle：借鉴其他项目 华盛顿科技政策研究
我国科学家成功获取奥氏马全基因组数据
日前，吉林大学考古学院蔡大伟教授团队与西北农林科技大学动物科技学院姜雨教授团队在马属动物古DNA研究领域取得重要进展。该研究在国际上首次成功获取已灭绝马属动物奥氏马的高质量全基因组数据，重建了马属动物的演化历史。 马科动物自古以来就与人们的关系密切,对人类社会文明的发展产生了重大影响。中国家马起
家猪基因组提供大规模数据，有助解析人类健康
近日，研究人员完成了几个品系家猪的全基因组测序和分析，其中包括可作为人类医学研究模型以及治疗性药物测试模型的迷你猪(mini-pig)。 一个物种的基因组在深入研究其生物学本质及演化进程时具有十分重要的作用。近日，由华大基因参与完成的两篇关于家猪全基因组测序和分析的文章分别在《自然》(Na
Science：利用宏基因组数据预测之前未知的蛋白结构
根据一项新的研究，从多种环境中收集的DNA序列数据有助研究人员构建出600多种蛋白家族的三维结构模型，而在此之前，它们的结构是未知的。这些宏基因组数据能够让人们在多种物种之间进行蛋白序列比较，从而允许利用统计学力量预测这些之前不可能预测的蛋白结构。相关研究结果发表在2017年1月20日那期Sci
解读美材料基因组计划：数据共享乃大势所趋
美国的材料基因组计划(MGI)启动至今已有两年，5位专家日前在《自然》杂志撰文，指出材料科学家应该如何在该计划中实施工作。 Sally Tinkle: 借鉴其他项目 华盛顿科技政策研究所政策分析师 MGI由总统巴拉克·奥巴马于2011年6月启动，旨在将应用于能源、交通和安全等领
－AACR：“GENIE”呼之欲出，志在共享癌症基因组临床数据
11月6日，Genomeweb报道，美国癌症研究协会（AACR）推出了一项叫做“GENIE”的国际基因组和临床数据共享项目，旨在将不同癌症中心的基因组和结果数据汇总起来。 该项目中的“GENIE”寓意Genomics（基因组学）、Evidence（证据）、Neoplasia（肿瘤）Inform
未来个体基因组数据存储空间不够怎么办
人类基因组图谱已绘制完成，不过多数个体的基因组还没有被绘制出来，至少迄今还未完成。但个体基因组图谱一旦完成，世界将面临一个问题：如今全球的计算机系统完全没有足够的空间来存储这些数据。 “仅基因组数据的体积问题便是基因组学真正普及至全球的关键障碍之一。”总部位于佩塔提克瓦的Geneformics
我国发布首个柑桔全基因组变异数据库
近日，《园艺研究》（Horticulture Research）在线发表了中国农业科学院柑桔研究所构建完成的柑桔全基因组变异数据库CitGVD（http://citgvd.cric.cn/home），这是第一个园艺类作物全基因组变异数据库。 柑桔是全世界最重要的商业水果作物之一。当前，柑桔类物
家猪基因组提供大规模数据，有助解析人类健康
近日，研究人员完成了几个品系家猪的全基因组测序和分析，其中包括可作为人类医学研究模型以及治疗性药物测试模型的迷你猪(mini-pig)。 一个物种的基因组在深入研究其生物学本质及演化进程时具有十分重要的作用。近日，由华大基因参与完成的两篇关于家猪全基因组测序和分析的文章分别在
华大参与：复杂宏基因组数据的新分析法
当前分析宏基因组数据的大多数方法，都依赖于与参考基因组的对比，但是许多环境中的微生物多样性远远超过了参考数据库所覆盖的范围。将复杂的宏基因组数据从头划分为特定的生物学实体（如特定的菌株或病毒），在很大程度上仍然是一个未解决的问题。 在2014年7月6日的《Nature Biotechnolog
庞国芳院士：谁掌握数据资源，谁就掌握了主动权
原文地址：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/8/507564.shtm
庞国芳院士：谁掌握数据资源，谁就掌握了主动权
高水平科技自立自强离不开原始创新，真正的原始创新来自基础研究，而可靠的数据资源是基础研究和原始创新的重要支撑。谁掌握数据资源，谁就掌握了原始创新的主动权和科技创新的战略先机。 “谁能把握大数据、人工智能等新经济发展机遇，谁就把准了时代脉搏。”习近平总书记一直高度重视信息化发展和大数据建设。在食
逾743万份数据，这些生物资源他们这么用
大数据大而无用？中国科学院微生物所研究员马俊才不这么认为。主持国内外生物相关数据库建设十余年，在他看来，其关键在于能否用大数据创造价值。“用好了，它就是金山；放着不用，它就是僵尸数据。”记者通过近日在京发布的最新中国科学院生物资源目录了解到，目前该数据库已汇集了中科院40个研究所72家生物资源库馆，
973计划资源环境领域项目数据汇交工作会议召开
“科学数据不仅有科研价值，它还有社会价值和经济价值。只有在共享平台上实现数据的共享和流动，数据才能不断升值。”在9月17日召开的973计划资源环境领域项目数据汇交工作会议上，数十位在研项目研究骨干、项目汇交联络人和主管部门领导共同研究科学数据的汇交与共享工作。中国工程院院士、数据汇交中
自然资源部首次公开重要领域地质数据资料
“珍惜自然资源，呵护美丽国土”是我们共同的责任和使命。今天是第49个世界地球日，自然资源部首次公开了大批用于我国经济社会发展重要领域的地质数据资料。 本次公开的地质资料数据内容包括近年来我国最新完成的多个重要领域覆盖全国的矿产地质、水
广东自然资源全要素将构建地表数据“一张图”
从广东省自然资源厅获悉，该厅日前印发《广东省自然资源调查评价监测体系建设方案(2021-2025年)》(以下简称《方案》)。根据该方案，广东自然资源全要素将构建地表数据“一张图”和快速联动监测体系“一把尺子量到底”。 据了解，《方案》以全省自然资源全要素为对象，以
广东自然资源全要素将构建地表数据“一张图”
从广东省自然资源厅获悉，该厅日前印发《广东省自然资源调查评价监测体系建设方案(2021-2025年)》(以下简称《方案》)。根据该方案，广东自然资源全要素将构建地表数据“一张图”和快速联动监测体系“一把尺子量到底”。 据了解，《方案》以全省自然资源全要素为对象，以常态化监测为骨架，以应用服