孔庆鹏课题组研究揭示DNA解旋酶基因ERCC6L为新肿瘤基因

肿瘤是一种病因复杂且异质性极高的疾病,发病机制尚不完全清楚。快速发展的肿瘤大数据(如基因组及转录组数据)积累,为甄别新的肿瘤相关基因、深入理解肿瘤发生发展的分子机制提供了绝佳的契机。 中国科学院昆明动物研究所孔庆鹏课题组,通过分析来自TCGA (The Cancer Genome Atlas)数据库的12种肿瘤的转录组数据发现:ERCC6L基因在12种肿瘤中都非常一致地显着高表达。该基因是一个新近发现的DNA解旋酶,与胚胎发育息息相关,然而与肿瘤的关系却从未见报道。研究人员首先通过体外细胞实验发现,沉默ERCC6L可显着抑制乳腺癌细胞(MCF-7, MDA-MB-231)和肾癌细胞(786-0)的增殖,细胞周期被阻滞在G0/G1期。进一步分析ERCC6L敲降后的细胞转录组数据及验证实验发现:ERCC6L敲降可显着抑制RAB31基因的转录和翻译水平,同时降低RAB31下游的MAPK途径的磷酸化水平和CDK2的蛋白表达。为了验......阅读全文

实体肿瘤检测JAK-2基因介绍

JAK2基因所编码的蛋白是一种非受体酪氨酸激酶,是Janus激酶家族的一员,该家族包括JAK1、JAK2、JAK3和TYK2。JAK/STAT是一条非常重要的信号通路,许多细胞因子如IFN、IL-2等和生长因子如EGF、CSF等都通过该信号传导途径诱导细胞的增殖、分化和凋亡。JAK与多种肿瘤尤其是血

2018肿瘤基因检测市场研究报告

随着基因测序技术的快速发展,国内基因检测行业自2015年迎来高峰,随即市场竞争不断加剧,基因检测应用范围也逐渐拓宽。目前华大基因、贝瑞基因依靠无创产前筛查等生育健康类基因检测服务,已于2017年相继上市并成为该细分领域头部公司。但肿瘤基因检测领域市场格局仍未稳定。全国每年约400万肿瘤新增病例,根据

肿瘤形成的内部因素原癌基因与抑癌基因

肿瘤形成(oncogenesis)的过程包括始发突变、潜伏、促癌和演进。始发突变是指细胞在致癌物的作用下发生了基因突变,但是突变发生后如果没有适当的环境不会发展为肿瘤,此阶段称为潜伏期;促癌是指在促癌剂(刺激细胞增长的因子,如激素)作用下开始增殖的过程,促癌因子的作用是可逆的,如果去除,引起扩增的克

肿瘤标志物——肿瘤基因P53抗体(P53AB)

肿瘤基因P53抗体(P53-AB)    正常范围:肿瘤基因P53抗体阴性。 检查介绍:P53基因是研究得比较广泛深入的一个基因。P53抗体可用于各种肿瘤的早期诊断和肿瘤的筛选试验。 临床意义:在肿瘤血清中P53抗体呈阳性的患者中,其抗体出现早于临床症状的占10%~20%。常见于乳腺癌、肺癌、结肠癌

实体肿瘤检测RIT1基因介绍

该基因编码ras相关GTPase亚家族的一个成员。编码蛋白参与调节与细胞应激相关的p38 mapk依赖性信号级联。该蛋白还与神经生长因子协同促进神经元的发育和再生。交替剪接导致多个转录变体。This gene encodes a member of a subfamily of Ras-relate

实体肿瘤检测TSC2基因介绍

这个基因的突变导致结节性硬化症。其基因产物被认为是一种肿瘤抑制因子,能够刺激特定的GTP酶。这种蛋白在细胞溶质复合体中与哈马汀结合,可能作为哈马汀的伴侣。选择性剪接导致编码不同亚型的多个转录变体。Mutations in this gene lead to tuberous sclerosis co

实体肿瘤检测NTHL1基因介绍

这个基因编码的蛋白质是一种核酸内切酶iii家族的dna n-糖基化酶。与大肠杆菌中的类似蛋白质一样,编码的蛋白质在含有氧化嘧啶残基的dna底物上具有dna糖苷酶活性,并且具有无嘌呤/无嘧啶裂解酶活性。The protein encoded by this gene is a DNA N-glycos

实体肿瘤检测NTRK1基因介绍

原肌球蛋白受体激酶A(TrkA),也称为高亲和力神经生长因子受体,神经营养性酪氨酸激酶受体1型或TRK1转化酪氨酸激酶蛋白,是人类中由NTRK1基因编码的蛋白质。 该基因编码神经营养性酪氨酸激酶受体(NTKR)家族的成员。 该激酶是膜结合受体,其在神经营养蛋白结合后磷酸化自身(自身磷酸化)和MAPK

实体肿瘤检测PALB2基因介绍

这个基因编码一种可能抑制肿瘤的蛋白质。这种蛋白与乳腺癌2早发蛋白(BRCA2)在核病灶结合并与之共定位,可能允许BRCA2稳定的核内定位和积累。This gene encodes a protein that may function in tumor suppression. This prote

实体肿瘤检测MYD88基因介绍

该基因编码一种在先天性和适应性免疫反应中起核心作用的细胞溶质适配器蛋白。这种蛋白在白细胞介素-1和toll样受体信号通路中起重要的信号转导作用。这些途径调节许多促炎基因的激活。编码蛋白由一个N端死亡结构域和一个C端toll-interleukin1受体结构域组成。这种基因缺陷的患者对化脓性细菌感染的

实体肿瘤检测FGFR1基因介绍

FGFR1基因所编码的蛋白质是属于成纤维细胞生长因子受体(FGFR)家族成员之一,目前已确定了四种由FGFRs, 即FGFR1、FGFR2、FGFR3和FGFR4。FGFR1是一种跨膜蛋白质,属于受体酪氨酸激酶,当FGF与FGFR1胞外段结合后,受体细胞内段酪氨酸激酶活性区首先发生自身磷酸化,然后使

实体肿瘤检测IDH1基因介绍

IDH1基因所编码的蛋白名为异柠檬酸脱氢酶1,人类IDH有三种类型,分别为IDH1、IDH2和IDH3,IDH1定位与细胞质和过氧化物酶体中,IDH2和IDH3定位与线粒体中。该类蛋白酶可以将异柠檬酸氧化为草酰琥珀酸,然后在转化为α-酮戊二酸。最先研究发现IDH1的突变与脑胶质瘤密切相关,之后又发现

实体肿瘤检测MDC1基因介绍

由该基因编码的蛋白质包含N-末端叉头结构域、两个BRCA1 C-末端(BRCT)基序和13个重复约41个氨基酸序列的中心结构域。编码蛋白需要激活s期和g2/m期细胞周期检查点以应对dna损伤。该核蛋白与磷酸化组蛋白h2ax在dna双链位点附近相互作用,突破其brct基序,促进atm激酶和减数分裂重组

实体肿瘤检测IDH2基因介绍

IDH2基因所编码的蛋白名为异柠檬酸脱氢酶2,人类IDH有三种类型,分别为IDH1、IDH2和IDH3,IDH1定位与细胞质和过氧化物酶体中,IDH2和IDH3定位与线粒体中。该类蛋白酶可以将异柠檬酸氧化为草酰琥珀酸,然后在转化为α-酮戊二酸。最先研究发现IDH1的突变与脑胶质瘤密切相关,之后又发现

新证据:免疫疗法应依据肿瘤基因特征

美国著名的克利夫兰诊所(Cleveland Clinic)的一项新研究表明,致病性聚合酶epsilon和delta (POLE/POLD1)的基因突变可改善对一种强大的免疫治疗方法——免疫检查点阻断疗法——的响应,文章发表在《自然-遗传学》(Nature Genetics)上。这一发现的亮点之一在于

实体肿瘤检测CBR3基因介绍

羰基还原酶3催化大量生物和药理活性羰基化合物还原为相应的醇。酶被分类为单体NADPH依赖的氧化还原酶。CBR3包含三个外显子,跨越11.2千碱基,与另一个羰基还原酶基因CBR1紧密相连。Carbonyl reductase 3 catalyzes the reduction of a large n

实体肿瘤检测DNMT3A基因介绍

CpG甲基化是一种表观遗传修饰,对胚胎发育、印记和X染色体失活具有重要意义。对小鼠的研究表明,DNA甲基化是哺乳动物发育所必需的。这个基因编码一种DNA甲基转移酶,被认为在从头甲基化中起作用,而不是维持甲基化。该蛋白定位于细胞质和细胞核,其表达受发育调节。CpG methylation is an

实体肿瘤检测ABCC2基因介绍

该基因编码的蛋白质是atp结合盒(abc)转运蛋白超家族的成员。abc蛋白通过细胞外和细胞内的膜运输各种分子。abc基因分为七个不同的亚家族(abc1,mdr/tap,mrp,ald,oabp,gcn20,white)。该蛋白是mrp亚家族的一员,参与多药耐药。这种蛋白在肝细胞的小管(顶端)部分表达

实体肿瘤检测DDR2基因介绍

含有盘状结构域结构域的受体2,也称为CD167b(分化簇167b),是人体中由DDR2基因编码的蛋白质。 含有盘状结构域结构域的受体2是受体酪氨酸激酶(RTK)。 RTK在细胞与微环境的交流中起着关键作用。 这些分子参与细胞生长,分化和代谢的调节。 在一些情况下,RTK通过膜转导信号的生化机制已显示

实体肿瘤检测TP53基因介绍

TP53基因编码的是分子量约为53kDa的蛋白,P35根据其分子量大小命名的,首次是在1979年发现致瘤病毒SV40可以与该蛋白形成复合物,并且将克隆得到p53转入到细胞可引起细胞癌变,所以最初的10年普遍认为p53是抑癌基因。后来发现之前肿瘤细胞来源的p53基因突变体能够促使细胞发生转化,而野生型

实体肿瘤检测FLT1基因介绍

血管内皮生长因子受体1是人体中由FLT1基因编码的蛋白质。 癌基因FLT属于src基因家族,与癌基因ROS(MIM 165020)有关。 与该家族的其他成员一样,它显示酪氨酸蛋白激酶活性,其对于控制细胞增殖和分化是重要的。 FLT基因的序列结构类似于FMS基因的序列结构(MIM 164770); 因

基因检测是肿瘤治疗的指路明灯

  4月16日上午,记者有幸在医大二院跟肿瘤和放疗两科的科主任王海涛教授一起出特需门诊。王主任的专业特长是运用基因检测和靶向药物对付各种难治性肿瘤,来的病人都是蛮有特点的。篇幅所限,选几个有代表性的病例。  第一个接诊的是个小伙子,带着女友的病历来咨询。女友28岁,在读博士,兰州人,在南京读书。20

实体肿瘤检测CDH1基因介绍

该基因编码E-钙粘蛋白(E-Cadherin)是钙依赖性细胞粘附蛋白,属于钙粘蛋白家族成员,CDH1基因参与调节细胞粘附、迁移和上皮细胞增殖,其功能缺失导致细胞更容易侵袭与转移,该基因的突变与胃癌、乳腺癌、结直肠癌、甲状腺癌和卵巢癌密切相关。

实体肿瘤检测CCND1基因介绍

该基因编码的蛋白质属于高度保守的细胞周期蛋白家族,其成员在整个细胞周期内具有显著的蛋白质丰度周期性。细胞周期蛋白起着调节CDK激酶的作用。不同的细胞周期蛋白表现出不同的表达和降解模式,这有助于每个有丝分裂事件的时间协调。该细胞周期蛋白与CDK4或CDK6形成复合物并作为其调节亚单位发挥作用,其活性是

肿瘤代谢基因调控的新机制揭示

  中国科学技术大学生命科学学院高平课题组和张华凤课题组在肿瘤代谢基因调控研究领域取得重要进展,相关研究成果日前在线发表于《自然·通信》上。  众所周知,肿瘤通过对自身细胞代谢的重编程而获得增殖优势。因此,探索肿瘤代谢异常的机制已成为肿瘤研究的焦点。c-Myc是一个重要的癌基因,它的异常表达会导致3

实体肿瘤检测NQO1基因介绍

该基因是NAD(P)H脱氢酶(醌)家族的成员,编码胞质2-电子还原酶。这种FAD结合蛋白形成同二聚体,并将醌类还原为对苯二酚类。这种蛋白质的酶活性阻止了醌类的单电子还原,从而导致自由基的产生。该基因突变与迟发性运动障碍(TD)、暴露于苯后血液毒性风险增加以及对各种癌症的易感性有关。这种蛋白的改变表达

实体肿瘤检测TSC1基因介绍

该基因编码一种生长抑制蛋白,被认为在稳定块茎素中起作用。这种基因的突变与结节性硬化症有关。选择性剪接导致多个转录变体。This gene encodes a growth inhibitory protein thought to play a role in the stabilization o

实体肿瘤检测CDK6基因介绍

细胞分裂蛋白激酶6(CDK6)是由CDK6基因编码的酶。它受细胞周期蛋白的调节,更具体地说是细胞周期蛋白D蛋白和细胞周期蛋白依赖性激酶抑制蛋白。由该基因编码的蛋白质是细胞周期蛋白依赖性激酶(CDK)家族的成员,其包括CDK4。CDK家族成员与酿酒酵母cdc28和粟酒裂殖酵母cdc2的基因产物非常相似

实体肿瘤检测MLH1基因介绍

MLH1基因编码的蛋白参与DNA错配修复,是遗传性非息肉性结肠癌(HNPCC)相关基因。其机制为DNA错配修复蛋白的功能缺陷,导致了染色体和微卫星不稳定,其中微卫星不稳定是引起HNPCC主要原因,并且DNA错配修复基因的突变可以解释90%以上的HNPCC。

基因测序仪在肿瘤诊断上的应用

肿瘤的发生是遗传基因和环境因素共同作用的结果,其中遗传基因是内因,与人体是否具有肿瘤易感基因有关。肿瘤易感基因的检测可以检测出人体内是否存在肿瘤易感基因或家族聚集性的致癌因素,根据个人情况给出人性化的指导方案。