人体微生物组可能已经处于生态学上的危险区！
我们如今生活的世界与我们的祖先当时生活的世界发生了很大的改变。随着我们进入了新的地理纪元-“人类世”，在世界上留下了很多足迹。我们如今面临的问题也越来越多，包括全球气候变暖，冰川融化以及生物多样性的减少。 不过另外一个问题却常常被忽视：我们体内的微生物种群数量也在大幅下降。 如果我们体内的微生物组是整个微生物世界里的“金丝雀”(这种鸟体质比较差,需要精心养护)的话，那么最近的研究则表明它已经快要不行了。 在非洲的田野里，我们经常可以看到来自哈德部落的猎户们熟练地宰杀一只狒狒，并在篝火边与他人分享美食。所有的部分都不会被浪费，包括器官、大脑以及肠胃等等。 这一场景以西方的标准来看则是十分可怕的。 不管它们如何获取食物，他们体内与环境中的微生物时刻发生着十分剧烈的交换，而这正是人类进化的源泉。 为什么这种交流如此重要呢？最近研究表明人体内的微生物种群数量的下降常常伴随着一系列疾病的发生，尽管两者的因果关系如何至今仍不......阅读全文
人体微生物组可能已经处于生态学上的危险区！
我们如今生活的世界与我们的祖先当时生活的世界发生了很大的改变。随着我们进入了新的地理纪元-“人类世”，在世界上留下了很多足迹。我们如今面临的问题也越来越多，包括全球气候变暖，冰川融化以及生物多样性的减少。 不过另外一个问题却常常被忽视：我们体内的微生物种群数量也在大幅下降。 如果我们体内的微
后微生物组时代－首次发现人体特有的病毒组
我们人体中的病毒会影响微生物群体的结构和行为，但是关于身体许多区域的噬菌体，也就是感染细菌的病毒，科学家们所知甚少。近期一组研究人员发现，在膀胱中整合进细菌基因组的是噬菌体要比细菌本身多得多，这项出乎人意料的研究发现公布在1月29日的the Journal of Bacteriology杂志上。
宏基因组及宏转录组测序揭示极端环境微生物的生态学作用
中山大学与千年基因合作应用宏基因组及宏转录组测序对极端环境酸性矿山废水（Acid mine drainage, AMD）中的微生物群落进行研究，相关成果于11月7日发表于The ISME Journal杂志。 本研究是继2012年11月发表于The ISME Journal杂志的微生物群落多样
赵立平专访：人类微生物组研究，解密人体第二基因组
2007年12月美国《科学》杂志预测：人体共生微生物的研究将可能是国际科学研究在2008年取得突破的7个重要领域之一。就如何研究共生微生物与人体健康的关系等问题，4月刚刚出席了巴黎国际人类微生物组研究联盟筹委会会议的上海交通大学生命科学技术学院教授赵立平接受了《科学时报》的采访。 深圳华大基因
Cell：人体微生物组产生上千种新的小蛋白
你的身体是一个仙境。这是一个充满了数万亿个细菌的仙境。但它并不像听起来的那么可怕。事实上，有越来越多的证据表明，我们健康的许多方面都与我们体内的细菌的组成和多样性密切相关，不过具体是如何相关联在一起的，目前在很大程度上还不清楚。 在一项新的研究，来自美国斯坦福大学医学院的研究人员发现这些存在于
2017年人体微生物组与健康学术会举办
21世纪是精准医学时代，人类基因组计划的实施推动了现代医学研究进入这个里程，号称人体第二基因组的“人体微生物组”的研究将彻底改变医学研究思维模式，为全面解析人体健康奥秘开辟一个全新的研究领域。 在此背景下，2017年人体微生物组与健康学术会于11月17日至18日在中国科学院微生物研究所举行，
Nature：98％的人体肠道微生物组差异竟由环境决定！
关于与生俱来与后天培养（nature vs nurture）的问题延伸到了我们的微生物组（microbiome）---我们每个人携带的细菌（它们中的大多数是有益细菌）群体。接二连三的研究已发现我们的微生物组几乎影响到我们的健康的每一个方面；它的微生物组成因人而异，而且可能是包括从体重增加到情绪在内的
新的肠道菌取样法助力人体微生物组学研究
最近，美国福赛思研究所、麻省综合医院（MGH）和哈佛大学公共卫生学院等处的科学家，开发出一种新的方法，收集用于基因组和转录组分析的唾液与粪便。该方法不需要专业人员和设施，同时还能保持样品的完整性。这种方法也为消化道微生物组的基因组成和乳糜泻、口腔癌、牙周炎和肥胖症相关的细菌，提供了重要的见解。
新的肠道菌取样法助力人体微生物组学研究
最近，美国福赛思研究所、麻省综合医院（MGH）和哈佛大学公共卫生学院等处的科学家，开发出一种新的方法，收集用于基因组和转录组分析的唾液与粪便。该方法不需要专业人员和设施，同时还能保持样品的完整性。这种方法也为消化道微生物组的基因组成和乳糜泻、口腔癌、牙周炎和肥胖症相关的细菌，提供了重要的见解。
Cell重磅发布15万人体微生物基因组！－揭示微生物新物种
微生物宏基因组是当今世界最热门的科研领域之一。越来越多的研究表明，人体微生物发挥着重要的健康作用，但大部分多样性仍未得到充分探索，尤其是在除肠道以外的身体部位及非西方人群。 在今日发表在Cell期刊的一项研究中，由意大利特伦托大学Nicola Segata领导的研究团队利用来自不同地理位置、生
深度分析人体病毒组
自从微生物学诞生以来，研究人员着重关注让我们、我们驯养的家畜和种植的植物患病的病原体。鉴于症状的产生是了解特定病毒是否在几年前就已存在的唯一方法，因此大多数得到很好研究的病毒是那些导致疾病的病毒。但是很多病毒长期地感染人类，不会导致疾病，但是可能会导致年龄非常小的、年龄非常大的或者存在免疫抑制的
危险区域目录现已发布
在化学与石油化工行业，基本上无法避免加工厂内不存在具有潜在爆炸危险性的空气。在设计与安装用于危险区域的称重系统时，必须将监管安全准则熟记于心。安全与区域分类火灾与爆炸是工厂的主要安全隐患。存在或者有可能存在爆炸气体的区域定义为“危险区域”。在危险区域作业的加工行业有义务进行风险分析或者危险与可操作性
“百万微生态”计划将构建全球最大人体微生物组数据库
2019年10月26日，“百万微生态”国际合作计划（MMHP）在深圳第14届国际基因组学大会（ICG-14）上正式启动，来自中国、瑞典、丹麦、法国、拉托维亚等多国科学家将合作开展微生物宏基因组研究，致力于在未来三至五年内对100万份来自肠道、口腔、皮肤、生殖道等器官的微生物组样品进行测序分析，绘
Cell：人体微生物也是“制药公司”
生活在人体内的细菌包含了为一系列类药性分子指定遗传密码的基因——包括一种由阴道细菌制造的新抗生素。研究人员将该发现报告于近日的《细胞》杂志上。 这种名为lactocillin的药物暗示微生物学领域还有尚未开发的广阔医疗前景。并未参与新研究的加拿大魁北克省拉瓦尔大学医院中心（CHUL）微生物学家
DGGE技术在微生物生态学中的应用
在自然界中存在大量丰富的微生物资源，但目前被人们所培养利用的仅仅占1%～10%，还有大量的微生物没有被人们所了解和利用。随着基因组学在生物技术领域的不断发展，微生物基因组学的研究凭借基因组研究(TIGR)所利用鸟枪法成功地对流感嗜血菌(Haem ophilus influenzae)的全基因组序列的
DGGE技术在微生物生态学中的应用
在自然界中存在大量丰富的微生物资源，但目前被人们所培养利用的仅仅占1%～10%，还有大量的微生物没有被人们所了解和利用。随着基因组学在生物技术领域的不断发展，微生物基因组学的研究凭借基因组研究(TIGR)所利用鸟枪法成功地对流感嗜血菌(Haem ophilus influenzae)的全基因组序
人体肚脐发现数百新微生物
把它叫做肠道细菌研究的变体吧。科学家在从自愿捐献者的肚脐中获取DN A类型样本时发现了662种显然在以前的科学研究中未见过的微生物。这表明，人的肚脐显然为细菌提供了合适的环境。 英国《新科学家》周刊说，北卡罗来纳州立大学科学家开展的这个肚脐生物多样性项目分析了一大群志愿者的肚脐
病原微生物对人体健康危害
水中病原微生物对人体健康形成的危害历史长久。受病原微生物污染的水体中含有大量的致病菌、病毒等,可引起伤寒、痢疾、霍乱和腹泻等肠道疾病。19世纪欧洲一些大城市因水源水质受到污染造成多次霍乱爆发和蔓延。在此之后,人类采用加氯消毒方式,基本上控制了水致传染病问题。但1970年代以来,饮用水中又不断发现新的
中科院最新文章解析人类母乳微生物菌群
母乳是婴儿最健康、理想的营养来源, 也是人类进化和文明最重要的特征之一. 最新的宏基因组学研究表明母乳含有高达数百种细菌, 而且包括一些常见的病原菌. 母乳微生物菌群是人类与微生物协同进化相互适应的产物, 而“微生物群落-宿主”生态系统的动态平衡则应是保持健康母乳的基础. 然而, 迄今为止, 从
土壤动物肠道微生物的生态学功能取得进展
蚯蚓是土壤中主要的大型土壤动物，它们对于土壤中碳素的稳定、矿化以及氮素的周转等方面有重要的贡献。但是此前，大多的研究都停留在土壤物本身，而忽略了土壤动物肠道微生物在其宿主发挥这些生态学功能过程中的作用。土壤动物的肠道是土壤微生物另一重要的“栖息地”，是一个天然可移动的厌氧环境，为厌氧微生物的生长
人体微生物可能成身分识别“新指纹”
哈佛大学研究人员11日说，人体肠胃细菌以及身体和皮肤各种微生物，可能像指纹一样成为独特的识别身分工具。 人体细菌可能因当事人的年纪、饮食、居住地方和整体健康情况，有很大的差异，而哈佛的研究首次探讨这种差异对识别身分的作用。 哈佛生物统计学系研究员傅兰索沙(Eric Franzosa)说：“把
微生物所发表中国微生物组数据平台
10月26日，《核酸研究》（Nucleic Acids Research）在线发表中国科学院微生物研究所微生物资源与大数据中心、世界微生物数据中心马俊才团队题为gcMeta: a Global Catalogueof Metagenomics platform to support the ar
新测序方法解析人体“第二基因组”
来自华盛顿大学圣路易斯分校，耶鲁大学等处的研究人员发表了题为“The Long-Term Stability of the Human Gut Microbiota”的文章，针对被称为人体“第二基因组”的肠道微生物组展开了研究，研究人员利用一种称为LEA-seq的方法，对多个个体粪便中的微生
人体肠道细菌基因组集研究成果
2019年2月5日上午，深圳华大团队在国际知名学术期刊自然旗下子刊自然生物技术上发表了关于人体肠道细菌基因组集（Culturable GenomeReference, CGR）研究成果。该研究提供了1500多条高质量的人体肠道细菌基因组，为肠道微生物组研究提供了大量全新的参考基因组数据，同时
利用人体微生物制药，这可能吗？
人体内共生的微生物能够生产天然药物，这些药物对维持人体健康起到了重要的作用，论文资深作者、UCSF助理教授Michael Fischbach 说。 Fischbach 说：“现在市面上的药物都是制药公司生产的，但我们现在知道，人体菌群也能生成同样有效的药物分子。” Fischbach 介绍到
微生物DNA进行人体识别引发隐私担忧
研究人员已经发现寄生于人体的微生物的聚集DNA，它又被称为‘gut print’，可以唯一地识别某个人。但这引发了隐私问题。 研究结果于5月11日发表在《美国国家科学院院刊》上，表明它可能识别人体微生物栖息研究方面的匿名参与者。该微生物将会透露个人健康、饮食或种族方面的细节。4月29日发表在
Cell：微生物组的确影响免疫
麻省总医院MGH、Broad研究所与荷兰的两家医学研究中心在Cell杂志上发表了人类功能基因组计划（HFGP）的重要研究成果。他们通过三项研究揭示了基因、微生物组和环境对免疫应答的影响。人类消化道中居住着大量的微生物，它们被统称为肠道微生物组。肠道微生物组在人类代谢食物、抵御感染和应答药物等过程中起
Cell：微生物组的确影响免疫
麻省总医院MGH、Broad研究所与荷兰的两家医学研究中心在Cell杂志上发表了人类功能基因组计划（HFGP）的重要研究成果。他们通过三项研究揭示了基因、微生物组和环境对免疫应答的影响。 人类消化道中居住着大量的微生物，它们被统称为肠道微生物组。肠道微生物组在人类代谢食物、抵御感染和应答药物等
Nature：揭秘地球微生物组计划
地球微生物组计划（Earth Microbiome Project）的目标是尽可能多地对地球微生物群落进行取样，以便促进人们对微生物及其与包括植物、动物和人类在内的环境之间的关系的理解。这一任务需要来自世界各地的科学家的帮助。到目前为止，这一计划已覆盖了从北极到南极的七大洲和43个国家，而且有超
Nature聚焦微生物组的家
人体内充满了微小的微生物，这些成百上千的细菌物种被统称为微生物组(microbiome)，人们认为它们有助于人体的健康与生存。胃肠道，尤其是结肠是最高密度和最高多样性细菌物种的家园。然而由于食物和流体的通过，这一系统不断发生变化，这些生物体是如何能够存留于其中并旺盛生长的呢? 由加州理工大