中山大学宣建伟:建立在大数据库基础上的真实世界研究

编者按:RWS是以患者为中心的结局研究。是运用流行病学研究方法,在真实无偏倚或偏倚较少的人群中,对某种或某些干预措施(包括诊断,治疗, 预后)的实际情况进行研究。 生物谷: 宣教授您好,非常感谢您参加生物谷主办的2017真实世界研究峰会, 并在会前接受生物谷的采访。真实世界研究提出之后,中国真实世界医疗大数据库的建立水到渠成,请您介绍一下真实世界医疗大数据库建立的背景和意义以及医疗大数据分析在循证医学管理中的应用情况。 回答:真实世界医疗大数据库的建立在中国才刚刚开始。这个医疗大数据库的意义在于我们能够把孤岛型的医疗数据能够整合起来形成一个真正意义上的大数据库。在构建大数据库的同时我们还能对现有的数据进行清洗整合结构化让她成为一个真正的能够供研究使用的真实世界医疗大数据库。在我们建立了这些医疗大数据库以后我们能够开展各种各方面的研究。对医院及管理层来讲我们可以进行有效的医院的运营管理的研究。从医生的角度出发我们能够进行真......阅读全文

美国CDC将建炭疽杆菌公共数据库

日前,美国疾病预防控制中心(CDC)表示,将在亚特兰大建立一个有关炭疽杆菌的公共数据库。CDC称,已经在寻找可以建立这一公共数据库的承包商。 这一举动源于6月份在亚特兰大实验室发生的炭疽杆菌事件。由于实验室部分研究人员,在让炭疽杆菌失去活性时未遵守适当程序,便将可能含有活菌样本转移到安

英特尔将建帕金森患者数据库

  帕金森症的患者通常都会被要求尽可能细致地做好自己的病情记录,以便于医生判断病情的进展。但不少患者都抱怨,我虽然正视自己的病情,但帕金森病并不是我生活的全部啊,按医生要求那样的忠实完整记录自己的病情?说起来容易做起来难!   好消息是,现在的病情监测可以很容易了。拜可穿戴技术所赐,帕金森病患者运

全球最大自闭症数据库上线

  总部位于美国纽约的Simons基金会日前宣布,全球最大的自闭症数据库(SSC)正式上线并向全球科学家开放。目前已有来自美国、加拿大、中国、法国、冰岛、澳大利亚、爱尔兰、巴西和卡塔尔等17国家相关机构的自闭症研究人员,通过云端查询等方式使用了这一数据库。  SSC包含近2600个家庭的基因组序列数

我国首个寻亲DNA数据库在京建立

   科技日报消息,我国第一个专门面向失散人员的寻亲DNA数据库日前在京宣告建立。据数据库建设方中科院北京华大方瑞司法物证鉴定中心的有关负责人介绍,通过该库,寻亲工作将变得方便快捷。同时,该库将免费为我国失散人群提供寻亲帮助,包括港澳台地区。     据悉,该库的第一批样本检测用试剂已经得到了美国

全球首个冰川微生物数据库

青藏高原被称为世界“第三极”和“亚洲水塔”。除南北极外,它是全球最大的冰川分布区,现有冰川2万条以上,面积超过2万平方公里,也是我国及亚洲20亿人赖以生存的十多条大江大河的源头。青藏高原冰川是微生物的天然存储器,封存了不同历史时期的微生物。 现在,中国科学家构建的

代谢组学常使用的数据库

  代谢组主要是对小分子代谢物(一般50-1500 Da)进行高通量定性和定量分析,代谢组分析产生了大量的生物信息数据。代谢组数据库的开发对于归纳总结这些大数据,方便后续的代谢组学数据分析,揭示隐藏在大数据背后的生物学机理具有十分重要的作用。  目前常用的代谢组学数据库有HMDB、NIST、LMSD

法律纠纷延迟大型毒性数据库启动

  研究人员表示,一个包含近万种化学物质的大型健康风险数据库或将让预测此前不存在任何数据的千万种消费化学品的毒性变得更加容易。但相关法律争议却意味着,他们不能像希望的那样公开这一数据库。 一个包含近万种化学物质的药物毒性数据库或能减少动物安全测试的需求。   “这个数据库具有能够挽救

研究开发表观组关联分析数据库

  近日,由中国科学院北京基因组研究所国家基因组科学数据中心开发的人类表观组关联分析数据库EWAS Data Hub正式上线。该项研究成果以EWAS Data Hub: a resource of DNA methylation array data and metadata 为题在国际学术期刊《

欧盟酒精饮料地理标志进入公共数据库

  欧委会官网7月26日消息。公共数据库“eAmbrosia -欧盟地理标志注册”于2019年4月推出,现包含了在欧盟注册的烈酒地理标志(GIs)。可获取信息包括烈酒地理标志的应用、发布或注册状态,以及它们受到官方保护的法律依据。eAmbrosia的设计目标是成为欧盟地理标志(EU GIs)的一站

我国建成污染源信息数据库

  在召开的“全国污染源普查总结表彰电视电话会议”上,环保部部长周生贤说,首次全国污染源普查进行了规模空前的入户登记、调查核实,全面掌握了我国污染源排放的基本情况,建立了统一的全国污染源信息数据库,完善了环境统计方式方法等。   “普查成果来之不易,需把成果转化好、应用好。”周生贤强

欧盟酒精饮料地理标志进入公共数据库

  欧委会官网7月26日消息。公共数据库“eAmbrosia -欧盟地理标志注册”于2019年4月推出,现包含了在欧盟注册的烈酒地理标志(GIs)。可获取信息包括烈酒地理标志的应用、发布或注册状态,以及它们受到官方保护的法律依据。eAmbrosia的设计目标是成为欧盟地理标志(EU GIs)的一站式

英政府设数据库保留无罪者DNA

  据《自然》网站报道,今年早些时候,英国政府曾计划将无罪的普通人的DNA保留在其大型公安数据库中,一时间引起舆论纷纷。欧洲人权法庭后来裁决,无罪者的DNA不应该被保留。   近日据英国媒体报道,从一些泄露出来的电子邮件得知,英国政府仍然决定保留无罪者的DNA,但时间不是之前所称的12年,而是6年

中国盐湖资源与环境科学数据库建成

  9日,中国科学院青海盐湖研究所历时6年建成的中国盐湖资源与环境科学数据库通过科技部验收,这也是中国唯一数据量最大的盐湖资源与环境科学基础数据共享系统。           盐湖资源是中国西部地区特色资源之一,也是中国具有相对国际优势的无机矿产资源,其中的钾、锂、硼、铷、铯等资源

基因组所完成开发RiceWiki数据库

  近日,中国科学院北京基因组研究所章张研究员课题组与北京理工大学、中国林业科学研究院及华中农业大学合作开发完成RiceWiki数据库。该数据库是基于维基百科的水稻基因信息平台,是可编辑且内容公开的公众注释系统。研究成果在Nucleic Acids Research杂志发表。   水稻是人类重

全球首个活人脑细胞数据库公布

  据美国《科学》杂志在线版29日消息称,艾伦脑科学研究所日前公布了全球首个活人大脑细胞数据库,该数据库信息可公开获取。在人类理解大脑的道路上,这一成就为科学家提供了深入探究人脑的重要资源,同时以前所未有的独特性,帮助医学界确定健康与患病大脑之间的不同。  2002年,微软公司共同创始人之一保罗·艾

“中国科学引文数据库”将面向全球推出

中国科学院国家科学图书馆近日与美国汤姆森科技信息集团共同宣布,将联手向全球推出“中国科学引文数据库”(CSCD),该数据库将依托ISI Web of Knowledge平台,让全世界更多的科研人员了解中国的科研发展及动态。 “中国科学引文数据库”由中国科学院历时20年组织研发,作为国内首个引文数据库

TPC:中国数据库性能破世界纪录

原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/3/497431.shtm

天津工生所举行TotalPatentZL数据库培训

  为提高TotalPatent数据库在科研中的实际使用效果,7月13日,中科院天津工业生物技术研究所信息资源中心特邀LexisNexis北方区培训讲师岳亭为职工和研究生进行TotalPatent数据库培训。   岳亭介绍了TotalPatent数据库的内容、功能及检索方法,从

中国盐湖资源与环境科学数据库建成

  9日,中国科学院青海盐湖研究所历时6年建成的中国盐湖资源与环境科学数据库通过科技部验收,这也是中国唯一数据量最大的盐湖资源与环境科学基础数据共享系统。  盐湖资源是中国西部地区特色资源之一,也是中国具有相对国际优势的无机矿产资源,其中的钾、锂、硼、铷、铯等资源成分关系国家的资源安全和战略安全,对

各种模式生物必需基因在线数据库

Essential Genes are the genes that are indispensable to sustain cellular life. The functions encoded by essential genes are considered as a foundation

“中医药临床证据数据库”正式启动

  4月22日,中医药临床证据数据库”启动仪式在杭州举行。国家食品药品监督管理局原副局长任德权、中国工程院院士、天津中医药大学校长张伯礼、李兰娟院士、李幼平教授、牛津大学临床实验中心和流行病学研究中心主任、牛津大学中国项目主任陈铮明教授及出席第二届循证中医药学国际论坛大会的数百名代表共同参与见证。中

研究发布大豆多维组学数据库SoyOmics

  大豆(Glycine max (L.) Merr.)是重要的粮油作物之一,其产量提升、品质改进关乎全球人口的需求和利益。高通量测序技术的发展促使大豆组学研究不断深入。实现大豆多维组学数据的整合分析,将会为大豆遗传育种提供有力支持。  近日,中国科学院遗传与发育生物学研究所田志喜团队联合北京基因组

化学键能数据库iBonD在京发布

  3月15日,清华大学基础分子科学中心和南开大学元素有机化学国家重点实验室程津培教授研究组在京发布了国际上首个涵盖全面、数据可靠、使用快捷方便、专业权威的网络版化学键能数据库iBonD1.0版。  键能是化学领域中最基础参数之一,因该参数直接反映出化合物的稳定性以及判断化学反应是否能发生,从而成为

首个CRISPR/Cas9靶序列数据库

  近期,来自美国国立卫生研究院和瑞典乌普萨拉大学的研究人员,在国际著名学术期刊《Nucleic Acids Research》上发表的一项研究中,首次提出了一个已在斑马鱼中经过实验验证的CRISPR/Cas9靶序列数据库。  CRISPR及CRISPR相关蛋白(Cas9),是在古细菌和细菌中发现的

全球最大癌症基因数据库发布

  美国国家癌症研究所(NCI)科学家发布了有史以来规模最大的癌症相关基因变异数据库,为研究者们提供了迄今为止最全面的方式,搞清楚如何将治疗药物靶向疾病。   周一NCI在一份声明中称,基于基因组学研究的新数据库,将对全球开放获取,预计将有助于研究人员加快新药的开发,同时能够更

武汉将建温室气体排放因子数据库

  武汉碳减排协会今天发布消息称,作为国家确定的7个碳排放权交易试点之一的武汉碳交易系统今年内将全面上线。   武汉碳减排协会会长程致舜说,交易系统技术层面的准备已经完成,不同物品在各环节的碳排放量都可以清楚地查询到。   据介绍,根据与法国波尔多市签署的友城合作协议,一个中法温室气体排放试点评

中国BIGD跻身国际生物组学数据库

  测序技术的发展将生命科学领域带入组学时代,海量的数据产出成为常态。组学是将基因、蛋白及代谢物等生物分子以整体为单位进行系统性的研究,基因组学、蛋白质组学和代谢物组学等相应产生。相较于此前以个体为单位的研究,组学最主要的特征就是大数据。随着组学数据的产出,搭建组学数据库,实现海量信息的存储、整合及

学术数据库免费时代何时来临

  “北大买不起知网,研究者看不起论文”,逐年上涨的论文数据库使用费令学术界叫苦不迭。26日是第16个世界知识产权日,让我们探讨一下如何在保护知识产权的同时,解决商业数据库“坐地起价”之怪现状。  学术资源的“商业化”  本月初,北京大学官网发布了通知,称因中国数据库商涨价过高,图书馆将停用“中国知

llumina向ClinVar数据库贡献人类遗传变异

  近日,来自圣地亚哥的消息– Illumina公司(纳斯达克股票代码:ILMN)宣布,它已向美国国家生物技术信息中心(NCBI)主办的公共数据库ClinVar贡献了超过95,000个人类遗传变异(信息)。Illumina所贡献的信息包括从致病变异到良性变异在内的各种类别的变异,这些变异是在Ill

学术与操作相结合-建立“食物份”数据库

  中国肯德基餐饮健康基金第六届学术研讨会在深圳举行。本次学术研讨会上,中国肯德基餐饮健康基金2013年度计划资助的7个项目,并分享了上一年度已资助项目的研究成果。   其中,2013年度最新资助项目中,最显著的一个变化是将学术研究成果与餐饮企业实际操作相结合。其中“营养健康示范餐厅创建模式