研究开发表观组关联分析数据库
近日，由中国科学院北京基因组研究所国家基因组科学数据中心开发的人类表观组关联分析数据库EWAS Data Hub正式上线。该项研究成果以EWAS Data Hub： a resource of DNA methylation array data and metadata 为题在国际学术期刊《核酸研究》（Nucleic Acids Research）在线发表。 近年来，表观组关联分析（Epigenome-wide Association Study，EWAS）已成为探索复杂性状表观遗传基础的有效策略。随着大量EWAS科研成果的发表，现已积累了海量表观遗传数据，尤其是DNA甲基化芯片数据，其海量数据的整合分析对系统研究不同实验条件下的DNA甲基化状态以及探索与各种性状相关的表观遗传机制具有重要意义。目前，国际上存在一些数据库来存储DNA甲基化芯片数据，但这些数据库缺乏有效和统一的归一化方法来消除不同数据集之间的批次效应，可能......阅读全文
研究开发表观组关联分析数据库
近日，由中国科学院北京基因组研究所国家基因组科学数据中心开发的人类表观组关联分析数据库EWAS Data Hub正式上线。该项研究成果以EWAS Data Hub： a resource of DNA methylation array data and metadata 为题在国际学术期刊《核
北京基因组所开发表观组关联分析数据库
近日，由中国科学院北京基因组研究所国家基因组科学数据中心开发的人类表观组关联分析数据库EWAS Data Hub正式上线。该项研究成果以EWAS Data Hub: a resource of DNA methylation array data and metadata 为题在国际学术期刊《核
基于低深度测序的关联分析方法
由于缺少非人类生物的单倍型参考panel，研究人员很难对这类生物进行全基因组关联分析（GWAS）。为了解决这个问题，牛津大学、威康信托人类遗传学中心和加州大学洛杉矶分校的研究人员开发了一种生物信息学方法，利用低覆盖度的全基因组测序数据填充基因型。该项研究近期发表在《Nature Genetics》上
芝麻大规模全基因组关联分析完成
由中国农科院油料所张秀荣研究员领衔的芝麻与特色油料遗传育种创新团队，与中科院国家基因研究中心等单位合作，在国际上率先完成了芝麻高密度单倍型图谱构建、主要农艺性状大规模全基因组关联分析。10月19日，国际知名期刊《自然·通讯》杂志在线发表了上述研究成果。 该研究得到973、国家自然科学基金、中国
人类不同祖先的全基因组关联分析
一项由埃克塞特大学领导的发表在《Nature Genetics》上的研究扩大了人类不同祖先的全基因组关联分析，并最终受益于全球患者护理。到目前为止，近87%的这种类型的基因组研究是在欧洲人身上进行的。 Lundquist研究所翻译基因组学和人口科学研究所研究员和所长，加州大学洛杉矶分校Geff
华大基因完成肠道微生物基因组关联分析
从物种、功能及生态群落上展示肠道微生物与结直肠腺瘤及结直肠癌的关联特征，这是深圳华大基因研究院、奥地利因斯布鲁克医科大学、奥本多夫医院、丹麦哥本哈根大学、华南理工大学等多家单位最新的联合取得的科研进展。3月11日，国际学术期刊《自然通讯》杂志发表了这项研究成果。该研究对结直肠腺瘤、结直肠癌的早期
全球生物库荟萃分析推动全基因组关联研究
历史上，人类基因的相关发现主要源自欧洲血统的人身上，如何将这些发现很好地转移到其他非欧洲人身上，仍然是一个悬而未决的问题。 目前，一个由来自四大洲的23个生物资料库组成的合作项目，正在揭示这种多样性的缺乏所造成的差距，如遗漏的致病突变等。该项目拥有超过200万志愿者的基因组数据。 近日，发表
“拉曼组内关联分析”揭示代谢物转化网络
细胞内代谢物之间是否正在发生相互转化，是细胞代谢活动最重要的动态特征之一，但其检测方法繁琐。为此，中国科学院青岛生物能源与过程研究所单细胞中心提出名为“拉曼组内关联分析”（Intra-Ramanome Correlation Analysis； IRCA）的理论框架与算法，并示范了细胞工厂功能测
细胞化学词汇关联tRNA
中文名称：关联tRNA英文名称：cognate tRNA定 义：由同一特异氨酰tRNA合成酶识别的所有tRNA。应用学科：遗传学（一级学科），分子遗传学（二级学科）
关联tRNA的结构特点
中文名称关联tRNA英文名称cognate tRNA定 义由同一特异氨酰tRNA合成酶识别的所有tRNA。应用学科遗传学（一级学科），分子遗传学（二级学科）
期刊数据库更新
图片来源：B. DOUTHITT/SCIENCE 期刊影响因子多年来备受批评，认为其扭曲了学术出版。近日，美国宾夕法尼亚州克拉尼特分析公司推出了其期刊引用报告（JCR）数据库的更新版本，并表示它提供了理解期刊特征和受众的背景信息。 影响因子代表期刊文章的引用次数，除以其两年间发表
期刊数据库更新
图片来源：B. DOUTHITT/SCIENCE 期刊影响因子多年来备受批评，认为其扭曲了学术出版。近日，美国宾夕法尼亚州克拉尼特分析公司推出了其期刊引用报告（JCR）数据库的更新版本，并表示它提供了理解期刊特征和受众的背景信息。 影响因子代表期刊文章的引用次数，除以其两年间发表的文章数量，
乳腺癌全转录组关联分析发现新的风险基因
美国范德堡大学和澳大利亚昆士兰医学研究所（QIMR Berghofer）领导的研究团队利用全转录组关联分析方法，找到与乳腺癌存在明显关联的48个基因。这项成果于6月18日发表在《Nature Genetics》上。 研究人员利用近12.3万名乳腺癌患者和近10.6万名对照的遗传预测基因表达谱
花叶芋叶片关联分析和叶绿体基因组研究获进展
广东省农业科学院环境园艺研究所特色花卉研究室在花叶芋叶片重要观赏性状关联分析和叶绿体基因组研究方面取得新进展。相关研究分别发表于Physiologia Plantarum和Genes。 花叶芋（Caladium）是天南星科花叶芋属多年生草本植物，被誉为“观叶皇后”。花叶芋资源丰富，表型性状变异丰
新冠肺炎疫情对畜牧业影响关联度分析
新冠肺炎疫情对畜牧业影响关联度分析。李胜利供图 新冠肺炎疫情之下，奶业受到哪些影响？如何平稳恢复和快速发展？未来走势如何？面临诸多挑战，在养殖、加工、消费等奶业全产业链上共同应对不确定性，成了目前整个行业的共同关切。 近日，中荷奶业发展中心发起举办了“乳事说|危机之下，奶业机会在哪”线上直播论坛
口腔、肠道微生物菌群元基因组关联分析
2015年7月28日，北京协和医院和华大基因等机构的研究人员共同合作完成了类风湿关节炎（RA）口腔和肠道微生物元基因组研究。本项研究揭示口腔和肠道微生物菌群异常是RA病理生理和疾控的重要环节，并且为元基因组学辅助的RA个性化诊疗方案提供基础。研究成果于今日发表在《自然医学》杂志。 RA是一种致
怎样用david数据库进行基因功能分析
Pathway功能分析及显著性判断对差异表达基因进行Pathway功能分析，并计算Pvalue进行显著性判断，Pvalue越小，表明该pathway变化越显著，并可对每条Pathway通路图进行展示，同时在相应的位置标注差异表达基因。2. Pathway中基因相关性分析根据每两个基因共出现在同一pa
大数据分析表明昆虫多样性与碳排放密切关联
目前人为的全球变暖与毁林事件导致森林昆虫多样性不断下降，历史上有没有发生过类似的事情呢？中国科学院南京地质古生物研究所科学家通过建立全球甲虫化石形态数据库，深入研究了二叠纪末大灭绝前后森林变化与甲虫演化的关系，为我们提供了新的见解。研究成果发表于最新一期英国综合性学术期刊eLife上。 昆虫作
关联tRNA的基本信息
中文名称关联tRNA英文名称cognate tRNA定 义由同一特异氨酰tRNA合成酶识别的所有tRNA。应用学科遗传学（一级学科），分子遗传学（二级学科）
抑郁或关联体内炎症
英国一项最新研究显示，抑郁症患者体内与炎症相关的C反应蛋白水平普遍高于普通人，意味着抑郁或关联体内炎症水平。这或许可以为更有针对性地治疗抑郁症提供新思路。 英国伦敦大学国王学院研究人员从英国生物医学库中提取近8.6万人的血样、基因数据和身心健康问卷，其中，将近31%的人患重度抑郁症。研究人员
GenBank数据库概述（三）
结构： 1、 结构主页 — 关于NCBI结构小组的一般信息和他们的研究计划，另外也可以访问分子模型数据库（MMDB）和用来搜索和显示结构的相关工具。 2、 MMDB：分子模型数据库 — 一个关于三维生物分子结构的数据库，结构来自于X-ray晶体衍射和NMR色谱分析。MMDB是来源于Brook
GenBank数据库概述（二）
FTP GenBank and Daily Updates：1. GenBank普通文件格式 — 参见GenBank记录样本和在GenBank公布通知中的详细描述，下载大多数最近的完全公告和日常积累或非积累更新数据。 2. ASN.1格式 — 摘要句法记号1，国际标准组织（ISO）数据表示格式，下载
核酸数据库的概念
中文名称核酸数据库英文名称nucleic acid data bank定 义DNA、RNA序列的资料库，主要包括已知序列名称、DNA或RNA全序列及其特性，如启动区、起始和终止密码的位置、编码区、限制酶切位点以及推导的翻译产物蛋白质序列等。应用学科生物化学与分子生物学（一级学科），方法与技术（二级
GenBank数据库概述（四）
NCBI站点地图---其他基因组数据介绍：1、 小鼠基因组 1) 小鼠基因组资源向导 ：把从各个中心来的各种小鼠相关的资源整合在一起，包括序列，图谱，和克隆信息以及指向小鼠种系和突变资源的指针。 2) 小鼠基因组测序：小鼠基因组计划的测序进展，HTG序列contigs（可以用大小和染色体号来浏览）由
GenBank数据库概述（一）
1. GenBank属于一个序列数据库的国际合作组织，包括EMBL和DDBJ。是NIH遗传序列数据库，一个所有可以公开获得的DNA序列的注释过的收集。GenBank同日本和欧洲分子生物学实验室的DNA数据库共同构成了国际核酸序列数据库合作。唯一人类基因序列集合（UniGene），人类基因组基因图
新方法可实现多环境数据的全基因组关联分析
全基因组关联分析是在自然群体中将标记基因型与复杂性状表型关联以挖掘复杂性状基因的方法，在动物、植物、林木和人类遗传中广泛应用。近日，华中农业大学植物科学技术学院教授章元明团队在植物学领域期刊额《分子植物》（Molecular Plant）上发表了研究论文，报道了全基因组关联分析方法学研究的突破性
多组学关联分析鉴定耐多药结核病血清标志物
肺结核（TB）的流行，特别是耐多药结核病（MDR-TB），已成为今天结核病治疗的一个重大挑战。浙江大学细胞生物学研究所李继承教授领衔的课题组采用iTRAQ标记结合2D LC-MS/MS，以及Solexa测序对MDR-TB患者，药物敏感结核病（DS-TB）患者，和健康对照组血清中的蛋白质组和miR
谷子单倍体型图谱及全基因组关联分析研究出炉
由中国农科院作物所、中科院上海生科院植生生态所国家基因中心、中科院遗传发育所等8家单位合作，在国际上率先完成了谷子单倍体型图谱的构建和大量农艺性状的全基因组关联分析，该成果于6月24日在Nature Genetics(自然-遗传学)发表，标志着我国在谷子遗传学研究领域取得了重要的突破。
微生物领域数据库及其分析系统建设研究取得进展
中国科学院计算机网络信息中心大数据技术与应用发展部与中科院微生物研究所等，在微生物领域数据库及其分析系统建设方面取得新进展，提出了一种利用语义网技术构建知识图谱的方法，可将冠状病毒相关的毒株、基因组、蛋白序列、蛋白结构、抗体、文献和ZL等多源异构数据映射至资源描述框架（RDF），并构建了基于语义网框
门上希和夫：深耕环境物质分析－AIQS数据库应用更广泛
分析测试百科网讯 2017年3月31日，由中国环境科学学会环境化学分会主办、中国科学院生态环境研究中心和岛津企业管理（中国）有限公司共同协办的“全国环境行业专家高峰论坛”在杭州城中香格里拉大酒店召开。在本次会议上，北九州市立大学/环境技术研究所的门上希和夫教授带来《日本环境中化学物质的分析方法》