Antpedia LOGO WIKI资讯

研究开发表观组关联分析数据库

近日,由中国科学院北京基因组研究所国家基因组科学数据中心开发的人类表观组关联分析数据库EWAS Data Hub正式上线。该项研究成果以EWAS Data Hub: a resource of DNA methylation array data and metadata 为题在国际学术期刊《核酸研究》(Nucleic Acids Research)在线发表。 近年来,表观组关联分析(Epigenome-wide Association Study,EWAS)已成为探索复杂性状表观遗传基础的有效策略。随着大量EWAS科研成果的发表,现已积累了海量表观遗传数据,尤其是DNA甲基化芯片数据,其海量数据的整合分析对系统研究不同实验条件下的DNA甲基化状态以及探索与各种性状相关的表观遗传机制具有重要意义。目前,国际上存在一些数据库来存储DNA甲基化芯片数据,但这些数据库缺乏有效和统一的归一化方法来消除不同数据集之间的批次效应,可能......阅读全文

研究开发表观组关联分析数据库

  近日,由中国科学院北京基因组研究所国家基因组科学数据中心开发的人类表观组关联分析数据库EWAS Data Hub正式上线。该项研究成果以EWAS Data Hub: a resource of DNA methylation array data and metadata 为题在国际学术期刊《

北京基因组所开发表观组关联分析数据库

  近日,由中国科学院北京基因组研究所国家基因组科学数据中心开发的人类表观组关联分析数据库EWAS Data Hub正式上线。该项研究成果以EWAS Data Hub: a resource of DNA methylation array data and metadata 为题在国际学术期刊《核

基于低深度测序的关联分析方法

由于缺少非人类生物的单倍型参考panel,研究人员很难对这类生物进行全基因组关联分析(GWAS)。为了解决这个问题,牛津大学、威康信托人类遗传学中心和加州大学洛杉矶分校的研究人员开发了一种生物信息学方法,利用低覆盖度的全基因组测序数据填充基因型。该项研究近期发表在《Nature Genetics》上

人类不同祖先的全基因组关联分析

  一项由埃克塞特大学领导的发表在《Nature Genetics》上的研究扩大了人类不同祖先的全基因组关联分析,并最终受益于全球患者护理。到目前为止,近87%的这种类型的基因组研究是在欧洲人身上进行的。  Lundquist研究所翻译基因组学和人口科学研究所研究员和所长,加州大学洛杉矶分校Geff

芝麻大规模全基因组关联分析完成

  由中国农科院油料所张秀荣研究员领衔的芝麻与特色油料遗传育种创新团队,与中科院国家基因研究中心等单位合作,在国际上率先完成了芝麻高密度单倍型图谱构建、主要农艺性状大规模全基因组关联分析。10月19日,国际知名期刊《自然·通讯》杂志在线发表了上述研究成果。  该研究得到973、国家自然科学基金、中国

华大基因完成肠道微生物基因组关联分析

  从物种、功能及生态群落上展示肠道微生物与结直肠腺瘤及结直肠癌的关联特征,这是深圳华大基因研究院、奥地利因斯布鲁克医科大学、奥本多夫医院、丹麦哥本哈根大学、华南理工大学等多家单位最新的联合取得的科研进展。3月11日,国际学术期刊《自然通讯》杂志发表了这项研究成果。该研究对结直肠腺瘤、结直肠癌的早期

全球生物库荟萃分析推动全基因组关联研究

历史上,人类基因的相关发现主要源自欧洲血统的人身上,如何将这些发现很好地转移到其他非欧洲人身上,仍然是一个悬而未决的问题。 目前,一个由来自四大洲的23个生物资料库组成的合作项目,正在揭示这种多样性的缺乏所造成的差距,如遗漏的致病突变等。该项目拥有超过200万志愿者的基因组数据。 近日,发表

“拉曼组内关联分析”揭示代谢物转化网络

  细胞内代谢物之间是否正在发生相互转化,是细胞代谢活动最重要的动态特征之一,但其检测方法繁琐。为此,中国科学院青岛生物能源与过程研究所单细胞中心提出名为“拉曼组内关联分析”(Intra-Ramanome Correlation Analysis; IRCA)的理论框架与算法,并示范了细胞工厂功能测

期刊数据库更新

图片来源:B. DOUTHITT/SCIENCE 期刊影响因子多年来备受批评,认为其扭曲了学术出版。近日,美国宾夕法尼亚州克拉尼特分析公司推出了其期刊引用报告(JCR)数据库的更新版本,并表示它提供了理解期刊特征和受众的背景信息。 影响因子代表期刊文章的引用次数,除以其两

期刊数据库更新

图片来源:B. DOUTHITT/SCIENCE 期刊影响因子多年来备受批评,认为其扭曲了学术出版。近日,美国宾夕法尼亚州克拉尼特分析公司推出了其期刊引用报告(JCR)数据库的更新版本,并表示它提供了理解期刊特征和受众的背景信息。 影响因子代表期刊文章的引用次数,除