全球最大癌症基因数据库发布

美国国家癌症研究所(NCI)科学家发布了有史以来规模最大的癌症相关基因变异数据库,为研究者们提供了迄今为止最全面的方式,搞清楚如何将治疗药物靶向疾病。 周一NCI在一份声明中称,基于基因组学研究的新数据库,将对全球开放获取,预计将有助于研究人员加快新药的开发,同时能够更好地将患者与疗法进行匹配。 当前所使用的大多数抗癌药物,都是基于其实证作用(empirical activity)。其中的大多数药物,我们知道存在作用靶标,但这些药物并没有与任何基因组学联系起来。 大多数的癌症治疗涉及很多的猜测工作,因为医生也没有办法确定某一特定患者是否有可能对当前许多常用药物或化疗有响应,抑或其癌症是否会对所用药物产生抗性。 为了创建数据库,NCI研究团队对60株人类癌细胞系进行了测序,得到了一张针对身体不同部位癌症特异性基因突变的详尽列表。 该项研究的成果已发表于美国癌症研究协会期刊《......阅读全文

BRCA基因突变信息-美国国家癌症研究所启动BRCA数据库

  日前,美国国家癌症研究所(NCI)宣布启动BRCA Exchange。这是一个汇集了全球成千上万个遗传性BRCA1和BRCA2基因变异信息的数据库。大众可以通过一个网站和一款智能手机app来获取数据库中的信息。这一数据资源让临床医生们可以参考专家们对不同BRCA基因变异与癌症关系的评估,从而对解

Nature:癌症数据库ClinVar打破Myriad垄断

        去年,美国最高法院判定Myriad Genetics持有的BRCA1和BRCA2 DNA序列测试ZL无效,美国最高法院判定也意味着未来美国国内的癌症检查价格将变得更加便宜、普遍。  BRCA1基因的发现和致病相关性是Mary-Claire King博士在1990年发现,尽管当时她的研

全球最大癌症基因数据库发布

  美国国家癌症研究所(NCI)科学家发布了有史以来规模最大的癌症相关基因变异数据库,为研究者们提供了迄今为止最全面的方式,搞清楚如何将治疗药物靶向疾病。   周一NCI在一份声明中称,基于基因组学研究的新数据库,将对全球开放获取,预计将有助于研究人员加快新药的开发,同时能够更

Nucleic-Acid-Res:大数据库助力癌症药物的开发

  近日,来自英国癌症研究所的研究人员通过研究表示,通过加入错误蛋白的3D结构,以及绘制癌症交流的图谱,就会为世界上最大的癌症药物数据库带来革命性的突破;最近更新的canSAR数据库或将为英国及全球的科学家们提供机会来设计出更加高效的癌症疗法,相关研究刊登于国际杂志Nucleic Acid Rese

Nat-Commun:癌症——基因突变的起源

  DNA的复制是细胞分裂的前提。但是,在存在某些破坏性成分的情况下,细胞将无法很好地执行相关操作,复制过程将变得更加缓慢且效率较低,这种现象称为“复制压力”。虽然已知“复制压力”与遗传突变的增加有关,但至今仍不清楚起作用的确切机制。  最近,日内瓦大学(UNIGE)的研究人员阐明了在“复制压力”下

《科学》重点文章:癌症与基因突变

生物通报道:来自霍德华休斯医学院,Ludwig癌症遗传与治疗中心(the Ludwig Center for Cancer Genetics and Therapeutics)以及约翰霍普金斯凯门综合癌症中心(Johns Hopkins Kimmel Comprehensive Cancer Cen

基因突变检测指导癌症靶向治疗

  肺癌和结直肠癌近年来已成为大多数国家癌症死亡的主要原因。由于个体遗传基因存在差异性,不同类型的癌症患者选择适合的靶向治疗药物或能取得预期的疗效,基因突变检测为医生提供了重要参考信息。中国国家食品药品监督管理局日前批准由瑞士罗氏诊断研发的cobas EGFR/KRAS基因突变检测技术用于临床基因突

NCCN增加女性癌症新基因突变检测

据医脉通报道,第21届美国国家综合癌症网络(National Comprehensive Cancer Network,NCCN)年会近日在好莱坞召开,会议增加了几个针对乳腺癌和卵巢癌遗传风险管理的新基因突变检测。 最近的研究发现PALB2基因突变与乳腺癌侵袭性相关,而RAD51C、RAD

基因突变让端粒失控 促发癌症

  近日,来自威斯达研究所的研究人员揭示了保护端粒(我们染色体末端结构)的部分蛋白复合物的结构,相关研究成果发表在 Nature Communications 上,该研究解释了与这个蛋白复合物相关的一组基因突变如何促进一系列癌症。  端粒是染色体末端的保护性结构,对人体基因组的复制和保护至关重要。端

如何利用TCGA数据库进行深度癌症研究及发大牛文章?

  玩转数据库,助你发牛文!   癌症研究究竟有多难?让我们来捋一下基本思路:首先,要有一定数量的高质量肿瘤临床样本;其次……等一下,是不是在“首先”这一步就卡住了?癌症研究中的高质量的肿瘤样本不但要有切除适当的肿瘤瘤体和癌旁组织,还需要每个病人的各项病理指征、家族病史、治疗手段、疗效以及对病人不

如何利用TCGA数据库进行深度癌症研究及发大牛文章?

玩转数据库,助你发牛文!癌症研究究竟有多难?让我们来捋一下基本思路:首先,要有一定数量的高质量肿瘤临床样本;其次……等一下,是不是在“首先”这一步就卡住了?癌症研究中的高质量的肿瘤样本不但要有切除适当的肿瘤瘤体和癌旁组织,还需要每个病人的各项病理指征、家族病史、治疗手段、疗效以及对病人不间断的随访信

超过8%的儿童癌症患者携带癌症易感基因突变研究概要

 《 New England Journal of Medicine》期刊公布的一项研究显示,超过8%的儿童癌症患者携带癌症易感基因突变。    研究者对1120例儿童癌症患者的肿瘤样本和正常组织进行了DNA测序,发现8.5%的患者的正常组织携带生殖细胞系致病或可能致病突变,这些突变会导致癌症风

这种基因突变导致1/4的人罹患癌症,并且还助力癌症生长

  癌症的发生与原癌基因的突变有关。研究表明,原癌基因例如Ras基因发生突变,会导致25%的人类癌症的发生。  近日弗兰西斯克里克研究所的Matthew Coelho博士做了相关实验后发现,Ras基因发生突变还可以抑制免疫系统的抗癌反应。相关研究成果以题为《Oncogenic RAS Signali

《科学》:多数癌症基因突变或因“坏运气”

  美国约翰斯·霍普金斯大学研究人员曾在两年前发表论文说,多数癌症发病要怪“坏运气”,遗传和环境因素影响相对较小。这一结论在科学界引起巨大争议。如今,该校研究人员经进一步分析再次报告说,多数癌症发病确实是因为运气不好。  干细胞分裂时  出现错误  这项于23日发表在美国《科学》杂志上的新研究称,近

新算法比较分析可搜索癌症基因突变

  桑福德伯翰医学研究所(Sanford Burnham Prebys Medical Discovery Institute,SBP)承担了前所未有的对一个新兴算法类别的比较分析,该算法通过聚焦内部基因结构,在癌症数据库中挖掘遗传信息(即亚基因像素算法),这与专注于基因视其为单个单元的经典方法形成

Nature--NEJM:癌症种类由基因突变模式决定

纪念斯隆-凯特琳癌症中心的道格拉斯·莱文博士是子宫内膜癌研究的研究负责人。   科学家发现,最危险的子宫内膜癌,与最糟糕的卵巢癌和乳腺癌相当类似,这提供了迄今为止最有力的证据,显示出癌症越来越被视为一种主要是由其基因图谱定义的疾病,而不是由其发病器官。   周三,《自然》杂志(Nature)上发

-利用肿瘤细胞的基因突变制备癌症疫苗

  个性化疫苗为治疗多对基因突变引发的癌症提供新的选择。  在一个小型临床试验中,利用在肿瘤细胞中的突变蛋白所制备的疫苗成功地引发了机体对癌细胞的免疫应答反应。  该结果是目前致力于研发个性化癌症治疗所得出的最新成果,并公布于4月2日的科学(Science)杂志中。在此次试验中,三位恶性黑色素瘤患者

北京基因组所发布癌症单细胞表达图谱数据库CancerSCEM

近日,中国科学院北京基因组研究所(国家生物信息中心)国家基因组科学数据中心开发的癌症单细胞表达图谱数据库CancerSCEM上线。该研究成果以CancerSCEM: a database of single-cell expression map across various human cance

北京基因组所发布癌症单细胞表达图谱数据库CancerSCEM

  近日,中国科学院北京基因组研究所(国家生物信息中心)国家基因组科学数据中心开发的癌症单细胞表达图谱数据库CancerSCEM上线。该研究成果以CancerSCEM: a database of single-cell expression map across various human can

300多种肿瘤-晚期癌症患者测序突变数据库发表的启示

  5月8日,Nature Medicine杂志发表一篇重量级文章,纪念斯隆-凯特琳癌症研究中心(MSKCC) 的科学家采用MSK-IMPACT方法,开展了一个大规模、前瞻性的临床测序研究。他们对上万名晚期癌症患者,接近300多种肿瘤进行了基因测序,同时收集了这些肿瘤病人的临床注释、病理等方面的信息

癌症相关的基因突变类型及临床解释AFDN

该基因编码一个多域蛋白,参与胚胎发育过程中细胞连接的信号和组织该基因与t(6;11)(q27;q23)易位的急性髓系白血病(americ myeloid leukemia,all-1)基因融合。另外,编码不同亚型的剪接转录变体已经被描述用于该基因,然而,并不是所有的都已经被完全描述出来了。

癌症相关的基因突变类型及临床解释-APLNR

该基因编码G蛋白偶联受体基因家族的一个成员编码蛋白与血管紧张素受体有关,但实际上是一种抑制腺苷酸环化酶活性的apelin受体,通过发挥高血压作用,对血管紧张素ii的压力作用起反调节作用。它在心血管和中枢神经系统、葡萄糖代谢、胚胎和肿瘤血管生成以及作为人类免疫缺陷病毒(HIV-1)受体发挥作用由选择性

癌症相关的基因突变类型及临床解释ASMTL

该基因编码的蛋白有一个N-末端,与枯草芽孢杆菌的多拷贝相关丝状(maf)蛋白和大肠杆菌的orfE相似,而C-末端与N-乙酰5-羟色胺O-甲基转移酶相似该基因位于X染色体和Y染色体的假常染色体区1(PAR1)。已经发现了三个编码不同亚型的转录变体。

癌症相关的基因突变类型及临床解释​ZAn

该基因编码一种蛋白质,在精子粘附卵透明带的物种特异性中发挥作用。编码蛋白位于顶体,可能参与信号传递或配子识别。该基因的等位基因多态性导致功能性和框移等位基因;参考基因组代表功能性等位基因。该基因的选择性剪接导致多个转录变体。

癌症相关的基因突变类型及临床解释​YWHSZ

该基因产物属于14-3-3蛋白家族,通过与含磷酸丝氨酸的蛋白质结合介导信号转导。这种高度保守的蛋白质家族在植物和哺乳动物中都有发现,这种蛋白质与小鼠、大鼠和绵羊的同源基因99%相同编码蛋白与IRS1蛋白相互作用,提示其在调节胰岛素敏感性中起作用在5’UTR中有几个不同但编码相同蛋白质的转录变体已经被

癌症相关的基因突变类型及临床解释BMX

该基因编码一个属于Tec激酶家族的非受体酪氨酸激酶该蛋白包含一个PH样结构域,通过结合磷脂酰肌醇3,4,5-三磷酸(PIP3)介导膜靶向性,以及一个结合酪氨酸磷酸化蛋白和信号转导功能的SH2结构域该蛋白参与多种信号转导途径,包括stat途径,并调节多种癌细胞的分化和致瘤性。另外,已经发现该基因的剪接

癌症相关的基因突变类型及临床解释AMOT

该基因属于血管抑制素结合蛋白的motin家族,具有保守的螺旋结构域和C末端PDZ结合基序编码蛋白主要在毛细血管内皮细胞和胎盘大血管中表达,可能介导血管抑制素对血管形成的抑制作用,以及在新生血管形成过程中内皮细胞向生长因子的迁移。选择性剪接导致编码不同亚型的多个转录变体。

癌症相关的基因突变类型及临床解释AHNAK

该基因编码的蛋白是一个大的(700kda)结构支架蛋白,由一个具有128个a a重复序列的中心结构域组成。编码蛋白可能在血脑屏障形成、细胞结构和迁移、心肌钙通道调节、肿瘤转移等多种过程中发挥作用。编码该基因的17 kDa亚型存在更短的变体,更短的异构体启动调节该基因的选择性剪接的反馈环。

癌症相关的基因突变类型及临床解释AIP

这个基因编码的蛋白质是芳香烃的受体和配体激活的转录因子。编码的蛋白质作为多蛋白复合物的一部分存在于细胞质中,但在配体结合后被转运到细胞核。这种蛋白质可以调节许多外源代谢酶的表达。此外,编码的蛋白可以特异性地结合并抑制乙型肝炎病毒的活性。已经发现了三个编码不同亚型的转录变体。

癌症相关的基因突变类型及临床解释BPTF

该基因通过其编码蛋白与针对阿尔茨海默病患者脑匀浆制备的单克隆抗体的反应性进行鉴定。对原蛋白(胎儿alz-50活性克隆1,fac1)的分析表明,该蛋白可能参与转录调控,是一种含有dna结合区和锌指基序的810a a蛋白。胎儿脑和神经退行性疾病患者中检测到高水平的FAC1这个基因编码的蛋白质实际上比最初