余路阳教授Nature子刊解析SUMO化修饰对动脉硬化的影响

来自浙江大学生科院的研究人员发表了题为“The critical role of SENP1-mediated GATA2 deSUMOylation in promoting endothelial activation in graft arteriosclerosis”的文章,发现了血管内皮中蛋白酶SENP1介导的蛋白翻译后SUMO化修饰,能通过调控转录因子GATA2在移植动脉硬化发生发展中的重要作用。 这一研究成果公布在6月1日的Nature Communications杂志上。文章的通讯作者是浙江大学生命科学学院余路阳教授,第一作者为余路阳课题组博士后裘聪博士。 器官移植后的慢性排斥反应能引起移植物动脉病变,最终导致移植失败。移植动脉硬化(Graft Arteriosclerosis, GA)是导致移植后血管病变的主要原因,其发生源于内皮粘附分子诱导表达为标志的血管内皮激活,继而导致移植物血管中新生内膜的生成、......阅读全文

【干货分享】四大类糖基化修饰

  相对于磷酸化、乙酰化修饰等相对较为简单的PTM来讲,糖基化修饰稍显复杂和多样,各位看官对糖基化修饰的知识了解多少呢?是否又对O糖、N糖傻傻分不清楚呢?没关系,今天小编带您一起走进糖的世界,一起揭开糖基化修饰的神秘面纱。  糖基化修饰主要发生在内质网和高尔基体。主要过程是将糖基在糖基转移酶作用下将

Nature:SUMOylation水平与细菌感染

 在感染过程中,食源性病原体“单核细胞增生李斯特菌”能利用宿主细胞的大量功能,包括涉及泛素化和磷酸化的、专门修饰关键蛋白活性的转录后修饰。致病细菌对被称为“SUMOylation”的泛素样修饰(真核细胞中一个重要过程)()的效应在很大程度上仍不清楚。现在,对被“单核细胞增生李斯特菌”感染的人类细胞和

最新进展:RNA的甲基化与去甲基化修饰

  德国慕尼黑的路德维希-马克西米利安大学(LMU)研究人员发现了细菌RNA中一种新型的化学修饰形式。显然,只有当细胞处于应激状态时,这种修饰才会附着在分子上,并且在恢复过程中会迅速去除。  核糖核酸(RNA)在化学形式上与DNA密切相关,而DNA是所有细胞中遗传信息的载体。实际上,RNA本身在将遗

蛋白质修饰与肿瘤研究

  蛋白质的修饰这一领域已成为全球生物医学界关注的焦点。除了一些传统的磷酸化和泛素化,硝基化、乙酰化、SUMO化引发关注外,还有一些修饰策略,如PEG化修饰、脂质体化、糖基化,这些复杂的调控作用在众多慢性疾病(退行性疾病、代谢性疾病、肿瘤、心血管、内分泌等)以及一些炎症等中都起到关键调控作用。通过对

2019年云序RNA甲基化修饰领域文章汇总

  感恩有你,一路同行!2019年末,云序生物携全体员工对一直以来关心和支持公司发展的广大新老客户致以最诚挚的问候!光阴如梭,一年转瞬又将成为历史,新的一年意味着新的起点、新的机遇、新的挑战,决心再接再厉,更上一层楼。回首即将过去的2019,云序生物不断创新,硕果累累;展望2020,任重道远却信心倍

表观新修饰6mA甲基化助力IF飙升(二)

3、数据分析标准分析:(1)DNA甲基化富集峰的识别通过高通量测序和生物信息分析,识别甲基化富集的基因组区域,默认p

Cell:不同生物的N糖基化修饰途径

  蛋白质翻译后修饰是指蛋白质在翻译后的化学修饰,它包含磷酸化、乙酰化、泛素化和甲基化等类型, 在调节蛋白质活性、结构和功能等方面发挥着重要的作用, 其重要性已被人们广泛认知。  随着许多新的翻译后修饰类型的出现, 蛋白质翻译后修饰这一研究领域变得越来越复杂而有趣。其中糖类的翻译后修饰能帮助蛋白定位

表观新修饰6mA甲基化助力IF飙升(一)

DNA甲基化修饰是表观遗传研究的热点之一,我们通常认为DNA甲基化就是胞嘧啶甲基化(5-methylcytosine, 5mC),却不知道随着测序技术的快速发展,科研者们已经在真核生物中(果蝇 、真菌、莱茵衣藻、秀丽隐杆线虫等)发现了一种新的DNA甲基化修饰—DNA-6mA甲基化,且DNA-

DNA甲基化——表现遗传学中DNA的修饰

DNA甲基化是哺乳动物DNA最常见的复制后调节方式之一,是正常发育、分化所必需的,具有重要的生物学意义。在DNA甲基转移酶 (DNAmethyltransferase,DNMT)的作用下,以S—腺苷甲硫氨酸(SAM)为甲基供体,可以将甲基基团转移到基因组DNA胞嘧啶第 5位碳原子(C5)

亚硫酸氢盐修饰后测序法检测甲基化——DNA甲基化

亚硫酸氢盐修饰后测序法主要可用来检测甲基化。基化实验方法原理重亚硫酸盐使DNA中未发生甲基化的胞嘧啶脱氨基转变成尿嘧啶,而甲基化的胞嘧啶保持不变,用PCR扩增(引物设计时尽量避免有CpG,以免受甲基化因素的影响)所需片段,则尿嘧啶全部转化成胸腺嘧啶。最后对PCR产物进行测序,并且与未经处理的序列比较

动脉硬化早期检测

PWV(脉搏波传播速度)、ABI(踝臂血压指数)1、检查意义:通过PWV、ABI异常,诊断下肢动脉疾病,常提示可能存在全身动脉粥样硬化疾病。及时进一步检查、通过改变不良生活习惯及药物治疗等方式进行干预,避免将来重大心脑血管疾病的发生。2、适用人群:* 年满20周岁以上;* 已被诊断为高血压(包括临界

Cell子刊:控制脑细胞通讯的关键蛋白

  神经递质是神经元发送的一类化学物质,它能与其它神经元上的特异性受体发生相互作用,促使这些神经元改变其电反应。大脑中的神经元就是通过这样的方式进行交流通讯。日前,Bristol大学的科学家们发现了控制神经元通讯的关键性事件,这一研究发表在十一月二十七日的Cell Reports杂志上。   

亚硫酸氢盐修饰后测序法甲基化检测

第一部分 基因组DNA的提取这一步没有悬念,完全可以购买供细胞或组织使用的DNA提取试剂盒,如果实验室条件成熟,自己配试剂提取完全可以。DNA比较稳定,只要在操作中不要使用暴力,提出的基因组DNA应该是完整的。此步重点在于DNA的纯度,即减少或避免RNA、蛋白的污染很重要。因此在提取过程中需使用蛋白

亚硫酸氢盐修饰后测序法检测甲基化

实验材料 DNA试剂、试剂盒 NaOH苯二酚(氢醌)亚硫酸氢钠石蜡油仪器、耗材 离心管恒温水浴锅铝箔纸实验步骤 1.将约2ugDNA于1.5mlEP管中使用DDW稀释至50ul; 2.加5.5ul新鲜配制的3M NaOH;  3. 42℃水浴30min; 水浴期间配制: 4.10mM对苯二酚(氢醌)

亚硫酸氢盐修饰后测序法检测甲基化

实验方法原理重亚硫酸盐使DNA中未发生甲基化的胞嘧啶脱氨基转变成尿嘧啶,而甲基化的胞嘧啶保持不变,用PCR扩增(引物设计时尽量避免有CpG,以免受甲基化因素的影响)所需片段,则尿嘧啶全部转化成胸腺嘧啶。最后对PCR产物进行测序,并且与未经处理的序列比较,判断是否CpG位点的甲基化状态。实验材料DNA

亚硫酸氢盐修饰后测序法检测甲基化

DNA甲基化             实验方法原理 重亚硫酸盐使DNA中未发生甲基化的胞嘧啶脱氨基转变成尿嘧啶,而甲基化的胞嘧啶保持不变,用PCR扩增(引物设计时尽量避免有CpG,以

小小甲基化修饰让小菜蛾“百毒不侵”

  小菜蛾作为一种世界性为害的重大农业害虫,也是世界上第一个被报道在田间对Bt生物杀虫剂产生高抗性的农业害虫。  小菜蛾能在不影响其自身生长发育的前提下对Bt杀虫剂进化出完美的高抗性。  近日,中国农业科学院蔬菜花卉研究所(以下简称蔬菜所)研究员张友军团队解析了小菜蛾Bt抗性的适合度代价补偿机制,首

看表观新修饰6mA甲基化如何助力IF飙升!

  DNA甲基化修饰是表观遗传研究的热点之一,我们通常认为DNA甲基化就是胞嘧啶甲基化(5-methylcytosine, 5mC),却不知道随着测序技术的快速发展,科研者们已经在真核生物中(果蝇 、真菌、莱茵衣藻、秀丽隐杆线虫等)发现了一种新的DNA甲基化修饰—DNA-6mA甲基化,且DNA-6m

RNA-m6A甲基化修饰研究相关研究的应用

如果新冠病毒SARS-CoV-2的大流行对我们有任何启发的话,那么要数对RNA修饰的研究了,此时研究病毒RNA以及其甲基化修饰等功能,显得比以往任何时候都更加重要。 而这是否意味着要研究病毒RNA本身不同的各种突变体或者表观遗传变化如何使这些病毒更灵活和感染力?还是研究从细胞和组织中收集的R

RANBP2基因编码的功能和结构描述

ran是ras超家族的一种小的gtp结合蛋白,与核膜相关,被认为通过与其他蛋白的相互作用来控制多种细胞功能。这个基因编码一个非常大的ran结合蛋白,免疫定位到核孔复合体。该蛋白是一个巨大的支架和嵌合体亲环素相关的核孔蛋白参与了ran-gtpase循环。编码蛋白直接与E2酶UBC9相互作用,并强烈促进

SUMO1-基因可挽救血管系统破损的心脏

  据在猪体内进行的一项新的研究报告,直接输送至心脏的基因疗法可扭转心力衰竭。心力衰竭是在一个人的心脏过于虚弱而无法恰当地泵血及让血液循环时发生的,它是老年人住院的一个主要原因。最近的临床试验显示,替换 SERCA2a——这是一个调节心脏钙泵的基因——可减轻心力衰竭。        Lisa

云序RNA修饰技术余义勋课题组植物m1A修饰调控机制的运用

  导读   RNA甲基化修饰在调控生物生长发育的过程中起重要作用,m6A和m5C在植物体内的产生机制和生物学功能已有较多研究论文发表,然而RNA m1A(N1-甲基腺嘌呤)修饰在植物中的研究还非常少。   近日,Plant Physiology 在线发表了华南农业大学余义勋课题组题为“The

与细胞周期信号通路相关因子介绍RANBP2

ran是ras超家族的一种小的gtp结合蛋白,与核膜相关,被认为通过与其他蛋白的相互作用来控制多种细胞功能。这个基因编码一个非常大的ran结合蛋白,免疫定位到核孔复合体。该蛋白是一个巨大的支架和嵌合体亲环素相关的核孔蛋白参与了ran-gtpase循环。编码蛋白直接与E2酶UBC9相互作用,并强烈促进

细胞周期信号通路相关RANBP2

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DNA损伤修复信号通路相关因子RANBP2

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RANBP2基因突变因子与药物介绍

ran是ras超家族的一种小的gtp结合蛋白,与核膜相关,被认为通过与其他蛋白的相互作用来控制多种细胞功能。这个基因编码一个非常大的ran结合蛋白,免疫定位到核孔复合体。该蛋白是一个巨大的支架和嵌合体亲环素相关的核孔蛋白参与了ran-gtpase循环。编码蛋白直接与E2酶UBC9相互作用,并强烈促进

与细胞代谢信号通路相关因子介绍RANBP2

ran是ras超家族的一种小的gtp结合蛋白,与核膜相关,被认为通过与其他蛋白的相互作用来控制多种细胞功能。这个基因编码一个非常大的ran结合蛋白,免疫定位到核孔复合体。该蛋白是一个巨大的支架和嵌合体亲环素相关的核孔蛋白参与了ran-gtpase循环。编码蛋白直接与E2酶UBC9相互作用,并强烈促进

细胞代谢信号通路相关的基因介绍RANBP2基因

ran是ras超家族的一种小的gtp结合蛋白,与核膜相关,被认为通过与其他蛋白的相互作用来控制多种细胞功能。这个基因编码一个非常大的ran结合蛋白,免疫定位到核孔复合体。该蛋白是一个巨大的支架和嵌合体亲环素相关的核孔蛋白参与了ran-gtpase循环。编码蛋白直接与E2酶UBC9相互作用,并强烈促进

RNA修饰技术在华南农大余义勋组植物m1A-调控机制的运用

  RNA甲基化修饰在调控生物生长发育的过程中起重要作用,m6A和m5C在植物体内的产生机制和生物学功能已有较多研究论文发表,然而RNA m1A(N1-甲基腺嘌呤)修饰在植物中的研究还非常少。   近日,Plant Physiology 在线发表了华南农业大学余义勋课题组题为“The N1-met

怎样治疗动脉硬化?

  1、扩张血管。  2、调节血脂  在合理膳食、适量运动的基础上,血脂仍高于正常时,可用调脂药。  3、抗血小板黏附和聚集  抗血小板粘附和聚集的药物可防止血栓形成,防止血管阻塞性疾病的发生和发展。  4、溶解血栓药和抗凝药  对动脉内血栓导致管腔狭窄或阻塞者,可用溶解血栓药、抗凝药,如尿激酶、重