支持还是反对？美国公司在华开启新生儿全基因组测序！
一家波士顿的DNA测序公司正在为中国新生儿提供全基因组测序，这引发了人们的争议：关于新生儿的遗传信息，父母到底应该了解多少？ Veritas Genetics解释说该测试将由医生开处方进行，将对新生儿950种严重幼年或者晚年疾病风险、200个与药物反应相关的基因以及超过100个身体特征的遗传学信息进行检测。 这项测试叫myBabyGenome，费用为1500美元，可以帮助找到新生儿基因组中隐藏的严重问题。 但是一些医生认为这个计划太超前了，“我认为兜售一些未被证实的数据是非常幼稚的做法，尤其是像婴儿这类脆弱的人群的信息。”Jim Evans说道，他是北卡罗来纳大学教堂山分校的一名遗传学教授。 问题在于许多致病基因带来的风险还不确定。就算小孩携带某个突变的致病基因，这也并不意味着小孩就一定会受影响，也正是这个问题引发了医生的疑问：将这些信息告知父母是否有用呢？ Veritas公司的测试还涉足了未知领域：它将通过检测......阅读全文
Science：新生儿测序遇冷，“基因组计划”行路难
新生儿测序是近年来比较热门的话题，中国新生儿基因组也于今年8月份正式起航，不过在此之前，美国已经开展了一项名为“BabySeq”的新生儿测序计划。10月19日，在加拿大温哥华召开的美国人类遗传学协会（ASHG）年会上，科学家们表示首个探讨利用新生儿基因测序来指导健康护理的研究项目——BabySe
计算/DNA测序仪
测序反应精确度计算公式：100%－差异碱基数(不包括n数)/650×100%差异碱基即测定的dna序列与已知标准dna序列比较不同的碱基，n为仪器不能辨读的碱基。
DNA测序仪定义
DNA序列测定分手工测序和自动测序，手工测序包括sanger双脱氧链终止法和maxam-gilbert化学降解法。自动化测序实际上已成为当今 dna序列分析的主流。美国pe abi公司已生产出373型、377型、310型、3700和3100型等dna测序仪，其中310型是临床检测实验室中使用最多
DNA测序的规律
生成互相独立的若干组带放射性标记的寡核苷酸，每组寡核苷酸都有固定的起点，但却随机终止于特定的一种或者多种残基上。 由于DNA上的每一个碱基出现在可变终止端的机会均等，因此上述每一组产物都是一些寡核苷酸混合物，这些寡核苷酸的长度由某一种特定碱基在原DNA全片段上的位置所决定。 在可以区分长度仅
DNA测序仪相关
分析或打印出彩色测序图谱 上机操作按仪器操作说明书安装毛细管，进行毛细管位置的校正，人工手动灌胶和建立运行的测序顺序文件。仪器将自动灌胶至毛细管，1.2kv预电泳5min，按编程次序自动进样，再预电泳(1.2kv，20min)，在7.5kv下电泳2h。电泳结束后仪器会自动清洗，灌胶，进下一样品
DNA测序仪原理
abi prism 310型基因分析仪(即dna测序仪)，采用毛细管电泳技术取代传统的聚丙烯酰胺平板电泳，应用该公司ZL的四色荧光染料标记的ddntp(标记终止物法)，因此通过单引物pcr测序反应，生成的pcr产物则是相差1个碱基的3''''末端为4种不同荧光染料的单
什么是DNA测序？
DNA测序（DNA sequencing，或译DNA定序）是指分析特定DNA片段的碱基序列，也就是腺嘌呤（A）、胸腺嘧啶（T）、胞嘧啶（C）与鸟嘌呤（G）的排列方式。快速的DNA测序方法的出现极大地推动了生物学和医学的研究和发现。在基础生物学研究中，和在众多的应用领域，如诊断，生物技术，法医生物学，
DNA测序用水介绍
DNA测序可以看作是三种技术或步骤的组合: 步骤1:通常通过基于PCR的技术生成DNA片段 步骤2:通过毛细管或常规琼脂糖凝胶电泳分离片段 步骤3:检测步骤,最常见的是荧光检测。 水质对每个步骤的影响将在单独的部分中介绍。 这里简要介绍了水质的影响。用于操作DNA测序仪的水质应符合某些
DNA测序技术综述
1977年，Sanger团队完成人类历史上第一个基因组序列噬菌体X174测序，并在3年后，成为“两度”获得诺贝尔化学奖的人（前一次是1958年）。Sanger测序技术诞生，让DNA片段的测序成为现实，此后这一技术独领风骚20多年。再后来的20年里，二代测序走向成熟、三代测序崭露头角，DNA测序技术以
DNA测序的原理
化学修饰法测序原理 化学试剂处理末段DNA片段，造成碱基的特异性切割，产生一组具有各种不同长度的DNA链的反应混合物，经凝胶电泳分离。化学切割反应：包括碱基的修饰，修饰的碱基从其糖环上转移出去在失去碱基的糖环处DNA断裂。 Sanger法测序的原理 就是利用一种DNA聚合酶来延伸结合在待定
纳米孔测序技术有望颠覆DNA测序市场？
Scott Tighe（左）等研究人员利用MinION设备在南极泰勒谷测序微生物DNA。 “我们能从手机上的残留物预言谁刚吃了一个橘子或者谁吃了猪肉。”美国纽约威尔康奈尔医学院计算生物学家Mason表示。你们相信吗？Christopher Mason有一个喜欢在会议上展示的技巧。通过从志愿者手机
DNA测序电泳前测序PCR产物的处理
1. 加入12 μl的TSR于离心管中，剧烈振荡，让其充分溶解DNA沉淀，稍离心。 2. 将溶液转移至盖体分离的0.2 ml PCR管中，稍离心。 3. 在PCR仪上进行热变性(95℃ 2 min)，冰中骤冷，待上机。
－新生儿测序：开启基因测序市场的新蓝海！
一个致力于改善生活和助力个性化治疗的伟大蓝图正在开启 基因测序新蓝海——新生儿基因测序 在美国，基因测序技术的春风不仅吹向了生命科学领域的各个行业，而且吹响了人们对美好健康新生活方式向往的新号角。 这不，当二代测序正逐渐成熟地在胎儿产前检测中的运用和新一代基因测序技术及其在
新生儿测序：开启基因测序市场的新蓝海！
基因测序新蓝海——新生儿基因测序 在美国，基因测序技术的春风不仅吹向了生命科学领域的各个行业，而且吹响了人们对美好健康新生活方式向往的新号角。 这不，当二代测序正逐渐成熟地在胎儿产前检测中的运用和新一代基因测序技术及其在肿瘤研究中的应逐渐火热；科学家们现在对基因测序技术又提出了新的应用领域—
个人基因测序成本高昂－新生儿测序引发伦理争议
日前，好莱坞“性感女神”安吉丽娜·朱莉为预防癌症隐患切除双侧乳腺，而她决定手术是因为基因筛查发现她携带家族遗传的缺陷基因BRCA1，导致她罹患乳腺癌的风险大大高于常人。这在医疗界引发新一轮关于基因筛查和基因疗法的讨论热潮。 和10年前相比，如今个人基因测序的费用大大降低。但了解自身基因的秘
新生儿基因组测序获NIH－2500万美元资助
美国国立卫生研究院(NIH)近日给予4个研究团队共500万美元的资助，以研究新生儿的基因组测序是否能比目前的新生儿筛查产生更多有用的医疗信息。这一项目名为基因组测序和新生儿疾病筛查计划。NIH计划在五年内共资助2500万美元。 美国儿童健康与人类发展研究所的主任Alan Guttmac
美新生儿测序计划遇冷
美国新生儿测序项目进入意想不到的坎坷期。 近日，美国首个探讨利用新生儿基因测序指导健康护理的研究项目陷入意想不到的困境：很少有父母愿意孩子参与其中。 哈佛大学布莱根妇女医院遗传学家 Robert Green与合作者在大约4年前开始计划实施新生儿测序项目，他们调查了500多名健康新生儿的
美国新生儿测序计划遇冷
美国新生儿测序项目进入意想不到的坎坷期。图片来源：UzFoto 近日，首个探讨利用新生儿基因测序来指导健康护理的研究项目陷入意想不到的困境：很少有父母愿意孩子参与其中。 在哈佛大学布莱根妇女医院遗传学家 Robert Green与合作者，在大约4年前开始计划实施新生儿测序项目，他们调查了50
454测序用于美洲奶牛种牛基因组测序项目
一只名为Pawnee Farm Arlinda Chief的种牛和它的儿子Walkway Chief Mark大约有60000个后代，其后代是牛奶生产的主力。最近一项研究中1，科学家通过454全基因组测序，掌握了他们的基因组中控制重要性状的基因，包括抗病能力、牛奶产量，这些性状已通过北美的当
影响DNA测序技术测序产物银染的因素
1. 水的质量对于染色的成功极其重要。超纯水(NANOpureR 或Milli-QR 的水)或双蒸水可获得较好的效果, 如果水中有杂质, 则低分子量条带可能无法出现。 2. 碳酸钠也非常重要。使用新鲜的，美国化学学会级碳酸钠较好，如Fisher和Kodak ACS试剂级碳酸钠(Fisher C
关于DNA测序技术的测序凝胶板的制备
一、玻璃板的处理 银染测序的玻璃板一定要非常清洁，一般先用温水和去污剂洗涤，再用去离子水冲洗玻璃板，除去残留的去污剂，最后用乙醇清洗玻璃板。玻璃板上遗留的去污剂微膜可能导致凝胶染色时背景偏高(棕色)。短玻璃板经粘合溶液处理可将凝胶化学交联于玻璃板上。这一步对于在银染操作过程中防止凝胶撕裂至关重
DNA测序方法自动测序法的操作步骤
一、准备工作1. BigDye测序反应试剂盒 主要试剂是BigDye Mix，内含PEZL四色荧光标记的ddNTP和普通dNTP，AmpliTaq DNA polymerase FS，反应缓冲液等。2. pGEM-3Zf (+) 双链DNA对照模板 0.2 g/L，试剂盒配套试剂。3. M13(-2
DNA测序测序凝胶的银染的影响因素
测序产物的银染是显现序列信息的一种新方法，本系统的成败受几个因素的影响 ① 水的质量对于染色的成功极其重要。超纯水（NANOpureR或Milli-QR的水）或双蒸水可获得较好的效果，如果水中有杂质，则低分子量条带可能无法出现。 ② 碳酸钠也非常重要。使用新鲜的，美国化学学会级碳酸钠较好，如
Illumina推出Nextera－DNA－Flex全基因组测序制备产品
近日，Illumina宣布推出一款全新的全基因组测序(WGS)文库制备产品——Nextera DNA Flex，它让全血和唾液样本省去了样本制备，也让文库制备流程跳过了一些繁琐步骤，比如DNA的机械片段化、定量和归一化。Nextera DNA Flex提供了一个快速、整合的流程，适合广泛的应用，
基因组直接测序法检测DNA的甲基化
基因组直接测序法是过去一直沿用的DNA甲基化的研究方法，用Maxam—Gilbert化学裂解法对基因组DNA进行处理，并以连接介导的PCR来放大信号强度，然后进行序列分析。此法是基于5mC在标准的Maxam—Gilbert胞嘧啶化学裂解反应中不被裂解，故5mC可通过在测序胶上缺少对应于胞嘧啶降解反应
试剂器材/DNA测序仪
1．bigdye测序反应试剂盒 主要试剂是bigdye mix，内含pe专利四色荧光标记的ddntp和普通dntp，amplitaq na polymerase fs，反应缓冲液等。2．pgem-3zf (+) 双链dna对照模板 0.2g/l，试剂盒配套试剂。3．m13(-21)引物 tgtaaa
发展历史/DNA测序仪
70年代末，WalterGilbert发明化学法、FrederickSanger发明双脱氧终止法手动测序，同位素标记80年代中期，出现自动测序仪（应用双脱氧终止法原理）、荧光代替同位素，计算机图象识别90年代中期，测序仪重大改进、集束化的毛细管电泳代替凝胶电泳2001年完成人类基因组框架图
DNA的测序技术4
３，染色，将胶板移至染色液中，摇床震荡３０分钟。 ４，凝胶洗涤，将染色后的胶板，放入超纯水中２－３秒后，迅速取出并竖起控水，随后把胶板放入预冷的显影液中（用量为总量的1/2），充分震荡，当第一批条带后，把胶板移入预冷的另一半显影液中，震荡，直至全部条带出现。 注意：从放入水到放入
DNA测序仪的计算
测序反应精确度计算公式：100%－差异碱基数(不包括n数)/650×100% 差异碱基即测定的dna序列与已知标准dna序列比较不同的碱基，n为仪器不能辨读的碱基。
DNA测序仪发展历史
70年代末，WalterGilbert发明化学法、FrederickSanger发明双脱氧终止法手动测序，同位素标记 80年代中期，出现自动测序仪（应用双脱氧终止法原理）、荧光代替同位素，计算机图象识别 90年代中期，测序仪重大改进、集束化的毛细管电泳代替凝胶电泳 2001年完成人类基因组