胰腺癌致病关键,也许藏在基因启动子中

过去 10 年来,对于肿瘤进行测序极大地增加了人们对于癌症的认识。根据不同的基因突变,许多看似相同的肿瘤被分成了许多亚型,而以此为基础,越来越多的个性化肿瘤药物相继出现。 不过,这些努力绝大部分都集中在人类染色体上的基因外显子部分。事实上,人类 21000 个基因的外显子序列仅仅占到了全部染色体 30 亿个碱基对的 2%,剩下的 98% 非编码序列有时被称作基因组中的“暗物质”。最近,一波新的研究瞄准了这 98% 的基因组,它们正在迅速推动癌症靶向药物研究。这其中的一项代表性研究来自美国冷泉港实验室(Cold Spring Harbor Laboratory),发表在了最近的《自然》杂志子刊《Nature Genetics》上。 美国科学家们的这项研究集中在了胰腺癌上,胰腺癌是常见肿瘤中恶性程度较高的一种,其 5 年存活率仅为 8%。之前对于胰腺癌的基因外显子测序已经发现了一些致癌基因,比如 p53 和 KRAS 等,不......阅读全文

胰腺癌致病关键,也许藏在基因启动子中

  过去 10 年来,对于肿瘤进行测序极大地增加了人们对于癌症的认识。根据不同的基因突变,许多看似相同的肿瘤被分成了许多亚型,而以此为基础,越来越多的个性化肿瘤药物相继出现。  不过,这些努力绝大部分都集中在人类染色体上的基因外显子部分。事实上,人类 21000 个基因的外显子序列仅仅占到了全部染色

基因内启动子的定义

中文名称基因内启动子英文名称intragenic promoter定  义被RNA聚合酶III识别的基因内的一段DNA序列。应用学科遗传学(一级学科),分子遗传学(二级学科)

基因外启动子的定义

中文名称基因外启动子英文名称extragenic promoter定  义位于基因转录区以外的启动子。许多小RNA基因、H1 RNA基因和U6 RNA基因等具有基因外启动子。应用学科生物化学与分子生物学(一级学科),基因表达与调控(二级学科)

基因内启动子的基本定义

中文名称基因内启动子英文名称intragenic promoter定  义被RNA聚合酶III识别的基因内的一段DNA序列。应用学科遗传学(一级学科),分子遗传学(二级学科)

启动子—基因表达的发动机

  众所周知,一段基因从转录开始,最终形成蛋白质执行功能,离不开一个高效、匹配的启动子。启动子的一般结构包括核心启动子元件和上游调控元件。核心启动子元件又包括转录起始点和TATA框,主要作为RNA聚合酶结合并起始转录的位点,上游调控元件能够通过与对应的反式作用因子相结合改变转录的效率,如图1。

基因外启动子的基本定义

中文名称基因外启动子英文名称extragenic promoter定  义位于基因转录区以外的启动子。许多小RNA基因、H1 RNA基因和U6 RNA基因等具有基因外启动子。应用学科生物化学与分子生物学(一级学科),基因表达与调控(二级学科)

启动子—基因表达的发动机

众所周知,一段基因从转录开始,最终形成蛋白质执行功能,离不开一个高效、匹配的启动子。启动子的一般结构包括核心启动子元件和上游调控元件。核心启动子元件又包括转录起始点和TATA框,主要作为RNA聚合酶结合并起始转录的位点,上游调控元件能够通过与对应的反式作用因子相结合改变转录的效率,如图1。     

启动子与转录因子/基因表达调控蛋白

目的基因的表达调控生命活动丰富多彩、千变万化。但是万变不离其宗,不管如何变化都围绕着中心法则展开。核酸作为遗传物质指导蛋白质的表达,表达产生的一些特殊蛋白(如转录因子、调控蛋白)反过来又对DNA指导合成蛋白质的过程进行调控。对基因表达调控的研究一直是生物学研究热点,涉及到生命活动的各个过程,也是各类

分子遗传学词汇基因内启动子

中文名称:基因内启动子英文名称:intragenic promoter定  义:被RNA聚合酶III识别的基因内的一段DNA序列。应用学科:遗传学(一级学科),分子遗传学(二级学科)

双向启动子可以协调调控反向运行的基因

  新的分析发现,发散性转录(一个启动子引导两个相邻基因向相反方向表达)在生命的所有领域都是保守的。  与生物学教科书中描述的相反,细菌和古生菌可以在基因组上以相反的方向进行转录。这要归功于双向启动子——RNA聚合酶可以在DNA序列上跳动,并以或另一种方式移动产生mRNA转录本。  5月6日发表在N

【大盘点】胰腺癌的基因和靶向治疗

  NCI 和 SEER 的数据显示胰腺癌 5 年生存只有 5-6%,大多数患者诊断时都已是进展期,区域性和远处转移分别为 27% 和 53%。胰腺癌治疗方面最近也没有突破性进展,含吉西他滨的治疗和手术是近 10 余年来的标准治疗,无论是用作新辅助还是辅助化疗,化疗选择很有限。美国 Frank 博士

与胰腺癌相关的基因突变及临床解释EGFR基因

BRCA1和BRCA2基因的遗传突变会增加患乳腺癌或卵巢癌的终生风险。BRCA1和BRCA2都参与了基因组稳定性的维持,特别是双链DNA修复的同源重组途径。BRCA2蛋白含有一个70 a a基序的几个拷贝,称为BRC基序,这些基序介导了与在DNA修复中起作用的RAD51重组酶的结合。BRCA2被认为

与胰腺癌相关的基因突变及临床解释EGFR基因

EGFR编码的蛋白是一种跨膜糖蛋白,也是表皮生长因子受体家族中的一员,该家族包括HER1(erbB1,EGFR)、HER2(erbB2,NEU)、HER3(erbB3)及HER4(erbB4),也属于受体酪氨酸激酶家族。EGFR作为细胞表面蛋白可与配体如表皮生长因子(EGF)结合,EGFR可被激活,

与胰腺癌相关的基因突变及临床解释KRAS基因

KRAS (Kirsten Rat Sarcoma Viral Oncogene Homolog)基因是GDP/GTP结合蛋白,比较重要的同家族基因还包括HRAS和NRAS。KRAS与GTP结合呈激活状态,与GDP结合呈关闭状态,KRAS可被生长因子或酪氨酸激酶(如EGFR)短暂活化,活化后的KRA

与胰腺癌相关的基因突变及临床解释MTHFR基因

该基因编码的蛋白质催化5,10-亚甲基四氢叶酸转化为5-甲基四氢叶酸酯,这是同型半胱氨酸再甲基化为蛋氨酸的共基质。该基因的遗传变异影响对闭塞性血管病、神经管缺陷、结肠癌和急性白血病的易感性,该基因的突变与亚甲基四氢叶酸还原酶缺乏有关。

与胰腺癌相关的基因突变及临床解释ATM基因

ATM基因编码的蛋白属于PI3/PI4激酶家族,这种蛋白是一种重要的细胞周期检查点激酶,通过磷酸化调控下游一系列重要蛋白,包括抑癌蛋白p53和BRCA1、检查点激酶CHK2、检查点蛋白RAD17和RAD9以及DNA修复蛋白NBS1。ATM和与其密切相关的蛋白ATR被认为是在细胞周期调控以及DNA损伤

与胰腺癌相关的基因突变及临床解释BRAF基因

该基因编码蛋白属于raf/mil家族的丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶,参与调控MAP/ERKs信号通路,在细胞分裂、分化和分泌起重要作用。BRAF基因的突变与各种癌症相关,包括非霍奇金淋巴瘤,结直肠癌,恶性黑色素瘤,甲状腺癌,非小细胞肺癌,肺腺癌。

与胰腺癌相关的基因突变及临床解释-CIC基因

该基因编码的蛋白质是果蝇黑胃管Capicua基因的一个同源基因,是转录抑制因子的高迁移率群(HMG)盒超家族成员。该蛋白包含一个参与DNA结合和核定位的保守HMG结构域和一个保守的C端。研究表明,这种蛋白的N末端区域与ATXN1(geneid:6310)相互作用,形成转录抑制复合物,体外研究表明,A

与胰腺癌相关的基因突变及临床解释FANCC基因

Fanconi贫血互补组(FANC)目前包括Fanca、Fancb、Fancc、Fancd1(也称为brca2)、Fancd2、Fance、Fancf、Fancg、Fanci、Fancj(也称为brip1)、Fancl、Fancm和Fancn(也称为palb2)。先前定义的组fanch与fanca相

与胰腺癌相关的基因突变及临床解释PTEN基因

PTEN基因编码的蛋白具有蛋白磷酸酶和脂质磷酸酶活性,是第一个具有磷酸酶活性的抑癌基因,也是是继p53和Rb基因之后,与肿瘤发生密切相关的一种抑癌基因,其主要机制因为PTEN是PI3K/Akt通路的主要负调控因子。PTEN的功能缺陷在人类多种肿瘤中广泛存在。

与胰腺癌相关的基因突变及临床解释CIC基因

该基因编码的蛋白质是果蝇黑胃管Capicua基因的一个同源基因,是转录抑制因子的高迁移率群(HMG)盒超家族成员。该蛋白包含一个参与DNA结合和核定位的保守HMG结构域和一个保守的C端。研究表明,这种蛋白的N末端区域与ATXN1(geneid:6310)相互作用,形成转录抑制复合物,体外研究表明,A

启动子分类介绍

①组成型启动子(constitutive promoter)是指在该类启动子控制下,结构基因的表达大体恒定在一定水平上,在不同组织、部位表达水平没有明显差异。使用最广泛的组成型启动子是花椰菜花叶病毒(CaMV)35S 启动子、来自根癌农杆菌Ti 质粒T-DNA 区域的胭脂碱合成酶基因nos 启动子,

启动子是什么?

启动子 (promoter),是位于基因5'端上游紧靠转录起点的一段非编码序列,其功能是引导RNA 聚合酶与基因相应部位的正确结合,启动基因的转录。一般来说, 原核基因的启动子比较简单,只有数十个碱基组成,而真核基因的启动子较大,可能涉及数千个碱基。启动子有方向性, 位于结构基因转录起始点的

启动子分类介绍

①组成型启动子(constitutive promoter)是指在该类启动子控制下,结构基因的表达大体恒定在一定水平上,在不同组织、部位表达水平没有明显差异。使用最广泛的组成型启动子是花椰菜花叶病毒(CaMV)35S 启动子、来自根癌农杆菌Ti 质粒T-DNA 区域的胭脂碱合成酶基因nos 启动子,

IL10基因装备病毒有望更好治疗胰腺癌

  两种不同的方法的组合,即病毒治疗及免疫治疗组合显示出治疗胰腺癌的“巨大潜力”。  一项由英国慈善胰腺癌症研究基金会资助的研究调查是否溶瘤牛痘病毒(经修饰以选择性地感染和杀死癌细胞的病毒)通过装备能调节机体免疫系统的一个基因后,能否更有效治疗胰腺癌。  虽然实验研究表明组合后既可以杀死癌细胞,也可

研究发现胰腺癌基因表达调控新机制

原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/11/512518.shtm

与胰腺癌相关的基因突变及临床解释PHSPB1基因

这种基因编码的蛋白质是由环境压力和发育变化引起的。编码蛋白参与应激抵抗和肌动蛋白组织,并在应激诱导下从细胞质转运到细胞核。该基因的缺陷是导致2型Charcot-Marie牙病(CMT2F)和远端遗传性运动神经病(DHMN)的原因。

与胰腺癌相关的基因突变及临床解释ETV1基因

这个基因编码一个转录因子家族成员。ets蛋白调节许多靶基因,这些靶基因调节细胞生长、血管生成、迁移、增殖和分化等生物学过程。所有的ets蛋白都含有一个ets-dna结合域,该域结合到含有共识5’-cgga[at]-3’的dna序列。该基因编码的蛋白质除了在C末端区域的ets-dna结合域外,在N末端

与胰腺癌相关的基因突变及临床解释RRM1基因

这个基因编码核糖核苷酸还原酶的大的催化亚单位,这是一种将核糖核苷酸转化为脱氧核糖核苷酸所必需的酶。在细胞周期的S阶段以及多个DNA修复过程中,可用的脱氧核糖核苷酸池对DNA复制很重要。选择性剪接导致多个转录变体。

与胰腺癌相关的基因突变及临床解释IGF2基因

该基因编码多肽生长因子胰岛素家族的一个成员,参与发育和生长。它是一个印记基因,仅从父系等位基因表达,该位点的表观遗传变化与Wilms肿瘤、Beckwith-Wiedemann综合征、横纹肌肉瘤和Silver-Russell综合征有关。存在一个通读的INS-IGF2基因,其5'区与INS基因重