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23GENEBANK正式发布GBGIAS基因组数据分析一体化服务平台

23GENEBANK的基因组数据分析系统,从GB-CHIP,GB-WGS-REPORT,GB-TARGRUG等一路走来,历经15项核心技术突破,完成了从基因芯片到二代测序,从定制靶向捕获测序到全基因组测序,从疾病风险预测到家族遗传性疾病检测再到肿瘤精准用药的全方位覆盖。 第三届“精准医疗与基因测序大会”期间,23GENEBANK正式发布GB-GIAS基因组数据分析一体化服务平台,受到广泛关注。本届大会于2017年7月15日,在北京·协和学术会堂盛大召开,并圆满结束。 罗氏、赛莫飞、诺河致源、瑞宁、23GENEBANK等企业代表参展,与会的数百位医疗行业从业者共同进行了最直观的交流。 23GENEBANK在本届大会期间发布的GB-GIAS基因组数据分析一体化服务平台,提供了灵活、高效、全面的基因分析解读方案,以下内容为GB-GIAS介绍: 什么是GB-GIAS? GB-GIAS(GeneBank Genomics d......阅读全文

Nat Comm| 张强锋组利用人工智能算法分析单细胞ATAC-seq数据

  近年来,深度学习等人工智能技术在图像识别,自然语言处理等领域取得了令人瞩目的成就。人工智能技术应用于生命科学,对生物信息多个领域产生了重大的影响。深度学习算法借助于生命科学大数据的飞速发展,从海量大数据中自动高效地提取特征进行学习,极大超越了依赖人工提取特征的传统人工智能算法,在医疗图像处理、结

精准医疗时代已至 基因测序数据分析成为关键

  随着医学技术提升、就医环境改善,困扰人们的复杂疾病是否能够得到更加有效的治疗?相关统计显示,针对城市居民死亡率较高的癌症(恶性肿瘤)、心脏病、冠心病等复杂疾病,传统医疗方案的治疗效果并不佳。据WINSymposium公布的数据显示,传统医疗在肿瘤治疗上用药无效率高达75%。人们仍然谈“癌”色变。

全面剖析:基因检测进入消费级市场的关键点

  目前越来越多的媒体开始重新炒作基因检测,很多人感觉消费和资本市场对基因检测的关注度越来越高。果真是基因检测市场的春天到来了吗?这一波热潮过后,基因检测能成为必需品吗?下面我从基因检测的瓶颈、模式创新和数据解读等方面和大家探讨一下基因检测成为必需品的关键转折点。  基因检测自身的三大瓶颈影响消费市

基因数据分析的主流软件

在过去的几年中,许多生物的基因组完成了测序工作,如何对如此庞大的原始序列信息进行分析和应用,正是现在最为棘手的问题。大量的基因预测软件和在线工具应运而生。如何广泛而深入地了解并能有的放矢地利用这些工具,已经成为21世纪分子生物学家的必修课。随着大规模EST和cDNA序列信息的获取,那些基于表达序列同

新一代测序技术(下)-SOLiD (ABI)

 【摘要】 2005年454公司首推划时代的新一代测序仪,从而引发了测序市场上454、Illumina、ABI等公司在新一代测序技术上的比拼高潮。也正是这种你追我赶,让绘制人类全基因组图谱由过去的耗费4.37亿美元和13年时间,骤然缩短到如今SOLiD 3运行一次即获得50GB可定位测序数据。新一代

北京基因组所召开生物计算研讨会

    10月27日下午,中国科学院北京基因组所组织召开了“北京基因组研究所计算生物学研讨会”,会议由所长吴仲义主持,书记杨卫平、副所长李俊雄、基因组所生物信息研究人员以及科技处相关人员参加了会议。   研讨会上,与会学者就目前计算生物学领域中涉及如何运用大规模高效的理论模型和数

大数据分析如何助力人类癌症、HIV等多种疾病的研究?

  近年来,科学家们逐渐开始使用大数据分析来对多种疾病进行研究,当然,研究人员也取得了多项研究进展,本文中,小编就对近年来相关研究成果进行整理,分享给大家!  【1】Cancer Immunol Res:科学家有望利用大数据分析来预测癌症患者对免疫疗法的反应  doi:10.1158/2326-60

最聪明的生物公司在做什么?扒一扒你不知道的黑科技

  近日,美国著名的《麻省理工科技评论》评选出了全球最聪明(创造力)的50家公司。这50个名单不仅包含了亚马逊、谷歌、微软等互联网巨头,也包含了创立于2013年的Editas Medicine这一类新型公司。在这50家公司里,生物医疗相关的公司总共有15家。  在这15家公司中,有10家公司与基因相

国内外蛋白质组学大腕云集 聚焦生物质谱前沿技术

  2014年7月3日,全国生物质谱学术报告会--生物质谱前沿技术邀请报告会在上海复旦大学隆重召开。此次活动旨在积极促进我国生物质谱技术的发展和应用,加强国内外相关研究领域的专家学者之间的交流与合作,特邀瑞士苏黎世联邦技术学院分子系统生物学

高通量测序技术技术的应用及前景

高通量测序技术是对传统测序一次革命性的改变, 一次对几十万到几百万条DNA分子进行序列测定, 因此在有些文献中称其为下一代测序技术(next generation sequencing)足见其划时代的改变, 同时高通量测序使得对一个物种的转录组和基因组进行细致全貌的分析成为可能, 所以又被称

高通量测序技术技术的应用及前景

  高通量测序技术技术的应用及前景   (作者:生物芯片上海国家工程研究中心 滕晓坤, 肖华胜)   高通量测序技术是对传统测序一次革命性的改变, 一次对几十万到几百万条DNA分子进行序列测定, 因此在有些文献中称其为下一代测序技术(next generation sequencing)足见其划

高通量测序技术技术的应用及前景

  高通量测序技术技术的应用及前景   (作者:生物芯片上海国家工程研究中心 滕晓坤, 肖华胜)   高通量测序技术是对传统测序一次革命性的改变, 一次对几十万到几百万条DNA分子进行序列测定, 因此在有些文献中称其为下一代测序技术(next generation sequencing)足见其划

中国版精准医疗计划将启动

  国家卫计委11月30日消息,目前我国正在制定“精准医疗”战略规划,或将纳入到“十三五”重大科技专项中。  精准医疗主要由基因测序等顶尖技术构成,将改变现有的诊断、治疗模式,为医学发展带来一场变革。据透露,我国将研发一批国产新型防治药物和医疗器械,形成一批我国定制、国际认可的疾病诊疗指南

肿瘤基因专家致力挖掘单细胞大数据潜能

  近年来,随着测序技术的迅猛发展,单细胞测序技术已逐渐走入人们视野。2013年,单细胞测序技术成为《自然》评选的“Method of the Year”。大多数的基于NGS的基因检测,都是在大量细胞宏观水平上,对整个细胞群进行遗传分析。单细胞测序技术则是在单个细胞的水平上,对其遗传物质进行检测,从

吴仲义蒲慕明再次呼吁及时公开共享数据

   截至2020年2月10日,共有55条2019-nCoV的病毒基因组可公开获取。其中,在1月22日以前获取的31份测序数据几乎全部来自于中国(仅有1例来自于美国)。然而1月22日以后,余下的24份数据一律源于境外,包括日本、韩国、新加坡、澳大利亚、美国、法国、英国等。  国内学术界对于所谓“高影

中检院发布二代测序试剂质量评价通用原则

  一.前言  本指导原则主要针对第二代测序(next generation sequencing,NGS)技术检测试剂(以下简称“NGS检测试剂”)产品质量提出指导性要求,涉及基本原则、主要原材料、检测流程及性能评价等方面。  本指导原则是对企业和检验人员的指导性文件,但不包括注册审批所涉及的行政

单细胞基因组测序如何实现:从实验到分析,步步解析

  随着生命科学研究的微观化,基于细胞群体的研究方法已不适用于某些研究领域(如肿瘤异质性、早期胚胎发育等)。单细胞基因组测序通过在单个细胞水平上进行测序,解决了用组织样本无法获得不同细胞间的异质性信息或样本量太少无法进行常规测序的难题,为科学家研究单个细胞的行为、机制等提供了新的方向。  【应用概览

谷歌致力于基因数据市场,整合Tute Genomics基因数据库

  谷歌希望凭借人类基因组云端服务Google Genomics在基因组研究市场占有一席之地,如今,公司正忙于用最好的工具来填满这个工具箱。   Google Genomics是谷歌2013年推出的一项云端服务,帮助大学实验室和医院等机构将患者或科研对象的生物基因储存到云端上,推进人类基因组信息的存

大型研究为癌症基因组分析奠定基础

  12月9日,国际癌症基因组协会(ICGC)在著名的《Nature Communications》杂志,发表了一篇令人瞠目的文章,它为即将到来的癌症基因组学研究时代,奠定了基础。该项目,是由Centro Nacional de Analisis Genómico (CNAG-CRG)和German

2022年NGS新一代测序市场规模将达300亿美元

2014年全球下一代测序(NGS)市场规模为20亿美元,预计2022年市场值达300亿美元。全基因组测序技术发展最快,逐渐霸占NGS市场。肿瘤研究和产前检测位居NGS应用市场的前二甲。行情分析:预计2022年市场值达300亿美元。根据Grand View Research 2015年9月的报道,20

基因检测:点亮个体化医疗前行之路

  日前,罗氏诊断宣布其KRAS基因突变检测已获中国食品药品监管总局批准上市。该检测通过对KRAS基因突变状态的识别,帮助医生选择适合患者基因特质的治疗方案,为转移性结直肠癌的靶向治疗提供依据,推进个体化医疗。  目前,国内企业也纷纷推进个体化医疗向临床应用的发展。业内人士指出,个体化医疗已经成为国

看表观新修饰-6mA甲基化如何助力IF飙升!

  DNA甲基化修饰是表观遗传研究的热点之一,我们通常认为DNA甲基化就是胞嘧啶甲基化(5-methylcytosine, 5mC),却不知道随着测序技术的快速发展,科研者们已经在真核生物中(果蝇 、真菌、莱茵衣藻、秀丽隐杆线虫等)发现了一种新的DNA甲基化修饰—DNA-6mA甲基化,且DNA-6m

半导体技术策动新一轮基因测序价格战

  从几万美元到几千美元,完成个人全基因组测序所需要的花费越来越少,所需要的时间越来越短,并且,发生这样加速度变化的频率也越来越高。  今年3月份,总部位于美国加利福尼亚州的生命科学厂商Life Technologies公司又宣布在中国推出新的台式基因测序仪 Ion Proton。借助该技

专访七桥基因:云端计算如何与基因学系统的完美结合?

  10月份,记者在高创会期间在硅谷专访了“七桥基因”董事长詹姆斯先生。以下为访谈实录。  记者:谢谢詹姆斯,很高兴您能接受我们的采访,您可以介绍一下您自己以及您代表的公司吗?  詹姆斯:当然可以,也谢谢您采访我。我是“七桥基因”公司的董事长,我们是一家云端计算公司,致力于生物医学、数据分析;我们专

基因测序产业百家争鸣 测序仪器市场被欧美垄断

  基因测序全产业链划分为上游的测序仪器与试剂耗材市场,中游的基因测序服务市场和下游的生物信息学分析市场。中下游市场面向群体包括医院、药厂、科研机构以及消费者等,医疗领域可分为医疗和非医疗两个领域。人体基因组和人体微生物基因组两个子领域。针对人体基因组的主要产品有肿瘤学(诊断筛查与治疗、靶向用药、伴

基因测序:上游三四代技术是趋势,下游样本积累是关键

  基因测序全产业链划分为上游的测序仪器与试剂耗材市场,中游的基因测序服务市场和下游的生物信息学分析市场。中下游市场面向群体包括医院、药厂、科研机构以及消费者等,可分为医疗和非医疗两个领域。  医疗领域可分为人体基因组和人体微生物基因组两个子领域。针对人体基因组的主要产品有肿瘤学(诊断筛查与治疗、靶

大数据研究推翻常规认识

  近年来,科学创新日渐进入"大数据"时代,各种高通量的分析手段以及各类"组学"的发展,使得我们对生命科学的基本原理以及与人类健康有关的疾病发生机制方面有了更加深入的认识。针对最近一段时间以来科学家们利用"大数据"的手段产生的科学进展,我们

贝瑞和康建成全球最大妇科肿瘤基因组数据库

  基因组大数据的重大意义开始凸显,贝瑞和康与阿里云合作开展的“神州基因组数据云”项目取得的阶段性成果,便已经收效显著。  9月23日,在第十九届全国临床肿瘤学大会暨CSCO学术年会上,北京贝瑞和康生物技术股份有限公司(以下简称“贝瑞和康”)公布了在生物信息分析领域和大数据建设方面做出的重要成果。 

数字盘点:中国高通量测序、生物信息服务公司表

  1. 华大基因  137台HiSeq;3台MiSeq; 31台Proton。  全方位高通量测序应用。  2. 药明康德基因中心  4台HiSeq;4台MiSeq;1台Proton;2台PGM;1台Affymetrix。  是目前中国唯一的美国CLIA认证实验室。 科研服务、测序和芯片外包服务、

生物信息学在基因芯片数据功能分析中的应用

   随着人类基因组计划(Human Genome Project)即全部核苷酸测序的即将完成,人类基因组研究的重心逐渐进入后基因组时代(Postgenome Era),向基因的功能及基因的多样性倾斜。通过对个体在不同生长发育阶段或不同生理状态下大量基因表达的平行分析,研究相应基因在生物体内的功能,