动物所发现DNA甲基化调控胚胎左右不对称发育
DNA甲基化是常见的表观遗传修饰形式，通常发生在CpG位点中的胞嘧啶，由DNA甲基转移酶所催化，将胞嘧啶（C）转变为5-甲基胞嘧啶（5mC）。DNA甲基化在基因转录调控、染色体结构稳定性、基因印记、X染色体失活等方面发挥作用。脊椎动物早期胚胎全基因组DNA甲基化图谱研究提示DNA甲基化可能在胚胎发育中发挥重要作用，然而关于DNA甲基化修饰在胚胎早期发育中的功能研究尚不全面。 脊椎动物体轴形成是胚胎早期发育的重要过程，包括前后轴、背腹轴以及左右轴的建立。除个体差异外，脊椎动物的外观呈现近乎完美的两侧对称结构，但内部器官却是不对称分布的，这个过程被称为左右不对称，在各个物种中普遍存在。左右不对称的建立首先是对称模式的打破和不对称信号的起始，随后组织中心形成并传递放大不对称信号，最后组织器官呈现不对称发育。然而DNA甲基化修饰是否参与胚胎左右不对称发育仍不清楚。 中国科学院动物研究所刘峰研究组利用斑马鱼为模式动物......阅读全文
基因组直接测序法检测DNA的甲基化
基因组直接测序法是过去一直沿用的DNA甲基化的研究方法，用Maxam—Gilbert化学裂解法对基因组DNA进行处理，并以连接介导的PCR来放大信号强度，然后进行序列分析。此法是基于5mC在标准的Maxam—Gilbert胞嘧啶化学裂解反应中不被裂解，故5mC可通过在测序胶上缺少对应于胞嘧啶降解反应
DNA甲基化检测或可帮助预测乳腺癌复发
发表在今天《临床实验胚胎学》杂志上的新研究表明有一种简单的血液测试方法可以确定癌症侵犯其他器官如肺、骨头或大脑等疾病复发的风险。这样的测试对改善所有类型的女性乳腺癌会产生深远影响，这种疾病会影响八分之一的女性。 在研究中，翻译基因组学研究院(TGen)的研究人员确定了21 DNA甲基化热点——
数字PCR技术在DNA甲基化检测中的应用
DNA甲基化是目前研究最多的表观遗传修饰之一，发生于CpG二核苷酸序列C5位置的胞嘧啶上，多发生于CpG岛上，研究发现，DNA甲基化参与调节多种细胞过程，包括胚胎发育，转录，X染色体失活，基因组印迹、染色体稳定性等。许多研究发现，DNA甲基化在一系列的疾病（如癌症等）起到十分重要的作用。在癌症患者中
dna甲基化抑制剂－aza和dec的区别
DNA甲基化在诸如胚胎发育、基因转录、染色质的结构和稳定性、X染色体的失活、基因组印记、细胞的癌变和衰老等生物过程中起到关键作用。DNA甲基化模式和水平取决于DNA甲基转移酶和去甲基化酶的作用。DNA去甲基化包括DNA主动去甲基化和被动去甲基化。其中,DNA去甲基化酶在DNA主动去甲基化中起关键作用
华人科学家发现DNA甲基化关键调节因子
《科学》基因表达调控新突破： DNA甲基化对哺乳动物发育至关重要。本研究利用DNA甲基化报告子敲入技术，对人类胚胎干细胞进行全基因组CRISPR-Cas9筛选。发现QSER1基因是发育相关基因二价启动子和准备状态增强子的关键保护因子，尤其是位于DNA甲基化峡谷内的基因。研究确定了QSER1和T
蛋白质DNA相互作用的甲基化和尿嘧啶干扰分析法—甲基化
实验方法原理在甲基化干扰实验中，探针通过将鸟嘌呤N-7及腺嘌呤N-3位用硫酸二甲酯 (DMS)进行甲基化而产生。这些甲基化的碱基可被哌啶特异性切割。实验材料含有蛋白质结合位点的DNA片段试剂、试剂盒TE 缓冲液 pH 7.5 〜8.0硫酸二甲酯（DMS)DMS反应缓冲液DMS终止缓冲液10 mg m
揭示全基因组DNA甲基化、半甲基化与遗传突变的新方法
5月31日，中国科学院北京生命科学研究院研究员孙中生团队与北京大学肿瘤医院合作，在Briefings in Bioinformatics上，发表了题为A new approach to decode DNA methylome and genomic variants simultaneousl
利用DNA甲基化工具或能有效预测机体健康寿命
死神终会降临在我们每个人头上，那么知道死神何时降临不是更好吗？近日，来自加州大学洛杉矶分校的科学家们通过研究开发出了一种新工具，或能帮助提前计划好与死神的约会，相关研究刊登于国际杂志Aging上；研究者指出，这种名为DNA甲基化GrimAge的生物标志物能帮助人们预测寿命和健康寿命，并能帮助测试
朱健康小组植物DNA去甲基化调控研究获进展
6月15日，《科学》杂志在线发表了中科院上海植物逆境生物学研究中心、中科院上海生命科学研究院植物生理生态所朱健康课题组的最新成果，他们研究揭示了编码一个组蛋白的乙酰化酶IDM1在植物去甲基化作用机制中的重要作用。这被认为是近年来表观遗传领域的一项重大突破。 DNA甲基化修饰是一种重要的表
朱健康教授等人PNAS利用CRISPR技术解析DNA甲基化
来自中科院上海生命科学研究院植物逆境生物学研究中心朱健康研究组和郎曌博研究组的研究人员发表了题为“Critical roles of DNA demethylation in the activation of ripening-induced genes and inhibition of r
人类基因组DNA甲基化数据分析
近期来自电子科技大学，清华大学等处的研究人员从CpG岛等基本定义出发，阐述了高通量DNA甲基化的检测技术以及针对芯片技术与下一代测序技术的低水平数据处理方法，并重点对比了基于机器学习理论对CpG位点及CpG岛甲基化水平的预测算法，以及所利用的特征对预测效果的影响与发展趋势。 DNA甲基化是表观
五花八门的DNA甲基化检测（上）
近年来涌现出不少DNA甲基化的检测技术，少说也有十几种。大致可以分为两类：特异位点的甲基化检测和全基因组的甲基化分析，后者也称为甲基化图谱分析(methylation profiling)。下面生物通给大家介绍一些常用的方法。 特异位点的甲基化检测 甲基化特异性PCR(MS-PC
在单细胞水平预测DNA甲基化的新方法
如今，DNA甲基化的检测已经达到了单细胞的分辨率。不过，目前的方法还不能完整覆盖CpG，总是留下一些缺口。英国的一个团队最近开发出一种计算方法，可准确填补这些缺口。这项结果发表在《Genome Biology》杂志上。 研究人员使用所谓的深度神经网络策略来开发他们的方法，并命名为DeepCp
广州生物院发现DNA被动去甲基化的新作用
DNA甲基化是胞嘧啶的甲基化是最重要的表观遗传学修饰之一，多项生物学过程均涉及DNA甲基化水平的调控。近日，中国科学院广州生物医药与健康研究院郑辉课题组通过研究细胞增殖过程中DNA甲基化（胞嘧啶的甲基化）的调控，发现DNA被动去甲基化的新作用。相关研究成果在线发表在Journal of Biol
DNA甲基化精确调控蟑螂的卵子成熟过程获揭示
华南师范大学生命科学学院任充华研究员和李胜教授团队从分子水平系统揭示了DNA胞嘧啶甲基化（5mC）如何调控德国小蠊的绒毛膜形成和受精过程，拓宽了大家对表观遗传调控昆虫生殖的认识。12月12日，相关成果以article形式在线发表于《自然-通讯》。 尽管我们已经了解到DNA甲基化对昆虫的生殖能力
Nat－Commun：老化细胞中DNA甲基化扮演关键角色
尽管在每个人的一生中其机体的DNA会一直保持不变，但是科学家们却知道机体DNA在不同年龄阶段的行使的功能却并不相同。随着个体年龄增加，机体DNA的甲基化模式会发生剧烈变化，DNA的甲基化模式被认为是机体DNA的第二种遗传密码，可以控制基因的开启或关闭，然而这些改变引发的后果却依然是一个谜。 近
华人研究组Nature解析“从头开始的DNA甲基化”
加州大学河滨分校的一个研究小组解析了在DNA甲基化过程中起关键作用的一种酶的晶体结构，这对于了解“从头开始的DNA甲基化”具有重要的意义。 这一研究成果公布在2月7日的Nature杂志上。由加州大学河滨分校的宋继奎（Jikui Song，音译），以及王钢（Gang Greg Wang，音译）领
研究揭示DNA甲基化调控棉花耐盐性的机制
近日，中国农业科学院棉花研究所功能基因组研究创新团队系统解析了DNA甲基化动态变化在棉花耐盐性中的关键作用，揭示了甲基转移酶基因GhDMT7通过调控淀粉和蔗糖代谢途径增强棉花耐盐性的分子机制。相关研究结果发表在《植物杂志》（The Plant Journal）上。DNA甲基化作为重要的表观遗传修饰，
广州生物院发现DNA被动去甲基化的新作用
DNA甲基化是胞嘧啶的甲基化是最重要的表观遗传学修饰之一，多项生物学过程均涉及DNA甲基化水平的调控。近日，中国科学院广州生物医药与健康研究院郑辉课题组通过研究细胞增殖过程中DNA甲基化（胞嘧啶的甲基化）的调控，发现DNA被动去甲基化的新作用。相关研究成果在线发表在Journal of Biol
研究发现DNA甲基化参与调控柑橘成熟新机制
1月12日，《美国国家科学院院刊》（PNAS）在线发表了中国科学院分子植物科学卓越创新中心/植物生理生态研究所上海植物逆境生物学研究中心郎曌博研究组题为Global increase in DNA methylation during orange fruit development and r
亚硫酸氢盐测序法检测DNA的甲基化
亚硫酸氢盐测序法（Bisulfite sequencing PCR，BSP）用亚硫酸氢盐处理基因组DNA，则未发生甲基化的胞嘧啶被转化为尿嘧啶，而甲基化的胞嘧啶不变。随后设计BSP引物进行PCR，在扩增过程中尿嘧啶全部转化为胸腺嘧啶，最后对PCR产物进行测序就可以判断CpG位点是否发生甲基化称为BS
甲基化干扰法鉴定与蛋白结合的DNA位点
放射性标记DNA探针的制备l 聚丙烯酰胺凝胶的制备1．按照（三）中操作流程灌制非变性聚丙烯酰胺凝胶。将10×TBE稀释成0.5×的工作浓度。聚丙烯酰胺的工作浓度取决于待测DNA片段的大小，200bp左右的片段需要4～5％的凝胶，小于100bp的片段应灌制6～8％的凝胶。 l DN
简述DNA甲基化分析仪的主要功能
DNA甲基化分析仪的主要功能：高度适用于表观遗传学研究的检测工具 焦磷酸测序技术配合QIAGEN表观遗传学产品线，提供高度可靠的序列数据，能够准确、灵敏的定量分析甲基化水平。甚至能够检测新的突变，以及低水平的DNA异常甲基化。PyroMark Q24包括了一个完整软件包，用于分析CpG位点甲基化
特异性位点的DNA甲基化的检测方法
相关专题1 甲基化敏感性限制性内切酶 (methylation-sensitive restriction Endonuclease，MS-RE)-PCR/Southern法这种方法利用甲基化敏感性限制性内切酶 对甲基化区的不切割的特性，将DNA消化为不同大小的片段后再进行分析。常使用的甲基化敏感的
五花八门的DNA甲基化检测（下）
近年来涌现出不少DNA甲基化的检测技术，少说也有十几种。大致可以分为两类：特异位点的甲基化检测和全基因组的甲基化分析，后者也称为甲基化图谱分析(methylation profiling)。下面生物通给大家介绍一些常用的方法。 全基因组的甲基化分析 基于芯片的甲基化图谱分析
DNA甲基化检测的序曲——亚硫酸氢盐转化
检测DNA甲基化的方法有很多种，在众多方法中，研究人员常常会使用到一项技术，那就是亚硫酸氢盐转化。DNA的亚硫酸氢盐处理将未甲基化的胞嘧啶转化成尿嘧啶，而甲基化的胞嘧啶保持不变。随后用测序、定量PCR和芯片等分析来比较处理和未处理DNA的序列，就能确定哪些碱基是甲基化的。尽管在理论上很简单，但亚硫酸
磁珠法DNA甲基化方案—高效特异的DNA亚硫酸盐转化与纯化
DNA甲基化是基因组DNA的一种主要表观遗传修饰形式。近年来，大量研究表明DNA甲基化修饰对于维持正常细胞功能、传递基因组遗传印记、胚胎发育以及人类肿瘤发生，起着至关重要的作用，由此甲基化研究成为表观遗传学，乃至生命科学研究的热点领域。那么如何检测单个基因或者全基因组的甲基化水平或者甲基化位点呢？当
全局DNA甲基化重塑技术帮助检验体外实验模型是否有效
一些神经疾病的发病率正在攀升，特别是那些与衰老有关的疾病，如阿尔兹海默症和帕金森。为了更好地了解这些疾病，评估潜在新疗法，生物学家需要能在实验室进行研究的精确模型。 来自Salk和Stanford的研究人员，与Baylor医学院的合作者证明，用之前发表的方法诱导神经细胞，与大脑中自然发育的神经
研究揭示植物中DNA半甲基化稳态维持的机制
DNA甲基化是一种常见的表观遗传修饰，其在基因表达调控中起着重要作用。在哺乳动物中，DNA甲基化主要发生在“胞嘧啶-鸟嘌呤”（CG）位点的胞嘧啶上。CG双链上两个胞嘧啶的甲基化状态通常一致，完全甲基化或非甲基化。这种对称的甲基化状态会在DNA复制过程中转化为不对称的“半甲基化”状态，再由DNA甲基转
动物所发现DNA甲基化调控胚胎左右不对称发育
DNA甲基化是常见的表观遗传修饰形式，通常发生在CpG位点中的胞嘧啶，由DNA甲基转移酶所催化，将胞嘧啶（C）转变为5-甲基胞嘧啶（5mC）。DNA甲基化在基因转录调控、染色体结构稳定性、基因印记、X染色体失活等方面发挥作用。脊椎动物早期胚胎全基因组DNA甲基化图谱研究提示DNA甲基化可能在胚胎