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如今，DNA甲基化的检测已经达到了单细胞的分辨率。不过，目前的方法还不能完整覆盖CpG，总是留下一些缺口。英国的一个团队最近开发出一种计算方法，可准确填补这些缺口。这项结果发表在《Genome Biology》杂志上。 研究人员使用所谓的深度神经网络策略来开发他们的方法，并命名为DeepCpG。他们将这种方法应用在几种小鼠或人类细胞的单细胞DNA甲基化数据上，证明DeepCpG在预测DNA甲基化上比现有的策略更佳。 这篇文章的通讯作者是欧洲分子生物学实验室的团队负责人Oliver Stegle。他在文中写道：“对于所有的细胞类型，DeepCpG能够比以往的方法更准确地预测甲基化状态。这种方法同时也揭示了已知和de novo序列motif，它们与细胞之间的甲基化变化存在关联。” DeepCpG将标有序列线索的DNA模块与双向门控递归网络相结合，此网络追踪基因组中CpG位点的甲基化是否存在。所得到的的“联合模块”将学习D......阅读全文
北京大学北京未来基因诊断高精尖创新中心，北大生命科学学院与第三医院等处的研究人员发表了题为“Single-cell DNA Methylome Sequencing of Human Preimplantation Embryos”的文章，利用单细胞DNA甲基化组高通量测序方法，首次在单细胞分辨
2017年12月19日，北京大学北京未来基因诊断高精尖创新中心、生命科学学院生物动态光学成像中心汤富酬研究组和北京大学第三医院乔杰研究组合作在国际知名学术期刊《自然遗传学》上在线发表题为“Single-cell DNA Methylome Sequencing of Human Preimpla
由英国及比利时的研究人员开发出的一种新方法，使得在单细胞中同时研究表观基因组及转录组成为可能。发布在《自然方法》（Nature Methods）上的实验方案，可帮助科学家们精确描绘出DNA甲基化改变与基因表达之间的关系。 近年来单细胞测序技术发展迅速，被广泛用于研究细胞间的基因表达谱（转录组）
2017年6月16日，北京大学生命科学学院生物动态光学成像中心汤富酬课题组在《Cell Research》杂志在线发表了题为“Single-cell multi-omics sequencing of mouse early embryos and embryonic stem cells”的研
2017年6月16日，北京大学生命科学学院生物动态光学成像中心汤富酬课题组在《Cell Research》杂志在线发表了题为“Single-cell multi-omics sequencing of mouse early embryos and embryonic stem cells”的研
单细胞转录组和甲基化组分析已经成为了单细胞研究的强大工具。然而，在单细胞中揭示DNA甲基化与基因表达的直接关联还比较困难。这是因为细胞之间存在较大的差异，又不能同时检测一个细胞的转录组和甲基化组。 加州大学范国平教授和同济大学薛志刚教授领导团队解决了这个问题。他们在五月五日的Geno
单细胞三重组学测序技术（scTrio-seq）单细胞中三种组学之间的对应关系癌症中两个细胞亚群的DNA拷贝数差异 2016年2月23日，《细胞研究》（Cell Research）杂志在线发表了北京大学生命科学学院生物动态光学成像中心汤富酬研究组、黄岩谊研究组和首都医科大学附属北京世纪坛医院暨北京大
单细胞基因组旨在通过组学方法研究单个细胞。近年来随着技术的发展，这一年轻的领域正在迅速成熟起来。单细胞基因组研究的前身可以追溯到用芯片检测单细胞的基因表达。不过，新一代DNA测序才是单细胞基因组学的大功臣，这些技术的出现让单细胞基因组研究最终一飞冲天。 2012年7月，Nature Biote
理解任何多细胞生命系统的前提是理解“细胞”，今天，单细胞研究已经不再只是纸上谈兵了，全球已经有许多实验室展开了单细胞研究。 生物通报道：12月21日Science杂志公布了2018年度十大科学突破。今年的Science十大科学突破之首是单细胞水平细胞谱系追踪技术，除此之外，今年的十大科学突破中
结直肠癌是胃肠道中常见的恶性肿瘤。基因组不稳定性、表观遗传异常以及基因表达失调是结直肠癌的典型分子特征。以往的单细胞研究只能分别检测基因组、甲基化组或转录组，而不能以单细胞分辨率同时开展多组学研究。 为了更好地了解结直肠癌的发展，北京大学的研究团队开发出一种单细胞测序方法，不仅能够分析单细胞的
微流控芯片，高通量技术，单细胞测序，CTC循环肿瘤细胞，纳米医学，ddPCR技术，单分子免疫阵列技术(SiMoA)，ctDNA，质谱检测，大数据，人工智能等等最新技术成果与应用案例纷纷亮相。 01 微流控芯片技术 微流控芯片，又称为芯片实验室（Lab on a Chip），是指在几平方厘米
微流控芯片，高通量技术，单细胞测序，CTC循环肿瘤细胞，纳米医学，ddPCR技术，单分子免疫阵列技术(SiMoA)，ctDNA，质谱检测，大数据，人工智能等等最新技术成果与应用案例纷纷亮相。 01 微流控芯片技术 微流控芯片，又称为芯片实验室（Lab on a Chip），是指在几平方厘米
2019年8月22日，北京大学第三医院乔杰课题组和汤富酬课题组合作，在国际权威学术期刊《自然》（Nature，IF：43.07）在线发表研究成果“Reconstituting the transcriptome and DNA methylome landscapes of human impl
本文中，小编整理了近年来科学家们在甲基化研究领域取得的重要研究成果，与大家一起学习！ 【1】Science：重大进展！揭示DNA甲基化增强基因转录机制 doi：10.1126/science.aar7854 DNA甲基化（DNA methylation）为DNA化学修饰的一种形式，能够在不
一、科学目标 本重大研究计划以情感和记忆的神经环路为主要研究内容，充分发挥医学科学、生命科学和信息科学等学科的特点以及学科交叉的优势，引入连接组、功能组等系统化的研究理念，结合临床情感和记忆障碍疾病特点，对情感和记忆（尤其是情感相关的记忆）的神经环路的结构和功能进行定量化描述。 二、核心科学
自1月22日以来，国家自然科学基金委员会官网已先后公布了16个重大研究计划2017年度项目指南，其中与生物医学相关的共7个。具体如下： 备注：血管稳态与重构的调控机制重大研究计划拟资助总直接费用并未在指南中直接标出，是根据信息计算所得 何为“重大研究计划”？ 据悉，国家自然科学基金委员会于
X染色体失活（XCI）是指雌性哺乳类细胞中，两条X染色体的其中之一失去活性的现象，过程中X染色体会被包装成异染色质，进而因功能受抑制而沉默化。Xist RNA是能引发X染色体沉默的长片段ncRNA，尽管Xist对XCI是必要的，但其对胚胎植入前的印记XCI的精确作用尚存争议。近日，安诺优达与法国
在雌性哺乳动物胚胎形成过程中，两条X染色体的其中一条失活，完成剂量补偿效应。对于小鼠而言，X染色体失活（XCI）主要分为两个阶段，第一阶段父源X染色体（Xp）启动印记失活，此失活状态在滋养外胚层细胞（TE）及原始内胚层细胞（PrE）中得以维持，但在囊胚内细胞团（ICM）的外胚层细胞中，Xp会出现
经过特殊的算法，我们得到了2018年前10个月中国生物医学风云榜人物及最火爆的3个重大学术界事件，能够上榜的风云人物/事件，都曾长时间占据过100多个公生物医学公众号的头版头条。 在此，我们精选了其中的3个事件及16位风云榜人物。我们对其进行了划分，分别是：6星级的3个事件，分别位诺贝尔奖，国
进行多项作业的脑的分隔 法国的研究人员报告说，当我们试图在同一时间做两件事时，我们脑中的每一半似乎都投入到一个不同的作业之中。这些发现也许可帮助解释为什么我们一般可同时较好地做两种工作但却不能同时做更多的工作。Sylvain Charron和Etienne Koechlin应用功能性核磁共
2017年6月16日，北京大学生命科学学院生物动态光学成像中心汤富酬课题组在《Cell Research》杂志在线发表了题为“Single-cell multi-omics sequencing of mouse early embryos and embryonic stem cells”的研
3 在神经科学中的应用单细胞测序技术帮助科学家更深入的了解大脑神经细胞。2017年，Salk生物研究所领导的团队根据甲基化和调控特征，区分小鼠和人类大脑样本中的神经元亚型，并鉴定出人类额叶皮质中一组新的神经元[6]。研究人员利用单细胞甲基化测序分析小鼠和人类额叶皮质样本中近6200个神经元，并根据甲
实现分子诊断技术和临床应用与转化的良好互动 labtech China Congress 2019邀您共探生命科学和精准医学未来新趋势 随着人类对疾病认识的不断深入及基因检测的技术进步，全球分子诊断市场快速增长，分子诊断新技术及其在临床上的最新应用得到飞速发展。临床诊疗已经进入精准医疗时代，
近日，刊登在国际杂志PLoS Genetics上的一项研究论文中，来自美国能源部联合基因组研究院的研究人员对230种古细菌和细菌基因组进行了测序，旨在研究DNA甲基化在原核生物中所扮演的关键角色。 细胞的表观基因组是基因组DNA特殊剪辑发生改变的一个特殊集合，这些表观基因组的改变会影响基因组的
临床类 杜克大学分子遗传学教授David Goldstein David Goldstein提出运用精准医学治疗神经系统疾病。Goldstein专注于几个癫痫患者大规模研究的课题，其中包括一项对超过350个患病的儿童及其父母进行测序来发现新突变的项目。尽管许多发现的突变属罕见突变，但是它
人类机体中有37万亿个细胞，然而将一种细胞与另外一种细胞进行区分的能力或许并不像我们想象中那么简单，近日，一项刊登在国际杂志Nature Biotechnology上的研究报告中，来自美国俄勒冈健康与科学大学（OHSU）的研究人员通过研究首次开发出了一种新方法，能够快速且有效地识别体内细胞的亚型
今天我们再来关注循环系统中一类很特殊的悬浮细胞：循环肿瘤细胞（Circulating Tumor Cell，CTC）。CTC是癌症病人体内由实体肿瘤病灶脱离而进入血管的肿瘤细胞，它们在外周血中痕量存在，大部分也会发生凋亡和被吞噬，但依旧有少数隐藏极好并伺机而动发展为肿瘤转移灶，因此是肿瘤发生
近日，中科院上海生科院生化与细胞所一项最新研究发现，小鼠早期胚胎中母源和父源基因组在单细胞的受精卵阶段，均会发生大规模的DNA主动和被动去甲基化，DNA双加氧酶Tet3介导了主动去甲基化的发生，而糖苷酶TDG并不参与该过程。相关研究成果在线发表于学术期刊《细胞—干细胞》。 该研究由中科院上海生
近日，中科院上海生科院生化与细胞所一项最新研究发现，小鼠早期胚胎中母源和父源基因组在单细胞的受精卵阶段，均会发生大规模的DNA主动和被动去甲基化，DNA双加氧酶Tet3介导了主动去甲基化的发生，而糖苷酶TDG并不参
2019年8月22日，北京大学第三医院乔杰课题组和汤富酬课题组合作，在国际权威学术期刊《自然》（Nature，IF：43.07）在线发表研究成果“Reconstituting the transcriptome and DNA methylome landscapes of human imp