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数字PCR技术在DNA甲基化检测中的应用

DNA甲基化是目前研究最多的表观遗传修饰之一,发生于CpG二核苷酸序列C5位置的胞嘧啶上,多发生于CpG岛上,研究发现,DNA甲基化参与调节多种细胞过程,包括胚胎发育,转录,X染色体失活,基因组印迹、染色体稳定性等。许多研究发现,DNA甲基化在一系列的疾病(如癌症等)起到十分重要的作用。在癌症患者中,与正常人体相比,DNA甲基化多发生两个变化:1、启动子区域CpG岛的高甲基化,导致肿瘤抑制基因沉默;2:重复区域的低甲基化,导致基因组不稳定1,2。图1:DNA甲基化与癌症的关系1DNA甲基化的改变多发生于癌症早期,在某些特定癌症中,检测特异的甲基化标志物有助于癌症的早期发现,进而大大提高癌症患者的生存率。目前,美国国家癌症协会(ACS)在最近更新的结直肠癌筛查指南中建议每3年做一次多靶点粪便DNA的甲基化检测。因此,急需找到一个灵敏度高、特异性强、操作简单快捷的方法对临床样本DNA甲基化进行检测。微液滴数字PCR (dd......阅读全文

数字PCR技术

数字PCR作为第三代PCR技术,它是将分子生物学与现代微机电、微纳制造等工程技术相结合的典范。数字PCR以聚合酶链式反应的理论和技术体系为基础,结合现代微机电和光学检测技术,实现单分子水平的核酸精确定量检测。数字PCR的核心思想是将核酸样品平行划分为大规模单分子水平的微反应单元,然后对众多微反应单元

数字PCR简介

1985年美国科学家Kary Mullis发明PCR方法以后,PCR已经成为生命科学研究领域中最常规的实验方法之一。PCR是用于放大扩增特定的DNA片段的分子生物学技术,可看作是生物体外的特殊DNA复制。PCR的最大特点,是能将微量DNA大量扩增。最传统的一代PCR采用琼脂糖电泳的方式对PCR产物进

数字PCR的原理

数字 PCR 的工作原理在于将 DNA 或 cDNA 样品分割为许多单独、平行的 PCR 反应,部分这些反应包含了靶标分子(阳性),而其他不包含(阴性)。 单个分子可以被扩增一百万倍或更多。 在扩增期间,TaqMan® 化学试剂及染料标记探针可用于检测特定序列的靶标。 当不存在任何靶标序列时,没有信

数字PCR应用(二)

4、能够有效区分浓度差异(变化)微小的样品:更好的准确度、精密度和重复性,可以用于精确测定靶基因的相对表达,基因拷贝数变异分析等。图4. qPCR和dPCR的对比 四.dPCR的多指标检测的实现 如同qPCR一样,dPCR中实现多指标的并行检测能显著降低检测成本,获取更丰富的检测信息。 不同于qPC

数字PCR的原理

数字 PCR 的工作原理在于将 DNA 或 cDNA 样品分割为许多单独、平行的 PCR 反应,部分这些反应包含了靶标分子(阳性),而其他不包含(阴性)。 单个分子可以被扩增一百万倍或更多。 在扩增期间,TaqMan® 化学试剂及染料标记探针可用于检测特定序列的靶标。 当不存在任何靶标序列时,没有信

数字PCR发展历程

传统的荧光定量PCR,经过多年的发展,已是很成熟的实验方案了。其中,最常用的是Taqman法和SYBR Green法。而在这二种方法当中,Taqman法又以其特异性高、定量精确,得到广大用户的认可。但是Taqman法PCR,它还是一个相对定量的办法。它测的是一个Ct值,也就是PCR到第几个循

数字PCR应用(三)

Fluidigm公司于2006年底推出了基于集成流体通路(IFC)芯片的Bio-Mark™ 高通量基因剖析系统。 其创新在于集成液体通路技术:应用集成电路制造工艺(光刻)在硅片或石英玻璃上刻上许多微管和微腔体,经过不同的控制阀门控制溶液在其中的活动来完成生物样品的分液、混合、PCR扩增。图8. Bi

什么是数字PCR

数字PCR技术是一种核酸分子绝对定量技术,其原理是将一个PCR反应体系分配到大量微小的反应单元中,在每个单元包含一个或多个拷贝的目标分子( DNA 模板) ,进行单分子模板扩增,扩增结束后通过阳性反应的数目和统计学方法计算原始样本中目标基因的拷贝数。

数字PCR应用(一)

一. PCR的发展历史 PCR技术自问世以来,在遗传病、病原体、癌基因等分子诊断领域和法医鉴定等方面发挥了巨大作用。第一代 PCR在进行扩增后通过凝胶电泳进行定性分析。 随着生物分子荧光技术的发展,1992年实时荧光定量PCR(Quantitative Real-time PCR, qPCR) 应运

什么是数字PCR

数字PCR即Digital PCR(dPCR),它是一种核酸分子绝对定量技术。相较于qPCR,数字PCR可让你能够直接数出DNA分子的个数,是对起始样品的绝对定量。PCR实际上是一个在模板DNA、引物(模板片段两端的已知序列)和四种脱氧核苷酸等存在的情况下,DNA聚合酶依赖的酶促合成反应,扩增的特异