科学家破译山药基因组,深入了解雌雄异株植物

当“飞人”博尔特屡屡获得世界冠军之后,牙买加当地广告语写道:“你想跑得和博尔特一样快吗?吃牙买加山药吧!”山药当然不是博尔特夺冠的秘诀,但却是非洲主要的粮食作物。日前,一个由日本研究人员领导的团队对白色几内亚山药(white Guinea yam)的基因组进行了测序。 尼日利亚的山药产量占世界总产量的70%左右,但目前的消费需求量已超过其产量。破译山药基因组变得至关重要,因为与小麦、玉米和水稻等粮食作物不同,山药尚未被驯化,属于被忽视的“孤儿”作物。了解这种关键植物的基因组学,将有助于农民提高山药的产量和可持续性。 山药是薯蓣科薯蓣属的成员之一。在西非和中非,最受欢迎的种类是白色几内亚山药(Dioscorea rotundata)。然而,这种植物是雌雄异株的,这可能影响了收成。在开花植物中,雌雄异株的植物大约只占5-6%,包括山药和芦笋。 于是,日本岩手生物技术研究中心的Ryohei Terauchi领导的团队分析了几......阅读全文

基因组作图的定义

中文名称基因组作图英文名称genome mapping;genomic mapping定  义确定界标或基因在构成基因组的各条染色体上的位置,以及染色体上各个界标或基因之间的相对距离,绘制遗传连锁图或物理图。应用学科生物化学与分子生物学(一级学科),方法与技术(二级学科)

双义基因组定义

中文名称双义基因组英文名称ambisense genome定  义双链DNA病毒中正义链和反义链同时含有可读框,其间被A-U富集区所分隔的一种基因组结构。应用学科遗传学(一级学科),基因组学(二级学科)

基因组DNA的提取

第一节 概 述DNA的提取通常用于构建文库、Southern杂交(包括RFLP)及PCR分离基因等。利用DNA较长的特性,可以将其与细胞器或质粒等小分子DNA分离。加入一定量的异丙醇或乙醇,的大分子DNA即沉淀形成纤维状絮团飘浮其中,可用玻棒将其取出,而小分子DNA则只形成颗粒状沉淀附于壁上及底部,

镶嵌基因组的定义

中文名称镶嵌基因组英文名称mosaic genome定  义由不同生物基因组的DNA序列经过重新组合而形成的一套杂合的生物体基因。应用学科生物化学与分子生物学(一级学科),核酸与基因(二级学科)

基因组重排的定义

基因组重排将重组的对象从单个基因扩展到整个基因组,可以在更为广泛的范围内对菌种的目的性状进行优化组合。

什么是基因组作图?

中文名称基因组作图英文名称genome mapping;genomic mapping定  义确定界标或基因在构成基因组的各条染色体上的位置,以及染色体上各个界标或基因之间的相对距离,绘制遗传连锁图或物理图。应用学科生物化学与分子生物学(一级学科),方法与技术(二级学科)

功能基因组的定义

表达一定功能的全部基因所组成的DNA序列,包括编码基因和调控基因。

细胞核基因组

  每条染色体含1个DNA分子,1个细胞的全部遗传信息(基因)都编码在线状的DNA分子上。由于每个体细胞中有2套染色体(2n),故所含的DNA是由两个基因组(genome)构成。每个单倍体基因组约含3.2×109bp.人类基因的平均长度为1~1.5kb,所以基因组以足以编码1.5×106蛋白质,但实

PNAS:甜瓜基因组测序

  甜瓜在世界范围具有很高的经济价值,日前西班牙的九个研究中心通力合作,利用罗氏454平台完成了甜瓜基因组的测序。除了甜瓜的全基因组,科学家还得到了 7个特定甜瓜品种的基因组,文章发表在Proceedings of the National Academy杂志上。   联合国粮农组织2009年

前基因组的概念

中文名称前基因组英文名称pregenome定  义某些病毒基因组DNA进入细胞核后,在宿主RNA聚合酶作用下产生的一条作为遗传信息载体的信使核糖核酸(mRNA)。可以通过逆转录形成双链的病毒基因组DNA。应用学科生物化学与分子生物学(一级学科),核酸与基因(二级学科)

基因组DNA的提取

基因组DNA的提取概 述   基因组DNA的提取通常用于构建基因组文库、Southern杂交(包括RFLP)及PCR分离基因等。利用基因组DNA较长的特性,可以将其与细胞器或质粒等小分子DNA分离。加入一定量的异丙醇或乙醇,基因组的大分子DNA即沉淀形成纤维状絮团飘浮其中, 可用玻棒将其取出,而小分

Nature:基因组的“气味”

  问问你身边的十个人,他们是如何寻找自己的伴侣的,也许你会得到十份不同的答案。不过也许他们都错了,一项最新的研究指出,嗅觉系统具有超乎想象的敏感性,能精确鉴别遗传上的相关性,这表明这种能力能为同类识别,伴侣选择,以及其它社会相互联系类型提供必要的信息。   许多方面的动物行为都需要了解

基因组的进化特征

基因组不仅仅是生物体基因的总和,基因组还含有其它可以考虑特定基因及其产物的特征。复制在基因组的塑造过程中起了重要作用。复制的范围包括短串联重复序列的延伸、基因簇的复制、整个染色体甚至整个基因组的复制。这种复制可能是创造遗传新性状的基础。

揭秘基因组“暗物质”

记国家自然科学基金重大研究计划“基因信息传递过程中非编码RNA的调控作用机制”  在人类遗传信息传递过程中,非编码RNA不参与编码蛋白质,占全部RNA的98%,如同宇宙中神秘的“暗物质”,是生命活动调控的“幕后推手”。  2014年起,中国科学家发起重大研究计划,并于2023年底完成结束评估。  在

基因组大小如何确定?

基因组大小是一个拷贝的单倍体基因组中DNA碱基对的总数。基因组大小与原核生物和低等真核生物的形态复杂性呈正相关。然而,在软体动物和上述所有其它高等真核生物之后,这种相关性已不再存在 ,主要是因为重复DNA的缘故。

叶绿体基因组的概念

采用高盐、低pH值法提取雷蒙德氏棉叶绿体DNA;通过物理剪切法获得随机断裂的DNA片段;剪切片段末端、补平修饰后与pCC1FOS载体连接;用噬菌体包装蛋白包装重组DNA,侵染大肠杆菌EPI300,构建了雷蒙德氏棉叶绿体基因组文库。对于叶绿体DNA剪切,以1 mL注射器中等速度吸打18次为最佳参数。

基因组测序仪简介

  基因组测序仪是一种用于生物学领域的分析仪器,于2012年12月19日启用。  技术指标  个体化基因组测序仪主机/ION TORRENT主机。  主要功能  样品处理、快速的运行时间以分析单个或多个样品 支持多重文库,从而实现最大的效率和经济性 可在必要时禁用个别测序通道,以节约试剂用量。

体内基因组编辑介绍

这应该是最受期待的基因治疗方法,即使用基因编辑技术直接修改体内突变的靶DNA,消除致病基因,恢复身体功能。这种方法的优点是可以治愈这种疾病。例如,在亨特综合征或血友病A患者中,尿酸-2-硫酸酯酶(IDS)或凝血因子-8在体内没有正常表达。如果将IDS或八因子基因插入基因组,它可以终身正常表达;缺点是

线粒体基因组的概念

线粒体是真核细胞的一种细胞器,有它自己的基因组,这些基因组统称为线粒体基因组。线粒体内的DNA,可参与蛋白质的合成,转录,与复制,具有较高的研究价值。

核基因组的概念

核基因组是指真核生物细胞核染色体所包含的的全部遗传信息即碱基对,有别于诸如叶绿体和线粒体的质体基因组,以及黏粒及质粒等其他基因组存在形式。

线粒体基因组的简介

线粒体是真核细胞的一种细胞器,有它自己的基因组,编码细胞器的一些蛋白质。除了少数低等真核生物的线粒体基因组是线状DNA分子外(如纤毛原生动物Tetrahymena pyniform和Paramecium aurelia以及绿藻Clam ydoomonas rein—hardtia 等),一般都是一个

表观基因组的概念

中文名称表观基因组英文名称epigenome定  义全基因组的甲基化图谱。应用学科遗传学(一级学科),基因组学(二级学科)

线粒体基因组的简介

  线粒体是真核细胞的一种细胞器,有它自己的基因组,编码细胞器的一些蛋白质。除了少数低等真核生物的线粒体基因组是线状DNA分子外(如纤毛原生动物Tetrahymena pyniform和Paramecium aurelia以及绿藻Clam ydoomonas rein—hardtia 等),一般都是

基因组DNA的定义

中文名称基因组DNA英文名称genomic DNA定  义组成生物基因组的所有DNA。应用学科生物化学与分子生物学(一级学科),核酸与基因(二级学科)

基因组重排的定义

基因组重排将重组的对象从单个基因扩展到整个基因组,可以在更为广泛的范围内对菌种的目的性状进行优化组合。

Nature公布小麦基因组

  利物浦大学、加州大学戴维斯分校等9所研究机构合作对小麦基因组进行了测序,他们的研究将于十一月二十九日在Nature杂志上发表,有望帮助人们增加小麦产量,培育更适应环境变化的品种。   到2050年,世界人口预计会从七十亿增加到九十亿,在可用耕地越来越少的情况下,要满足全球对粮食持续增长的需求,

Nature:水母基因组之谜

太平洋侧腕水母的基因组中缺少很多常见基因。  栉水母基因序列草图的发表揭示了一种与众不同的神经系统。  栉水母(comb jelly)——或栉水母门动物(ctenophore)——看起来就像微小的迪斯科球,它们利用特殊的纤毛推动自己在海洋中游动,并且用粘性触手来捕获更微小的猎物。圣奥古斯丁佛罗里达大

基因组大小如何决定?

基因组大小是一个拷贝的单倍体基因组中DNA碱基对的总数。基因组大小与原核生物和低等真核生物的形态复杂性呈正相关。然而,在软体动物和上述所有其它高等真核生物之后,这种相关性已不再存在,主要是因为重复DNA的缘故。

认识泛基因组测序

什么是泛基因组?2005年,Tettelin等人提出了微生物泛基因组概念(pangenome,pan源自希腊语‘παν’,全部的意思),泛基因组即某一物种全部基因的总称。2009 年,Li等人首次采用新全基因组组装方法对多个人类个体基因组进行拼接,发现了个体独有的DNA序列和功能基因,并首次提出了“

基因组重排的原理

1998年Maxygen公司的Stemmer等人提出了一种新的分子育种方法——全基因组重排技术,这种技术是分子定向进化在全基因组水平上的延伸,它将重组的对象从单个基因扩展到整个基因组-,因此可以在更为广泛的范围内对菌种的目的性状进行优化组合。基因组重排技术主要在传统诱变的基础上与原生质体融合相结合进