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PNAS:甜瓜基因组测序

甜瓜在世界范围具有很高的经济价值,日前西班牙的九个研究中心通力合作,利用罗氏454平台完成了甜瓜基因组的测序。除了甜瓜的全基因组,科学家还得到了 7个特定甜瓜品种的基因组,文章发表在Proceedings of the National Academy杂志上。 联合国粮农组织2009年的数据显示,世界范围内的甜瓜产量为每年两千六百万吨,是重要的农业经济作物。 甜瓜基因组测序结果显示,其基因组拥有四亿五千万个碱基对和27.427个编码基因。研究人员通过重建22,218个系统进化树,对甜瓜与其已测序的直系和旁系亲属进行了比较分析。甜瓜亲缘最近的是黄瓜,而甜瓜基因组比黄瓜基因组要大得多,黄瓜基因组只有约三亿六千万碱基对。研究人员发现这两种作物的基因组大小差异,主要是由转座子扩增引起的。此外,研究人员没有在甜瓜基因组中发现近代倍增现象,而这一现象在植物中很常见。 研究人员鉴定了与甜瓜抗病能力相关的411个基因。......阅读全文

花生二倍体野生种全基因组测序完成

  国际花生基因组计划(International Peanut Genome Initiative, IPGI)——由多国作物遗传学家参与的国际团队,于2014年4月2日宣布,历经数年努力后成功完成了世界上首个花生全基因组测序。新测定的花生基因组序列将为世界各地的研究人员和植物育种者使用,来促

作物基因组学研究进展

  摘要:农作物基因组学研究的发展,对于有效利用现代分子生物学手段进行物种的遗传改良发挥了重要作用。随着测序技术的发展,已经实现对重要农作物,如水稻、小麦、玉米、大豆、油菜、棉花、蔬菜等作物基因组的测序或重测序,在此基础上完成对控制重要农艺性状基因的克隆和鉴定。本文综述了2017年度主要农作物基因组

Nature:系统解析斑马鱼参考基因组

  斑马鱼(Zebrafish)是研究发育生物学的新兴模式动物。斑马鱼由于具有饲育容易、胚胎透明、体外受精、突变种多、遗传学工具成熟等诸多优点,近年来已成为研究脊椎动物发育与人类遗传疾病的新兴模式动物。   近日,英国桑格研究所(Wellcome Trust Sanger Institute)

盘点:2012年顶尖基因组研究

  基因组研究是一门新兴的、发展迅速的生命科学,其普遍应用及向其他学科、领域的不断渗透日趋明显,这些学科涵盖了现代农业、生物能源、生态环境和人类健康等各个方面。随着测序成本的下降,基因组研究成果也呈现井喷之势。近日The Scientist对2012年最突出的基因组研究进行了盘点……   1.

最新Nature完成四个基因组测序成果

  高通量低成本测序技术令物种基因组测序研究一日千里,在最新公布的Nature杂志(11月29日)上,就接连公布了四种生物的基因组,它们分别是小麦和大麦,以及两种小型藻类:Bigelowellia natans 和Guillardia theta。   根据来自世界粮农组织的信息,小麦与大麦在

今夏最热门的基因组测序研究,中国学者再立新功

  大千世界无奇不有,这都是进化的功劳。大航海时代,科学家们扬帆远航去探索大自然的神奇造化。如今,科学家们正在测序技术的帮助下进一步揭示生命的奥秘。The scientist杂志对近期最热门的一些基因组测序成果进行了盘点,我国学者参与的两项测序研究格外引人注目。  种属:虎鲸(Orcinus orc

作物基因组学研究进展(二)

⑵小麦基因组研究小麦是全球最重要的粮食作物之一,小麦的稳产和增产对我国乃至全世界粮食安全的影响举足轻重。近年来由于全球气候变化、环境变化的影响,小麦生产面临严峻的挑战,对于小麦的育种和品种改良工作提出了新的要求。普通小麦(Triticum aestivum L.)是3个不同亚基因组形成的异源

华大基因、卡迪夫大学联合发表Nature子刊新文章

  来自英国卡迪夫大学、深圳华大基因研究所等处的研究人员近日完成了对游隼和猎隼的基因组测序,提供了关于捕食生物生活方式演变的一些新认识,相关论文“Peregrine and saker falcon genome sequences provide insights into evolution o

The Scientist:最热门基因组研究

  The Scientist杂志是由科学信息研究所(ISI,现为汤姆森路透科技集团)的创始人Eugene Garfield于1986年创办的一份双周刊报纸,后又转变为一本每月出版的杂志,同时伴有每日更新的在线新闻。主要刊登生命科学相关信息,并帮助科学家分析研究的,以协助决策影响他们的

The Scientist:最热门基因组研究

  The Scientist杂志是由科学信息研究所(ISI,现为汤姆森路透科技集团)的创始人Eugene Garfield于1986年创办的一份双周刊报纸,后又转变为一本每月出版的杂志,同时伴有每日更新的在线新闻。主要刊登生命科学相关信息,并帮助科学家分析研究的,以协助决策影响他们的工作生活。

The scientist:近期最受关注的基因组测序 TOP5

  The scientist杂志集中盘点了近期最受关注的一些基因组测序成果,包括山地大猩猩、绿脓杆菌、金丝雀等。  种属:山地大猩猩(Mountain gorilla)  获得东部大猩猩的一个亚种群——山地大猩猩的第一个全基因组序列,揭示出在10万年的时间里这一种群一直在衰退,因此导致了有限的遗传

西北农林科技大学PLOSGenetics发表红枣基因组序列测序结果

高品质的干枣基因组序列,以及从其近缘种树木的基因序列,能够阐明这种人类已经种植超过7000年的古老果树的驯化历史。近期,西北农林科技大学与美国康奈尔大学Boyce Thompson植物研究(BTI)以及北京林业大学的研究人员合作,对中国干枣进行了基因组测序,相关结果发表在12月22日的《PLOS G

最新基因组测序成果盘点

  近来,各大杂志上陆续发表了不少重要的基因组测序成果。the scientist杂志对此进行了盘点,以飨读者。   种属:野鸭,绿头鸭(Anas platyrhynchos)   基因组:约13 billion bp   鸭子是几乎所有甲型流感病毒的天然宿主(包括H5N1)。日前,研究人员测

最新Nature公布两大基因组测序结果

  6月11日的Nature杂志公布了两项重要的基因组测序结果:巨桉树基因组,以及栉水母“太平洋侧腕水母”的基因组,这些遗传信息的解析将有助于我们更深入的了解生物功能基因变异,以及相关经济产物的作用机理。  来自佛罗里达大学的研究人员发表了栉水母“太平洋侧腕水母”(Pleurobrachia bac

科学家开发新的宏基因组分析工具

  对环境样品(如海水、医院表面和人类肠道)直接进行微生物测序,已经阐明了我们世界中存在的大量微生物。然而,一个微生物物种可能存在遗传多样性,而在宏基因组分析中往往捕获不到这种多样性。最近在《Genome Research》发表的一项研究中,科学家们开发了一种新的工具,来检测细菌物种内的遗传差异,并

科学家首次测绘“一家四口”基因组

  美国《科学》杂志网站3月10日介绍说,美国研究人员首次为一个四口之家进行了全基因组测序,这种以家庭为单位的基因组分析将为遗传学及相关疾病研究提供更多有价值的信息。   来自美国“系统生物学研究所”的研究人员在10日发布的一份新闻公报中说,他们与基因组测序公司合作,对一对夫妻和他们的两个孩子进行

The scientist:2013年度最热基因组

  新的一年即将来临,The scientist杂志盘点了2013年度的高引基因组研究,让我们看看今年又有哪些新解码的基因组受到热捧。   斑马鱼基因组   种属:Zebrafish, Danio rerio   基因组大小:~1.41 billion base pairs   斑马鱼(Da

SMRT测序改善CRISPR效果的评估

  新兴的CRISPR技术在短短一年多的时间内掀起了基因组编辑的热潮。然而,对于这些基因改造手段的效率和结果,我们仍难以评估。目前的一些工具如荧光报告基因、克隆分析,缺乏生成报告细胞系时所需的灵敏度。高通量测序方法虽然能克服这一问题,但无奈读长太短,而供体DNA模板往往很长。   到目前为止,还没

SMRT测序:评估基因编辑效果的新利器

  新兴的CRISPR技术在短短一年多的时间内,掀起了基因组编辑的热潮。然而,对这些基因改造手段的效率和结果,我们仍难以评估。目前的一些工具,如荧光报告基因、克隆分析,缺乏生成报告细胞系时所需的灵敏度。高通量测序方法虽能科服这一问题,但无奈读长太短,而供体DNA模板往往很长。   目前,还没有一种

宏基因组学:查明微生物身份新手段

  背景   《美国医学会杂志》(JAMA)近期刊发了一篇题为《利用不需培养的宏基因组学测序技术研究产志贺毒素大肠杆菌O104∶H4暴发株》的研究论文,引起了学界和社会的广泛关注。这篇论文中应用了一种称为“宏基因组学”的技术方法,不通过培养,直接从病人样品中检测分析其携带的病原微生物,甚至可以

天大化学再造酵母走向应用 自然通讯 研究长文同期发表

  本站讯 2018年5月22日,天津大学元英进教授带领的合成生物学研究团队在《自然通讯》期刊同期发表三篇研究长文,文中介绍了精确控制基因组重排技术等一系列研究成果。该成果填补了基因组结构变异的技术空白,提高了细胞工厂的生产效率,加速了微生物的进化和生物学知识的发现。这是继人工合成酵母染色体打破非生

最新果蝇基因组测序,展现奇妙的进化

  对真核生物进行全基因组测序在二十世纪还是一项了不起的大工程,直到2000年末人们还只完成了四项这样的研究。不过自那以后,测序技术的飞速进步使全基因组测序对于许多研究团队来说触手可及,现在每隔不久就会涌现出一项新的测序成果。日前,维也纳兽医大学Christian Schlötterer研究组的

科学家测绘"一家四口"基因组

杂志网站3月10日介绍说,美国研究人员首次为一个四口之家进行了全组,这种以家庭为单位的基因组将为遗传学及相关疾病研究提供更多有价值的信息。 来自美国“系统学研究所”的研究人员在10日发布的一份新闻公报中说,他们与基因组测序公司合作,对一对夫妻和他们的两个孩子进行了全基因组测序。这家的两个孩子都患

玉米基因组更详细图谱出炉

  美国研究人员12日在《自然》杂志网络版上发表论文称,他们利用新一代测序技术对玉米自交系B73进行测序,得到了新的、更详细的基因组图谱。研究显示,玉米具有良好的表型可塑性,不同品系玉米的基因组差异明显。这意味着在全球气候环境变化不断加剧的情况下,玉米仍有巨大的发展空间。  玉米是生物学研究中的重要

玉米基因组更详细图谱出炉

  美国研究人员12日在《自然》杂志网络版上发表论文称,他们利用新一代测序技术对玉米自交系B73进行测序,得到了新的、更详细的基因组图谱。研究显示,玉米具有良好的表型可塑性,不同品系玉米的基因组差异明显。这意味着在全球气候环境变化不断加剧的情况下,玉米仍有巨大的发展空间。  玉米是生物学研究中的重要

盘点近期最热门的基因组测序成果

  The scientist杂志对近期最热门的一些基因组测序成果进行了盘点,包括碎米荠、远东豹、中国甘草、光肩星天牛和黑花蝇。  种属:碎米荠(Cardamine hirsuta)  基因组大小:1亿9800万个碱基对  上个月(10月31日),欧洲的研究人员在《Nature Plants》上发表

Nature:科学家完成云杉超大基因组草图

  在超过两亿年的历史中,极具生态重要性的松柏类植物在森林中占据着统治地位。   现在,瑞典斯德哥尔摩大学生命科学实验室(Science for Life Laboratory)和于默奥植物科学中心(Umeå Plant Science Centre)的科学家完成了对挪威云杉(Picea

北京基因组研究所Plant cell基因组研究新成果

  来自中科院北京基因组研究所、荷兰瓦赫宁根大学和中科院/马普学会等10多家机构的研究人员组成的一个研究小组,通过测序及分析醉蝶花(Tarenaya hassleriana)的基因组提供了关于十字花科植物繁殖性状和基因组进化的新认识。相关研究发表在植物学权威期刊The Plant Cell杂志上

高血压新突破:吸烟行为确定调节高血压的关键基因

  研究人员利用一项技术,为人类基因组的复杂性分析打开了大门,研究人员发现了几十种影响血压的新遗传变异。科学家们发现了新的基因区域,并通过观察吸烟行为,证实了许多已知的基因区域的作用,吸烟是影响血压的许多生活方式因素之一。  该研究由美国国家心脏,肺和血液研究所(NHLBI),国立卫生研究院的一部分

癌细胞线粒体DNA漂移的分子机理

  通过对57例结肠癌患者的基因组进行基因分析,研究人员发现患者体细胞核内的平均线粒体DNA数量比健康人高4.42倍。“这表明,迁移到核基因组中的线粒体DNA可能对癌症的发展起重要作用,”本文的共同作者,来自UAB公共卫生学院的生物统计学教授Hemant K. Tiwari博士和UAB医学院遗传学教