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华大智造测序仪适配10XGenomics的Chromium系统

2018年1月8日,在中国深圳和美国普莱森顿,华大智造(MGI)和10X Genomics公司同时宣布BGISEQ-500RS与10X Genomics设备的linked reads技术和单细胞转录组建库技术兼容。同时,华大表示,在第12届国际基因组学大会上发布的MGISEQ-2000和MGISEQ-200也将兼容10X Genomics系统。这两款测序仪预计在2018年2月正式发售, 华大希望通过华大系列测序仪进一步降低高通量测序成本。 “华大智造已经拥有四款高通量测序仪,能够支持研究者开发更多的测序应用。通过与10X Genomics合作,华大智造能为单细胞研究者提供更多的选择空间。”华大智造CEO牟峰说。华大测序产品将具备兼容Chromium系统的能力,与单细胞3’端测序技术联合,能在细胞层面发现更多的基因表达模式。 “对我们客户来说,采用严格的标准来衡量10X Genomics搭配的测序仪是非常重要的,所以我们在......阅读全文

多种测序技术成就高质量的蚊子基因组

  提起蚊子,相信大家没有爱只有恨吧。这种恼人的生物不仅会吵得你睡不好觉,还会传播多种疾病。每年全球大约有4亿人感染由埃及伊蚊(Aedes aegypti)传播的病毒,包括登革热、黄热病、寨卡和基孔肯雅病毒。  为了更好地了解蚊子背后的生物学,并开发消灭蚊子的工具,由洛克菲勒大学领导的国际研究团队本

2018年基因组测序盘点——各种有趣的动物

  2018年,各国科学家继续卯足了劲,对本国的珍(qi)稀(pa)动物进行基因组测序。他们的目标是保护濒危动物(如考拉、金枪鱼),对付入侵物种(如小龙虾、海蟾蜍),抑或是从中发现长寿的秘密(如乌龟、鹦鹉)。  与之前采用单一技术的研究不同,如今的基因组测序研究大多结合Illumina短读长和Pac

华大智造测序仪适配10X Genomics的Chromium系统

  华大智造(MGI)和10X Genomics公司同时宣布BGISEQ-500RS与10X Genomics设备的linked reads技术和单细胞转录组建库技术兼容。  2018年1月8日,在中国深圳和美国普莱森顿,华大智造(MGI)和10X Genomics公司同时宣布BGISEQ-500R

2017年度十大医疗发明:从CAR-T芯片到10倍基因组

  科学家杂志(The Scientist)评选出了2017年度的十大医疗技术发明。他们是:  1. IsoCode芯片:分析CAR-T细胞的芯片    今年二月由Isoplexis公司推出,它包含数千个只能容纳单细胞的微型腔室。在每个微室内,15个分离空间的槽内包含多达三种针对特定分泌蛋白的不同抗

王建斌/黄岩谊合作组比较液滴超高通量单细胞RNA测序

  自2009年汤富酬研究员首次报道其开创性工作【1】以来,单细胞RNA测序技术已经逐渐成为生物医学研究的重要方法,其在发育生物学和干细胞领域展现出强大的应用前景。随着单细胞转录组扩增方法的不断优化,以及测序通量的持续提升,研究人员已经不再满足于几十甚至几百个单细胞所提供的信息量。2015年以来,一

中国学者Cell发文 揭示肝癌免疫微环境的动态特征

   2019年10月31日,北京大学生物医学前沿创新中心(BIOPIC)、北大-清华生命科学联合中心、生命科学学院、北京未来基因诊断高精尖创新中心(ICG)张泽民课题组联合首都医科大学附属北京世纪坛医院彭吉润课题组以及德国药企勃林格殷格翰公司多位科学家,在国际期刊Cell上发表了题为Landsca

单细胞测序——“刻画”肝癌免疫微环境的动态特征

  肝细胞癌是世界范围内死亡率排名第三的癌症,其中中国的肝癌发病率居世界之首【1】。HBV的慢性感染是中国肝细胞癌发生的主要原因,其感染导致肿瘤微环境常伴随慢性炎症。免疫逃逸被认为是癌症发展的标志之一,目前研究表明,肿瘤存在多种免疫逃逸机制,提出了研究肿瘤微环境中不同免疫细胞状态的重要性【2】。而单

全球测序行业10大巨头:Illumina第一Thermo第二 中国占2席

  近日,GEN网站推出“Top 10 Sequencing Companies”榜单,盘点了全球测序行业10大巨头。其中,Illumina拔得头筹,中国企业占得2个席位,分别是华大基因(排名第3)、金唯智(排名第8)。图片来源:16sucaiwang  近年来,随着“精准医疗”的深入布局,基因测序

全球测序行业的10大巨头,中国占2席

近日,GEN网站推出“Top 10 Sequencing Companies”榜单,盘点了全球测序行业10大巨头。其中,Illumina拔得头筹,中国企业占得2个席位,分别是华大基因(排名第3)、金唯智(排名第8)。图片来源:16sucaiwang近年来,随着“精准医疗”的深入布局,基因测序行业市场

Nature Genetics:多种技术解析草莓基因组

  近日,美国密歇根州立大学和加州大学戴维斯分校的研究人员组装出近乎完整的栽培草莓基因组,并揭示了这种复杂的异源多倍体的起源和进化过程。  一转眼又到了草莓上市的季节。这种小巧可爱的果实有着酸甜可口的味道,可搭配出各种各样的美妙滋味。不过,对于草莓的基因组,你又了解多少?  世界各地广泛种植的凤梨草

单细胞测序方法这么多,用户该如何选择?

  生物分子资源实验室协会(ABRF)是一个独特的会员协会,由700多名在资源和科研生物技术实验室工作的科学家组成。近日,ABRF 2019年会在美国圣安东尼奥市举行。与会人员称,研究人员目前有越来越多的单细胞测序方法可供选择。  去年,ABRF的基因组学研究小组以乳腺癌细胞系为研究对象,报告了多个

【综述】2016年新一代测序技术

  新一代测序几乎影响了生物学领域的每一个角落,科学家们用这一技术测序基因组、评估遗传学变异、定量基因表达、研究表观遗传学调控和探索微观生命。新一代测序市场如今异常繁荣,但开发者们并没有停下自己的脚步。在最近的基因组生物学技术进展年会(AGBT)上,各大公司纷纷推出了自己的新产品。这些创新旨在推动新

高通量测序技术的原理及各平台优势和实践应用的分析

  随着人类基因组计划(human genome project )在2003年顺利完成,基因组测序技术取得了长足的进步,这直接导致了每兆基因组成本的大幅下降以及检测的基因组数量越来越多。人们对基因组的复杂性深感震惊,这也引导着测序技术的进一步发展。最近的一些突破性技术使得测序技术在更短的时间内可以

高通量测序技术的原理及各平台优势和实践应用的分析

  随着人类基因组计划(human genome project )在2003年顺利完成,基因组测序技术取得了长足的进步,这直接导致了每兆基因组成本的大幅下降以及检测的基因组数量越来越多。人们对基因组的复杂性深感震惊,这也引导着测序技术的进一步发展。最近的一些突破性技术使得测序技术在更短的时间内可以

高通量测序技术的原理及各平台优势和实践应用的分析 5

图5: 长读长实时测序原理。长reads的合成与真正测序的平台不同的是,合成长读长技术依赖于一个barcode系统来结合不同的片段,通过已有的短读长测序仪来获得长读长reads61。该方法将大的DNA分子分割成若干个小片段到微孔中或者乳液中。每个微孔或者乳液中的模板被切割并且加上了barcodes。

单细胞精度解析人类T淋巴细胞起源及胸腺器官发生

  T淋巴细胞是宿主适应性免疫系统中最重要的免疫细胞之一,在抵抗病原入侵、维持机体稳态以及抗肿瘤等方面起到不可或缺的作用【1,2】。胸腺是T淋巴细胞发育的必需场所【3】。胎肝或骨髓来源的胸腺定植祖细胞(thymus seeding progenitor, TSP)迁移定植到胸腺后,即为早期胸腺祖细胞

10x Genomics独创短读序列技术 两年收入增涨20倍

  近日,基因检测初创公司10x Genomics又筹集了3500万美元。本次融资是该公司D轮融资的延续,10x Genomics将用这笔资金继续推进研发工作和扩大产品营销。  在2018年4月,10x Genomics就已筹集了5000万美元的D轮融资,由Meritech Capital领投,Fi

单细胞转录组测序(scRNA-seq)的十个问答解惑

  高通量组学研究已经发展了快20年,从最开始的基因芯片到二代测序,从编码基因到lncRNA,circRNA,从三代测序的出现到单细胞组学研究的火热,相信在这个领域中共事的小伙伴们都深有感触。大家都知道高通量单细胞测序现在很火,但是不是所有的研究都适用,是不是所有的样本都能进行单细胞测序呢?本期小编

单细胞转录组测序(scRNA-seq)的十个问答解惑

高通量组学研究已经发展了快20年,从最开始的基因芯片到二代测序,从编码基因到lncRNA,circRNA,从三代测序的出现到单细胞组学研究的火热,相信在这个领域中共事的小伙伴们都深有感触。大家都知道高通量单细胞测序现在很火,但是不是所有的研究都适用,是不是所有的样本都能进行单细胞测序呢?本期小编带来

盘点:全球十大顶尖基因测序公司

  新一代测序(NGS)的市场规模到底有多大?据BCC Research统计,到2022年NGS市场将达到105亿美元。MarketsandMarkets则更加乐观一些,估计届时将达到124.5亿美元。不过BIS Research的预测较为保守,认为市场增长速度将相对缓慢一些,预计2024年达到11

单细胞分离技术

单细胞测序日趋火爆的原因很大程度上得益于单细胞分离技术的不断完善。这一讲,我们将跟大家一起回顾传统的单细胞分离技术,并重点介绍单细胞分离技术的新宠微孔芯片技术及微流控技术。图1为目前常见单细胞分离设备。图1:目前常见单细胞分离设备传统单细胞分离技术相信许多实验人员,都见过下面我们要介绍的传统的单细胞

《科学家》期刊:2018 top 10创新产品

随着大数据和全基因组测序的发展成熟和大量研究的广泛开展,有时不免让人觉得研究人员将他们的显微镜(microscope)更换为宏观镜(macroscope)。但是,《科学家》杂志举办的2018年十大创新竞赛讲述了一个不同的故事:单个细胞。在《科学家》杂志的独立评审团评选出的2018年十大创新产品中,它

张锋等四位权威专家评定!2018 十大发明!

  随着大数据、全基因组测序等越来越“大”的手段被利用到研究中,我们在看待研究上好像也站在越来越“大”的视角上。  这次让我们把视角缩小到一个细胞上,看看下面这些帮助研究者“撬开”细胞,研究更细微的核酸与蛋白质的“神兵利器”们,它们是由 The Scientists Magazine 评选出的 20

单细胞RNA测序,众多研究都pick它

  多细胞测序和单细胞测序,你pick谁?如今,大多数研究人员也许会选择后者,因为不一样的角度,会带来不一样的见解。  多细胞测序和单细胞测序,你pick谁?如今,大多数研究人员也许会选择后者,因为不一样的角度,会带来不一样的见解。单细胞测序的最初动力来自癌症研究,可帮助人们了解肿瘤异质性和肿瘤微环