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单细胞转录组测序(scRNAseq)的十个问答解惑

高通量组学研究已经发展了快20年,从最开始的基因芯片到二代测序,从编码基因到lncRNA,circRNA,从三代测序的出现到单细胞组学研究的火热,相信在这个领域中共事的小伙伴们都深有感触。大家都知道高通量单细胞测序现在很火,但是不是所有的研究都适用,是不是所有的样本都能进行单细胞测序呢?本期小编带来单细胞测序Q&A。 Q1:为什么要进行单细胞测序? A1:单细胞,就是从单个细胞出发去做研究。细胞是组成生命体的最基本单元,从基本单元出发去研究,才能从小到大,以点到面,从局部到整体去理解生物学问题。曾经有朋友给我看了下面的图片,形象地展示了从Bulk研究到单细胞研究的必要性。 Q2:单细胞测序能做哪些层面的检测? A2:单细胞研究现在最多的是转录组研究,称为scRNA-seq的方法进行单细胞转录组测序。当然,虽然已发表的研究很多,但可实现的检测还有染色质可接近性检测(chromatin access......阅读全文

单细胞转录组测序(scRNA-seq)的十个问答解惑

高通量组学研究已经发展了快20年,从最开始的基因芯片到二代测序,从编码基因到lncRNA,circRNA,从三代测序的出现到单细胞组学研究的火热,相信在这个领域中共事的小伙伴们都深有感触。大家都知道高通量单细胞测序现在很火,但是不是所有的研究都适用,是不是所有的样本都能进行单细胞测序呢?本期小编带来

单细胞转录组测序(scRNA-seq)的十个问答解惑

  高通量组学研究已经发展了快20年,从最开始的基因芯片到二代测序,从编码基因到lncRNA,circRNA,从三代测序的出现到单细胞组学研究的火热,相信在这个领域中共事的小伙伴们都深有感触。大家都知道高通量单细胞测序现在很火,但是不是所有的研究都适用,是不是所有的样本都能进行单细胞测序呢?本期小编

RNA-seq综述(六)

单细胞分析scRNA-seq于2009年首次报道,当时的研究者在含有裂解缓冲液的EP管中分离了单个卵母细胞。单细胞测序对生物学新问题的解释,以及现有的实验室和计算方法以极快的速度发展,甚至最近几年综述都已经过时了。每种scRNA-seq方法都需要将实体组织进行分离,分离出单个细胞(使用不同的方法),

9102,《Nature Methods》上scRNA-seq“天天”见

  《Nature Methods》是专门用来对生命科学研究领域具有显著性意义的新方法和研究技术改进的经典杂志。单细胞转录组测序是2019年不折不扣的热点领域,截至2019年9月,Nature Methods总共发表了10篇关于单细胞转录组测序相关的研究报道。本期,小编和大家一起分享这些重要的研究成

华大基因再出手 单细胞转录组学测序技术的系统分析

  单细胞转录组测序(Single-cell RNA-seq)是在单细胞水平对转录组(mRNA)进行测序的一项新技术,可发现细胞群体中真正起作用的细胞,特别适合对高度异质性的干细胞、肿瘤细胞及胚胎发育早期的细胞群体进行研究,认识细胞分子机制和基因调控网络。单细胞RNA-seq技术需要在测序前制备文库

9102,《Nature Methods》上scRNA-seq“天天”见

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研究开发单细胞测序分析TEs表达的工具包

  中国科学院广州生物医药与健康研究院(以下简称广州健康院)陈捷凯课题组和南方科技大学Andrew Hutchins课题组合作开发出单细胞测序分析转座元件表达的工具包scTE。相关研究3月5日发表于《自然—通讯》。据悉,生物岛实验室副研究员何江平为该论文第一作者,陈捷凯、Andr

单细胞检测技术在肿瘤研究中的新挑战和新方向

  单细胞转录组研究是近期生命科学领域运用最火的组学检测技术之一,来自麻省总医院和哈佛医学院的研究人员在《Molecular Cell》(Suva and Tirosh 2019)上讨论了单细胞转录组测序技术在肿瘤研究中的经验与未来挑战。在此,我们对该review中的部分内容进行解读和分享。   

广州生物院开发出单细胞测序分析转座元件表达的工具包

  3月5日,中国科学院广州生物医药与健康研究员研究院陈捷凯课题组与南方科技大学研究员Andrew Hutchins课题组合作,开发出单细胞测序分析转座元件表达的工具包scTE。相关研究成果以Identifying transposable element expression dynamics a

单细胞RNA测序,众多研究都pick它

  多细胞测序和单细胞测序,你pick谁?如今,大多数研究人员也许会选择后者,因为不一样的角度,会带来不一样的见解。  多细胞测序和单细胞测序,你pick谁?如今,大多数研究人员也许会选择后者,因为不一样的角度,会带来不一样的见解。单细胞测序的最初动力来自癌症研究,可帮助人们了解肿瘤异质性和肿瘤微环