『合成生物』精准微调遗传电路工具包

他们创建了一个启动子库,其中富含许多模块,每种模块可以对一种或多种化学输入做出特殊反应,通过自定义动态区间设计,实现内部代谢通量微调控制,甚至能构建出“无渗漏”启动子操纵基因电路。 “益生菌在很多方面影响人类健康,许多合成生物学家都在研究可用于疾病诊断或治疗的工程益生菌,让微生物在人体内生产药物或其他复杂分子,以对抗癌症、炎症性肠病等疾病,”Rice大学生物学教授Matthew Bennett说。 “合成生物学家需要创造根据环境线索自动开启或关闭的基因,”他说。“它们将作为益生菌的传感器,指导它们在何时何地进行药物生产。” 以埃希氏大肠杆菌(Escherichia coli)为研究对象,Bennett的研究生Ye Chen、博后研究员Joanne Ho等人正在运用模块化分子拼图的方式创造调节基因表达开启/关闭的启动子。 虽然基因电路在某些方面类似电子电路,但这些分子元件的开和关却相对比较复杂。基因本身无法直接转化为蛋......阅读全文

用λ噬菌体-PL-启动子在大肠杆菌中表达克隆基因实验

实验材料 载体和细菌菌株PL 表达载体阳性对照质粒试剂、试剂盒 考马斯亮蓝染色溶液或银染溶液L-色氨酸SDS 凝胶加样缓冲液SDS-聚丙烯酰胺凝胶靶基因或 cDNA 片段LB 琼脂平板LB 培养基M9 基本培养基仪器、耗材 SorvallGSA 转头或相当的转头沸水浴振荡培养器实验步骤 材料缓冲液和

用λ噬菌体-PL-启动子在大肠杆菌中表达克隆基因实验

            实验材料 载体和细菌菌株 PL 表达载体 阳性对照质粒 试剂、试剂盒 考马斯亮蓝染色溶液或银染溶液

用λ噬菌体-PL-启动子在大肠杆菌中表达克隆基因实验

λ噬菌体 PL 启动子是受控于温度敏感阻抑物(cIts857) 的强效启动子,阻抑物可在低温下阻抑 PL 启动子的转录,但在髙温下不能。因此带有λ噬菌体启动子的载体必须以带有 cIts857 基因的菌株作为宿主。本实验来源于分子克隆实验指南(第三版)下册,作者:〔美〕J. 萨姆布鲁克 D.W. 拉塞

用-IPTG-诱导启动子在大肠杆菌中表达克隆化基因实验

实验材料 带有 lacIq 或 lacIq1 等位基因的适于转化的大肠杆菌菌株IPTG 诱导的表达载体试剂、试剂盒 考马斯亮蓝染色溶液或银染溶液IPTGSDS 凝胶加样缓冲液SDS-聚丙烯酰胺凝胶靶基因或 cDNA 片段LB 琼脂平板LB 培养基仪器、耗材 SorvallGSA 转头或相当的转头沸水

用-IPTG-诱导启动子在大肠杆菌中表达克隆化基因实验

本方案将在疑难解析和诱导启动子表达蛋白的优化部分讨论影响质粒表达效率的因素。本实验来源于分子克隆实验指南(第三版)下册,作者:〔美〕J. 萨姆布鲁克 D.W. 拉塞尔。实验材料带有 lacIq 或 lacIq1 等位基因的适于转化的大肠杆菌菌株IPTG 诱导的表达载体试剂、试剂盒考马斯亮蓝染色溶液或

用-IPTG-诱导启动子在大肠杆菌中表达克隆化基因实验

            实验材料 带有 lacIq 或 lacIq1 等位基因的适于转化的大肠杆菌菌株 IPTG 诱导的表达载体 试剂、试剂盒

用-T7-噬菌体启动子在大肠杆菌中表达克隆基因实验

实验材料 大肠杆菌菌株 HMS174(DE3) 或 BL21(DE3)pET 载体或同类载体阳性对照质粒试剂、试剂盒 考马斯亮蓝染色溶液或银染溶液IPTGSDS 凝胶加样缓冲液SDS-聚丙烯酰胺凝胶靶基因或 cDNA 片段NZCYM 琼脂平板NZCYM 培养基仪器、耗材 SorvallGSA 转头或

用-T7-噬菌体启动子在大肠杆菌中表达克隆基因实验

            实验材料 大肠杆菌菌株 HMS174(DE3) 或 BL21(DE3) pET 载体或同类载体 阳性对照质粒 试剂、试剂盒

用-T7-噬菌体启动子在大肠杆菌中表达克隆基因实验

Tabor 和 Richardson 在 1985 年及 Studier 和 Moffatt 在 1986 年提出了一个新的利用 T7 噬菌体启动子的表达系统,使用的是从 T7 噬菌体基因组获得的转录信号。本实验来源于分子克隆实验指南(第三版)下册,作者:〔美〕J. 萨姆布鲁克 D.W. 拉塞尔。实

启动子分类介绍

①组成型启动子(constitutive promoter)是指在该类启动子控制下,结构基因的表达大体恒定在一定水平上,在不同组织、部位表达水平没有明显差异。使用最广泛的组成型启动子是花椰菜花叶病毒(CaMV)35S 启动子、来自根癌农杆菌Ti 质粒T-DNA 区域的胭脂碱合成酶基因nos 启动子,

启动子分类介绍

①组成型启动子(constitutive promoter)是指在该类启动子控制下,结构基因的表达大体恒定在一定水平上,在不同组织、部位表达水平没有明显差异。使用最广泛的组成型启动子是花椰菜花叶病毒(CaMV)35S 启动子、来自根癌农杆菌Ti 质粒T-DNA 区域的胭脂碱合成酶基因nos 启动子,

启动子阻抑的定义

中文名称启动子阻抑英文名称promoter suppression定  义由于转录抑制因子的作用或甲基化修饰等使启动子活性减弱或丧失。应用学科生物化学与分子生物学(一级学科),基因表达与调控(二级学科)

翻滚启动子的定义

中文名称翻滚启动子英文名称flip-flop promoter定  义可颠倒的启动子。最早见于沙门氏菌的两种鞭毛蛋白基因的交替表达。这些基因都受一个可以颠倒的DNA片段控制,在一个顺式作用因子的调节下,这个片段从不同的方向驱动不同基因的表达,后来发现奇异变形杆菌的氯霉素抗性基因和珠蛋白基因等基因的表

启动子阻抑的定义

中文名称启动子阻抑英文名称promoter suppression定  义由于转录抑制因子的作用或甲基化修饰等使启动子活性减弱或丧失。应用学科生物化学与分子生物学(一级学科),基因表达与调控(二级学科)

启动子封堵的定义

中文名称启动子封堵英文名称promoter occlusion定  义上游启动子对下游启动子的阻碍作用。应用学科生物化学与分子生物学(一级学科),基因表达与调控(二级学科)

启动子解脱的定义

中文名称启动子解脱英文名称promoter escape定  义发生在真核生物基因转录起始过程后期的一个现象,即转录起始复合体形成后RNA聚合酶从启动子上脱离,此后RNA聚合酶不再依赖启动子就能继续完成转录,但是转录的速度也因此而受到限制。应用学科生物化学与分子生物学(一级学科),基因表达与调控(二

启动子封堵的概念

中文名称启动子封堵英文名称promoter occlusion定  义上游启动子对下游启动子的阻碍作用。应用学科生物化学与分子生物学(一级学科),基因表达与调控(二级学科)

启动子解脱的定义

中文名称启动子解脱英文名称promoter escape定  义发生在真核生物基因转录起始过程后期的一个现象,即转录起始复合体形成后RNA聚合酶从启动子上脱离,此后RNA聚合酶不再依赖启动子就能继续完成转录,但是转录的速度也因此而受到限制。应用学科生物化学与分子生物学(一级学科),基因表达与调控(二

启动子的功能介绍

一个启动子是一组DNA序列能使一个基因进行转录。启动子是由RNA聚合酶所确认,并且引发转录。在RNA的合成中,启动子是一种方法区分哪一个基因用作制造mRNA,及进而控制细胞制造哪一种蛋白质。

杂合启动子的定义

中文名称杂合启动子英文名称hybrid promoter定  义由两种或两种以上不同启动子元件融合构成的一个新的启动子。如tac启动子就是将色氨酸启动子Ptrp-35区域与突变的乳糖启动子PlacUV5的-10区域融合构成的杂合启动子,兼具Ptac强启动能力和乳糖启动子可操控特性(受lacI产物的阻

启动子清除的概念

聚合酶转录时,首先结合到启动子上,找到特异结合位点,激活后起始转录。 特异性结合的聚合酶-启动子复合物连接紧密,如果转录要延长需要聚合酶的前进,只有脱离结合的启动子才可以。聚合酶离开结合的启动子以延伸转录产物的过程就叫启动子清除。

克隆启动子的方法

随着基因工程的发展,常常需要构建一种能高水平表达异源蛋白质的表达载体。启动子对外源基因的表达水平影响很大,是基因工程表达载体的重要元件。因此研究启动子的克隆方法,对研究基因表达调控和构建表达载体至关重要。迄今为止,国外尚未见到有关启动子克隆方法的综述性报道,国内仅孙晓红等曾就启动子的结构、分类、克隆

启动子的基本结构

启动子是一段位于结构基因5'端上游区的DNA序列,能活化RNA聚合酶,使之与模板DNA准确地相结合并具有转录起始的特异性。因为基因的特异性转录取决于酶与启动子能否有效地形成二元复合物,故RNA聚合酶如何有效地找到启动子并与之相结合是转录起始过程中首先要解决的问题。有实验表明,对许多启动子来说

启动子清除的定义

聚合酶转录时,首先结合到启动子上,找到特异结合位点,激活后起始转录。 特异性结合的聚合酶-启动子复合物连接紧密,如果转录要延长需要聚合酶的前进,只有脱离结合的启动子才可以。聚合酶离开结合的启动子以延伸转录产物的过程就叫启动子清除。

启动子元件的功能

中文名称启动子元件英文名称promoter element定  义启动子中的一些顺式作用序列,可以位于启动子的任何方向和任何位置(上游或下游)。可以被一些转录因子所识别,从而调节启动子的活性。应用学科生物化学与分子生物学(一级学科),基因表达与调控(二级学科)

克隆启动子的方法

随着基因工程的发展,常常需要构建一种能高水平表达异源蛋白质的表达载体。启动子对外源基因的表达水平影响很大,是基因工程表达载体的重要元件。因此研究启动子的克隆方法,对研究基因表达调控和构建表达载体至关重要。迄今为止,国外尚未见到有关启动子克隆方法的综述性报道,国内仅孙晓红等曾就启动子的结构、分类、克隆

双向启动子的定义

双向启动子( bidirectional promoter)位于两个相邻且转录方向相反的基因之间 的一段DNA序列。

基因内启动子的定义

中文名称基因内启动子英文名称intragenic promoter定  义被RNA聚合酶III识别的基因内的一段DNA序列。应用学科遗传学(一级学科),分子遗传学(二级学科)

双向启动子的转录机制

双向启动子的双向转录机制可能是两个RNA聚合酶同时聚集在无核小体区的边界,然后在两个方向上起始转录.双向启动子在真核生物基因组中广泛分布 ,大多数的双向启动子缺少TATA盒,而具有较高的GC含量和丰富的CpG岛。

概述启动子的基本结构

  启动子是一段位于结构基因5'端上游区的DNA序列,能活化RNA聚合酶,使之与模板DNA准确地相结合并具有转录起始的特异性。因为基因的特异性转录取决于酶与启动子能否有效地形成二元复合物,故RNA聚合酶如何有效地找到启动子并与之相结合是转录起始过程中首先要解决的问题。有实验表明,对许多启动子