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轻松人造病毒的新技术平台

在自然界中,噬菌体(bacteriophages)随处可见。本质上它们属于病毒,主要攻击并杀死特定细菌。利用这种特性,研究人员和医务人员希望通过人工改造噬菌体来对付细菌感染,例如某些食品工业已经采用天然噬菌体来破坏食品中的病原体了。 然而,基因工程噬菌体却是一个极具挑战的项目。在苏黎世联邦理工大学食品微生物学教授Martin Loessner的带领下,一组研究团队刚刚在《PNAS》期刊发表文章,正式提出了一款制造工程噬菌体的新技术平台。 利用该平台,研究人员得以实现系统性地基因修饰噬菌体基因组,赋予噬菌体额外功能,让它们在细菌L型(缺乏细胞壁的Listeria细胞,或称L form)中复制。 “在以前,修改噬菌体基因组几乎是不可能的,”Loessner说。即便可以,这些方法也非常低效,一个基因只能整合到噬菌体一小片已知基因组中,将被修饰过的噬菌体分离出来就像大海捞针。 “我们曾经必须筛选数百万个噬菌体,才能找到富含所......阅读全文

微生物测序会忽视一些重要信息

  基因组测序应该能够揭示一个有机体的整个遗传组成。对于传染病专家来说,可以用这种技术来分析一种致病菌,以确定它能造成多大危害,以及它是否具有抗生素耐药性。但是,美国洛克菲勒大学的一项最新研究表明,目前的测序技术会忽视掉一些重要的信息:浮动在细菌染色体(细胞遗传物质的核心)外的DNA分离碎片。相关研

英科学家称噬菌体病毒有望成为下一代抗生素

可杀死肠胃细菌病毒 比传统抗生素效果更好  英国剑桥的科学家最近宣称,在英国的康河里发现的噬菌体病毒可能成为下一代抗生素。 英国剑桥郡威康信托桑格研究所的安娜·托里伯说:“噬菌体把细菌当作感染对象,某些噬菌体仅仅攻击特定的细菌。因此,通过使用噬菌体病毒攻击引起疾病的细菌,可以治疗

PNAS:用CRISPR解决世界性难题

   近年来致病菌的抗生素抗性越演越烈,这已经成为了一个世界性的难题。科学家们日前在CRISPR技术的基础上,开发了一个双噬菌体系统,能够使耐药菌敏感化,并且有选择的杀死它们。这项研究发表在五月十八日的美国国家科学院院刊PNAS杂志上。  传统的噬菌体疗法是用一种或多种噬菌体去感染和裂解相应的细菌菌

Nature发现肠道菌的同盟军

  哈佛大学Wyss研究所的科学家们发现,当肠道菌受到抗生素攻击时,肠道内的病毒会成为它们的同盟军,使细菌快速产生对药物的抗性。这项研究发表在Nature杂志上。   这些被称为噬菌体的肠道病毒,能够在细菌间传递基因,由此帮助细菌在抗生素的攻击下存活。能够抵抗多种抗生素的细菌被称为超级菌,而这项研

从自然环境中分离和纯化噬菌体实验

实验方法原理因为噬菌体是专性寄生物,所以自然界中凡有细菌分布的地方,均可发现其特异的噬菌体的存在,亦即噬菌体一般是伴随着宿主细菌的分布而分布的,例如粪便与阴沟污水中含有大量大肠杆菌,故也能很容易地分离到大肠杆菌噬菌体;乳牛场有较多的乳酸杆菌,也容易分离到乳酸杆菌噬菌体等。虽然近年的研究表明,自由噬菌

Nature重磅:噬菌体疗法成功治疗酒精性肝病

  北京时间11月14日,发表在 Nature 上的一项新研究中,来自美国加州大学圣地亚哥分校(UCSD)医学院的研究人员首次将噬菌体疗法应用于小鼠,成功治疗酒精性肝病。  噬菌体,是一种专门破坏细菌的病毒。在20世纪初,研究人员曾尝试用噬菌体作为一种治疗细菌感染的潜在方法。但后来由于抗生素的出现,

噬菌体的分离、纯化及效价测定

一、目的要求 1、学习分离、纯化噬菌体的基本原理和方法。 2、学习噬菌体效价测定的基本方法。 二、基本原理 因为噬菌体是专性寄生物,所以自然界中凡有细菌分布的地方,均可发现奇特异的噬菌体的存在,亦即噬菌体是伴随着宿主细菌的分布而分布的,例如粪便与阴沟污水中含有大量大肠杆菌,故也能很容

反CRISPR噬菌体合作克服CRISPR-Cas免疫

  英国埃克塞特大学的研究人员发现,一种被称为噬菌体的病毒在面对迎面而来的攻击时,首先削弱细菌的防御力,然后再杀死细菌。  这一发现是一个关键性突破,它将有助于改善噬菌体疗法,治疗危机生命的细菌感染。  细菌有防御系统,例如众所周知的CRISPR-Cas,以保护自身免受病毒侵袭。像军备竞赛一样,噬菌

深圳先进院首次揭示肠道噬菌体组与II型糖尿病的相关性

  近日,中国科学院深圳先进技术研究院合成生物学研究所(筹)研究团队,在人体微生物组研究领域取得进展,相关研究成果以A Human Gut Phage Catalog correlates the Gut Phageome with Type 2 Diabetes为题,发表在Microbiome(《

中国学者《Microbiome》揭示肠道噬菌体组与II型糖尿病相关性

   中科院深圳先进技术研究院合成生物学研究所(筹)的研究人员发表了题为“A Human Gut Phage Catalog correlates the Gut Phageome with Type 2 Diabetes”的文章,通过人肠道噬菌体集揭示肠道噬菌体组和II型糖尿病的相关性,这首次证实

芬兰教授建议用噬菌体疗法对付“超级细菌”

  因抗生素滥用等因素导致的“超级细菌”一直是困扰医学界的难题。芬兰赫尔辛基大学细菌学教授米卡埃尔·斯库尔尼克认为,噬菌体也许能用来对付“超级细菌”。  “超级细菌”是指那些对多种抗生素具有耐药性的细菌。据世界卫生组织统计,全球每年有70万人死于“超级细菌”感染,其中包括23万新生儿。噬菌体是一种专

P1噬菌体转导试剂盒使用说明

P1噬菌体转导试剂盒产品说明书(中文版)主要用途P1噬菌体转导试剂是一种旨在通过供体大肠杆菌制备具有部分细菌基因的噬菌体,感染特定受体大肠杆菌,获得细菌之间基因片段的转移,而获得遗传重组的权威而经典的技术方法。该技术经过精心研制、成功实验证明的。其适用于通用型非特异性基因片段的转导。产品严格无菌,即

与CRISPR/Cas系统相爱相杀的抗CRISPR蛋白研究最新进展 一

CRISPR/Cas系统是目前发现存在于大多数细菌与所有的古菌中的一种免疫系统,被用来识别和摧毁抗噬菌体和其他病原体入侵的防御系统。在CRISPR/Cas系统中,CRISPR是规律间隔性成簇短回文重复序列(clustered regularly interspaced short palindr

噬菌体的检查及效价测定

实验方法原理噬菌体是一类专性寄生于细菌和放线菌等微生物的病毒,其个体形态极其微小,用常规微生物计数法无法测得其数量。当烈性噬菌体侵染细菌后会迅速引起敏感细菌裂解,释放出大量子代噬菌体,然后它们再扩散和侵染周围细胞,最终使含有敏感菌的悬液由混浊逐渐变清,或在含有敏感细菌的平板上出现肉眼可见的空斑──噬

细菌和噬菌体的遗传分析 1

遗传重组是生命的重要现象之一,在生物进化过程中起着极其重要的作用。从低等的原核生物到高等的哺乳动物其重组方式是多种多样的。真核生物中的遗传重组,主要是通过染色体上的基因自由组合或交换实现的,是生物有性生殖过程的一部分,形成的二倍性合子的遗传组分,一半来自父体,一半来自母体,基因的自由结合和交换是在两

魏文胜:基因组编辑平台技术及未来产业运用发展趋势

  “基因组编辑未来产业运用发展是如今的热点,利用这个技术,不管做动植物转化改造还是医药领域应用,可以做的事情非常多,但是具体怎么落地?我跟大家一样,有的时候会觉得无从下手,所以今天我会更多从技术层面给大家做一个简单的介绍。”  △魏文胜 北京大学生命科学学院教授  以下是正文:  各位下午好!谢谢

Nature:新研究揭示cGAMP信号保护细菌免受噬菌体感染

  cGAS-STING途径是动物中细胞自主性先天免疫系统的重要组成部分。cGAS蛋白(cyclic GMP–AMP synthase, 环状GMP-AMP合酶)是细胞质病毒DNA的传感蛋白,一旦在细胞质中检测到病毒DNA,就会产生结合STING蛋白并激活免疫反应的环状GMP-AMP(cGAMP)信

专家称抗生素研发跑不赢耐药菌 减弱研发动力

研究人员检查菌种 四川抗菌素工业研究所所长易八贤  国内现存唯一一家国家级抗生素工业研究所位于成都  因为“超级细菌”带来的风暴,45岁的易八贤最近颇受关注。易八贤任所长的四川抗菌素工业研究所(以下简称研究所)与他本人同龄,45年来先后研发了100余种抗生素,是目前国内现存唯一的国

抗生素失效?用噬菌体“打败”超级细菌

  科技日报北京1月30日电 感染了超级细菌的患者并非无药可救,噬菌体有望成他们的新救星。据《麻省理工技术评论》网站29日报道,随着DNA测序和人工智能的发展,美国一些初创公司正将这种“细菌杀手”变成抗生素的替代品。   随着越来越多的细菌对现有药物产生了抗药性,对替代品的需求很迫切。美国每年大约

细菌克隆的溶解实验

细菌克隆的溶解实验可以用于:(1)从表达特定融合蛋白质的重组噬菌体构建噬菌体溶源菌;(2)从该溶源菌诱导合成并纯化出融合的目的蛋白质。实验方法原理具有原噬菌体的细菌称为溶原性细菌。噬菌体分为烈性噬菌体和溶原性噬菌体,在感染于寄主细菌细胞时,前者往往在菌体内增殖并将菌体裂解。实验材料大肠杆菌噬菌体试剂

Nature:噬菌体疗法有望治疗酒精性肝病

  噬菌体是专门破坏细菌的病毒。在20世纪初期,科学家们就已尝试使用噬菌体作为治疗细菌感染的潜在方法。但是随后抗生素出现了,噬菌体也就失宠了。然而,随着抗生素耐药性感染的增加,人们对噬菌体治疗重新产生了兴趣。在少数情况下,在用尽了所有其他替代方法后,实验性噬菌体疗法(phage therapy)已成

细菌克隆的溶解实验

细菌克隆的溶解实验             实验方法原理 具有原噬菌体的细菌称为溶原性细菌。噬菌体分为烈性噬菌体和溶原性噬

Nature:对抗感染,除了抗生素人类还能靠什么

  自亚历山大•弗莱明发现青霉素以来,已经过去了八十多年。当年一鸣惊人的抗生素如今已经陷入困境,抗生素滥用导致的抗性问题成为了世界级难题。  近年来,抗生素的效力在不断降低,新抗生素的开发严重滞后。“我们需要做出改变,”葛兰素史克的Stephen Baker说。那么,除了抗生素人们还能够用什么对抗感

Nature:除了抗生素人类还能靠什么

  自亚历山大·弗莱明发现青霉素以来,已经过去了八十多年。当年一鸣惊人的抗生素如今已经陷入困境,抗生素滥用导致的抗性问题成为了世界级难题。  近年来,抗生素的效力在不断降低,新抗生素的开发严重滞后。“我们需要做出改变,”葛兰素史克的Stephen Baker说。那么,除了抗生素人们还能够用什么对抗感

2月王牌聚焦:人体内微生物研究推陈出新

  近年来人体肠道微生物组成为了研究“新宠”,这方面研究主要聚焦于细菌,那么人体内的病毒,噬菌体呢?2月的系列进展也许能给出部分答案。  芝加哥洛约拉大学的一组研究人员分析来自181位女性患者膀胱中收集到的序列数据,从他们研究的200个细菌基因组中鉴定出大部分细菌都有的450多种可能的噬菌体序列。超

AEM:噬菌体可扩散抗生素耐药性

  近日,来自维也纳兽医大学(University of Veterinary Medicine)的研究人员通过对从奥地利超市、街边市场等处购买的50份鸡肉样本进行分析,发现有将近一半的样本都被噬菌体污染了,而且这种噬菌体还有能力将抗生素耐药性基因从一种细菌转移到另一种细菌;相关研究发表于Appli

Cell子刊:单分子噬菌体感染

  加州理工学院的研究人员首次观察到了单个病毒通过导入自身DNA感染单个细菌的过程,并且对DNA转移速度进行了检测。通过研究噬菌体感染细菌的过程,研究人员发现决定噬菌体DNA转移速度的是宿主细胞而非病毒遗传物质的量。该文章发表在Current Biology杂志的网站上。   “我们的实验能够

λ噬菌体的铺平板培养实验

噬菌斑起源于单个噬菌体颗粒对单个细菌的感染。第一次感染后合成的子代病毒颗粒吸附和感染邻近细菌,后者依次释放另一代子代病毒颗粒。如果细菌生长在半固体培养基(如含琼脂糖或琼脂)上,这种子代病毒颗粒的扩散是有限的。本实验来源「分子克隆实验指南第三版」黄培堂等译。实验方法原理噬菌斑起源于单个噬菌体颗粒对单个

细菌的突变

  遗传型变异中常见的一种为突变(Mutation),即细菌的基因结构发生偶然的改变。一般突变会导致所编码蛋白质的改变,从而使细菌出现新的特性或失去原有的某些特性。细菌的自然突变率与其生物的自然突变相同,每106~108次细胞分裂发生一次。由于细菌每20~30分钟分裂一代,故突变株相对较多

霍乱的传播扩散可以利用噬菌体疗法预防么?

  近期发生在美国的一例引人注目的病例中,一种杀菌的病毒混合制剂成功治疗了一位囊性纤维化的患者,这名患者遭受了对多种抗生素都产生耐药性的病原体引起的致死性感染。当然了,能够治愈感染最好不过了,那么使用噬菌体(杀菌病毒)来预防感染效果如何?其适用于治疗某些疾病吗?尽管利用病毒来预防由细菌引起的感染可能