细胞死亡带来的灵感PNAS公布胰腺癌检测新方法
细胞死亡是健康和疾病状态下人类生物学的一个重要特征。它可以预示病理早期阶段（例如形成中的肿瘤或自身免疫疾病/神经退行性疾病的开始），标志疾病进展，反映治疗的成功（如抗癌药物），鉴别治疗意外的毒性作用等等。然而直到现在，都不大可能在特定人类组织中非侵入性地检测细胞死亡。 来自耶路撒冷希伯来大学Ruth Shemer博士和Yuval Dor教授，及Hadassah医学中心的Benjamin Glaser教授领导的一个国际研究小组研发出了一种新方法，可以根据濒死细胞释放的循环DNA的甲基化模式来推测特定组织中的细胞死亡。这有助于鉴别来自机体所有细胞类型的cfDNA，为监测和诊断广谱的人类病理过程，及更好地认识正常组织动态提供了一个微创窗口。 通过320名患者和对照者参与的一系列实验中，研究人员证明这种方法可以检测多种病理过程，包括糖尿病、癌症、外伤和神经退行性变。 新的血液测试通过组合两个重要生物学原理可检测一些特定组织中的......阅读全文
关于DNA甲基化分析仪的基本介绍
DNA甲基化分析仪是一种用于基础医学领域的分析仪器，于2017年3月14日启用。 DNA甲基化分析仪的技术指标： 焦磷酸测序技术基于测序原理，数分钟内可获得定量数据。PyroMark Q24是提供实时测序信息的完整体系，高度适用于表观遗传学研究和遗传分析。该系统包括PyroMark Q24、
Cell发布革命性DNA甲基化分析技术
Whitehead研究所的研究人员开发出了一种方法，监测单个细胞中随着时间推移发生的DNA甲基化改变。这一突破性的研究成果发布在顶级科学期刊《细胞》（Cell）杂志上。 DNA甲基化对正确控制基因表达及细胞身份——使得细胞具有相同遗传物质的细胞变为神经细胞、肌肉细胞或皮肤细胞，起至关重要的作用
研究揭示肠癌DNA甲基化调控新机制
原文地址：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/9/508004.shtm
Alpha助力DNA甲基化表型调控新发现
NA甲基化(DNA methylation)是指在DNA甲基化转移酶的作用下，在基因组CpG二核苷酸的胞嘧啶5'碳位共价键结合一个甲基基团。为DNA化学修饰的一种形式，能够在不改变DNA序列的前提下，改变遗传表现。DNA甲基化能引起染色质结构、DNA构象、DNA稳定性及DNA与蛋白质相互作用方式
检测DNA甲基化识别四种常见癌
中美研究人员26日说，DNA甲基化标记作为一种全新的微创检测方式，只需检测少量组织即可获得足量的DNA用于分析，且至少可以有效识别结直肠癌、肺癌、乳腺癌和肝癌4种常见恶性肿瘤。 这项工作由美国加州大学圣迭戈分校张康教授与中国第四军医大学西京医院郝晓柯教授及中山大学徐瑞华教授等人合作完成，相
植物DNA甲基化的调控研究获重要进展
近日，中国科学院华南植物园农业与生物技术中心研究员陈琛、副研究员王昌虎团队与合作者，在国家自然科学基金面上项目和青年项目、广州市科技计划项目的资助下，对植物DNA甲基化的调控研究取得重要进展。相关成果发表于《自然-通讯》（Nature Communications）。DNA甲基化是表观遗传修饰中的一
Nature：10000人最大研究！“超重”改变DNA甲基化
12月21日，发表在Nature杂志上题为“Epigenome-wide association study of body mass index, and the adverse outcomes of adiposity”的研究证实，节假日养出的“肉”（biao）除了会让你看起来更bigge
植物DNA甲基化的调控研究获重要进展
近日，中国科学院华南植物园农业与生物技术中心研究员陈琛、副研究员王昌虎团队与合作者，在国家自然科学基金面上项目和青年项目、广州市科技计划项目的资助下，对植物DNA甲基化的调控研究取得重要进展。相关成果发表于《自然-通讯》（Nature Communications）。 DNA甲基化是表观遗传修
关于DNA甲基化检测的操作方法介绍
1、DNA甲基化检测— 基因组DNA的提取及浓度测定，设计引物时要求所扩增的片段中必须含有一个或一个以上的CpG岛，以保证检测可以正常进行。 2、DNA甲基化检测— 基因组DNA进行化学修饰，主要采用亚硫酸氢钠修饰，注意温度和时间的掌握，修饰后的DNA单链比较脆弱，操作应轻柔，避免剧烈振荡。适
揭示玉米DNA甲基化变异对表型的贡献
DNA甲基化对植物的生长发育和环境响应起着十分重要的作用。作为一种较为稳定的遗传信息，DNA甲基化既可由DNA序列变异诱发，也可独立于DNA序列产生纯表观遗传变异，这种独立的程度和DNA甲基化对基因表达以及表型变异的影响一直是研究热点。近日，华中农业大学和美国明尼苏达大学合作解析了玉米自然群体中
线虫基因组中存在DNA甲基化现象
2012年10月18日，吉林大学和华大基因合作完成的旋毛形线虫不同发育阶段DNA甲基化差异分析的相关研究成果在国际著名期刊《基因组生物学》(Genome Biology)上发表。该研究首次证实了线虫基因组中存在DNA甲基化现象，改写了长期以来认为线虫中没有该表观遗传修饰的历史，同时也使以DN
哺乳类动物的DNA甲基化特点
哺乳类动物一生中DNA甲基化水平有着显著变化：在受精卵最初几次卵裂中，去甲基化酶清除DNA分子上几乎所有从亲代遗传下来的甲基化标记；在胚胎植入子宫时，一种新的甲基化遍布整个基因组，构建性甲基化酶使DNA重新建立一个新的甲基化模式，一旦细胞内新的甲基化模式建成，将通过维持甲基化酶以“甲基化维持”的形式
DNA分析系统：基因甲基化研究的最佳工具
甲基化研究对于基因的 调控和肿瘤的发生有非常密切的关系。在一般正常的细胞中，基因调控区CpG岛处于非甲基化的状态。而当细胞发生癌变后，这些CG区域往往呈现甲基化状态。英国医学刊物《the Lancet》报道奥地利因斯布鲁克医学院的专家们早就可以通过检测大便中DNA的甲基化变化，把健康人的大便
组蛋白修饰与DNA甲基化之间的关系
在引起基因沉默的过程中，沉默信号(DNA甲基化、组蛋白修饰、染色质重新装配)是如何进行的?谁先谁后?这是一个“鸡和蛋”的问题，目前仍处于研究阶段，还没有定论。研究发现DNA甲基化和组蛋白乙酰化是一个相互促进、加强的过程，如许多HDAC可以和DNMTl、3a、3b相互作用；而甲基化CpG结合蛋白—
汪海林：维生素C调控DNA甲基化
2014年8月26日，第十三届全国青年分析测试学术报告会在陕西西安南洋大酒店隆重开幕。本届全国青年分析测试学术报告会由中国分析测试协会青年学术委员会举办，西安交通大学电子材料研究所承办，来自全国各地的分析测试学界代表近200人参加了此次报告会。来自中科院生态环境中心的汪海林教授为大家带来题为《维
DNA甲基化酶的类型和作用介绍
基因组中DNA的甲基化模式是通过DNA甲基转移酶实现的。DNA甲基化酶分为2类，即维持DNA甲基化转移酶（Dnmtl或维持甲基化酶）和从头甲基化酶。根据序列的同源性和功能，真核生物DNA甲基化转移酶又分为4类：Dnmtl/METl、Dnmt2、CMTs和Dn-mt3。DnmtliiMETl类酶参与C
DNA甲基化在肿瘤发生中的作用
越来越多的研究表明，在肿瘤形成过程中包含两大类机制。一个是通过DNA核苷酸序列改变而形成突变，即遗传学机制。肿瘤作为一种遗传学疾病在分子生物学领域已经得到证实。另外一个就是表观遗传学(epigenetics)机制，即不依赖DNA序列改变导致基因表达水平的变化，它在肿瘤形成过程中的作用越来越受到重视。
DNA甲基化研究方法的回顾与评价(图)
摘要： DNA 甲基化是表观遗传学(Epigenetics)的重要组成部分，在维持正常细胞功能、遗传印记、胚胎发育以及人类肿瘤发生中起着重要作用，是目前新的研究热点之一。随着对甲基化研究的不断深入，各种各样甲基化检测方法被开发出来以满足不同类型研究的要求。这些方法概括起来可分为三类：整体水平的甲
Ⅱ型DNA甲基化酶的基本信息
中文名称Ⅱ型DNA甲基化酶英文名称type Ⅱ DNA methylase定 义编号：EC 2.1.1.37。三类甲基化酶之一，包括内切酶和甲基化酶两种成分，作用在识别位点(回文结构)内或其附近，反应不需要ATP；而Ⅰ型和Ⅲ型都是需要ATP的双功能酶，在距不对称的识别序列较远处使DNA甲基化，又能
Ⅱ型DNA甲基化酶的基本信息
中文名称Ⅱ型DNA甲基化酶英文名称type Ⅱ DNA methylase定 义编号：EC 2.1.1.37。三类甲基化酶之一，包括内切酶和甲基化酶两种成分，作用在识别位点(回文结构)内或其附近，反应不需要ATP；而Ⅰ型和Ⅲ型都是需要ATP的双功能酶，在距不对称的识别序列较远处使DNA甲基化，又能
去甲基化酶ALKBH5在胰腺癌中的应用（三）
总结本文作者通过RNA-seq, m6A-seq, MeRIP-qPCR, ChIP, CoIP,双荧光素酶实验等方法，研究发现去甲基化酶ALKBH5缺失会加重胰腺ai的发生和不良临床病理表现特征。ALKBH5的过度表达可降低了体外肿 瘤的增殖、迁移和侵袭活性，改善了体内肿 瘤生长，而ALK
去甲基化酶ALKBH5在胰腺癌中的应用（一）
文章导读表观遗传修饰如m6A甲基化在肿 瘤的发生和发展中起到重要作用。而甲基化酶对ai症的影响也受到广 泛关注。其中去甲基化酶ALKBH5已被报道过能通过维持乳腺ai细胞的干细胞性而促进肿 瘤的形成，还有文章探究过其在急性白血病中的作用，但其对胰腺ai的影响还缺乏研究。今年5月份发表在M
去甲基化酶ALKBH5在胰腺癌中的应用（二）
4.ALKBH5抑 制胰腺ai细胞生长和转移将过表达ALKBH5的ai细胞移植到裸鼠体内，发现过表达ALKBH5的ai细胞生成的肿 瘤体积明显小于对照组，并且细胞生长的指示分子Ki-67的表达也明显降低。染色显示过表达ALKBH5的组织中侵袭和转移的指示分子MMP-2和MMP-9表达降低，敲
昆明动物所揭示DNA去甲基化与DNA损伤修复之间的调控作用
3月21日，EMBO Reports在线发表了中国科学院昆明动物研究所李家立课题组的研究论文，该文揭示了DNA去甲基化与DNA损伤修复之间的调控作用。昆明动物所助理研究员蒋德伟为文章第一作者，研究员李家立为通讯作者。 准确而有效的DNA损伤与修复应答对机体各种类型的细胞维持基因组完整性是十分重
老年痴呆症新解释：DNA甲基化
2014年8月17日发表在《自然·神经科学》杂志上的一项研究发现，脑部早期DNA甲基化（DNA methylation）参与阿尔茨海默症（AD）的形成。 DNA甲基化能化学修饰DNA，是DNA特定区域生物活性的标记物。该研究是迄今为止第一例大型的全表观基因组学关联分析（Epigenome-wi
两篇PNAS：蛋白纳米孔检测DNA甲基化
两个独立的研究团队利用通道蛋白实现纳米孔测序，成功鉴别了5-甲基胞嘧啶和5-羟甲基胞嘧啶。这两篇文章发表在同一期的美国国家科学院院刊PNAS杂志上。 基因组所蕴含的编码信息，包括DNA序列和核苷酸修饰两个部分。其中，动态的DNA甲基化模式，是基因表达的重要调控者，与细胞分化、胚胎发育和癌症
科学家绘制正常组织DNA甲基化单体图谱
中国科学院分子细胞科学卓越创新中心研究员石建涛，联合上海交通大学医学院附属瑞金医院教授方海，在《基因组研究》（Genome Research）上，在线发表了题为A DNA methylation haplotype block landscape in human tissues and preim
Cell子刊：DNA甲基化的不完全重置
Babraham研究所的科学家们揭示了生殖细胞(卵子和精子)发育时DNA重置的机制。众所周知，表观遗传学修饰是指不改变DNA序列的DNA修饰，DNA上添加这样的小基团会改变基因的活性。在人们的一生中(包括在子宫内的发育)，表观遗传学修饰都在不断积累和变化，环境也能够对表观遗传学修饰发生影响。
研究揭示受精卵DNA去甲基化重要机制
近日，中科院上海生科院生化与细胞所一项最新研究发现，小鼠早期胚胎中母源和父源基因组在单细胞的受精卵阶段，均会发生大规模的DNA主动和被动去甲基化，DNA双加氧酶Tet3介导了主动去甲基化的发生，而糖苷酶TDG并不参与该过程。相关研究成果在线发表于学术期刊《细胞—干细胞》。 该研究由中科院上海生
研究发现植物DNA主动去甲基化新机制
近期《美国国家科学院院刊》（PNAS）杂志在线发表了中国科学院分子植物科学卓越创新中心上海植物逆境生物学研究中心朱健康研究组题为Histone Acetylation Recruits the SWR1 Complex to Regulate Active DNA Demethylation i