AJHG:科学家鉴别出新型的遗传性结直肠癌风险因子

近日,一项刊登在国际杂志the American Journal of Human Genetics上的研究报告中,来自MIT博德研究所等机构的研究人员对将近3800名结直肠癌患者进行研究揭示了有望改善疾病风险筛查的机会及治疗手段,这是迄今为止最大的一项种系研究。个体患结直肠癌的风险有30%都是遗传性的,然而研究人员并不清楚这种遗传特性背后的根源到底是什么?而且目前结直肠癌易感基因的列表仅能够解释大约10%的遗传风险。图片摘自:Susanna M. Hamilton 为了揭示一些隐藏在疾病背后的遗传特性,研究人员对上述结直肠癌患者进行研究,在参与DNA损伤修复及和结直肠癌风险并无关联的40个基因中寻找遗传性的突变;研究结果表明,一小部分但却非常明显病人亚群机体中或许拥有DNA修复基因的遗传性突变,而且这些基因突变和结直肠癌风险并不相关。 在研究人员所筛查的680名患者中,31名患者机体中已知的结直肠癌风险基因中都携带有促......阅读全文

具有遗传风险的基因介绍SDHD基因

这个基因编码呼吸链复合物ii的一个成员,负责琥珀酸的氧化。编码蛋白是将复合物锚定在线粒体内膜基质侧的两个完整膜蛋白之一。该基因突变与肿瘤的形成有关,包括遗传性副神经节瘤。疾病的传播几乎完全通过父系等位基因发生,这表明该位点可能是母系印记。这个基因在1号、2号、3号、7号和18号染色体上有假基因。选择

具有遗传风险的基因介绍SDHA基因

这个基因编码琥珀酸泛醌氧化还原酶的一个主要催化亚单位,一个线粒体呼吸链的复合物。该复合物由四个核编码亚单位组成,位于线粒体内膜。这种基因突变与一种线粒体呼吸链缺乏症(leigh综合征)有关。在染色体3q29上发现了一个假基因。另外,已经发现该基因编码不同亚型的剪接转录变体。

具有遗传风险的基因介绍KIT基因

KIT基因编码的蛋白是干细胞因子受体SCFR,也被称为原癌基因c-kit或酪氨酸蛋白激酶kit或CD117,是一种受体酪氨酸激酶,这个基因突变与胃肠道间质瘤,肥大细胞病,急性髓性白血病有关。

具有遗传风险的基因介绍SDHB基因

呼吸链的复合物II,特别参与琥珀酸的氧化,携带电子从FADH到COQ。复合物由四个核编码亚单位组成,并定位于线粒体内膜。铁硫亚单位高度保守,包含三个富含半胱氨酸的簇,这些簇可能包含酶的铁硫中心。该基因的零星和家族性突变导致副神经节瘤和嗜铬细胞瘤,并支持线粒体功能障碍和肿瘤发生之间的联系。

具有遗传风险的基因介绍POLE基因

该基因编码DNA聚合酶epsilon的催化亚单位。这种酶参与DNA修复和染色体DNA复制。该基因突变与结直肠癌12和面部畸形、免疫缺陷、利维多和身材矮小有关。

具有遗传风险的基因介绍MUTYH基因

该基因编码一种参与dna氧化损伤修复的dna糖苷酶。这种酶在腺嘌呤与鸟嘌呤、胞嘧啶或8-氧-7,8-二氢鸟嘌呤(一种主要的氧化损伤的DNA损伤)不适当配对的部位从DNA主干上切除腺嘌呤碱。蛋白质定位于细胞核和线粒体。这种基因产物被认为通过在氧化损伤后引入单链断裂而在细胞凋亡信号中发挥作用。该基因突变

具有遗传风险的基因介绍HFE-基因

该基因编码的蛋白是一种膜蛋白,与mhcⅠ类蛋白相似,与beta2微球蛋白(beta2m)相关。认为该蛋白通过调节转铁蛋白受体与转铁蛋白的相互作用来调节铁的吸收。铁储存障碍,遗传性血色素沉着症,是一种隐性遗传疾病,是由该基因缺陷引起的。至少有9个选择性剪接的变异已经被描述为这个基因。已发现其他变体,但

具有遗传风险的基因介绍MITF基因

该基因编码一个转录因子,包含碱性螺旋环螺旋和亮氨酸拉链结构特征。调节黑素细胞视网膜色素上皮的分化和发育,并负责黑素生成酶基因的色素细胞特异性转录。该基因的杂合子突变引起听觉色素综合征,如Waardenburg综合征2型和Tietz综合征。另外,还发现了编码不同亚型的剪接转录变体。

具有遗传风险的基因介绍PDGFRA基因

PDGFRA基因编码的蛋白全名为血小板源性生长因子受体α,是一种细胞表面受体酪氨酸激酶,PDGFRA可以与其相应的配体PDGF结合后活化,再激活磷脂酰肌醇、cAMP及多种蛋白质的磷酸化途径,调控细胞的分裂和增殖,当基因激活异常时,则会导致肿瘤的发生并促进肿瘤血管生成,PDGFRA的突变与胃肠道间质瘤

具有遗传风险的基因介绍MAX基因

该基因编码的蛋白质是碱性螺旋环螺旋亮氨酸拉链(bhlhz)转录因子家族的成员。它能与其他家族成员形成同二聚体和异二聚体,包括mad、mxi1和myc。myc是一种参与细胞增殖、分化和凋亡的肿瘤蛋白。同二聚体和异二聚体竞争一个共同的dna靶位点(e盒),这些二聚体形式之间的重排提供了一个复杂的转录调控

具有遗传风险的基因介绍FANCG基因

fanconi贫血互补组(fanc)目前包括fanca、fancb、fancc、fancd1(也称为brca2)、fancd2、fance、fancf、fancg、fanci、fancj(也称为brip1)、fancl、fancm和fancn(也称为palb2)。先前定义的组fanch与fanca相

具有遗传风险的基因介绍VHL基因

VHL基因的突变会导致林岛综合征(Von Hippel—Lindau Syndrome,VHL),即VHL综合征,也VHL基因名字的来源。VHL综合征是常染色体显性遗传性肿瘤疾病,一般包括肾囊肿、肾细胞癌、胰腺囊肿、胰腺癌、嗜铬细胞瘤、视网膜血管瘤、上皮性囊腺瘤和大脑脊髓的血管瘤病。发病机制为VHL

具有遗传风险的基因介绍FANCC基因

Fanconi贫血互补组(FANC)目前包括Fanca、Fancb、Fancc、Fancd1(也称为brca2)、Fancd2、Fance、Fancf、Fancg、Fanci、Fancj(也称为brip1)、Fancl、Fancm和Fancn(也称为palb2)。先前定义的组fanch与fanca相

具有遗传风险的基因介绍ATM基因

ATM基因编码的蛋白属于PI3/PI4激酶家族,这种蛋白是一种重要的细胞周期检查点激酶,通过磷酸化调控下游一系列重要蛋白,包括抑癌蛋白p53和BRCA1、检查点激酶CHK2、检查点蛋白RAD17和RAD9以及DNA修复蛋白NBS1。ATM和与其密切相关的蛋白ATR被认为是在细胞周期调控以及DNA损伤

饮食不健康或是年轻人患结直肠癌主要风险因素

科技日报北京8月15日电 (记者张佳欣)美国克利夫兰诊所的一项新研究表明,来自饮食的代谢产物是诱发早发性结直肠癌的主要风险因素,特别是与红肉和加工肉类相关的代谢产物。发表在最新一期《npj精准肿瘤学》上的论文,分析了代谢产物和微生物组数据集,强调年轻人(小于60岁)预防结直肠癌的最佳方式之一是注重健

饮食不健康或是年轻人患结直肠癌主要风险因素

美国克利夫兰诊所的一项新研究表明,来自饮食的代谢产物是诱发早发性结直肠癌的主要风险因素,特别是与红肉和加工肉类相关的代谢产物。发表在最新一期《npj精准肿瘤学》上的论文,分析了代谢产物和微生物组数据集,强调年轻人(小于60岁)预防结直肠癌的最佳方式之一是注重健康饮食。克利夫兰诊所研究人员对在该诊所接

与结直肠癌相关的基因突变类型HIF1A基因

该基因编码转录因子缺氧诱导因子-1(hif-1)的α亚单位,是由α亚单位和β亚单位组成的异二聚体。HIF-1通过激活许多基因的转录,包括那些参与能量代谢、血管生成、细胞凋亡和其他蛋白质产物增加氧气输送或促进对缺氧的代谢适应的基因,作为细胞和全身对缺氧的稳态反应的主要调节器。因此,HIF-1在胚胎血管

与结直肠癌相关的基因突变类型EPHB4基因

肾上腺素受体及其配体,肾上腺素,介导许多发育过程,特别是在神经系统。根据其结构和序列关系,肾素被分为通过糖基磷脂酰肌醇连接锚定在膜上的肾素-A(efna)类和作为跨膜蛋白的肾素-B(efnb)类。EPH受体家族根据其胞外结构域序列的相似性及其与肾素A和肾素B配体结合的亲缘关系分为2组。肾上腺素受体构

与结直肠癌相关的基因突变类型-EPAS1基因

该基因编码一个转录因子,参与氧调节基因的诱导,随着氧水平的下降而诱导。编码蛋白包含一个基本的螺旋-环-螺旋结构域蛋白二聚结构域以及一个在信号转导途径中发现的对氧水平有反应的结构域。该基因突变与红细胞增多症家族性4型有关。

与结直肠癌相关的基因突变类型SMAD4基因

SMAD4基因编码的蛋白属于SMAD家族,可以被跨膜丝氨酸/苏氨酸受体激酶激活,如转化生长因子TGF-β受体,因此作为TGF-β信号的重要胞浆内信号级联分子,SMAD4可以自身形成同源复合物或与激活型其他的SMAD家族成员形成异源复合物,转移位到细胞核内,与其他转录因子协同作用,调节TGF-β应答基

与结直肠癌相关的基因突变类型THBS2基因

该基因编码的蛋白质属于凝血酶敏感蛋白家族。是一种二硫键联的同源三聚体糖蛋白,介导细胞间和细胞间和基质间的相互作用。这种蛋白已被证明是一种有效的肿瘤生长和血管生成抑制剂。对小鼠的研究表明,这种蛋白可能调节间充质细胞的细胞表面特性,并参与细胞粘附和迁移。

与结直肠癌相关的基因突变类型IRS2基因

该基因编码胰岛素受体底物2,这是一种胞质信号分子,通过充当不同受体酪氨酸激酶和下游效应器之间的分子接头来调节胰岛素、胰岛素样生长因子1和其他细胞因子的作用。这种基因的产物在受体刺激时被胰岛素受体酪氨酸激酶磷酸化,在IL4治疗后被白细胞介素4受体相关激酶磷酸化。

与结直肠癌相关的基因突变类型DKK1基因

这个基因编码一种属于Dickkopf家族的蛋白质。是一种具有两个富含半胱氨酸区域的分泌蛋白,通过抑制Wnt信号通路参与胚胎发育。骨髓血浆和外周血中dkk1水平升高与多发性骨髓瘤患者存在溶骨性骨病变有关。

与结直肠癌相关的基因突变类型HSPA5基因

该基因编码的蛋白是热休克蛋白70(hsp70)家族的成员。局限于内质网(ER)内腔,参与ER中蛋白质的折叠和组装。由于这种蛋白质与许多ER蛋白质相互作用,它可能在监测蛋白质通过细胞的转运中起到关键作用。

与结直肠癌相关的基因突变类型-GSTP1基因

谷胱甘肽S-转移酶(GSTS)是一个酶家族,通过催化许多疏水性和亲电性化合物与还原性谷胱甘肽的结合,在解毒过程中发挥重要作用。根据其生化、免疫和结构特性,可溶性GST可分为4大类:α、μ、π和θ。GST家族成员是一个多态基因,编码活性的、功能不同的GSTP1变异蛋白,被认为在异种代谢中起作用,并在癌

与结直肠癌相关的基因突变类型PSMD4基因

26S蛋白酶体是一种多催化蛋白酶复合物,由2个复合物、一个20S核和一个19S调节器组成,具有高度有序的结构。20S核由4个28个不相同亚单位的环组成,2个环由7个α亚单位组成,2个环由7个β亚单位组成。19S调节器由一个碱基(包含6个ATPase亚单位和2个非ATPase亚单位)和一个LID(包含

与结直肠癌相关的基因突变类型-CDKN1A基因

这个基因编码一种有效的细胞周期蛋白依赖激酶抑制剂。编码蛋白结合并抑制细胞周期蛋白依赖性激酶2或-细胞周期蛋白依赖性激酶4复合物的活性,因此在G1期起调节细胞周期进展的作用。该基因的表达受到肿瘤抑制蛋白p53的严格控制,通过该蛋白介导p53依赖细胞周期G1期停滞,以响应各种应激刺激。该蛋白可与DNA聚

与结直肠癌相关的基因突变类型CDX2基因

该基因是尾相关同源盒转录因子基因家族的成员。编码蛋白是参与细胞生长和分化的肠道特异性基因的主要调节因子。这种蛋白也在肠道的早期胚胎发育中起作用。这种基因的异常表达与肠道炎症和肿瘤发生有关。

与结直肠癌相关的基因突变类型TP53基因

TP53基因编码的是分子量约为53kDa的蛋白,P35根据其分子量大小命名的,首次是在1979年发现致瘤病毒SV40可以与该蛋白形成复合物,并且将克隆得到p53转入到细胞可引起细胞癌变,所以最初的10年普遍认为p53是抑癌基因。后来发现之前肿瘤细胞来源的p53基因突变体能够促使细胞发生转化,而野生型

与结直肠癌相关的基因突变类型NOTCH1基因

NOTCH1基因所编码的蛋白是一种高度保守的细胞表面受体,Notch家族包括4种受体,分别为NOTCH1,NOTCH2,NOTCH3和NOTCH4,他们的配体包括JAG1,JAG2,DLL1,DLL3和DLL4。Notch信号的紊乱不仅直接而且还可通过其他多条信号通路间接的诱导肿瘤发生,已发现Not