青岛能源所新一代元基因组平台建设取得进展
元基因组是指一定环境下整个微生物群落中的所有遗传信息的总和。元基因组数据的收集与分析克服了传统分离培养方法仅局限于群落中可培养组分（一般仅占1%）的缺陷，使挖掘、认识与利用不可培养的组分（即另外之99%）成为可能，为全面研究自然状况下微生物群落的结构与功能提供了新途径。 元基因组的研究和分析需要一套强大、完整的序列收集和生物信息学分析平台。在科技部863、中国科学院信息化E-Science等项目的资助下，中国科学院青岛生物能源与过程研究所功能基因组团队负责人、中科院“百人计划”入选者徐健研究员等开发了基于第二代测序技术与超算技术相结合的新一代元基因组实验与计算平台。该平台能够实现大规模、高通量、高自动化的元基因组数据采集、分析，涵盖了元基因组原始数据质量评价工具、高通量与多维化元基因组分析与比较方法以及群落数据可视化工具等核心分析环节，能够从系统和网络水平上认识、模拟和筛选微生物个体和群体的结构、功能及调......阅读全文
PNAS：与珊瑚有关的微生物群的宏基因组学
对珊瑚礁相关微生物群落的一个大尺度宏基因组学调查表明，这些微生物的分类学组成最多地受到了珊瑚和水藻等深海底大生物体的影响，而它们的代谢特化随着局部海洋学状况而变化。微生物群落影响相关珊瑚礁的健康，但是支配微生物群落结构和基因流的机制在很大程度上仍然未知。 Linda Wegley Kelly
探索神秘的微生物群落
微生物虽然看不见，但却是无处不在的。人体的肠道和皮肤、地球的海洋和土壤，甚至植物的叶片和种子，都有它们的身影。在大多数情况下，这些微生物群落是由许多不同的物种组成的。研究人员试图鉴定这些微生物群落的组成，但相当有难度。Sarah Webb在这一期的《BioTechniques》上介绍了目前的进展
微波炉也有微生物群
在灼热的热液喷口、零度以下的极地等地球极端恶劣环境中，仍有生物顽强生存甚至茁壮成长，它们被统称为“极端微生物”。而近日一项发表于《微生物学前沿》的研究发现，极端微生物扩展出了新的“栖息地”，一个人类日常生活中十分常见的厨房工具——微波炉。这是首次研究微波炉是否也有自己的微生物群。该研究挑战了一个常见
基因测序找出肠道核心微生物群
人类肠道中有数以万亿计的微生物，也称为肠道菌群，与多种疾病如肠炎、肥胖、糖尿病等都有关系。最近，比利时鲁汶大学和荷兰格林宁根大学两个团队分别在《科学》杂志发表论文，通过两项大型研究计划找出了肠道核心微生物群，为进一步建立生物标记体系，评估肠道菌群是否正常提供了线索。 肠道微生物组能产生维生素
微塑料改变海鸟肠道微生物群
原文地址：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/3/497279.shtm
PNAS：从基因到植物微生物群
像人类和动物一样，植物也有微生物群。一个由芝加哥大学领导的研究小组，包括INRAE，研究了一种植物物种内的遗传变异是否控制其叶片微生物群的组成。研究人员在两年多的时间里在四个地点的实验装置中种植了3万多株植物，以分析一株模型植物的200个基因型的叶片微生物群的变异和繁殖成功率(通过种子产量估计)。7
微塑料改变海鸟肠道微生物群
意大利科学家在最新一期《自然·生态与进化》杂志发表的一项研究指出，与摄入较少微塑料的海鸟相比，摄入高水平微塑料的野生海鸟肠道内的微生物总体上更丰富多样，但目前尚不清楚这种多样性的增加对海鸟意味着什么。微塑料是宽度小于5毫米的塑料碎片。本月发表的一项研究指出，海洋上漂浮着大约230万吨微塑料。海鸟寿命
经常暴饮暴食？肠道微生物群在作怪！
暴饮暴食症（OD）患者通常表现出对可口食物的渴望。对暴饮暴食的控制减少通常会导致过度偏好高能量和美味的食物，以及在短时间内过度进食。这可能会严重影响身心健康。饮食和压力是OD发展的两个最重要的因素。在训练过的动物中也发现了类似的由压力和节食史引起的暴饮行为。ODs在当代社会仍然是一个普遍存在的问
－Science：人类肠道微生物群有多稳定
研究人员研发出了一种改进了的、用来分析在我们肠道中和平相处的细菌群落的技术，这使得他们能够对这些细菌群落随着时间的推移而呈现的稳定性有所了解。对于为了长期的健康干预而用这些多样的微生物作为标靶而言，定义人类肠道微生物群落的稳定性是至关重要的。然而，科学家们对有关这些微生物株在我们肠道中是多么难以
迄今最详细合成肠道微生物群构建
美国研究人员在最新一期《细胞》杂志上撰文指出，他们构建出了迄今最详细、最完整的合成肠道微生物群——由100多种细菌组成，并将其成功移植到小鼠体内。能够添加、删除和编辑单个细菌，将使科学家更好地理解肠道微生物群与健康之间的联系，并最终开发出一流的微生物组疗法。 此前研究表明，肠道微生物群会影响人的
微生物群移植可改善剖宫产婴儿神经发育
原文地址：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/6/503149.shtm南方医科大学教授谢日华、何彦与上海交通大学附属第六人民医院副研究员陈天璐、美国西奈山伊坎医学院Jose Clemente等合作发现，将母亲阴道中的细菌转移到经由剖宫产分娩的新生儿身上，
研究发现胎盘内还有特殊的微生物群
很长一段时间以来，胎盘被认为是处于一种完全无菌的环境。然而最近的研究发现胎盘中确实存在独特的微生物群落。虽然，正常情况下这些微生物是不治病的，但是，研究显示这种微生物群落可能和婴儿的早产存在一定的关系。 早在2012年，美国休斯顿Baylor医学院Kjersti Aagaard研
研究揭示微生物群能调节人体应激反应
据11月5日《细胞代谢》杂志报道，来自爱尔兰国立科克大学和爱尔兰微生物组研究中心的一项突破性研究揭示，肠道中数以万亿计的微生物群通过与人体昼夜节律相互作用，在调节应激反应中发挥着关键作用。 研究表明，肠道微生物群能够调节人体应激激素的昼夜节律。肠道微生物群的消耗会导致大脑核心昼夜节律系统紊乱，
《自然》撰文探究微生物群落研究未来走势
科学家一直在探究人体内的微生物群落对健康和疾病的影响，现在该领域的研究正在从一知半解向全面、普适化方向发展。过去5年来，研究者的主攻方向是寄居在人体中的微生物对多种疾病的影响，例如糖尿病、癌症及自闭症。 随着研究的推进，公众对微生物菌落的热情也在升温，《纽约时报》就曾以“我们是细菌”为标题予以
新研究揭示微生物群落组装机制
原文地址：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/11/511972.shtm中山大学中山医学院教授丁涛团队研究揭示了人类口腔生物被膜（OBM）菌群过程中的纵向时序群体感应网络，并通过实验验证了细菌群体感应网络在预测和操纵菌群装配过程中的有效性。近日，相关成果
肠道微生物群可以防止急性砷中毒
在蒙大拿州立大学进行的研究表明，人体肠道中的微生物在防止砷毒性方面发挥着重要作用，这一问题影响了通过受污染的饮用水接触砷的大约2亿人。 在过去的五年中，MSU博士候选人Michael Coryell与他的顾问Seth Walk和委员会成员Timothy McDermott一起研究人类肠道
如何推测微生物群落的“城堡”是否坚固
原文地址：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2024/3/519478.shtm近年来，肠道菌群健康及其对疾病预防和治疗已成为热门话题。人体肠道微生物组在抵抗致病菌定殖过程中发挥着重要作用，健康的肠道菌群像是一座坚固的城堡，定殖抗性则是城堡的防御系统，能够识别并抵
咖啡能带来更健康的肠道微生物群？
一项新的研究表明，咖啡因的摄入与健康的肠道微生物群有关。肠道微生物群是生活在消化道中的数万亿微生物，它们影响着你的整体健康。 近年来，大量研究表明，从2型糖尿病到某些癌症再到帕金森氏症，饮用咖啡与降低各种健康风险之间存在关联。 与此同时，越来越多的证据表明，肠道微生物群落的组成可能会影响你的
J－Virol：肠道微生物群落如何影响HIV进展
HIV或许是一种肠道疾病，这种概念容易让我们忽视该病因性传播和血液传播的特性，而实际上HIV感染并且杀灭的是CD4+细胞，而大约三分之二的T细胞都位于肠道中的淋巴组织中，在那里HIV就会繁殖扩散。近年来对血液的研究得到了越来越多科学家们的关注，因为血液可以在全身不断循环，而肠道似乎难以到达，研究
－Nature－：肠道微生物群丰富程度对健康的影响
肥胖是心血管病、糖尿病、骨质疏松症和包括一些癌症在内的其他疾病的一个风险因素。必须有其他影响因素存在，才能确定肥胖者会患哪种代谢疾病。本期Nature上两篇论文分析这些因素中的一个所起作用，这个因素就是肠道微生物群的丰富程度。Le Chatelier等人分析了非肥胖者和肥胖者的肠道微生物基因
Nat－Commun：Tempol通过改变肠道微生物群降低肥胖
2013年9月24日，Nature Communications上发表的一篇论文提出，抗氧化剂Tempol通过改变小肠微生物群来降低小鼠的肥胖。这项研究提出了肠道微生物群在药物作用和体重调控中都有所涉及的另一个例子，同时也揭示了小肠中一个可能会被证明是减肥药物有用目标的信号通道。 Fr
父亲对新生儿微生物群也有贡献
母亲对新生儿微生物群构成的贡献已经有了很好的记录，现在荷兰和意大利科学家发现，父亲或许对婴儿肠道微生物组成也有重要贡献。相关研究6月12日发表于《细胞宿主和微生物》。胎儿胃肠道是无菌的，婴儿的身体在出生时和出生后不久就有了微生物定植。婴儿肠道菌株中大约有一半可以追溯到母亲的肠道。这让研究人员推测，其
玉米根际微生物群落组装策略获揭示
近日，中国农业科学院农业资源与农业区划研究所植物营养团队揭示了养分胁迫下玉米根际微生物群落以功能需求为原则的组装策略。相关成果发表在《新植物学家》（New Phytologist）上。作物通过调控根际微生物群落结构和功能，可以有效提高作物养分利用效率。然而，根际微生物组在不同土壤类型和养分水平下的组
粪便微生物群移植传播耐药大肠杆菌菌血症
美国马萨诸塞州总医院Elizabeth L. Hohmann课题组发现，耐药性大肠杆菌菌血症可通过粪便菌群移植传播。该研究10月30日在线发表于《新英格兰医学杂志》。据悉，粪便微生物群移植（FMT）是一种治疗复发性难治性艰难梭菌感染的新方法，目前正在积极研究其他适用条件。 该研究团队描述了两名
减不了肥？这要怪你的肠道微生物群
根据一项新的研究，与减肥成败最密切相关的因素是肠道微生物群，与体重指数（BMI）无关。研究结果于本周发表在美国微生物学会开放获取期刊《mSystems》上。 研究主要作者、美国西雅图系统生物学研究所科学家克里斯蒂安·迪纳博士称：“你的肠道微生物群可以帮助或导致对减肥的抵御，这开辟了尝试通过改变
解开人类微生物群系奥秘，可能成为抗癌帮手
抗癌疗法如今是各家国际药厂竞争白热化的领域，各种理论推陈出新，而最新的研究方向，则是找上了人体中数以兆计的“小小兵”做为抗癌的帮手，那就是包括肠道菌在内的人类微生物群系（Microbiome），过去肠道菌疗法多用于治疗肠道疾病如困难梭状芽孢杆菌（Clostridium difficile）感染以
婴儿早期肠道微生物群与食物敏感性有关
日本理研综合医学科学中心（IMS）的Hiroshi Ohno领导的一项研究最近表明，在一个月大的婴儿身上发现的某些肠道细菌与食物敏感性和食物过敏的发展有关，尤其是对鸡蛋，而其他类型的细菌则没有。该研究还发现了预测新生儿肠道中存在哪种细菌的因素。总之，这些发现表明，某些益生菌补充剂可能是预防食物过敏的
新研究发现体内微生物群体失衡可能导致癌症
尽管在癌症的预防和治疗方面取得了重大进展，但恶性肿瘤导致的死亡人数逐年稳步上升。在工业化国家，每两三个人中就有一个人在一生中患上一种癌症，而且这一趋势还在上升。长期以来，某些病原体，特别是病毒和细菌，被认为是癌症的潜在病因。三种病毒和一种细菌被认为是危险因素：人乳头瘤病毒、人乙型和丙型肝炎病毒，
新方法实现跨物种微生物群落可控组装
自然界微生物群落发挥着重要作用。土壤中的微生物菌群在碳循环中发挥重要作用；肠道微生物菌群在代谢营养物质和防止病原体入侵方面起着关键作用。 如何让不同类型的微生物相互交流并行使更多的功能？ 中科院深圳先进技术研究院合成生物所戴卓君团队在人工合成微生物群落领域，针对跨物种菌群因为竞争关系难以稳定
甜味剂影响人体微生物群并能改变血糖反应
自19世纪晚期以来，非营养性甜味剂承诺在不含热量的情况下提供糖的甜味。长期以来，人们一直认为它们对人体没有影响，但一项新研究发现，这些糖的替代品并非惰性的，事实上，其中一些可以改变人体微生物群，从而改变人体的血糖水平。相关论文8月19日发表于《细胞》杂志。 早在2014年，该论文通讯作者、以色列