青岛能源所新一代元基因组平台建设取得进展
元基因组是指一定环境下整个微生物群落中的所有遗传信息的总和。元基因组数据的收集与分析克服了传统分离培养方法仅局限于群落中可培养组分（一般仅占1%）的缺陷，使挖掘、认识与利用不可培养的组分（即另外之99%）成为可能，为全面研究自然状况下微生物群落的结构与功能提供了新途径。 元基因组的研究和分析需要一套强大、完整的序列收集和生物信息学分析平台。在科技部863、中国科学院信息化E-Science等项目的资助下，中国科学院青岛生物能源与过程研究所功能基因组团队负责人、中科院“百人计划”入选者徐健研究员等开发了基于第二代测序技术与超算技术相结合的新一代元基因组实验与计算平台。该平台能够实现大规模、高通量、高自动化的元基因组数据采集、分析，涵盖了元基因组原始数据质量评价工具、高通量与多维化元基因组分析与比较方法以及群落数据可视化工具等核心分析环节，能够从系统和网络水平上认识、模拟和筛选微生物个体和群体的结构、功能及调......阅读全文
新研究发现体内微生物群体失衡可能导致癌症
尽管在癌症的预防和治疗方面取得了重大进展，但恶性肿瘤导致的死亡人数逐年稳步上升。在工业化国家，每两三个人中就有一个人在一生中患上一种癌症，而且这一趋势还在上升。长期以来，某些病原体，特别是病毒和细菌，被认为是癌症的潜在病因。三种病毒和一种细菌被认为是危险因素：人乳头瘤病毒、人乙型和丙型肝炎病毒，
新方法实现跨物种微生物群落可控组装
自然界微生物群落发挥着重要作用。土壤中的微生物菌群在碳循环中发挥重要作用；肠道微生物菌群在代谢营养物质和防止病原体入侵方面起着关键作用。 如何让不同类型的微生物相互交流并行使更多的功能？ 中科院深圳先进技术研究院合成生物所戴卓君团队在人工合成微生物群落领域，针对跨物种菌群因为竞争关系难以稳定
早产或与胎盘中微生物有关
美国一个研究小组说，孕妇胎盘并不像人们此前认为的那样是一个无菌环境，而是生存着一个小型但多元的微生物群落。这些微生物直接影响胎儿的健康，甚至可能与胎儿是否早产有关。 微生物群落是细菌、病毒与真菌等的总称。休斯敦贝勒医学院副教授谢斯蒂·奥高及同事在美国《科学转化医学》杂志上报告说，新研究表明，孕
早产或与胎盘中微生物有关
美国一个研究小组说，孕妇胎盘并不像人们此前认为的那样是一个无菌环境，而是生存着一个小型但多元的微生物群落。这些微生物直接影响胎儿的健康，甚至可能与胎儿是否早产有关。 微生物群落是细菌、病毒与真菌等的总称。休斯敦贝勒医学院副教授谢斯蒂·奥高及同事在美国《科学—转化医学》杂志上报告说，新研究表明，
Cell：靶向作用肠道微生物群落或可帮助治疗心脏疾病
最近，来自克利夫兰诊所的研究人员通过研究首次发现，靶向作用肠道微生物可以帮助抑制由富含红肉、鸡蛋及高脂肪乳制品而引发的心脏疾病；这项研究发现基于研究人员此前的研究结果，之前他们发现，氧化三甲胺（TMAO）—一种在动物脂肪消化过程中在肠道中产生的副产物，和动脉粥样硬化及心脏疾病的发生直接相关。
肠道微生物群落或与人类结肠炎发生有关
肠道内稳态（intestinal homeostasis）是由特化的宿主细胞和肠道微生物群落所维持，Wnt/β-连环蛋白信号对于胃肠道的发育和平衡至关重要，其功能失调往往与炎症和结直肠癌的发生有关；Axin1能负向调节活化的Wnt/β-连环蛋白信号，但研究人员对于其在调节人类健康和疾病过程中的宿
新方法可有效靶向调控肠道微生物群落功能
近日，中国农业科学院北京畜牧兽医研究所研究员赵圣国、王加启等开发建立了优势酶结构驱动的微生物群靶向功能调控方法，相关研究成果发表在国际期刊iMeta上。微生物群落在各种生态系统中发挥着关键作用，尽管对微生物群落的种类和功能多样性进行了广泛研究，但调控靶向微生物功能的有效技术仍然有限。传统的微生物组调
人死后体内微生物群仍有重要科研价值－预测疾患状况
据国外媒体报道，研究人员近日发现，人死后体内的微生物群可用来预测特定的疾患状况，如是否患有心脏病等。这意味着，研究“死后微生物群”或能帮助研究人员调查公众的健康情况，“可作为评估人群健康水平的有效工具”。该研究的主要作者、密歇根州立大学法医昆虫学家珍妮弗·佩恰尔（Jennifer Pechal）
肠道和精液微生物群失调与特发性男性不育有关
虽然现在很多人表示不愿意生小孩或不想要二胎，但是当真正被检查出不孕不育时，从不想生到不能生的转变过程仍然是痛苦和绝望的。 在中国，越来越多人面临不孕不育的烦恼。据数据显示，2012-2018年期间，我国的不孕不育人数迅速从4000万大关上升到5000万大关。在这些不孕夫妇中，约有一半因男性因素
天然微生物群落如何调控杨树生长和耐盐性
接种不同土壤菌群对NL895杨无性系幼苗生长的影响 中国林科院亚林所供图不同土壤微生物群落在杨树幼苗根系的组装特征及其对苗木生长和耐盐的调控 中国林科院亚林所供图 近日，国际期刊《化学圈》（Chemosphere）在线发表了中国林业科学研究院亚热带林业研究所林业微生
Science：揭示天然的多反应性IgA识别微生物群机制
免疫球蛋白A（IgA）是一种最为丰富的哺乳动物抗体类型。在稳态下，80%以上的分泌抗体的浆细胞产生IgA。IgA在肠道粘膜等屏障表面上特别丰富，在那里，它与先天性的调节物（包括粘液和抗菌肽）一道组成第一道防线。IgA被认为包被着驻留在肠道中的共生微生物群（commensal microbiota
肠道微生物群影响小鼠骨骼肌的质量和功能
一个国际研究小组发现，小鼠肠道微生物群在骨骼肌质量维持和功能方面发挥着重要作用。在发表于《Science Translational Medicine》杂志上的论文中，该小组描述了他们在野生和实验室饲养的小鼠上的实验，以及他们的最新发现。图片来源：https://cn.bing.com 在过去
改良肠道微生物群－治疗患儿胃肠道和行为症状
肠道微生物作为人体最庞大、最复杂的微生态系统，不仅关乎了人体的生理功能，许多研究表明某些心理疾病也受肠道微生物的影响，比如困扰当代许多人的自闭症。 近日由Dae-Wook Kang发表的一篇名为《微生物转移治疗对自闭症和肠道微生物的长期疗效》指出自闭症谱系障碍(ASD)患者肠道微生物群与自闭症
剖宫产术后微生物群改变对婴儿免疫系统的影响
来自卢森堡大学卢森堡系统生物医学中心(LCSB)的科学家与瑞典和卢森堡的同事一起观察到，在自然产道分娩期间，来自母亲肠道的特定细菌会传给婴儿并刺激婴儿的免疫反应。剖宫产打断了这种微生物传播方式。“这或许可以解释为什么从流行病学角度来说，剖宫产的孩子比顺产的孩子更容易患上免疫系统相关慢性疾病，”领
城市环境所微生物群落环境响应研究获进展
土壤水分条件是微生物呼吸活性及生态功能实现的重要因素，干旱或极端淹水均不利于土壤中多数微生物实现最佳能量生产与代谢。土壤从干旱向淹水的转变过程会在短时间内发生，微生物活动受到刺激并被抑制。目前，对该过程中潜在微生物的响应机制仍缺乏了解。 中国科学院城市环境研究所研究员姚槐应研究组通过土壤DNA
鱼类肠道微生物群落调控机制研究上取得重要进展
日前，珠江水产研究所养殖与营养研究室谢骏研究员团队在草鱼肠道微生物群落调控机制上取得重要进展，研究成果发表系列SCI论文。 养殖鱼类对营养物质消化吸收是以肠道微生物群落稳态为前提，肠道微生物群落失调将直接影响鱼类对饲料的利用效率，急剧加重养殖水体污染负担。鱼类肠道微生物群落失调已成为影响鱼类健
青岛能源所元基因组计算方法学研究取得新进展
近日，在科技部863计划、国家自然科学基金等项目的支持下，中国科学院青岛生物能源与过程所功能基因组团队在元基因组计算方法学取得了系列进展。 纤维素降解、沼气生成等生物能源过程均由复杂微生物群落完成。元基因组学可克服自然界中大部分微生物难以培养的问题，通过直接测定、分析微生物群落
宏基因组及宏转录组测序揭示极端环境微生物的生态学作用
中山大学与千年基因合作应用宏基因组及宏转录组测序对极端环境酸性矿山废水（Acid mine drainage, AMD）中的微生物群落进行研究，相关成果于11月7日发表于The ISME Journal杂志。 本研究是继2012年11月发表于The ISME Journal杂志的微生物群落多样
北京生科院提出微生物组解析新技术
1月23日，国际学术期刊《自然-通讯》（Nature Communications）在线发表了中国科学院北京生命科学研究院计算基因组学实验室赵方庆团队题为MetaSort untangles metagenome assembly by reducing microbial community
研究揭示植物抗病基因与根际微生物群落新型关系
近日，中国农业科学院蔬菜花卉研究所蔬菜病害防控创新团队揭示了抗病基因（R基因）可重塑植物根际微生物群落，并通过招募有益微生物作为核心微生物种群，构建更加稳定和复杂的微生物网络结构，从而提高植物抗病性的新机制。相关研究结果发表在《微生物组》(microbiome)上。接种NA13的植株（左）可提高植物
我国科学家发现火山热液系统可孕育微生物群落
原文地址：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/7/504917.shtm近日，国际学术期刊《地球物理学研究杂志-海洋》以封面文章形式报道了中国科学院海洋研究所在西太平洋马努斯弧后盆地超酸性火山-热液系统的最新研究成果。科研人员通过开展原位综合定量探测和微生
机器学习模型从肠道微生物群预测癌症免疫治疗反应
“研究结果表明，机器学习模型可以揭示微生物群-免疫疗法的相互作用，最终可能改善癌症患者的预后。” 纽约州布法罗- 2022年7月19日-一篇新的研究论文于2022年7月19日发表在Oncotarget杂志上，题为“使用机器学习模型预测肠道微生物群的癌症免疫治疗反应”。“在过去的十年中，使用靶向免疫
Soil－Biology－－Biochemistry：土壤微生物群落定量研究优化策略
近日，中国农业科学院农业资源与农业区划研究所植物营养团队研究提出土壤微生物群落定量研究优化策略。相关成果发表在《土壤生物学与生物化学（Soil Biology & Biochemistry）》上。 微生物群落的组成和功能在人类健康、全球元素循环、作物生长和植物抗病中发挥关键作用。随着高通量测序
上海交通大学权威期刊最新综述介绍微生物群体调控机制
上海交通大学微生物代谢国家重点实验室、生命科学技术学院何亚文团队周莲副研究员以第一作者在国际微生物领域综述期刊《微生物学进展》(Trends In Microbiology, 2015年影响因子9.5)上发表了最新综述论文。文章针对农作物病原黄单胞菌的群体感应调控机制，全面系统地总结了DSF-家
中外科学家全方位分析全球微生物群落
6月14日，第一届地球环境微生物计划(EMP)会议在深圳召开。世界各国科学家将携手全方位分析全球范围内微生物群落的多样性及功能。项目将对全球典型的环境样本进行宏基因组测序，其中包括土壤、海洋、空气、淡水生态系统等整个地球表面的绝大多数的微生物群落。 会上，来自各国的专家学者相互分享了微生物
青藏高原土壤微生物群落对温度的响应机制
土壤微生物在陆地生态系统碳、氮循环中起着重要的作用，土壤微生物对全球变化的响应直接影响着生态系统的结构和功能。但是，人们尚不清楚土壤微生物对气候变暖或变冷的响应过程和机制是什么。 中国科学院成都生物研究所研究员李香真课题组芮俊鹏与中国科学院青藏高原研究所研究员汪诗平合作，在青藏高原利用土壤移植
微生物群落对土壤健康及作物产量的影响研究
土壤微生物调控土壤养分循环过程与植物生产力，是土壤健康的重要指标。在农业生态系统中，土壤微生物群落（细菌、真菌、线虫等）以多营养级微食物网形态共存，尤其在根-土界面（根际微环境）中发挥重要作用，直接或间接影响作物健康和产量。研究土壤微生物群落稳定性、多样性影响作物产量的作用机制，可为农业可持续性
水生所揭示斑马鱼肠道微生物群落构建及演替规律
生物多样性的形成和维持机制一直以来都是生态学研究的重要内容。针对群落的构建规律，生物多样性的时空格局是研究的重点，其中关注最多的是物种-面积理论，但主要是针对动、植物在典型岛屿的分布规律，而微生物方面的研究相对较少。由于动物消化道最开始是无菌的，之后通过迁入、迁出形成了特定的群落并维持
基因测序找出肠道核心微生物群－有助于判断多种疾病
人类肠道中有数以万亿计的微生物，也称为肠道菌群，与多种疾病如肠炎、肥胖、糖尿病等都有关系。最近，比利时鲁汶大学和荷兰格林宁根大学两个团队分别在《科学》杂志发表论文，通过两项大型研究计划找出了肠道核心微生物群，为进一步建立生物标记体系，评估肠道菌群是否正常提供了线索。 肠道微生物组能产生维生素、
顾为东谈雾霾：看不见的微生物群污染
“剖析雾霾产生的深层原因，掌握雾霾形成机理，才能从根本上解决中国雾霾治理难题。”日前，国家“973”计划风能项目首席科学家、江苏省发改委宏观经济研究院院长顾为东在谈到中国雾霾治理时对记者如是说。 顾为东通过对收集的国内外雾霾相关文献进行数理分析和实地试验研究后，认为造成中国雾霾频发严重的主要原