Eppendorf参加第一届地球环境微生物计划(EMP)会议

中国 深圳(2011年7月5日) 6月13-15日,全球领先的生物技术公司Eppendorf参加了由深圳华大基因、基因组标准协会(GSC)和地球环境微生物联盟(EMP)共同举办的 “第一届地球环境微生物计划(EMP)会议”。一直以来Eppendorf公司和地球环境微生物联盟(EMP)有着良好的长期合作,此次在中国举办的首届大会作为双方全球合作范围地区中又一新地区的扩充,以共同推进微生物基因组学的发展。 Eppendorf此次携带旗下高端PCR仪 Mastercycler pro、可同时处理2块96孔板的小型高速离心机5430、新款Xplorer电动移液器和可拆分的96孔PCR板等产品参会,引起了众多参会学者的兴趣。其中,可进行高通量全自动核酸提取的自动移液工作站epMotion 更成为诸多产品中的亮点。 “EMP计划”旨在全方位分析全球范围内微生物群落的多样性及功能,该项目将对全球......阅读全文

地球微生物或可污染地外天体环境

  导语:地球微生物可污染地外天体环境?据国外媒体报道,外层空间对生命而言是个非常极端的环境,但科学家发现一些顽强的生命能够在外太空生存。而这些微生物可能会污染地外天体环境,导致不清楚地外生命的起源。   据国外媒体报道,地球生命是否能够在外太空存活?外层空间对生命而言是个非常极端的环境,但科学家发

微生物宏基因组测序可以解释地球氮循环?

  微生物(细菌和古细等)是全球生物地球化学循环的重要驱动者。阐明微生物生物地理分布及其驱动过程对于预测环境变化将如何影响生物地球化学循环非常重要。以往微生物生物地理学的研究常常聚焦在物种的层面。然而,越来越多的研究表明,由于微生物群落固有的功能冗余性,微生物群落的功能变化通常与其物种组成变化是解耦

Eppendorf参加第一届地球环境微生物计划(EMP)会议

  中国 深圳(2011年7月5日) 6月13-15日,全球领先的生物技术公司Eppendorf参加了由深圳华大基因、基因组标准协会(GSC)和地球环境微生物联盟(EMP)共同举办的 “第一届地球环境微生物计划(EMP)会议”。一直以来Eppendorf公司和地球环境微生物联

基因组高通量测序的原理

测序方案建立在双脱氧测序法(Sanger等,1977)的基础上。为了从每一克隆插入片段两端成对地进行测序,每一个质粒模板DNA板应配备两个384孔循环测序反应板。测序反应采用Big Dye Terminator chemistry version 3.1(AppliedBiosystems)和标准M

第一届地球环境微生物计划会议在深圳召开

  6月14日,第一届地球环境微生物计划(EMP)会议在深圳召开。世界各国科学家将携手全方位分析全球范围内微生物群落的多样性及功能。项目将对全球典型的环境样本进行宏基因组测序,其中包括土壤、海洋、空气、淡水生态系统等整个地球表面的绝大多数的微生物群落。   会上,来自各国的专家学者相互分享了微生物

地球生物基因组计划正式启动

  据物理学家组织网报道,科学家近日在英国伦敦正式启动了一个庞大的全球性项目——地球生物基因组计划(EBP),准备在10年内对地球上所有150万种已知真核生物的基因组进行测序、编目和分类,预计耗资47亿美元。   科学家称,地球生物基因组计划是继人类基因组计划(HGP)之后的“下一个生物学登月计划”

基金委重视并推动微生物与地球环境相互作用研究

  如今地球环境危机、资源危机、健康危机日益严重,如何解决这些危机已成为现代科学研究所关注的重大科学问题。微生物是地球所有生命的奠基者,并逐渐改变着地球的环境,因而认知微生物与地球环境的相互作用机制不仅是解决上述问题的关键,也是环境微生物学研究本身的核心科学问题。国家自然科学基金委于2012年年底在

中美倡议启动“地球生物基因组计划”

  在美国斯密森尼生物多样性基因组学项目组与中国华大基因公司近日联合主办的生物基因组学会议(BioGenomics2017)闭幕论坛上,加州大学戴维斯分校基因组学家哈瑞斯·莱文等人和华大基因生物学家张国捷等组成的科研团队联合倡议,全球科学家合作开启另一项与人类基因组计划(HGP)类似的项目——地球生

中国科学家参与全球最大微生物基因组研究项目

  中国科学家22日宣布将参与全球最大微生物基因组研究项目(Earth Microbiome Project,EMP),并承担核心工作。该项目旨在全面、系统地研究全球范围内的微生物群落的功能及进化多样性,以便更好地造福人类。  与以往的微生物研究有所不同,该项目的研究对象不仅仅集中于海洋和

微生物或致地球生物灭绝

  据报道,研究发现,大约2.52亿年前,甲烷八叠球菌属微生物排出大量甲烷和二氧化碳气体,导致超过9成生物死亡。   美国麻省理工学院和中国科学院的科研人员联合研究认定,这类看似不起眼的微生物是生物“大灭绝”的“真凶”。   在大约2.52亿年前的二叠纪末期,陆地和海洋中共有超过90%的生物死亡

Nature:揭秘地球微生物组计划

  地球微生物组计划(Earth Microbiome Project)的目标是尽可能多地对地球微生物群落进行取样,以便促进人们对微生物及其与包括植物、动物和人类在内的环境之间的关系的理解。这一任务需要来自世界各地的科学家的帮助。到目前为止,这一计划已覆盖了从北极到南极的七大洲和43个国家,而且有超

“地球资源环境动态监测技术”项目组

   北京时间2017年9月8日12时49分墨西哥沿岸近海发生8.2级地震,9月20日2时14分墨西哥中部附近发生7.2级左右地震,两次地震给墨西哥人民带来了重大人员和经济损失。应墨西哥政府减灾机构请求,国家重点研发计划“地球观测与导航”重点专项“地球资源环境动态监测技术”项目组于9月10日通过“国

关注气候与水-保护地球环境

  2020年世界气象日的主题有些特殊,是与世界水日(3月22日)共用一个主题——“气候与水”。  这是因为气候与水密不可分,两者都是可持续发展、气候变化和减少灾害风险等全球目标的核心。  目前世界正面临着由缺水、洪水和干旱以及缺乏清洁供水等带来的挑战,迫切需要改进预报、监测和管理,并解决水资源超量

我国高通量微生物培养芯片研究取得进展

  微生物已经在工业、农业、能源、环境、医药等诸多领域发挥着无可替代的作用。筛选获得优良的菌种是提升相关产业技术水平的重要途径。通常,微生物的液体培养筛选需要同时在数十上百个培养瓶或试管中进行。这使得整个筛选过程劳动强度大,效率较低。   最近,中科院苏州纳米技术与纳米仿生研究所国际实验室的甘明哲

美国农业部加入地球生物基因组计划

  美国农业部(USDA)近日宣布,将正式加入“地球生物基因组计划”(EBP)的合作研究。USDA认为通过加入这个生物学领域的“登月计划”,必将给未来农业发展带来数百万个强大的、全新的应对挑战解决方案。   EBP是一项国际合作倡议,将在未来10年内对超过150万种物种的DNA进行测序。2018

美国农业部加入地球生物基因组计划

   美国农业部(USDA)近日宣布,将正式加入“地球生物基因组计划”(EBP)的合作研究。USDA认为通过加入这个生物学领域的“登月计划”,必将给未来农业发展带来数百万个强大的、全新的应对挑战解决方案。   EBP是一项国际合作倡议,将在未来10年内对超过150万种物种的DNA进行测序。2018年

微生物所在微流控高通量筛选塑料解聚酶研究中取得进展

  塑料污染是当今世界面临的重要环境问题之一,塑料污染不仅会破坏生物多样性、加剧气候变化,更危及人类和地球的健康。微生物降解塑料是理想、环保的方法,也是近年来的研究重点。目前已发现众多环境和宏基因组分析来源的塑料解聚微生物和酶,后续也利用理性和半理性设计改造以满足其在活性和热稳定性等方面需求。但目前

高通量的PCR模板植物基因组DNA制备方法(四)

2.3  高通量的分子标记检测 本方法制备的DNA浓度虽然低,用96针复制器加入0.5~1 µL模板进行33~35个PCR循环就可获得足够浓度的产物,并不需要加入特别多的Taq酶(甚至使用量为每45~50 µL PCR反应液1 U也能扩增分子标记)。该方法已对数万份水稻样品进行了分子标记(S

高通量的PCR模板植物基因组DNA制备方法(一)

摘  要:制备大量生物样品的模板DNA用于PCR检测是费时费人工的工作。本文介绍一种高通量的植物基因组DNA(gDNA)快速制备及其用于PCR基因型检测的操作方法。将一小段单子叶植物苗叶片(长度约30 mm或40 mm,与96方孔板的孔深大致相同) 或一小块(约2~4 mg)双子叶植物叶片放入9

高通量的PCR模板植物基因组DNA制备方法(二)

1.2  植物材料  1.2.1 水稻秧苗。将1.6-mL 96方孔板底部用6 mm电钻头打穿,或将旧96孔PCR板的底部剪去约4 mm。使用时将方孔板压入少量泥巴。每孔放入1粒萌动的水稻种子,在自然日光下(或人工气候箱)生长至3~4片叶。其他植物小苗也可用类似方法种植。 1.2.2 水稻大植株的鲜

高通量的PCR模板植物基因组DNA制备方法(三)

将纯化定量的水稻品种(93-11)基因组DNA标准样品(0.5~8 ng)与1.0 µL本方法制备的水稻品种(02428)基因组DNA混合作为模板,用InDel 标记引物(表1)进行PCR扩增和PAGE检测。箭头指某反应(或2个反应之间)其02428与93-11条带的信号值大致相等(即DNA

地球生命或诞生于零度环境

科学家发现在DNA之前还存在一个RNA世界,RNA被认为是“多才多艺”的遗传信息载体   据国外媒体报道,地球生命是否拥有一个极度寒冷的开端?科学家已经发现,早在35亿年前,地球上就开始出现了原始生命形式,根据1871年查尔斯· 达尔文的推测,早期生命可能开始于一个温暖的小池塘中,但

丁仲礼视察地球环境研究所

  7月22日,中国科学院副院长丁仲礼视察地球环境研究所。   丁仲礼听取了地球环境研究所所长刘禹研究员作的工作汇报,对地球环境研究所的发展历程、人才培养与队伍建设、基础设施建设、领导班子建设等方面取得的突出成绩给予充分肯定,他代表院党组对地球环境研究所全体干部职工的辛勤工作表示感谢

“地球资源环境动态监测技术”项目正式启动

  10月20日,国家重点研发计划“地球观测与导航”重点专项“地球资源环境动态监测技术”项目实施方案论证暨启动会在中国科学院遥感与数字地球研究所召开。来自项目参加单位的近90位科研骨干参加会议。  由遥感地球所研究员、中科院院士郭华东、国家卫星气象中心研究员卢乃锰、首都师范大学教授宫辉力等7位专家组

詹文龙视察地球环境研究所

        7月21日,中国科学院副院长詹文龙视察地球环境研究所。   詹文龙一行首先参观了西安加速器质谱中心,随后听取了刘禹所长的工作汇报。刘禹重点汇报了地环所试行马普模式以来在科研目标凝练、人才培养和吸引、基础设施建设和科研成果等方面的主要成效。   詹文龙对地球环境研究所

科学家再现超级地球内部极端环境

  美国和德国科学家最近合作进行了新的激光驱动冲击压力实验,在实验室再现太阳系外超级地球和巨行星深内部的极端环境,以及类地行星诞生时的混乱环境,利用超快光学测量技术揭示了构成行星的重要物质性质,这些物质决定了行星的形成和演化过程。相关论文发表在1月23日的《科学》杂志上。  石英(SiO2)是组成岩

地质地球所趋磁细菌生物控制矿化机理研究取得新进展

  铁元素是地壳中含量第四的元素,它不仅是生物所必须的微量元素之一,而且还可以影响海洋和陆地系统的地球化学性质,对于维护地球生态系统的稳定具有重要贡献。近年来,越来越多的研究表明微生物是调控全球铁元素地球化学循环的重要驱动力之一。其中,在体内矿化合成铁磁性矿物磁小体的趋磁细菌是一类重要的铁细菌功能群

宏基因组及宏转录组测序揭示极端环境微生物的生态学作用

  中山大学与千年基因合作应用宏基因组及宏转录组测序对极端环境酸性矿山废水(Acid mine drainage, AMD)中的微生物群落进行研究,相关成果于11月7日发表于The ISME Journal杂志。  本研究是继2012年11月发表于The ISME Journal杂志的微生物群落多样

苏州纳米所高通量微生物培养芯片研究取得进展

  微生物已经在工业、农业、能源、环境、医药等诸多领域发挥着无可替代的作用。筛选获得优良的菌种是提升相关产业技术水平的重要途径。通常,微生物的液体培养筛选需要同时在数十上百个培养瓶或试管中进行。这使得整个筛选过程劳动强度大,效率较低。   最近,中科院苏州纳米技术与纳米仿生研究所国际实验室的甘明哲

454高通量测序研究土壤微生物的新手段

在陆地生态系统中,在土壤中生活有数量庞大的微生物种群,包括原核微生物如细菌、蓝细菌、放线菌及超显微结构微生物, 以及真核生物如真菌、藻类( 蓝藻除外) 、地衣等。它们与植物和动物有着明确的分工,主要扮演“分解者”的角色,几乎参与土壤中一切生物和生物化学反应,担负着地球C、N、P、S 等物质循环