国家863计划课题“高性能计算化学应用系统”通过验收

7月21日,科技部高技术中心组织验收专家组对中国科学院计算机网络信息中心承担的国家863计划课题“高性能计算化学应用系统”进行了现场验收。 课题依托中国国家网格的软硬件资源,形成集标准化输入、高性能计算、计算结果可视化及智能分析为一体的、面向理论化学计算和药物分子设计的计算化学应用软件系统SCChem,包括三维分子建模软件GridMol,自主研发计算化学软件CCSD-EOM、NASC、HONPAS、BDF、Xi’an-CI、DMC2ZPE以及与著名计算化学商业软件的标准接口。在计算化学可扩展并行计算方面开展了深入研究,开发了可有效利用1024处理器/核的计算化学并行软件,并在新发光材料研究方面得到了实际应用。高性能计算化学应用系统在HF程序大规模并行化、基于网格环境的三维可视化分子建模软件GridMol、半经验的MRCI算法、多参考态二级微扰方法等方面的研究工作有所创新,具有良好的应用前景。 验收专......阅读全文

2010高性能计算理论与计算化学国际研讨会在哈尔滨召开

  12月6日至8日,由中国科学院计算机网络信息中心超级计算中心(SCCAS)“计算化学虚拟实验室”(VLCC)与哈尔滨理工大学(HUST)联合主办的2010高性能计算——理论与计算化学国际研讨会(ISTCC10)在哈尔滨市举行。来自美国、加拿大、俄罗斯、中国香港、中国大陆等五个国

国家863计划课题“高性能计算化学应用系统”通过验收

  7月21日,科技部高技术中心组织验收专家组对中国科学院计算机网络信息中心承担的国家863计划课题“高性能计算化学应用系统”进行了现场验收。   课题依托中国国家网格的软硬件资源,形成集标准化输入、高性能计算、计算结果可视化及智能分析为一体的、面向理论化学计算和药物分子设计的计算化

高性能科学计算的基础算法与可计算建模项目指南

  本重大研究计划以实际需求为牵引,从基础研究入手,加强科学计算领域的重要基础科学问题研究,设计高效基础算法,建立满足实际精度要求的可计算模型,提高利用计算机解决科学与工程问题的能力,为前沿科学研究和重大需求提供进一步的科学计算支撑,有力地促进科学计算硬件、软件协调发展,促进数学与其他学科的交叉融合

2012年高性能计算化学软件NWChem讲习班举办

  10月17日至19日,由中科院计算机网络信息中心、美国能源部西北太平洋国家实验室(PNNL)下属环境分子科学实验室(Environmental Molecular Sciences Laboratory,EMSL)和清华大学联合举办的“2012年高性能计算化学软件NWChem讲习班”在北

新型光子芯片突破高性能计算“带宽瓶颈”

原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/7/504111.shtm

“2012年理论与高性能计算化学国际会议”在南京举行

  7月8日至11日,由中国科学院计算机网络信息中心超级计算中心(SCCAS)计算化学虚拟实验室(VLCC)主办、南京理工大学协办的 “2012理论与计算化学国际研讨会”(ICT-HPCC12)在江苏省南京市召开。本次会议由美国国家科学院院士、Journal of Physical Chem

腺苷的计算化学数据

疏水参数计算参考值(XlogP):无氢键供体数量:4氢键受体数量:8可旋转化学键数量:2互变异构体数量:3拓扑分子极性表面积:140重原子数量:19表面电荷:0复杂度:335同位素原子数量:0确定原子立构中心数量:4不确定原子立构中心数量:0确定化学键立构中心数量:0不确定化学键立构中心数量:0

胆碱的计算化学数据

1. 疏水参数计算参考值(XlogP):-0.42. 氢键供体数量:13. 氢键受体数量:14. 可旋转化学键数量:25. 互变异构体数量:06. 拓扑分子极性表面积:20.27. 重原子数量:78. 表面电荷:19. 复杂度:46.510. 同位素原子数量:011. 确定原子立构中心数量:012.

蟾毒色胺的计算化学数据

疏水参数计算参考值(XlogP):无氢键供体数量:2氢键受体数数量:2可旋转化学键数量:3互变异构体数量:9拓扑分子极性表面积:39.3重原子数量:15表面电荷:0复杂度:208同位素原子数量:0确定原子立构中心数量:0不确定原子立构中心数量:0确定化学键立构中心数量:0不确定化学键立构中心数量:0

阿糖胞苷的计算化学数据

计算化学数据1、疏水参数计算参考值(XlogP):无2、氢键供体数量:43、氢键受体数量:54、可旋转化学键数量:25、互变异构体数量:36、拓扑分子极性表面积:1297、重原子数量:178、表面电荷:09、复杂度:38310、同位素原子数量:011、确定原子立构中心数量:412、不确定原子立构中心

溴酚蓝的计算化学数据

1.疏水参数计算参考值(XlogP):无2.氢键供体数量:23.氢键受体数量:54.可旋转化学键数量:25.互变异构体数量:36.拓扑分子极性表面积92.27.重原子数量:298.表面电荷:09.复杂度:66210.同位素原子数量:011.确定原子立构中心数量:012.不确定原子立构中心数量:013

组胺的计算化学数据

1.疏水参数计算参考值(XlogP):无2.氢键供体数量:23.氢键受体数量:24.可旋转化学键数量:25.互变异构体数量:26.拓扑分子极性表面积:54.77.重原子数量:88.表面电荷:09.复杂度:64.710.同位素原子数量:011.确定原子立构中心数量:012.不确定原子立构中心数量:01

草酸的计算化学数据

1.疏水参数计算参考值(XlogP):-0.32.氢键供体数量:23.氢键受体数量:44.可旋转化学键数量:15.互变异构体数量:无6.拓扑分子极性表面积:74.67.重原子数量:68.表面电荷:09.复杂度:71.510.同位素原子数量:011.确定原子立构中心数量:012.不确定原子立构中心数量

胆碱的计算化学数据

  1. 疏水参数计算参考值(XlogP):-0.4  2. 氢键供体数量:1  3. 氢键受体数量:1  4. 可旋转化学键数量:2  5. 互变异构体数量:0  6. 拓扑分子极性表面积:20.2  7. 重原子数量:7  8. 表面电荷:1  9. 复杂度:46.5  10. 同位素原子数量:

油酸的计算化学数据

1、疏水参数计算参考值(XlogP):无2、氢键供体数量:13、氢键受体数量:24、可旋转化学键数量:155、互变异构体数量:06、拓扑分子极性表面积:37.37、重原子数量:208、表面电荷:09、复杂度:23410、同位素原子数量:011、确定原子立构中心数量:012、不确定原子立构中心数量:0

精胺的计算化学数据

1、 疏水参数计算参考值(XlogP):-1.12、 氢键供体数量:43、 氢键受体数量:44、 可旋转化学键数量:115、 拓扑分子极性表面积(TPSA):76.16、 重原子数量:147、 表面电荷:08、 复杂度:86.19、 同位素原子数量:010、 确定原子立构中心数量:011、 不确定原

腺苷的计算化学数据

疏水参数计算参考值(XlogP):无氢键供体数量:4氢键受体数量:8可旋转化学键数量:2互变异构体数量:3拓扑分子极性表面积:140重原子数量:19表面电荷:0复杂度:335同位素原子数量:0确定原子立构中心数量:4不确定原子立构中心数量:0确定化学键立构中心数量:0不确定化学键立构中心数量:0

尿酸的计算化学数据

1.疏水参数计算参考值(XlogP):-1.92.氢键供体数量:43.氢键受体数量:34.可旋转化学键数量:05.互变异构体数量:436.拓扑分子极性表面积:99.37.重原子数量:128.表面电荷:09.复杂度:33210.同位素原子数量:011.确定原子立构中心数量:012.不确定原子立构中心数

赤藓糖醇计算化学数据

  疏水参数计算参考值(XlogP):-2.3  氢键供体数量:4  氢键受体数量:4  可旋转化学键数量:3  拓扑分子极性表面积(TPSA):80.9  重原子数量:8  表面电荷:0  复杂度:48  同位素原子数量:0  确定原子立构中心数量:2  不确定原子立构中心数量:0  确定化学键立

肌酐计算化学数据

  1.共价键单元数量:1  2.氢键供体数量:1  3.氢键受体数量:1  4.可旋转化学键数量:0  5.互变异构体数量:5  6.拓扑分子极性表面积58.7  7.重原子数量:8  8.表面电荷:0  9.复杂度:151  10.同位素原子数量:0  11.确定原子立构中心数量:0  12.不

睾酮的计算化学数据

1、疏水参数计算参考值(XlogP):无2、氢键供体数量:13、氢键受体数量:24、可旋转化学键数量:05、互变异构体数量:56、拓扑分子极性表面积:37.37、重原子数量:218、表面电荷:09、复杂度:50810、同位素原子数量:011、确定原子立构中心数量:612、不确定原子立构中心数量:01

腺苷的计算化学数据

疏水参数计算参考值(XlogP):无氢键供体数量:4氢键受体数量:8可旋转化学键数量:2互变异构体数量:3拓扑分子极性表面积:140重原子数量:19表面电荷:0复杂度:335同位素原子数量:0确定原子立构中心数量:4不确定原子立构中心数量:0确定化学键立构中心数量:0不确定化学键立构中心数量:0

泼尼松的计算化学数据

疏水参数计算参考值(XlogP):1.5氢键供体数量:2氢键受体数量:5可旋转化学键数量:2互变异构体数量:27拓扑分子极性表面积(TPSA):91.7重原子数量:26表面电荷:0复杂度:764同位素原子数量:0确定原子立构中心数量:6不确定原子立构中心数量:0确定化学键立构中心数量:0不确定化学键

丙酮的计算化学数据

疏水参数计算参考值(XlogP):-0.1氢键供体数量:0氢键受体数量:1可旋转化学键数量:0互变异构体数量:2拓扑分子极性表面积:17.1重原子数量:4表面电荷:0复杂度:26.3同位素原子数量:0确定原子立构中心数量:0不确定原子立构中心数量:0确定化学键立构中心数量:0不确定化学键立构中心数量

腺苷-的计算化学数据

疏水参数计算参考值(XlogP):无氢键供体数量:4氢键受体数量:8可旋转化学键数量:2互变异构体数量:3拓扑分子极性表面积:140重原子数量:19表面电荷:0复杂度:335同位素原子数量:0确定原子立构中心数量:4不确定原子立构中心数量:0确定化学键立构中心数量:0不确定化学键立构中心数量:0

阿糖胞苷的计算化学数据

1、疏水参数计算参考值(XlogP):无2、氢键供体数量:4 3、氢键受体数量:5 4、可旋转化学键数量:2 5、互变异构体数量:3 6、拓扑分子极性表面积:129 7、重原子数量:17  8、表面电荷:0 9、复杂度:383 10、同位素原子数量:0 11、确定原子立构中心数量:4 12、不确定原

吡啶的计算化学数据

  疏水参数计算参考值(XlogP):无  氢键供体数量:0  氢键受体数量:1  可旋转化学键数量:0  互变异构体数量:0  拓扑分子极性表面积:12.9  重原子数量:6  表面电荷:0  复杂度:30.9  同位素原子数量:0  确定原子立构中心数量:0  不确定原子立构中心数量:0  确定

地高辛的计算化学数据

疏水参数计算参考值(XlogP):1.3氢键供体数量:6氢键受体数量:14可旋转化学键数量:7互变异构体数量:0拓扑分子极性表面积(TPSA):203重原子数量:55表面电荷:0复杂度:1450同位素原子数量:0确定原子立构中心数量:21不确定原子立构中心数量:0确定化学键立构中心数量:0不确定化学

泼尼松的计算化学数据

疏水参数计算参考值(XlogP):1.5氢键供体数量:2氢键受体数量:5可旋转化学键数量:2互变异构体数量:27拓扑分子极性表面积(TPSA):91.7重原子数量:26表面电荷:0复杂度:764同位素原子数量:0确定原子立构中心数量:6不确定原子立构中心数量:0确定化学键立构中心数量:0不确定化学键

腺苷的计算化学数据

疏水参数计算参考值(XlogP):无氢键供体数量:4氢键受体数量:8可旋转化学键数量:2互变异构体数量:3拓扑分子极性表面积:140重原子数量:19表面电荷:0复杂度:335同位素原子数量:0确定原子立构中心数量:4不确定原子立构中心数量:0确定化学键立构中心数量:0不确定化学键立构中心数量:0