《自然》封面:新方法根据结构预测功能
来自美国加州大学旧金山分校药理化学系,得克萨斯农工大学(Texas A&M University),Albert Einstein 医学院的研究人员利用一种变通的分子对接方法(一种用来寻找潜在药物的计算机辅助的模拟方法),设计出一种根据结构来预测某种具有未知活性的酶的功能的方法。如果这一新方法也适用于其他酶,那么就可以作为一种有力工具确定关键的酶在体内是如何发挥作用的。这一研究成果公布在《Nature》封面上。 原文检索:Nature 448, 775-779 (16 August 2007) | doi:10.1038/nature05981; Received 24 January 2007; Accepted 7 June 2007; Published online 1 July 2007Structure-based activity prediction for an enzyme of unknown ......阅读全文
趋磁细菌合成磁小体机制揭开-独特蛋白折叠磁铬
一支由法国原子能及可替代能源署(CEA)领导、法国国家科研中心(CNRS)参与研究的国际团队通力合作,揭示了趋磁细菌体内一种名为MamP的蛋白质主导合成磁小体的机制及其结构特征。该研究使得人们对“生物矿化”有了进一步的理解,同时也为生物纳米磁体在医学和污水处理等方面的广泛应用提供了新机遇。相关研
研究解码内质网应激与未折叠蛋白响应的关系
中国科学院生物物理研究所王立堃研究员团队开发了一种新型的荧光报告系统,揭示了在多种生理和病理条件下,内质网蛋白稳态的动态变化。相关论文近日发表于《细胞报告》。内质网是负责蛋白质折叠和运输的重要细胞器。内质网中的蛋白质折叠压力,可能导致未折叠或错误折叠的蛋白质积累,即“内质网应激”。这一情况会激活未折
PNAS:生命起源于高盐环境下的可折叠蛋白
生命起源是无生命分子形成生命系统的过程。地球上的第一个生命应该是微观的,它必须能够进行自我复制,还要能适应当时的环境条件。那么在生命之初到底是先有蛋白还是先有RNA呢? 目前科学家们普遍接受的理论是“RNA起源”假说,即RNA是第一个生命分子。但日前,佛罗里达州立大学医学院的一项最新研究为生命
上海药物所蛋白质折叠计算模拟研究取得进展
在生物体系中,蛋白质通过折叠成特定的三维结构发挥功能。这种折叠过程可能受到不同因素的影响,如配体结合、聚合状态等。充分理解蛋白质折叠过程对于药物分子设计、蛋白质突变所导致致病机理的预测、深入了解细胞功能以及进化都至关重要。大规模计算机模拟有潜力从原子水平捕捉整个蛋白系统的动态过程,但是
研究解码内质网应激与未折叠蛋白响应的关系
中国科学院生物物理研究所王立堃研究员团队开发了一种新型的荧光报告系统,揭示了在多种生理和病理条件下,内质网蛋白稳态的动态变化。相关论文近日发表于《细胞报告》。 内质网是负责蛋白质折叠和运输的重要细胞器。内质网中的蛋白质折叠压力,可能导致未折叠或错误折叠的蛋白质积累,即“内质网应激”。这一情况会
AI生成超越自然界的蛋白?
美国研究人员使用人工智能(AI)来设计超越自然界的新蛋白质。他们开发的机器学习算法,可生成具有特定结构特征的蛋白质,这些蛋白质可用于制造具有特定机械性能(如刚度或弹性)的材料,从而取代作为原料的石油或陶瓷。研究论文发表在最新一期《化学》杂志上。 麻省理工学院、IBM沃森AI实验室和塔夫茨大学研究人
简述周期蛋白依赖性蛋白激酶的结构
在结构上,Cdks有三个重要的功能域。第一个功能域是ATP的结合部位和该酶的活性部分;第二功能域是调节亚基(Cyclin)的结合部位;第三功能域是P13suc1的结合部位(P13suc1能抑制激酶活性,阻止细胞进入或退出M期)。各种Cdk在细胞周期内特定的时间被激活,通过磷酸化底物,驱使细胞完成
上海光源用户在《自然》发表两项蛋白晶体结构研究成果
一、葡萄糖转运蛋白GLUT1-4的结构与机理研究 10月18日,清华大学医学院教授颜宁研究组在Nature以Research Article的形式发表了题为Crystal structure of a bacterial homologue of glucose transporter
肌动蛋白的结构组成
肌动蛋白是细胞中两种细丝的单体 亚基 :细丝,细胞骨架的三个主要成分之一,以及细丝,是肌细胞中收缩装置的一部分。它可以作为称为G-肌动蛋白 (球状)的游离单体存在,或作为称为F-肌动蛋白 (丝状)的线性聚合物 微丝的一部分存在,这两者对于细胞的移动和收缩等重要的细胞功能是必不可少的。
弹性蛋白酶的结构
弹性硬蛋白是一种由丙氨酸、亮氨酸、异亮氨酸等非极性氨基酸残基交联而成的网状结构,它可以耐受酸碱处理,并能抵抗一般蛋白酶的消化。
关于微管蛋白的结构简介
是一种球蛋白,是细胞内微管的基本结构单位。它是由两个蛋白质分子,即α-、β-微管蛋白分子聚合而成的异二聚体;每个这样的二聚体又与两个核苷酸分子相结合,一个属紧密结合,另一个为疏松结合,而且可以快速交换。分子量12万,沉降系数6s。微管蛋白有两个尺寸相等而结构不同的亚基(α和β)。其亚基分子量为5
关于糖蛋白的结构介绍
糖蛋白中的糖链变化较大,含有丰富的结构信息。寡糖链往往是受体、酶类的识别位点。 1、 N-糖苷键型(N-连接) N-糖苷键型主要有三类寡糖链: ① 高甘露糖型,由GlcNAc和甘露糖组成; ② 复合型:除了GlcNAc和甘露糖外、还有果糖、半乳糖、唾液酸; ③ 杂合型,包含①和②的特征
脂蛋白(a)的结构及组成
1.1 Lp(a)的结构及组成 Lp(a)是一种富含胆固醇的脂蛋白,核心部分为中性脂质和apoB-100分子,其外围包绕着亲水性的apo(a),二者以二硫键共价连接;其中apo(a) 是Lp(a)的特征性糖蛋白成分,主要由一种称为Kringle的特征性结构构成,Kringle由80~114个氨基
肌动蛋白的结构特性
它的氨基酸序列也是最高度保守的蛋白质之一,因为它在进化过程中几乎没有变化 ,在藻类和人类等多种物种中的差异不超过20%。它有两个显着特征:它是一种缓慢水解 ATP的酶 ,是生物过程的“通用能量货币”。 但是,ATP是必需的,以保持其结构完整性。其高效的结构由几乎独特的折叠过程形成。此外,它能够比任何
低密度脂蛋白的结构
每个天然低密度脂蛋白颗粒都能够乳化,即围绕所携带的脂肪酸,使这些脂肪能够在细胞外的水中在身体周围移动。每个颗粒包含一个载脂蛋白B-100分子(ApoB-100,一种具有4536个氨基酸残基和514kDa质量的蛋白质),以及80到100个额外的辅助蛋白质。每个低密度脂蛋白都有一个高度疏水的核心,由称为
载脂蛋白CII的结构
人Apo CⅡ为含79个 氨基酸残基的单链多肽,分子量为9.1kD。先合成的Apo CⅡ含101氨基酸残,其中 22个氨基酸构成信号肽,除去信号肽后则转变为成熟Apo CⅡ。Apo CⅡ的等电点为5.0,其氨基酸组成有3个特点: ⑴缺乏组氨酸和半胱氨酸; ⑵ 含有较多的极性氨基酸; ⑶苏氨酸及丝
G蛋白偶联受体结构介绍
G蛋白偶联受体均是膜内在蛋白(Integral membrane protein),每个受体内包含七个α螺旋组成的跨膜结构域,这些结构域将受体分割为膜外N端(N-terminus),膜内C端(C-terminus),3个膜外环(Loop)和3个膜内环。受体的膜外部分经常带有糖基化修饰。膜外环上包含有
蛋白质的基本结构
蛋白质是以氨基酸为基本单位构成的生物高分子。蛋白质分子上氨基酸的序列和由此形成的立体结构构成了蛋白质结构的多样性。蛋白质具有一级、二级、三级、四级结构,蛋白质分子的结构决定了它的功能。一级结构(primary structure):氨基酸残基在蛋白质肽链中的排列顺序称为蛋白质的一级结构,每种蛋白质都
微管蛋白的结构功能特点
是一种球蛋白,是细胞内微管的基本结构单位。它是由两个蛋白质分子,即α-、β-微管蛋白分子聚合而成的异二聚体;每个这样的二聚体又与两个核苷酸分子相结合,一个属紧密结合,另一个为疏松结合,而且可以快速交换。分子量12万,沉降系数6s。微管蛋白有两个尺寸相等而结构不同的亚基(α和β)。其亚基分子量为5.5
黄素蛋白的结构与功能
FAD或FMN与酶蛋白部分之间是通过非共价键相连,但结合牢固,因此氧化与还原(即电子的失与得)都在同一个酶蛋白上进行,故黄素核苷酸的氧化还原电位取决于和它们结合的蛋白质,所以有关的标准还原电位指的是特定的黄素蛋白,而不是游离的FMN或FAD;在电子转移反应中它们只是在黄素蛋白的活性中心部分,而其本身
样本蛋白的结构性质
了解样本蛋白的结构性质有助于选择最合适的抗体,至少两方面因素需要考虑。待测样本蛋白的结构域:抗体是由各种不同免疫原免疫宿主而制备得来,其中的免疫原包括:全长蛋白、蛋白片断、多肽、全有机体(如:细菌)或细胞,抗体说明书一般都有免疫原的描述,如果打算检测的是蛋白片断或一种特殊的同型物或蛋白全长的某一区
本周蛋白的结构及特性
凝溶蛋白又称本周蛋白(BJP)、本琼氏蛋白、本斯·琼斯氏蛋白(Bence-Jones protein),是免疫球蛋白的轻链单体或二聚体,属于不完全抗体球蛋白,由Bence Jones于一多发性骨髓瘤患者尿液中发现。分子量约4万,在pH4.9的酸性环境中加热至40℃~60℃凝固,温度上升到90℃~10
载脂蛋白E的结构
载脂蛋白E是一种富含精氨酸的碱性蛋白,人ApoE是由299个氨基酸残基组成,分子量为34145D,含32个Arg和12个Lys存在于血浆的CM、VLDL及其残粒和β-VLDL中均含有ApoE,一部分ApoE在血液中与ApoAⅡ形成复合体。 Shore于1973年首先发现ApoE,Rall等于1
波形蛋白的结构简介
一个波形蛋白单体,与其他中间丝相似,有着一个中央α螺旋结构域,在前端盖著一个非螺旋的胺基,及于末端盖著一个羧基。两个单体会互相扭曲,形成一个卷曲螺管形状的二聚物。两个二聚物会进一步形成一个四聚物,再与其他四聚物相连成为一片。 α螺旋序列包含一组疏水的氨基酸,这组氨基酸在螺旋表面形成一层“疏水性
G蛋白偶联受体结构介绍
G蛋白偶联受体均是膜内在蛋白(Integral membrane protein),每个受体内包含七个α螺旋组成的跨膜结构域,这些结构域将受体分割为膜外N端(N-terminus),膜内C端(C-terminus),3个膜外环(Loop)和3个膜内环。受体的膜外部分经常带有糖基化修饰。膜外环上包含有
铁蛋白的结构特点
铁蛋白的分子结构是由一层蛋白壳围绕着铁和磷酸盐分子组成的铁核,外径12~13nm,分子量500kDa。从不同来源(如人、马、牛蛙和细菌等)的铁蛋白结构特征来看,所有的铁蛋白虽然在一级结构上变化很大(氨基酸序列相似性有时才达到14%),但本质上都有相同的体系结构。蛋白壳均为由24个亚基以高度对称性方式
蛋白激酶A的结构简介
PKA全酶以四聚体形式存在,但PKA被靶向到特定组分时,也会在细胞中形成更高阶的结构。经典的PKA全酶结构由两个调节亚基(R亚基)和两个催化亚基(C亚基)组成。催化亚基包含活性位点、在结合和水解ATP的蛋白激酶中发现的一系列典型残基以及结合调节亚基的结构域。调节亚基具有结合到cAMP的结构域,该
血浆脂蛋白的组成结构
脂蛋白中脂质与蛋白质之间没有共价键结合,多数是通过脂质的非极性部分与蛋白质组分之间以疏水性相互作用而结合在一起。一般认为血浆脂蛋白都具有类似的结构,呈球状,在颗粒表面是极性分子,如蛋白质,磷脂,故具有亲水性;非极性分子如甘油三酯、胆固醇酯则藏于其内部。磷脂的极性部分可与蛋白质结合,非极性部分可与
简述网格蛋白的结构
有两种类型的轻链:α链和β链,二者的氨基酸有60%是相同的,但还不知道它们在功能上有什么差别。许多三腿复合物再组装成六边形或五边形网格结构,即包被亚基,然后由这些网格蛋白亚基组装成披网格蛋白小泡。
核糖核蛋白颗粒的结构
中文名称核糖核蛋白颗粒英文名称ribonucleoprotein particle定 义由RNA和蛋白质组合的颗粒体。如信号识别颗粒、端粒酶、核糖核酸酶P、核糖体、剪接体、编辑体等。应用学科生物化学与分子生物学(一级学科),核酸与基因(二级学科)