基因组测序诠释裸鼹鼠“长生不老”秘笈
由韩国梨花女子大学和深圳华大基因共同主导完成的裸鼹鼠基因组研究成果,10月13日在《自然》上在线发表。研究从基因组、转录组水平上对裸鼹鼠奇特的生物学特性进行了诠释,不仅有助于更加清楚地阐明裸鼹鼠能在黑暗、低氧等恶劣环境中生存并且能够保持长寿和抗癌的生理机理,对促进其他生物学和生物医学研究也具有重要意义。 裸鼹鼠是挖掘类啮齿目动物,终生在黑暗的地下生活,几乎完全丧失了视觉,仅依靠身体两侧的触须来辨认方向。虽属哺乳动物,却像冷血动物一样通过与环境的热交换来调节体温。裸鼹鼠长达30年以上的寿命,远长于其只有4—5年寿命的近亲——大鼠和小鼠,同时还能在低氧、高二氧化碳浓度的地下环境中生活,对癌症具有超级免疫力。科学家希望探讨其“长生不老”秘笈,挖掘其“抗痛抗癌”的机理,为人类所用。 科学家对一只雄性裸鼹鼠进行测序、组装和注释。分析发现,裸鼹鼠和大鼠、小鼠的祖先约在7300万年前分化,其基因组有93%的区域与......阅读全文
我国科学家开发高效基因组序列分析工具
类的疾病易感性和生理特征等常见性状的差异,往往由DNA序列变化造成,这些DNA片段缺失、增加、异位等变化被统称为遗传变异。全基因组关联研究(Genome-Wide Association Study,GWAS)是通过比对大量人群的遗传信息,利用统计学检测遗传变异和性状之间关联性的方法。西湖大学的
我国科学家成功破译南美白对虾基因组
中国科学院海洋研究所(以下简称中科院海洋所)科研团队历时10年成功破译凡纳滨对虾(又称南美白对虾)基因组,并获得高质量的对虾基因组参考图谱,研究成果日前在《自然—通讯》上在线发表。 中科院海洋所研究员相建海介绍,对虾基因组是世界上公认的高复杂基因组,科研团队尝试了从一代到三代的各种基因组测序平
科学家构建高质量金粟兰基因组图谱
11月26日,《自然—通讯》以背靠背的形式在线发表了两项由中国科研团队主导的研究,这两项研究填补了核心被子植物最后一个主要分枝——金粟兰目的基因组信息,为破解被子植物的早期演化历程提供了更翔实的证据。被子植物是地球上数量最多、种类最丰富的植物类群。还原植物清晰的间亲缘关系系统发育树,对了解被子植物的
中外科学家成功解析西瓜基因组
2012年11月26日,由北京市农林科学院、深圳华大基因研究院和康奈尔大学等多家单位合作完成的西瓜基因组相关研究成果在《自然•遗传学》(Nature Genetics)杂志发表。这项研究为西瓜基础生物学研究及其种质资源培育、抗病及遗传改良提供了宝贵资源,同时,也为葫芦科植物的进化和比较基因组
科学家开发新的宏基因组分析工具
对环境样品(如海水、医院表面和人类肠道)直接进行微生物测序,已经阐明了我们世界中存在的大量微生物。然而,一个微生物物种可能存在遗传多样性,而在宏基因组分析中往往捕获不到这种多样性。最近在《Genome Research》发表的一项研究中,科学家们开发了一种新的工具,来检测细菌物种内的遗传差异,并
中国科学家PNAS发表基因组研究新成果
来自军事医学科学院微生物流行病研究所、华大基因研究所、伦敦大学学院等研究机构的研究人员发表了题为“Historical variations in mutation rate in an epidemic pathogen, Yersinia pestis”的研究论文,解析了鼠疫耶尔森氏菌(
我科学家成功绘制小麦D基因组草图
中国农科院作物科学研究所与深圳华大基因研究院等合作,在国际上率先完成了小麦D基因组供体种——粗山羊草基因组草图的绘制,结束了小麦没有组装基因组序列的历史。该项成果北京时间近日在线发表于《自然》杂志,标志着我国的小麦基因组研究跨入世界先进行列。 据项目牵头人、中国农科院作科所研究员贾继增介绍
中国科学家PNAS发布辣椒全基因组测序
辣椒(Capsicum annuum)是一种重要的经济作物,它在满足人们口腹之欲的同时,还是世界上广为使用的药物。辣椒富含维生素和营养,可以用来生产许多药物、天然染色剂和化妆品。 为了更好的理解辣椒属的进化、驯化和特化,四川农业大学玉米研究所、遵义农科院辣椒研究所、华南农业大学园艺学院
科学家获得首个两型结实植物基因组
地上/下两型结实是被子植物中一类独特的结实方式。被子植物中13科24个属存在两型结实现象,两型豆为豆科两型豆属一年生缠绕草本植物,常生于海拔300~1800米的山坡,分布于中国东北、华北等地,在日本、北美亦有分布。其同一植株上能够产生3种类型的花,即地上开放花、地上闭锁花和地下闭锁花,能够分别在
中美科学家联合发布首个蚂蚁基因组
中美联合发布首个蚂蚁基因组揭秘社会型昆虫寿命及行为差异遗传机制 8月27日,中美科学家联合完成的蚂蚁基因组项目在《Science》(《科学》)杂志上发表。 蚂蚁是常见的社会型昆虫之一,同一蚁群内部的蚂蚁都具有相同的遗传物质组成,但是它们之间在寿命和行为上却具有极大差异。蚁后寿命
科学家绘制肝癌药物基因组学“蓝图”
8月1日,国际学术期刊Cancer Cell 在线发表了中国科学院生物化学与细胞生物学研究所惠利健研究组、中国科学院上海营养与健康研究所李亦学研究组、第二军医大学附属东方肝胆外科医院张海斌研究组以及南京大学医学院附属鼓楼医院施晓雷合作的题为A Pharmacogenomic Landscape
中国科学家PNAS发表基因组研究新成果
来自军事医学科学院微生物流行病研究所、华大基因研究所、伦敦大学学院等研究机构的研究人员发表了题为“Historical variations in mutation rate in an epidemic pathogen, Yersinia pestis”的研究论文,解析了鼠疫耶尔森氏菌(
科学家破译甘蔗细茎野生种基因组
6月3日,福建农林大学海峡联合研究院基因组中心教授张积森团队以《同源多倍体甘蔗细茎野生种的近期基因组演化》为题,相关研究发表在《自然—遗传学》上。 该研究解析了细茎野生种天然同源四倍体Np-X基因组,并利用基因组学手段系统阐明了甘蔗细茎野生种(又称割手密)的起源、染色体基数、基因组倍体、关键性状
中国科学家Nature-Genetics发布重要基因组草图
来自国家人类基因组南方研究中心、新疆医科大学第一附属医院和复旦大学等处的研究人员,成功绘制出了细粒棘球绦虫(Echinococcus granulosus)的基因组序列草图。这一研究提供了关于这种寄生虫与宿主的相互作用、养分吸收、节裂(strobilization)、生殖、免疫逃避和成熟机制
中外科学家绘出小豆基因组草图
中外科学家12日在美国《国家科学院学报》上报告说,他们已经绘制出小豆的基因组草图。这将有助于从基因水平上分析小豆性状,培育更多小豆新品种。 北京农学院和国际半干旱热带作物研究所等机构的研究人员利用第二代测序技术完成了小豆全基因组的测序,组装出了高质量的小豆基因组框架图,结果显示小豆有3.4万
我科学家倡导“基因组编辑作物”管理框架
基因组编辑是对生物基因组进行定向改变的技术,目前在医学中非常热门。有专家预测,该技术在农业作物育种上也将呈现更加广阔的前景。然而,对于这一技术,世界各国尚处于观望状态,也无相关的管理标准。日前,我国科学家在国际权威期刊《自然—遗传》上与国外科学家联合撰文,对基因组编辑在作物育种上的应用提出了管理
多国科学家破译大麦主要致病真菌基因组
一个由数国科研人员组成的研究小组日前成功破译了大麦的主要致病真菌——禾本科布氏白粉菌的基因组。这项成果将有助于人们了解真菌的特性,从而研究出防治植物病虫害的新方法。 这项研究由美国、法国、英国、德国、丹麦等国的研究人员合作完成。研究者在最新一期美国《科学》杂志上报告说,真菌是植物的主
科学家成功绘制虹鳟鱼完整基因组
法国科研人员最近完成了虹鳟鱼基因组的完整测序,并发现虹鳟鱼基因组较好地保留了1亿年前一次重要进化事件的遗迹,可以帮助了解脊椎动物的进化历程。 虹鳟鱼属鲑科,原产于北美洲太平洋沿岸。它肉质鲜美,在全世界被广泛养殖,同时也是被科学家研究最多的鱼类之一。 来自法国国家农学研究中心、国家基因
我科学家成功绘制小麦D基因组草图
中国农科院作物科学研究所与深圳华大基因研究院等合作,在国际上率先完成了小麦D基因组供体种——粗山羊草基因组草图的绘制,结束了小麦没有组装基因组序列的历史。该项成果北京时间近日在线发表于《自然》杂志,标志着我国的小麦基因组研究跨入世界先进行列。 据项目牵头人、中国农科院作科所研究员贾继增介绍
科学家绘制出首幅小麦基因组物理图谱
《科学》:有助于培育出更高产和抗旱的小麦新品种 一个由法国、美国、澳大利亚等国科学家组成的研究小组日前为小麦的一个基因组绘制出了首幅物理图谱,这一成果将有助于科学家培育出更高产和抗旱的小麦新品种。 基因组物理图谱是指有关构成基因组的全部基因的排列和间距的信息,它是通过对构成基因组的DNA分子进行
中国科学家主导完成盐芥基因组研究
由中科院遗传与发育生物学研究所、深圳华大基因研究院等多家单位共同完成的盐芥(Thellungiella salsuginea)基因组研究成果在《美国国家科学院院刊》(PNAS)在线发表(http://www.pnas.org/content/early/2012/07/05/12099541
我科学家主导完成白菜全基因组研究
8月29日,由多国科学家共同合作完成的白菜全基因组研究成果在《自然—遗传学》上在线发表。这是由中国科学家主导,通过国际合作完成的又一重大成果。 白菜类蔬菜包括结球白菜、小白菜、菜心和芜菁等形态各异的一大类蔬菜。据了解,科学家开展了白菜基因组注释、比较基因组学、基因组进化和各种
我国科学家破译世界性害虫基因组
福建农林大学1月11日宣布,该校副校长尤民生教授带领的科研团队在全球首次破译世界性害虫小菜蛾基因组。此举奠定了中国在小菜蛾基因组研究领域的国际领先地位,并将为农业害虫的可持续控制提供新的研究思路。 由尤民生教授主持、深圳华大基因研究院共同完成、英国剑桥大学等参与的小菜蛾基因组研究成果
科学家破译茶枝柑基因组遗传图谱
茶枝柑属于芸香科柑橘属宽皮橘物种,是历经700多年驯化栽培的柑橘变种,其果皮制干即为中药“广陈皮”,含有多种生物活性成分。多甲氧基黄酮是“广陈皮”中关键的药用成分,但目前对其生物合成的遗传基础及调控机制知之甚少。近日,我国科学家在“广陈皮”活性成分合成调控机制研究方面取得重要进展,他们通过多组学技术
科学家测绘一家四口基因组
杂志网站3月10日介绍说,美国研究人员首次为一个四口之家进行了全组,这种以家庭为单位的基因组将为遗传学及相关疾病研究提供更多有价值的信息。 来自美国“系统学研究所”的研究人员在10日发布的一份新闻公报中说,他们与基因组测序公司合作,对一对夫妻和他们的两个孩子进行了全基因组测序。这家的两个孩子都患
我国科学家开发高质量基因组组装软件
11月25日,中国科学院遗传与发育生物学研究所梁承志研究组开发的高质量基因组组装软件HERA在《自然-通讯》在线发表(Nature Communications,DOI:10.1038/s41467-019-13355-3)。论文题目为Assembly of chromosome-scale c
中国科学家Nature子刊基因组测序新成果
感染结核病永远都不会有一个最合适的时间,近年来形势变得更加的糟糕。 尽管已经开展了数十年的抗生素研究,随着结核耐药菌株的增长,当前的治疗方案仍然非常的有限。在2010年,至少有65万结核病例对两种最有效的一线抗生素耐药。在2012年,在印度发现了完全耐药和无法有效治疗的结核分枝杆菌。
多国科学家破解硬粒小麦全基因组图谱
近日,来自意大利、加拿大、德国等多国科研机构的科学家共同在Nature Genetics上发表了题为“Durum wheat genome highlights past domestication signatures and future improvement targets”的文章,绘制
中国科学家Nature子刊发布新基因组草图
来自中国热带农业科学院、中国科学院、华盛顿大学等10多家机构的研究人员,成功绘制出了木薯(Cassava)的基因组序列草图。研究结果发表在10月10日的《自然通讯》(Nature Communications)杂志上来自中国热带农业科学院、中国科学院、华盛顿大学等10多家机构的研究人员,成功绘制
《自然》:中美科学家联合绘出番木瓜基因组草图
记者从南开大学了解到,中美科学家在世界上首次绘制完成一株转基因经济作物的全基因组图谱。这篇名为《转基因热带水果植物——番木瓜的基因组草图》的成果发表在4月24日出版的国际权威科学杂志《自然》上。 这项转基因经济作物的全基因组图谱研究成果,对农作物育种、农业生产和人类对转基因植物的认识具有极其重要的意