基因组测序诠释裸鼹鼠“长生不老”秘笈
由韩国梨花女子大学和深圳华大基因共同主导完成的裸鼹鼠基因组研究成果,10月13日在《自然》上在线发表。研究从基因组、转录组水平上对裸鼹鼠奇特的生物学特性进行了诠释,不仅有助于更加清楚地阐明裸鼹鼠能在黑暗、低氧等恶劣环境中生存并且能够保持长寿和抗癌的生理机理,对促进其他生物学和生物医学研究也具有重要意义。 裸鼹鼠是挖掘类啮齿目动物,终生在黑暗的地下生活,几乎完全丧失了视觉,仅依靠身体两侧的触须来辨认方向。虽属哺乳动物,却像冷血动物一样通过与环境的热交换来调节体温。裸鼹鼠长达30年以上的寿命,远长于其只有4—5年寿命的近亲——大鼠和小鼠,同时还能在低氧、高二氧化碳浓度的地下环境中生活,对癌症具有超级免疫力。科学家希望探讨其“长生不老”秘笈,挖掘其“抗痛抗癌”的机理,为人类所用。 科学家对一只雄性裸鼹鼠进行测序、组装和注释。分析发现,裸鼹鼠和大鼠、小鼠的祖先约在7300万年前分化,其基因组有93%的区域与......阅读全文
中国科学家完成水稻5个“近亲”基因组测序
中国科学家3日说,他们完成了亚洲栽培稻(一般称为水稻)5个“近亲”的全基因组测序,获得了高质量的基因组参考序列。这有望进一步推动水稻品种的改良。 中国科学家在美国《国家科学院学报》上报告说,他们从2007年至今,自主完成了尼瓦拉野生稻、非洲栽培稻、短舌野生稻、展颖野生稻和南方野生
科学家阐释为何基因组变化速度难以确定
人类基因突变不仅仅是科幻电影描述的那样,它们还能记录进化事件的时间。 数学家一直在计算π的数值,即便他们已经知道了超过12万亿位数字;物理学家也在不停地鞭策自己,因为他们无法确定3个有效数字外的万有引力常数。相比之下,遗传学家在人类DNA突变速度方面正面临两难抉择。 这一速率对校
中国科学家Nature子刊发布新基因组草图
来自中国热带农业科学院、中国科学院、华盛顿大学等10多家机构的研究人员,成功绘制出了木薯(Cassava)的基因组序列草图。研究结果发表在10月10日的《自然通讯》(Nature Communications)杂志上(延伸阅读:我国领衔完成木薯基因组测序并揭示其进化特征 )。 中国热带农业科学
NSMB:科学家发现调节基因组复制的代码信号
三年前,来自西班牙国家癌症研究中心的研究者首次对干预细胞重要过程的特殊蛋白进行了描述,该细胞过程即细胞分裂期间遗传物质的复制过程,当时研究者发现,DNA复制的关键基因组区域充满着特殊蛋白的修饰,即为小分子泛素样修饰蛋白(Small ubiquitin-like modifier, SU
中国科学家破译大黄鱼全基因组测序
由浙江海洋学院院长吴常文领衔,上海交通大学、复旦大学等机构科学家参加的研究团队最近联合破译了大黄鱼全基因组测序,构建了大黄鱼基因组图谱,并成功解析其先天免疫系统基因组特征。日前,该研究成果发表在《自然》杂志上。这是继半滑舌鳎之后,我国公布的第二个海水鱼类的基因组图谱,也是世界上第一个石首科鱼类基
中国科学家Nature子刊公布新基因组草图
来自合肥工业大学、四川大学、四川省自然资源科学研究院、北京百迈客生物科技有限公司等10多家机构的研究人员组成的一个研究小组成功绘制出了猕猴桃(Actinidia chinensis)的全基因组序列草图。相关成果发表在10月18日的《自然通讯》(Nature Communications)杂志
美国科学家开发全基因组测序水稻变体
水稻不仅是全球一半人口的主食,也为研究能源作物提供了模型。为优化生物燃料作物,科学家正寻找决定水稻产量、抗病性和灌溉效率等性状的基因。 最近在《植物细胞》杂志刊登的一篇论文中,美国加州大学戴维斯分校的研究团队与来自能源部联合基因组研究所的合作者,宣布开发出粳稻Kitaake的第一个全基因组测
科学家获取首个中国地区古人基因组数据
记者从中国科学院古脊椎动物与古人类研究所获悉,由该所研究员付巧妹、高星、同号文及博士后Melinda Yang领衔的古人类研究团队,与德国马普进化人类研究所等团队合作,于前不久获取了第一个中国地区古人的基因组数据。这也是截至目前东亚地区最为古老的人类基因组数据。 10月12日,这项成果以“4万
科学家成功绘制-首幅小麦基因组物理图谱
一个由法国、美国、澳大利亚等国科学家组成的研究小组日前为小麦的一个基因组绘制出了首幅物理图谱,这一成果将有助于科学家培育出更高产和抗旱的小麦新品种。 基因组物理图谱是指有关构成基因组的全部基因的排列和间距的信息,它是通过对构成基因组的DNA分子进行测定而绘制的。绘制物理图谱的目的是把有关基因的遗传
我国科学家发布大黄鱼全基因组图谱
由浙江海洋学院、上海交通大学、复旦大学等高校研究机构联合破译的大黄鱼全基因组图谱,日前在世界权威期刊——《自然》周刊发表。这是继半滑舌鳎之后,我国公布的第二个海水鱼类的基因组图谱,也是世界上第一个石首科鱼类基因组图谱,标志着我国海洋生物学的研究真正进入基因组时代。 自1985年大黄鱼人工养殖
科学家利用基因组编辑扩大昆虫学研究
基因组测序,即科学家使用实验室方法来确定特定生物体的基因组成,正在成为昆虫研究的一种常见做法。对昆虫生物学的深入了解有助于科学家更好地管理昆虫,包括那些对生态系统有益的昆虫,以及那些破坏食物供应并通过携带疾病威胁人类健康的昆虫。研究人员开发了一种名为fanflow4insect的工作流方法,可以注释
我国科学家完成大蒜基因组测序和组装
近日,中国农业科学院麻类研究所南方蛋白饲料植物资源开发与利用团队联合有关高校和企业,历时4年完成了大蒜基因组的测序和组装工作。相关研究成果在线发表在《分子植物》上。 据课题组成员刘头明研究员介绍,大蒜是重要的蔬菜作物之一,我国大蒜的年播种面积达到1000万亩以上。大蒜具有膨大的鳞茎,富含大
红薯基因组测序后,科学家重新了解红薯家史
4月12日发表在《当代生物学》杂志上的证据表明,红薯在人类开始食用前就出现了。研究结果还表明,在没有人类帮助的情况下,红薯就从美洲到达了波利尼西亚。这一发现让人们猜测波利尼西亚和美洲大陆之间是否在前哥伦布时期就已开始接触。 红薯是世界上被广泛食用的作物之一,也是维生素A前体的重要来源。英国
科学家呼吁关注全球基因组数据库污染
样品处理有可能是导致DNA数据库广泛污染的最主要原因 2月16日发表在《公共科学图书馆·综合》(PLoS ONE)期刊上的一份研究报告称康涅狄格大学的遗传学家Mark Longo及同事发现由顶级公共测序机构提供的测序结果构建的基因组数据库中的大约1/5的细菌、植物和非灵长类动物基因
我国科学家完成甜橙基因组图谱找到甜橙起源
甜美又不上火的甜橙来源于柚作为母本和橘杂交,其后代再与橘杂交而形成的杂种。华中农业大学徐强博士等人26日发表在国际著名学术刊物《自然-遗传学》题为“甜橙基因组图谱”的研究论文,提出了甜橙起源这一新理论。 专家表示,甜橙基因组将在理论上为柑橘基因功能研究提供框架,也将在应用上为果实品质包括色
科学家强调:基因组编辑技术不能安全用于人类
科技日报讯 (记者刘霞)据美国《科学》杂志网站日前报道,一个由多国科研机构组成的国际委员会3日发表报告称,可遗传人类基因组编辑(HHGE)当前还达不到安全、有效地应用于人类的相关标准,各国在决定是否批准这类技术进入临床应用前,应展开广泛的讨论并进行严格监督。 这一国际委员会名为“人类生殖系基
中国科学家宣布完成“兰花基因组框架图”
11月15日,中国科学家在深圳宣布完成“兰花基因组框架图”。兰花基因组计划的开展,不仅揭示兰花的进化历史和奥秘,为后续兰花功能和进化基因组学研究打下坚实的基础,而且为如何保护我国宝贵的兰花种质资源提供科学的政策依据,为下一步开发和利用兰科植物基因资源宝库提供重要的资源平台。 兰科植物(兰花
科学家破译模式植物金鱼草的基因组
金鱼草(Antirrhinum majus L.)也称龙头花(snapdragon),车前科多年生草本植物,因花似金鱼或龙头而得名,是常见的盆栽、切花及庭院观赏的园艺花卉,在古罗马时代就已完成了驯化。在过去的三十年中,金鱼草一直作为分子和发育遗传学的模式作物,很多关键基因是在金鱼草中被首次发现,
科学家重建30亿年前基因组化石
据美国物理学家组织网12月20日(北京时间)报道,化石有助于古生物学家编写自那时起的生命进化史,但要绘制出早于寒武纪的30亿年前的生命图景,还非常困难。因为寒武纪前的软体动物细胞很少留下化石印记,但这些早期的生命却留下了一些微小的化石:DNA。麻省理工学院的生物学家利用现代基因组,
中国科学家Nature-Genetics发表基因组研究新成果
红彤彤的现代番茄(西红柿)比起最初来自南美洲安第斯山脉区域、豌豆大小的野生祖先要大了近一百倍。为了追踪番茄育种的悠久历史,以及了解人类施加的选择如何改变了番茄的基因组,由来自中国农业科学院、华中农业大学等10多家国内外机构的研究人员组成的一个国际研究小组,对360个番茄品种,其中包括野生型和驯化
科学家为一种细菌重编基因组密码
报道,最近,美国耶鲁大学和哈佛大学的科学家合作,为一种细菌重新编写了完整的基因组编码,并提高了其抗病毒能力。相关论文发表在10月18日的《科学》杂志上。 “这是第一次从根本上改变了遗传密码。”论文共同高级作者、耶鲁大学分子、细胞与发育生物学副教授法伦·艾萨克斯说,“创造一个有着新基因编码的
科学家开发新的人类基因组组装方法
最近,美国杨百翰大学的研究人员,开发出了一种新的人类基因组组装方法,并无意中发现了一种新的方法,可识别几种常见遗传病中难以捉摸的标记。 这种新方法依赖于研究人员开发的一种新算法,这种方法对于DNA序列中特定类型的变异,更为敏感。 本文第一作者、计算机科学博士Paul Bodily指出:“这需
中国科学家绘就谷子基因组单倍型图谱
由中国农科院作物科学研究所、中科院上海生科院国家基因研究中心、中科院遗传与发育生物学研究所等8家单位组成的科研团队,在国际上率先完成了谷子单倍体型图谱的构建和47个主要农艺性状的全基因组关联分析。相关成果6月23日在线发表于《自然—遗传学》杂志。 据介绍,谷子为二倍体,基因组小、自花
科学家首次测绘“一家四口”基因组
美国《科学》杂志网站3月10日介绍说,美国研究人员首次为一个四口之家进行了全基因组测序,这种以家庭为单位的基因组分析将为遗传学及相关疾病研究提供更多有价值的信息。 来自美国“系统生物学研究所”的研究人员在10日发布的一份新闻公报中说,他们与基因组测序公司合作,对一对夫妻和他们的两个孩子进行
科学家发现胰腺癌基因组中存“弱点”
澳大利亚科学家在最新一期英国《自然》杂志上报告说,他们进行的一项基因组比较研究发现,部分胰腺癌患者的肿瘤基因组中存有“弱点”,这一发现为开发个人订制式的治疗方法提供了可能性。 胰腺癌是第四大致死性癌症。负责这项研究的加文医学研究所研究人员说,他们的研究分析了100个胰腺癌病人肿瘤组织的基因组
中国科学家开发出高质量基因组组装软件
高质量基因组序列对于研究一个物种基因组的结构、功能、进化、基因定位和克隆等都至关重要。目前单分子测序技术的发展,已使得构建高质量基因组草图越来越容易。然而,这些草图序列仍然存在着由于组装序列碎片化而导致的多种错误,比如不完整的基因序列、排列到染色体上之后的片段遗漏、排列顺序错误和方向错误等。这些
我国科学家完成鲤鱼全基因组序列图谱绘制
近日,由中国水产科学研究院首席科学家孙效文牵头,中国水产科学研究院联合黑龙江水产研究所、中科院基因组研究所、哈佛大学、奥本大学等单位组建的国际合作研究团队,完成了鲤鱼全基因组序列图谱绘制,在国际上首个完成全面解析的异源四倍体硬骨鱼类基因组图谱。该研究成果于9月21日在国际生物学权威期刊《自然—
中国科学家启动国际“大熊猫基因组研究”项目
新华网2008年3月6日电 由中国科学家发起,加拿大、英国、美国、丹麦等国科学家联合参与的国际“大熊猫基因组研究”项目6日正式启动。中国科学家表示,将在半年之内完成大熊猫基因组的框架图。 据深圳华大基因研究院介绍,国际“大熊猫基因组研究”项目所产生的基因组信息将会对生态、进化、测序技术等众多科研领
中澳科学家对高粱进行全基因组测序分析
由澳大利亚昆士兰大学、华大基因等单位的科学家对高粱进行了全基因组测序及分析,发现高粱基因组中存在大量的遗传变异,为高粱及其它粮食作物的育种改良提供了宝贵的遗传资源。8月28日,最新研究结果在《自然·通讯》杂志上发表。 中澳两国的科学家通过对44株不同来源的高粱样本,包括地方品种、改良品种和
科学家公布完整尼安德特人基因组
据物理学家组织网3月19日报道,德国马克斯·普朗克研究院莱比锡人类进化研究所已经完成了对尼安德特人的基因组测序,各科学团体自今日起能从互联网上免费获得完整的尼安德特人基因数据。 该项目由马克斯·普朗克社会科学院资助,是斯万特·帕博小组近30年前开始的古老DNA研究工作的一部分。