DNA测序技术

目前还有一种基于半导体芯片的新一代革命性测序技术——Ion Torrent。该技术使用了一种布满小孔的高密度半导体芯片, 一个小孔就是一个测序反应池。当DNA聚合酶把核苷酸聚合到延伸中的DNA链上时,会释放出一个氢离子,反应池中的PH发生改变,位于池下的离子感受器感受到H+离子信号,H+离子信号再直接转化为数字信号,从而读出DNA序列(图)。这一技术的发明人同时也是454测序技术的发明人之一——Jonathan Rothberg,它的文库和样本制备跟454技术很像,甚至可以说就是454的翻版,只是测序过程中不是通过检测焦磷酸荧光显色,而是通过检测H+信号的变化来获得序列碱基信息。Ion Torrent相比于其他测序技术来说,不需要昂贵的物理成像等设备,因此,成本相对来说会低,体积也会比较小,同时操作也要更为简单,速度也相当快速,除了2天文库制作时间,整个上机测序可在2-3.5小时内完成,不过整个芯片的通量并不高,目前是10G左右......阅读全文

三款热门新一代测序仪的比较

  生物通报道 来自英国Wellcome Trust Sanger研究院的研究人员对市场上三款热门测序仪(Ion PGM、PacBio RS、MiSeq)的性能进行了比较。该成果发表在7月24日的《BMC Genomics》上。   蓬勃发展的新一代测序(NGS)技术彻底改变了基因组学和遗传学

LIFE-金牌赞助第六届国际基因组学大会

第六届国际基因组学大会(ICG-6)在2011年11月12日至15日在深圳东部华侨城隆重召开。本次会议由华大基因(BGI)主办,召集了世界各地400多名从事基因组学研究的科学家,生物制药业界,学术刊物编辑。来自各方的专家在汇报基因组学领域最新科研进展的同时将会深入讨论农业育种,医疗健

高通量测序技术的原理及各平台优势和实践应用的分析-3

边合成边测序:SNA(454,Ion Torrent)与CRT不同的是,SNA方法依赖于单信号标记dNTP来对链进行延伸。四种核糖核酸都必须反复添加到测序反应过程中。不仅如此,SNA不需要将dNTP屏蔽,因为测序反应过程中下一个碱基的缺失会阻止链的延伸。碱基的寡聚体则是一个例外,在这种情况下,信号的

一代测序、二代测序及三代测序的应用对比

  一、初现庐山真面目  一代测序:又称Sanger测序(多分子,单克隆)  历史:第一代DNA测序技术(又称Sanger测序)在1975年,由Sanger等人开创,并在1977年完成第一个基因组序列(噬菌体X174),全长5375个碱基。研究人员经过30年的实践并对技术及测序策略的不断改进(如使用

一代测序、二代测序及三代测序的应用对比

  一、初现庐山真面目  一代测序:又称Sanger测序(多分子,单克隆)  历史:第一代DNA测序技术(又称Sanger测序)在1975年,由Sanger等人开创,并在1977年完成第一个基因组序列(噬菌体X174),全长5375个碱基。研究人员经过30年的实践并对技术及测序策略的不断改进(如使用

他创立的基因公司卖给了罗氏、赛默飞-现在又卖家给BioRad

  Bio-Rad Laboratories公司在当地时间本周一宣布,已同意收购数字PCR方面的竞争对手RainDance Technologies,具体的交易价格尚未透露。此次收购预计在2017年第一季度完成。  这是一次资本领先者对技术领先者的收购。在RainDance快速崛起之前,Bio-Ra

他创立的基因公司卖给了罗氏、赛默飞-现在又卖家给BioRad

  Bio-Rad Laboratories公司在当地时间本周一宣布,已同意收购数字PCR方面的竞争对手RainDance Technologies,具体的交易价格尚未透露。此次收购预计在2017年第一季度完成。  这是一次资本领先者对技术领先者的收购。在RainDance快速崛起之前,Bio-Ra

-iPad大小的DNA测序工具即将问世?

  一家由Facebook亿万富豪尤里.米尔纳(Yuri Milner)支持的小型企业正在寻求进入DNA测序的热门领域,其所研发的产品是一款和笔记本电脑相同尺寸和重量——可能也会是相同价格——的设备。   “我们所谈论的DNA测序工具是一款类似于iPad的设备,使用起来非常简便,成本也相当低廉

Life-Tech-2011年收入37.8亿美元-增长5%

  美国时间2012年2月7日,Life Technologies公布了公司第四季度财报。财报数据显示,公司第四季度收入10.1亿美元,较去年同期增长8%,也高于华尔街9.677亿美元的预期。   该公司表示,“在该季度中,遗传系统部的非GAAP收入较去年增加了13%,至2.78亿美元。Ion T

DNA测序

                自动测序法 双脱氧链末端终止法 非同位素银染 鸟枪法 Maxam-Gilbert化学修饰法             实验方法

DNA测序

DNA测序(主要内容如下)·         Sequencing Gel Preparation·         Preparation of Templates ·         DNA Sequencing by the Dideoxy Method·         DNA Sequen

DNA测序

实验方法原理 ABI  PRISM 310型基因分析仪(即DNA测序仪),采用毛细管电泳技术取代传统的聚丙烯酰胺平板电泳,应用该公司ZL的四色荧光染料标记的ddNTP(标记终止物法),因此通过单引物PCR测序反应,生成的PCR产物则是相差1个碱基的3'末端为4种不同荧光染料的单链DN

高通量测序平台及其性能参数介绍

  Roche 454、Illumina、Solexa和ABI SOLiD为主的三个测序平台,目前最主流的二代测序平台是 Illumina 所生产的测序仪,包括 MiSeq 系列、 HiSeq 系列、 NextSeq系列等。另外的还包括罗氏公司的 454 测序仪(目前已关闭)、华大基因的 BGI-C

利用Ion半导体测序开展基因表达谱分析

     新一代测序技术的出现改变了基因表达谱分析和转录组研究。在其他方法还依赖预知信息进行杂交探针或qPCR引物设计时,RNA-Seq技术可直接对测序文库中任一RNA分子进行无假设的分析。RNA-Seq技术不单能测定转录本数,研究表达水平差异 [1],还能检测序列特异的信息,如转录本的起始和终止位

DNA测序的测序原理

DNA测序的测序原理是:利用一种DNA聚合酶来延伸结合在待定序列模板上的引物。直到掺入一种链终止核苷酸为止。每一次序列测定由一套四个单独的反应构成,每个反应含有所有四种脱氧核苷酸三磷酸(dNTP),并混入限量的一种不同的双脱氧核苷三磷酸。由于ddNTP缺乏延伸所需要的3-OH基团,使延长的寡聚核苷酸

DNA测序的测序技术

高通量测序技术(High-throughput sequencing)又称“下一代”测序技术(Next-generation sequencing technology),以能一次并行对几十万到几百万条DNA分子进行序列测定和一般读长较短等为标志。根据发展历史、影响力、测序原理和技术不同等,主要有以

DNA测序PCR测序反应

  1. 取0.2 ml的PCR管,用记号笔编号,将管插在颗粒冰中,按下表加试剂:  所加试剂 测定模板管 标准对照管  BigDye Mix 1 μl 1 μl  待测的质粒DNA 1 μl -  pGEM-3Zf (+) 双链DNA - 1 μl  待测DNA的正向引物 1 μl -  M13(

赛默飞世尔再推癌症检测产品

  赛默飞世尔科技公司近日宣布,适用于癌症研究的靶向检测产品线又增添四款新产品,包括Oncomine Immune Response Research Assay,它能够拷问肿瘤微环境,并鉴定免疫治疗临床试验中的预测性标志物。这一系列产品适用于Ion Torrent NGS平台,与FFPE样品兼容。

面向未来的“离子源”―Life-Tech-新一代测序技术研讨会

  每种技术都有演化的过程,包括测序技术的发展。低成本、高通量、高精准度的优势使得第二代测序技术已经展示其魅力、其应用不再局限于单纯的测序,而能有助于科研人员更全面、更深入地分析基因组、转录组及蛋白质之间交互作用组的各项数据。同时,另一种革新性的半导体芯片测序技术平台也正渐渐的成为了众多科研工作者的

高通量测序(NGS)的过程及原理介绍

  高通量测序技术的一般过程是将DNA(或cDNA)随机片段化,加上接头序列,制备用于上机测序的文库,通过对文库中数以万计的克隆(colony)进行延伸反应,检测对应的信号获取序列信息,最终通过数据分析来挖掘序列中的科学问题。几种不同测序平台的原理及步骤如下:(1)Roche 454平台  Roch

二代测序(Next-generation-sequencing)的定义

  二代测序也被成为高通量测序指的是现代不同的测序技术,不同于之前的Sanger测序,它的速度更快,价格也更为便宜,主要有以下几个平台:  -  Illumina (Solexa) sequencing  -  Roche 454 sequencing  -  Ion torrent: Proton

LifeTech欲加速Ion半导体技术的开发

  Life Technologies公司近日宣布,在跨过Life Tech内部的研发里程碑之后,它将加速其Ion Torrent半导体技术的开发,以便实现广泛的蛋白质组和以抗体为基础的应用。   蛋白质组和以抗体为基础的技术普遍应用在科研、应用科学和临床诊断的多个市场。Life Tec

-DNA-Electronics公司2400万美元收购NanoMR

  近日,致力于半导体DNA测序技术的DNA Electronics公司(简称DNAe)宣布出资2400万美元收购NanoMR公司。NanoMR公司是位于美国新墨西哥州的一家致力于发展医学科技的公司,主要经营遗传分析和测序等服务。  本次收购于1月15日完成,合并后的公司以DNAe公司品牌在英国和美

Illumina押对了基因测序,下一位颠覆行业的是谁?

  基因测序行业格局已定 Illumina占据近7成市场  全球基因测序巨头Illumina公司最近公布了2014年的财报,让我们来看看这些振奋人心的数据:全年的收入增速为31%,毛利率为69.2%,收入增长32%至5.12亿美元,Non-GAAP净利润达到了1.29亿美元,对应0.87美元的每股收

DNA测序仪

DNA序列测定分手工测序和自动测序,手工测序包括sanger双脱氧链终止法和maxam-gilbert化学降解法。自动化测序实际上已成为当今dna序列分析的主流。美国peabi公司已生产出373型、377型、310型、3700和3100型等dna测序仪,其中310型是临床检测实验室中使用最多的一种型

DNA测序仪

DNA序列测定分手工测序和自动测序,手工测序包括sanger双脱氧链终止法和maxam-gilbert化学降解法。自动化测序实际上已成为当今 dna序列分析的主流。美国pe abi公司已生产出373型、377型、310型、3700和3100型等dna测序仪,其中310型是临床检测实验室中使用最多的一

DNA测序市场

DNA测序市场:快照  DNA 测序预计将在 2021-2031 年的预测期内显示出有希望的增长,因为它在微阵列和其他分析方法等各种应用中的执行。DNA测序具有成本效益,具有很高的准确性和速度,甚至可以从低样本中得出输出。DNA测序技术已经从第一代升级到第三代。DNA 测序系统因其功能而受到关注,可

DNA测序技术的测序规律

生成互相独立的若干组带放射性标记的寡核苷酸,每组寡核苷酸都有固定的起点,但却随机终止于特定的一种或者多种残基上。由于DNA上的每一个碱基出现在可变终止端的机会均等,因此上述每一组产物都是一些寡核苷酸混合物,这些寡核苷酸的长度由某一种特定碱基在原DNA全片段上的位置所决定。在可以区分长度仅差一个核苷酸

简述DNA测序的测序规律

  生成互相独立的若干组带放射性标记的寡核苷酸,每组寡核苷酸都有固定的起点,但却随机终止于特定的一种或者多种残基上。  由于DNA上的每一个碱基出现在可变终止端的机会均等,因此上述每一组产物都是一些寡核苷酸混合物,这些寡核苷酸的长度由某一种特定碱基在原DNA全片段上的位置所决定。  在可以区分长度仅

DNA测序仪pcr测序反应

  pcr测序反应  (1) 取0.2ml的pcr管,用记号笔编号,将管插在颗粒冰中,按下表加试剂:  所加试剂 测定模板管 标准对照管  bigdye mix 1μl 1μl  待测的质粒dna 1μl -  pgem-3zf (+) 双链dna - 1μl  待测dna的正向引物 1μl -