水生所发现基因组可编码藻胆体降解蛋白的无尾噬藻体
噬藻体是侵染蓝藻的病毒。噬藻体与宿主的相互作用以及对蓝藻高度专一的致死性感染,可调节控制水华蓝藻的密度与种群结构,减少蓝藻水华的形成与危害,有助于蓝藻细胞溶解物参与地球生物化学循环。作为一种潜在控制有害蓝藻水华的生物效应因子,噬藻体成为水生病毒学和水环境科学研究的热点对象。 近日,中国科学院水生生物研究所张奇亚团队和桂建芳团队共同阐明了首株无尾噬藻体PaV-LD(Planktothrix agardhii Virus from Lake Dong -hu) 全基因组结构及其编码的藻胆体降解蛋白(NblA)的生物学功能。PaV-LD是从武汉东湖水样中培养分离的水华丝状蓝藻噬藻体,其基因组为双链DNA,共有95299个碱基对,含有142个推导基因。质谱分析从PaV-LD中鉴定出13个分子量大小范围在 27KDa 至 172KDa 的主要结构蛋白,但缺少已知噬藻(菌)体必备的几种尾结构蛋白。系统进化分析揭示,PaV......阅读全文
Fcγ-受-体-介-导-的-黏-附-作-用-和-吞-噬-作-用-的-检-测
实验步骤基本方案 FcY 受体介导的吞噬作用材 料原代巨噬细胞或巨噬细胞株(单 元 6.1 和 8. 5)R P M I -5 完 全 培 养 基(或其他培养基)绵 羊 红 细 胞(S R B C ) ,用 Alsever 溶 液 I : I (V /V ) 稀 释(附 录 1)生理盐水: 0. 9
复旦鉴定出4种自噬体连接化合物有望治疗亨廷顿舞蹈
亨廷顿舞蹈病(Huntington's disease, HD)是已被最广泛研究的四种主要神经退行性疾病之一。它的临床症状包括不受控制的舞蹈样行为(即舞蹈病)以及认知不足和精神异常。鉴于导致这种疾病的亨廷顿蛋白突变体(mutant huntingtin, mHTT, 突变型HTT)的生化
造礁石珊瑚纯净基因组构建技术获突破
近日,南方海洋科学与工程广东省实验室(广州)魏辅文院士团队在珊瑚生物学研究方面取得重要进展,开发出珊瑚纯净基因组构建的新技术框架,克服了珊瑚基因组学研究中长期存在的复杂共生体污染问题,将助力珊瑚组学研究迈向新的高度。相关成果发表于《创新》(The Innovation)。构建造礁石珊瑚纯净基因组的新
什么是细胞自噬
自噬是指细胞分解细胞质等自身构成成分的现象。自噬作用是细胞加速新陈代谢,或者在饥饿时获得能量的一个重要手段。自噬在各种生命活动中发挥着重要作用,比如它可以加速细胞内的新陈代谢,或者在细胞处于饥饿状态时从分解产物中获得能量。自噬过程中,细胞需要一个特殊的“口袋”将有待分解的物质包围并隔离起来,这个叫做
细胞自噬研究策略
医学科研实验基础知识笔记(四):细胞自噬研究策略细胞自噬是指细胞在外界环境因素的影响下, 细胞利用溶酶体降解自身受损、 变性或衰老的大分子物质以及细胞器的自我消化过程。自噬是细胞的一种自我保护机制, 广泛存在于真核细胞内, 在调节细胞生存和死亡的过程中, 起着重要的作用。当细胞发生自噬后, 在自噬相
什么是细胞自噬?
自噬(英语:Autophagy,或称自体吞噬)是一个涉及到细胞自身结构通过溶酶体机制,负责将受损的细胞器、错误折叠的蛋白及其他大分子物质等运送至溶酶体降解并再利用的进化保守过程。自噬是广泛存在于真核细胞的现象,并且可分为巨自噬、微自噬和分子伴侣介导的自噬三大类。这是一个受到紧密调控的步骤,此步骤是细
细胞自噬系统介绍
自噬是近年来很热门的领域,做一下系统的介绍或讨论,内容:1) 什么是自噬?包括自噬的定义、形态学特征、分子基础、调控等2)自噬的意义自噬与细胞存活、细胞死亡、疾病、衰老等的关系3)怎么研究自噬?主要谈谈怎么证明细胞发生了自噬,即自噬的判断标准和各种研究自噬的方法及局限性。一、自噬的过程——从一张图片
自噬溶酶体的作用
自噬性溶酶体是一种自体吞噬泡, 作用底物是内源性的,即细胞内的蜕变、破损的某些细胞器或局部细胞质。这种溶酶体广泛存在于正常的细胞内,在细胞内起“清道夫”作用,作为细胞内细胞器和其它结构自然减员和更新的正常途径。在组织细胞受到各种理化因素伤害时,自噬性溶酶体大量增加,因此对细胞的损伤起一种保护作用。自
自噬流怎么检测
1.检测LC3II/LCI: lc3参与自噬的形成,自噬形成时,胞浆型LC3(即LC3-I)会酶解掉一小段多肽,转变为(自噬体)膜型(即LC3-II),LC3II升高代表自噬的启动;2.检测P62:P62可以通过自噬来降解,因此P62可以反映自噬的强弱。当LC3 II升高,P62同时降低,表明自噬流
自噬流怎么检测
1.检测LC3II/LCI: lc3参与自噬的形成,自噬形成时,胞浆型LC3(即LC3-I)会酶解掉一小段多肽,转变为(自噬体)膜型(即LC3-II),LC3II升高代表自噬的启动;2.检测P62:P62可以通过自噬来降解,因此P62可以反映自噬的强弱。当LC3 II升高,P62同时降低,表明自噬流
自噬激活Hippo通路
而最早关于Hippo通路与自噬关系的论文则是2014年发表于《JEM》的一篇论文。mTORC1信号是自噬途径主要的上游抑制通路,而在TSC1缺失的细胞中,mTORC1通路则维持组成型激活状态。该项研究的研究者发现,在TSC1缺失的细胞中,不仅自噬受到抑制, Hippo通路也受到显著抑制。机制研究发现
自噬流怎么检测
1.检测LC3II/LCI: lc3参与自噬的形成,自噬形成时,胞浆型LC3(即LC3-I)会酶解掉一小段多肽,转变为(自噬体)膜型(即LC3-II),LC3II升高代表自噬的启动;2.检测P62:P62可以通过自噬来降解,因此P62可以反映自噬的强弱。当LC3 II升高,P62同时降低,表明自噬流
上海师大团队破解染色体级别基因组密码
中新网上海12月16日电 (记者 许婧)上海师范大学16日发布消息称,该校王全华研究团队在菠菜基因组研究领域又取得一项重大标志性研究成果。团队联合康奈尔大学Boyce Thompson研究所(BTI)费章君教授课题组等多家科研机构完成了新一代菠菜基因组精细图谱绘制、重要农艺性状遗传基础和菠菜驯化
龙井茶树染色体级别基因组组装成功
龙井43 中国农科院供图 近日,《自然—通讯》在线发表了我国科学家在茶树全基因组组装和茶树起源演化研究上取得的重要突破。该项研究由中国农业科学院茶叶研究所(以下简称茶叶所)和中国农业科学院深圳农业基因组研究所(以下简称基因组所)主导并携手中国科学院昆明动物研究所(以下简称昆
染色体级别的铁线蕨基因组首次绘制
日前,中国农业科学院深圳农业基因组研究所联合国内外8家科研院所首次绘制了染色体级别的铁线蕨基因组,揭示了蕨类植物孢子发育、真叶植物起源和种子演化、茉莉素信号通路进化等分子机制。相关研究成果发表在《自然—植物(Nature Plants)》。 真蕨植物以孢子体和配子体均具有光合自养能力为主要特
用比较基因组杂交描述染色体结构异常实验
实验方法原理比较基因组杂交(CGH)是一种能够在一步全基因组筛查程序,描述G带不能发现的细胞遗传物质增加或减少的分子细胞遗传学技术。CGH优于进行全染色体涂染(wcp)的常规荧光原位杂交(FISH)和多色FISH之处,是它不仅能够识别增加的未知片段的染色体来源,而且还可将该片段定位于特定的染色体区带
染色体级别橡胶基因组研究揭秘乳胶生物合成
橡胶树是大戟科植物。在植物界大约2500种产胶植物中,橡胶树产生的以聚异戊二烯为主要功能成分的天然胶乳约占全球天然橡胶的98% 以上。图片来源于网络 比起可能造成巨大环境污染的人工合成橡胶产业,天然橡胶因其良好的弹性、伸展性、耐老化等综合理化性能而具有不可替代性,是任何国家必须具备的重要战略
微阵列—比较基因组杂交技术检测染色体异常
【摘要】近年微阵列一比较基因组杂交(microarraycomparativegenomichybirdization,microarray.CGH)技术被应用到临床细胞遗传学领域。该技术是选择DNA特殊片段作为靶,固化在载体上,形成密集、有序的分子微阵列。然后,从测试标本中提取DNA,将测试DNA
昆明动物所发布碧凤蝶染色体水平基因组
蝴蝶因其丰富的形态多样性,自达尔文时代就作为研究物种适应性进化的重要类群之一,近几年更被认为是研究形态遗传、进化和发育的理想模型,已成为发育生物学、进化生物学、种群遗传学、保护生物学和生态学等研究领域的重要模式生物之一。凤蝶科是具有重要进化地位的蝴蝶支系,其丰富的色彩和形态等多样性是昆虫生态与进
研究创制基因组重构的高抗高产新多倍体
有性生殖是真核生物的主要繁殖方式。在有性生殖过程中,减数分裂同源重组与雌雄配子融合使子代产生遗传多样性。这些多样性是农业选择育种的基础。但是,有性生殖获得的优良性状特别是杂种优势易在后续世代中发生分离。因此,利用单性克隆生殖方式快速固定优势基因型,避免后代性状分离,永久维持杂种优势性状,被誉为农业育
中外百余名科学家《科学》公布重要测序结果
生物通报道:来自美国加州大学洛杉矶分校,法国巴黎第六大学(Université Paris 6),中国中山大学生物技术研究中心,比利时列日大学(University of Liège)等多处研究机构,由115名科学家的组成的研究团体,历经三年完成了莱茵衣藻(Chlamydomonas reinhar
青岛能源所等微藻甾体类化合物合成机制研究取得进展
甾体类化合物在真核生物中分布,但其在微藻中的代谢途径和生理作用知之甚少。近日,由中国科学院青岛生物能源与过程研究所单细胞研究中心和澳大利亚西澳大学澳大利亚研究委员会植物能源生理卓越中心(ARC Centre of Excellence, Plant Energy Biology)组成的联合研究团
生命学院研究组报道首个完整藻胆体的冷冻电镜三维结构
10月19日,清华大学生命科学学院隋森芳教授研究组在《自然》(Nature)期刊上在线发表题为《海洋红藻藻胆体的结构》(Structure of phycobilisome from the red alga Griffithsia pacifica)的研究论文,首次报道世界上第一个完整藻胆体的
青岛能源所微藻产油遗传机理和进化机制研究取得新进展
近日,中国科学院青岛生物能源与过程研究所在微藻产油的遗传和进化机制研究方面取得新进展。研究人员以微拟球藻为模式生物,较为系统地阐明了高产油性状的遗传基础及进化机制,为高产油藻的筛选和育种提供了坚实基础和崭新思路。相关成果已于2014年1月9日在线发表于PLoS Genetics。 自然
蓝藻门、裸藻门、黄藻门、硅藻门鉴定-——蓝藻门鉴定
实验材料色球藻属念珠藻属颤藻属藻类试剂、试剂盒I-KI 溶液0.1%甲基蓝溶液浓KOH溶液仪器、耗材显微镜镊子解剖针载玻片盖玻片滴管培养皿吸水纸实验步骤蓝藻是最原始最古老的光合自养原植体植物。细胞无核膜、核仁及其他细胞器,在细胞中央具有核物质,属于原核生物。蓝藻植物体多为蓝绿色,含叶绿素 a 、藻蓝
新研究:长春新碱有助于跨物种脑老化的自噬功能下降
自噬功能下降被认为是衰老的标志。在许多组织中,这种胞质内降解途径的活性随着年龄的增长而降低,自噬诱导可以缓解许多生物的衰老,包括小鼠。自噬是神经元的重要保护途径,衰老是常见神经退行性疾病的主要危险因素。在这里,作者描述了小鼠大脑中的自噬生物发生随着年龄的增长而下降,这与老年小鼠和人脑组织中SOR
自噬受体蛋白招募自噬起始相关ULK复合物分子机制
Nat Comm 细胞自噬(Autophagy)是真核细胞中一种高度受调控的、溶酶体依赖的细胞代谢过程,对于维持细胞内稳态以及促进细胞的生长、发育和存活具有至关重要的作用。选择性自噬通过自噬受体蛋白来特异性地识别和降解特定的底物,包括蛋白聚集体、受损线粒体、外源性的入侵病原体等。选择性自噬在众
单链丝状噬菌体展示系统
一、单链丝状噬茁体展示系统 1、pIII展示系统及噬苗体抗体 丝状噬茵体是单链DNA病毒,pIII是病毒的次要外完蛋白(minor coatprotein)、位于病毒颗粒的一端,每个病毒颗粒都有3—5个拷贝pIII蛋白,pIII有两个位点可供外源序列插入,即N端和近N端可伸屈胃内。当抗体片段或蛋
揭示昆虫绿僵菌通过微自噬途径调控附着胞脂滴降解机制
6月16日,Autophagy在线发表了中国科学院分子植物科学卓越创新中心王成树研究组完成的研究论文Activation of microlipophagy during early infection of insect hosts by Metarhizium robertsii。该研究揭示
关于插入型λ类噬菌体载体的简介
外源的DNA克隆到插入型的λ载体分子上,会使噬菌体的某种生物功能丧失效力,即所谓的插入失活效应。插入型的λ载体又可以分为免疫功能失活的(inactivatiortofimmunityfunction)和大肠杆菌β-半乳糖苷酶失活的(inactlvatlonofE.coliβ-galactosid