上海师大团队破解染色体级别基因组密码

中新网上海12月16日电 (记者 许婧)上海师范大学16日发布消息称,该校王全华研究团队在菠菜基因组研究领域又取得一项重大标志性研究成果。团队联合康奈尔大学Boyce Thompson研究所(BTI)费章君教授课题组等多家科研机构完成了新一代菠菜基因组精细图谱绘制、重要农艺性状遗传基础和菠菜驯化历史的解析。 该研究成果12月13日以“基因组解析揭示菠菜的驯化和农艺性状的遗传基础”为题在《自然·通讯》(Nature Communications)杂志在线发表。 菠菜富含维生素和矿物质元素等营养物质,是重要的叶用蔬菜,中国作为世界上最大的菠菜生产和消费国,栽培面积逐年增加。 上海师范大学王全华研究团队一直致力于菠菜种质资源的收集、评价与创新利用和重要性状关键基因的挖掘与基因组学研究,聚焦菠菜核心种质资源体系、菠菜抗逆及优良品质的分子机制和雌性系育种技术的研究,先后选育“沪菠”系列菠菜新品种8个,累计推广面积10000亩以上......阅读全文

“蚕姑娘”性染色体基因组密码破解

  7月8日,西南大学教授代方银团队首次获得了家蚕W染色体完整基因组序列,并揭示了鳞翅目昆虫W染色体起源与进化新机制。相关研究成果近日发表于期刊《科学进展》。  家蚕性别的决定机制一直受到科学界关注。以家蚕为代表的鳞翅目昆虫性染色体在昆虫界独树一帜。不同于大多数昆虫性染色体组为XX/XY系统,其性染

“蚕姑娘”性染色体基因组密码破解

7月8日,记者从西南大学获悉,该校教授代方银团队首次获得了家蚕W染色体完整基因组序列,并揭示了鳞翅目昆虫W染色体起源与进化新机制。相关研究成果近日发表于期刊《科学进展》。家蚕性别的决定机制一直受到科学界关注。以家蚕为代表的鳞翅目昆虫性染色体在昆虫界独树一帜。不同于大多数昆虫性染色体组为XX/XY系统

上海师大团队破解染色体级别基因组密码

  中新网上海12月16日电 (记者 许婧)上海师范大学16日发布消息称,该校王全华研究团队在菠菜基因组研究领域又取得一项重大标志性研究成果。团队联合康奈尔大学Boyce Thompson研究所(BTI)费章君教授课题组等多家科研机构完成了新一代菠菜基因组精细图谱绘制、重要农艺性状遗传基础和菠菜驯化

破解染色体级别基因组密码解析栽培菠菜的“前世今生”

  上海师范大学16日发布消息称,该校王全华研究团队在菠菜基因组研究领域又取得一项重大标志性研究成果。团队联合康奈尔大学Boyce Thompson研究所(BTI)费章君教授课题组等多家科研机构完成了新一代菠菜基因组精细图谱绘制、重要农艺性状遗传基础和菠菜驯化历史的解析。  该研究成果以“基因组解析

破译农业害虫粘虫染色体级基因组密码:为害虫防治策略升级提供关键助力

研究背景在广袤的农田里,有一种害虫正悄无声息地威胁着农作物的生长,它就是粘虫(Mythimna separata)。粘虫堪称农业界的 “破坏大王”,凭借着强大的迁飞能力和不挑食的习性,所到之处,水稻、玉米、小麦等众多农作物都难逃厄运。在亚洲和澳大利亚的大片农田中,常常能看到它肆虐的身影,给农业生产带

中国种茶树全基因组密码破解

  记者从安徽农业大学获悉,该校茶树生物学与资源利用国家重点实验室宛晓春教授研究团队,联合深圳华大基因等单位,破解了世界上分布最广的中国种茶树的全基因组信息,成果日前在线发表于《美国科学院院刊》上。  世界主栽茶树分属两个变种:即中国种和阿萨姆种,前者叶小,分布广泛,适制绿茶等六大茶类;后者叶大,主

Nature首次解密肚子里的基因组密码

  我们身体里含有大量的微生物基因组,数量比我们本身的基因组多得多,一项最新研究表明,我们肚子肠道里的微生物基因组,就如同人类DNA个体之间存在差异一样,也是大不相同。   这项研究是第一个分类记录肠道微生物遗传变异的研究成果,肠道是我们人类摄取营养成分,合成维生素,防止感染,以及生产天然降低炎症

小麦野生近缘种基因组“密码”被破解

  记者宋喜群、冯帆从山东农业大学获悉,该校农学院教授孔令让研究团队首次组装了小麦远缘杂交常用物种中间偃麦草和鹅观草染色体水平的高质量基因组序列,解析了二者基因组结构差异与独立多倍化演化路径,对两者携带的抗小麦赤霉病基因Fhb7同源序列的功能与抗性效应进行了研究,为小麦抗性遗传改良及牧草育种提供了重

康乃馨遗传密码被破解-有助花卉染色体组研究

  日本农业和食品产业技术综合研究机构近日宣布,他们与东京农工大学等机构合作解读了康乃馨的全部染色体组,这将为康乃馨的品种改良提供极大方便,并有助于促进其他花卉的染色体组研究。  据宣布,研究人员以一种名为“弗朗西斯科”的红色康乃馨为研究对象,弄清了康乃馨其中6.22亿个碱基对中91%的碱基对排列,

中国聋病基因组计划欲破译耳聋密码

  在解放军总医院耳鼻咽喉头颈外科听力诊断中心测听室内,一周岁的聪聪对各项听力测试均反应正常。这也说明,借助胚胎植入前遗传学诊断技术,我国首例阻断重度遗传性耳聋治疗取得成功。  聪聪的父母均为我国遗传性耳聋的常见致病基因GJB2携带者。一年前,这对夫妇在经历胚胎植入前的耳聋基因诊断、胚胎着床后应用单

中国聋病基因组计划欲破译耳聋密码

   在解放军总医院耳鼻咽喉头颈外科听力诊断中心测听室内,一周岁的聪聪对各项听力测试均反应正常。这也说明,借助胚胎植入前遗传学诊断技术,我国首例阻断重度遗传性耳聋治疗取得成功。  聪聪的父母均为我国遗传性耳聋的常见致病基因GJB2携带者。一年前,这对夫妇在经历胚胎植入前的耳聋基因诊断、胚胎着床后应用

AI模型“Evo”:揭开基因组“密码全书”新篇章

《科学》杂志15日发布了一项突破性研究成果:美国斯坦福大学Arc研究所团队利用人工智能(AI),开发出一种大规模基因组基础模型“Evo”,翻开了生命的“密码全书”。该模型采用先进架构,能够以前所未有的精度,解析和设计从分子层面到整个基因组级别的DNA、RNA及蛋白质序列。其不仅能够预测突变对细胞内部

染色体水平冬瓜参考基因组发布

近日,广东省农业科学院蔬菜研究所发布了染色体水平冬瓜参考基因组。相关研究发表于Scientific Data,广东省农业科学院蔬菜研究所副研究员罗文龙和副研究员闫晋强为该论文共同第一作者,广东省农业科学院蔬菜研究所研究员江彪为通讯作者。广东省农业科学院蔬菜研究所于2019年对黑皮大冬瓜B227进行基

“活化石”软体动物基因组揭示眼睛进化密码

   眼睛是我们接收外界信息的一个重要器官,通过眼睛我们才能看到这个多样的世界。但人类的视觉和其他物种有着很大的差别,更有一些物种眼睛的结构和色彩感知能力远不如人类,虽然其近亲进化出了复杂的眼睛,那些眼睛只有简单结构的“古老”物种,是如何保持其原始眼睛特征的?  5月11日,《自然-生态与进化》杂志

染色体级别的银杏参考基因组公开

银杏果实 曹福亮供图  作为裸子植物银杏纲唯一的孑遗物种,银杏不仅具有特殊的科学研究价值,而且具有重要的应用价值。  近日,南京林业大学联合中国农业科学院农业基因组研究所在《自然—植物》在线发表了染色体级别的银杏参考基因组,是目前已发表的组装质量最高的裸子植物参考基因组。  论文共同通讯作者、中国工

研究发布碧凤蝶染色体水平基因组

  蝴蝶因其丰富的形态多样性,自达尔文时代就作为研究物种适应性进化的重要类群之一,近几年更被认为是研究形态遗传、进化和发育的理想模型,已成为发育生物学、进化生物学、种群遗传学、保护生物学和生态学等研究领域的重要模式生物之一。凤蝶科是具有重要进化地位的蝴蝶支系,其丰富的色彩和形态等多样性是昆虫生态与进

科学家为一种细菌重编基因组密码

  报道,最近,美国耶鲁大学和哈佛大学的科学家合作,为一种细菌重新编写了完整的基因组编码,并提高了其抗病毒能力。相关论文发表在10月18日的《科学》杂志上。   “这是第一次从根本上改变了遗传密码。”论文共同高级作者、耶鲁大学分子、细胞与发育生物学副教授法伦·艾萨克斯说,“创造一个有着新基因编码的

基因组密码被解锁:深度学习模型破解非编码区奥秘

人类基因组中超98%的遗传变异位于非编码区,这些变异通过调控染色质可及性、三维构象、剪接加工等多种分子机制影响基因表达,最终导致疾病发生。由于调控机制的复杂性和细胞类型特异性,目前解读非编码变异的分子效应仍是重大挑战。现有深度学习模型在预测功能基因组特征时,往往在输入序列长度与预测分辨率之间难以兼顾

人类基因组概述

  一、细胞核基因组  每条染色体含1个DNA分子,1个细胞的全部遗传信息(基因)都编码在线状的DNA分子上。由于每个体细胞中有2套染色体(2n),故所含的DNA是由两个基因组(genome)构成。每个单倍体基因组约含3.2×109bp。人类基因的平均长度为1-1.5kb,所以基因组以足以编码1.5

北京基因组所合作研究揭示密码子表的内在规律

  对于绝大多数物种来说,外界所能提供的能源是有限的,如何有效利用有限的资源,往往对物种的生存起决定作用。中国科学院北京基因组研究所基因组科学与信息重点实验室胡松年组客座研究员陈卫华以及德国杜塞尔多夫大学、欧洲分子生物实验室的合作者们从全新的角度出发,对“能量节省”压力下基因组的演化情况进行了系统研

国家重点实验室破解中国种茶树全基因组密码

  当前,世界主栽茶树分属两个变种: 中国种和阿萨姆种。省部共建茶树生物学与资源利用国家重点实验室安徽农业大学宛晓春教授研究团队,联合深圳华大基因和中国科学院国家基因研究中心等相关研究团队,以国家级茶树品种舒茶早(中国种)为材料,用二代和三代测序技术对其进行测序,采取杂合组装策略,获得覆盖基因组93

日本量子密码通信技术传送人类基因组实验成功

  据日本《共同社》获悉,日本东芝公司和日本东北大学东北Medical Megabank机构(仙台市)近日宣布,成功开展了利用可防止信息被偷窥的新一代技术“量子密码通信”传送人类遗传信息(基因组)完整数据的实证试验。据悉,容量庞大的基因组数据传送在全球尚属首次,东芝介绍称这一实验确认了量子密码技术的

北京基因组所合作研究揭示密码子表的内在规律

  对于绝大多数物种来说,外界所能提供的能源是有限的,如何有效利用有限的资源,往往对物种的生存起决定作用。中国科学院北京基因组研究所基因组科学与信息重点实验室胡松年组客座研究员陈卫华以及德国杜塞尔多夫大学、欧洲分子生物实验室的合作者们从全新的角度出发,对“能量节省”压力下基因组的演化情况进行了系统研

利用DNA遗传密码构建出化学密码

  大自然每天都表明它是复杂的和有效的。有机化学家们羡慕它,这是因为他们的常规性工具限制他们取得更为简单的成就。多亏瑞士日内瓦大学教授Stefan Matile研究团队的研究,这些限制可能成为过去的事情。相关研究结果刊登在Nature Chemistr

昆明动物所发布碧凤蝶染色体水平基因组

  蝴蝶因其丰富的形态多样性,自达尔文时代就作为研究物种适应性进化的重要类群之一,近几年更被认为是研究形态遗传、进化和发育的理想模型,已成为发育生物学、进化生物学、种群遗传学、保护生物学和生态学等研究领域的重要模式生物之一。凤蝶科是具有重要进化地位的蝴蝶支系,其丰富的色彩和形态等多样性是昆虫生态与进

用比较基因组杂交描述染色体结构异常实验

实验方法原理比较基因组杂交(CGH)是一种能够在一步全基因组筛查程序,描述G带不能发现的细胞遗传物质增加或减少的分子细胞遗传学技术。CGH优于进行全染色体涂染(wcp)的常规荧光原位杂交(FISH)和多色FISH之处,是它不仅能够识别增加的未知片段的染色体来源,而且还可将该片段定位于特定的染色体区带

染色体级别橡胶基因组研究揭秘乳胶生物合成

   橡胶树是大戟科植物。在植物界大约2500种产胶植物中,橡胶树产生的以聚异戊二烯为主要功能成分的天然胶乳约占全球天然橡胶的98% 以上。图片来源于网络  比起可能造成巨大环境污染的人工合成橡胶产业,天然橡胶因其良好的弹性、伸展性、耐老化等综合理化性能而具有不可替代性,是任何国家必须具备的重要战略

染色体级别的铁线蕨基因组首次绘制

   日前,中国农业科学院深圳农业基因组研究所联合国内外8家科研院所首次绘制了染色体级别的铁线蕨基因组,揭示了蕨类植物孢子发育、真叶植物起源和种子演化、茉莉素信号通路进化等分子机制。相关研究成果发表在《自然—植物(Nature Plants)》。  真蕨植物以孢子体和配子体均具有光合自养能力为主要特

龙井茶树染色体级别基因组组装成功

   龙井43    中国农科院供图 近日,《自然—通讯》在线发表了我国科学家在茶树全基因组组装和茶树起源演化研究上取得的重要突破。该项研究由中国农业科学院茶叶研究所(以下简称茶叶所)和中国农业科学院深圳农业基因组研究所(以下简称基因组所)主导并携手中国科学院昆明动物研究所(以下简称昆

微阵列—比较基因组杂交技术检测染色体异常

【摘要】近年微阵列一比较基因组杂交(microarraycomparativegenomichybirdization,microarray.CGH)技术被应用到临床细胞遗传学领域。该技术是选择DNA特殊片段作为靶,固化在载体上,形成密集、有序的分子微阵列。然后,从测试标本中提取DNA,将测试DNA