武汉植物园在植物NAC蛋白进化研究中取得新进展

NAC蛋白是植物中最大的转录因子家族之一,广泛存在于陆生植物中。NAC蛋白参与植物生长发育和器官模式建成的许多特异方面。越来越多的研究表明,NAC蛋白在植物应答生物及非生物胁迫过程中发挥重要的作用。 中科院武汉植物园植物应用基因组学学科组博士研究生朱婷婷在彭俊华研究员的指导下,通过对9种陆生植物的全基因组序列检索发现,在苔藓和石松植物中NAC蛋白的数量小于30,而在被子植物中则多于100。系统发育分析表明,这些NAC蛋白由21个亚家族组成,在各亚家族中,NAC蛋白的转录激活区存在高度保守的基序,这些特异基序可能在NAC蛋白的进化过程中起着重要作用。研究还指出,NAC蛋白很有可能起源于4亿年前,并随着维管植物的分化而广泛扩张。 与前人局限于被子植物的研究相比,该研究对更广泛来源的植物全基因组数据进行分析,重新界定了NAC蛋白的亚家族以及各亚家族的特异性,并首次对NAC蛋白的进化史进行了探讨。 ......阅读全文

武汉植物园在莲NAC转录因子研究中获进展

  NAC转录因子是植物特有的一类转录因子,广泛存在于植物界,并参与调节植物的各种生物学过程,例如器官发生、组织发育以及胁迫应答响应等。然而,莲中NAC转录因子家族尚未报道。  近日,Frontiers in genetics发表了中国科学院武汉植物园莲种质资源与遗传育种学科组撰写的题为Genome

武汉植物园在植物NAC蛋白进化研究中取得新进展

     NAC蛋白是植物中最大的转录因子家族之一,广泛存在于陆生植物中。NAC蛋白参与植物生长发育和器官模式建成的许多特异方面。越来越多的研究表明,NAC蛋白在植物应答生物及非生物胁迫过程中发挥重要的作用。   中科院武汉植物园植物应用基因组学学科组博士研究生朱婷婷在彭俊华研究员

让植物在陆地上立足的蛋白?

  野生型小立碗藓。   据一项新的研究披露,在地球的早期植物生活完成从水至陆地的过渡之前,这些先驱植物必须要演化出用于传输水的专门细胞--而一组被称作NAC转录因子的特别蛋白可能在该发展中起着一种重要的作用。Bo Xu及其同事知道,这些转录因子会作用于某些基因而产生陆地维管植物的专门化的往返

《科学》:苔藓基因组有望揭开陆生植物进化之谜

一个国际科学家小组近日通过分析苔藓基因组发现,苔藓基因的丰富性超乎想象,并且具有许多独特的变异。根据苔藓在植物进化树上的独特位置,这一发现将有助于揭示植物从水生到陆生的过程。相关论文12月13日在线发表于《科学》(Science)杂志上。 图片说明:通过测序苔藓基因组,科学家有望弄清植物由水生到陆

遗传所童依平组|硝酸盐诱导的NAC转录因子调控硝化反应..

遗传所童依平组|硝酸盐诱导的NAC转录因子调控硝化反应增产小麦通告:今日起,原“imOmics精华速递”改版为“旭月活体研究通讯”,简称“旭月通讯”,每周一期。除介绍最新的NMT文献外,还有实验设计、设备操作、数据分析、文章撰写、审稿答疑......更多干货,等你来撩。NISC文献编号:C2015-

遗传发育所发现大豆调控抗盐耐旱的分子机制

  大豆是重要的经济作物,是人类食用油脂和蛋白及动物饲料的重要来源。其在响应非生物胁迫的分子调控机制方面的研究仍然存在较大空白。  中国科学院遗传与发育生物学研究所基因组生物学研究中心/植物基因组学国家重点实验室陈受宜研究组和张劲松研究组在前期的研究中鉴定出一系列能够响应逆境胁迫的转录因子。该研究利

植物应答干旱胁迫新路径揭示

  锚定在细胞膜上的转录因子如何在植物面对干旱胁迫时发挥抗旱作用?这一众多科学家感兴趣的问题,得到了部分解答。12日,科技日报记者从中国农业大学了解到,该校农业生物技术国家重点实验室王涛教授研究团队在植物应答干旱胁迫的分子机制领域取得突破。相关论文于7月6日在线发表在国际植物学顶级学术期刊《植物细胞

Cell子刊发布首个植物转录因子文库

  近日科学家们借助自动化平台,建立了首个植物遗传学开关的综合性文库,以帮助全球学者更好的理解植物对环境改变的适应,培育更好的植物品种。相关论文于七月十七日发表在Cell旗下的Cell Reports杂志上。  该文库的建立耗时八年,包含大约两千个植物转录因子的克隆。转录因子是天然的遗传学开关,研究

PIL家族转录因子抑制植物分蘖机制获解析

近日,山东省农业科学院水稻研究所研究员谢先芝、中国农业科学院作物科学研究所研究员孙加强和孔秀英等合作,报道了PIL家族转录因子直接与SPLs互作,并在抑制小麦、水稻和拟南芥分蘖/分枝方面发挥重要作用。相关论文在线发表于《新植物学家》。株高、分蘖数、分蘖角等结构是小麦、水稻等作物株型的重要决定因素之一

研究揭示转录因子在小麦抗白粉病中的作用机制

近日,西北农林科技大学农学院张宏研究员团队以多组学数据分析挖掘到的小麦转录因子TaNAC1为切入点,揭示了其在小麦抗白粉病中的遗传基础和作用机制,解析了该基因亚基因组同源基因的功能性遗传差异,并阐明了其调控细胞凋亡和增强抗病性的作用机理。该研究成果发表在New Phytologist上。该研究发现瞬

研究团队发现玉米籽粒发育与灌浆协同调控中心因子

  近期,中国科学院分子植物科学卓越创新中心研究员巫永睿课题组在Plant Cell上,在线发表了题为The B3 Domain-Containing Transcription Factor ZmABI19 Coordinates Expression of Key Factors Require

科学家构建小麦籽粒发育中的转录调控图谱

近日,中国农业科学院作物科学研究所研究员路则府团队在《生物技术通报(英文)》(aBIOTECH)发表了文章,构建了小麦籽粒发育不同阶段的全基因组染色质开放图谱以及基因表达图谱,并对小麦籽粒发育中关键转录因子的调控网络进行了解析,揭示了小麦籽粒发育中亚基因组的分化调控,同时发掘了共调控淀粉与蛋白合成的

玉米转录因子和籽粒重要转录因子互作协同调控醇溶蛋白

玉米(Zea mays)原产于墨西哥和中美洲地区,是一种由古印第安人(Indians)在数千年前利用野生墨西哥类蜀黍(Euchlaenamexicana)(现存在于墨西哥和尼加拉瓜)杂交而来的品种。但是,作为一类重要的粮食作物,天然玉米籽粒在其营养价值上却有着重要的缺陷。根据已有的文献报道,玉米籽粒

玉米转录因子ZmMADS47和籽粒转录因子Opaque2-调控醇溶蛋白

  玉米(Zea mays)原产于墨西哥和中美洲地区,是一种由古印第安人(Indians)在数千年前利用野生墨西哥类蜀黍(Euchlaenamexicana)(现存在于墨西哥和尼加拉瓜)杂交而来的品种。但是,作为一类重要的粮食作物,天然玉米籽粒在其营养价值上却有着重要的缺陷。根据已有

研究揭示转录因子在小麦抗白粉病中的作用机制

近日,西北农林科技大学农学院张宏研究员团队以多组学数据分析挖掘到的小麦转录因子TaNAC1为切入点,揭示了其在小麦抗白粉病中的遗传基础和作用机制,解析了该基因亚基因组同源基因的功能性遗传差异,并阐明了其调控细胞凋亡和增强抗病性的作用机理。该研究成果发表在New Phytologist上。该研究发现瞬

科学家破解陆生植物起源密码

  多细胞轮藻具备根茎叶的分化,被学术界认为是陆生植物的祖先。近日,科学家获得了绿色植物界最古老单细胞轮藻(Mesostigma viride)的首个基因组,在表观组和转录组研究中取得重大突破。相关成果在线发表于《尖端科学(Advanced Science)》。  单细胞生物到多细胞生物的演化是生命

华南植物园铁皮石斛抗逆机制研究取得进展

  铁皮石斛(Dendrobium officinale Kimura et Migo)是兰科(Orchidaceae)石斛属(Dendrobium)多年生附生草本植物,是我国传统名贵中药材。  铁皮石斛自然分布区域很广,我国秦岭淮河以南的大分布地区均有发现,野生状态下的铁皮石斛主要附生于树干、岩石

遗传所周俭民发表植物免疫新成果

  七月二十一日,国际著名植物学期刊《Plant Cell》在线发表了中科院遗传与发育生物学研究所周俭民研究员带领的一项最新研究成果。这项研究报道称,丁香假单胞菌III型效应蛋白AvrB,可通过COI1和NAC转录因子定义的一条经典JA信号通路,诱导气孔开放,并使气孔对丁香假单胞菌产生毒力。   气

能控制转录终止的蛋白质ρ因子

能控制转录终止的蛋白质ρ因子(ρ factor)是一种与转录终止相关的蛋白质。1969年,Roberts J在T4噬菌体感染的大肠杆菌中发现了能控制转录终止的蛋白质,命名为ρ因子。ρ因子是由相同亚基组成的六聚体蛋白质,亚基分子量为46kD  。ρ因子能结合RNA,又以对poly C的结合能力最强 

转录因子和调节蛋白是包含关系吗

调节蛋白是个很大的概念,其调节对象可以包括DNA、RNA以及蛋白质,而转录因子特指对基因转录水平进行调节的蛋白质,从这一角度上说,”调节蛋白“概念涵盖转录因子。调节蛋白还包括:各种修饰蛋白(例如对DNA进行甲基化乙酰化修饰的蛋白、蛋白磷酸化甲基化蛋白),RNA剪接蛋白、蛋白辅助蛋白(分子伴侣)等等。

植物所等阐明水稻胚乳中清蛋白积累的分子机制

  禾本科植物胚乳累积的淀粉和贮藏蛋白是人类重要的食物来源。根据在不同溶剂中的溶解度不同,水稻胚乳贮藏蛋白可分为谷蛋白、醇溶蛋白、清蛋白和球蛋白。其中清蛋白是水稻胚乳中丰富的水溶性蛋白,也是主要的致敏蛋白,人们对其积累调控机制尚不清楚。此前研究结果表明水稻胚乳特异性表达的转录因子NAC20和NAC2

CCAAT转录因子

中文名称CCAAT转录因子英文名称CCAAT transcription factor定  义可与启动子中的CCAAT元件发生特异性相互作用的转录因子。应用学科细胞生物学(一级学科),细胞遗传(二级学科)

辅助转录因子

中文名称辅助转录因子英文名称ancillary transcription factor定  义协助RNA聚合酶同启动子结合,并促进已结合的RNA聚合酶启动转录速率的转录因子。应用学科细胞生物学(一级学科),细胞遗传(二级学科)

转录因子组成

真核生物在转录时往往需要多种蛋白质因子的协助。一种蛋白质是不是转录结构的一部分往往是通过体外系统看它是否是转录起始所需要的。一般这些促成转录起始所需的转录结构包括三个重要的组成部分:亚基RNA聚合酶的亚基,它们是转录必须的,但并不对某一启动子有特异性。复合物某些转录因子能与RNA聚合酶结合形成起始复

遗传发育所揭示赤霉素调控纤维素合成的分子机制

  纤维素是细胞壁的主要成分,其含量与结构影响茎秆机械强度等农艺性状。纤维素的合成与组装过程复杂,受多种激素和环境因子等严格调控。赤霉素是上世纪中期“绿色革命”的关键激素,在降低株高、增强作物抗倒性方面发挥了重要作用。但对于该激素是否调控纤维素合成及相关分子机制仍知之甚少。  中国科学院遗传与发育生

植物叶绿体基因组可以全部转录的新机制

  叶绿体是地球上绿色植物把光能转化为化学能、供给地球上的其它生物能量来源的重要细胞器,对叶绿体的功能和叶绿体基因组转录机制的研究一直以来是全球细胞生物学家、遗传学家和分子生物学家孜孜以求的研究热点。中国科学院昆明植物研究所研究员高立志带领的研究团队,历时五年,通过对三种高等植物(水稻、玉米和拟南芥

陆生植物的定向选择分析

在陆地上,植物扎根于土壤,以吸收其中的养分和水分,通过茎干与分枝支撑一片片绿叶沐浴阳光(根、茎和叶的分化也是高等植物的象征)。在合适的水分和养分存在的条件下,对太阳光的有效利用是陆生植物群落进化的重要驱动力。陆生植物对太阳光的有效利用必定导致植物群落的立体化发展,其中一些植物向大型化的参天大树发展,

启动子与转录因子/基因表达调控蛋白

目的基因的表达调控生命活动丰富多彩、千变万化。但是万变不离其宗,不管如何变化都围绕着中心法则展开。核酸作为遗传物质指导蛋白质的表达,表达产生的一些特殊蛋白(如转录因子、调控蛋白)反过来又对DNA指导合成蛋白质的过程进行调控。对基因表达调控的研究一直是生物学研究热点,涉及到生命活动的各个过程,也是各类

Nat-Commun:揭秘转录因子“勘察”细胞基因组的分子机制

  转录因子(TFs)是一种能调节基因表达的特殊蛋白,其能在完整的基因组中搜索并结合特殊区域来调节基因的表达;我们都知道,转录因子不仅能结合特殊的DNA序列,还能非特异性结合任何DNA链。这些非特异性的关联就能够明显增加转录因子寻找特殊靶点的能力,然而目前研究人员并不清楚在扫描大量基因组、定位以及结

关于基因转录的转录因子介绍

  转录因子(transcription factor)是起调控作用的反式作用因子。转录因子是转录起始过程中RNA聚合酶所需的辅助因子。真核生物基因在无转录因子时处于不表达状态,RNA聚合酶自身无法启动基因转录,只有当转录因子(蛋白质)结合在其识别的DNA序列上后,基因才开始表达。转录因子的结合位点