大化所动物所在代谢组学研究中取得新进展

近日,中科院大连化学物理研究所许国旺研究员领导的研究组(1808组)利用其构建的代谢组学技术平台取得重要科研成果。他们与中科院动物研究所康乐院士研究组合作,首次发现了肉碱类代谢物在飞蝗两型转变过程中的关键调控作用。相关论文已在线发表在《美国国家科学院院刊》(PNAS)上(doi: 10.1073/pnas.1119155109 PNAS February 10, 2012)。 代谢组学作为系统生物学的分支,在生命科学研究中具有广阔的应用空间与巨大的实用价值。飞蝗散居型和群居型之间的转变(型变)正是复杂生物现象的典型代表,是蝗灾爆发的关键生物学基础。揭示飞蝗型变背后隐藏的生物调控机制具有重要的现实意义。多年来,康乐研究组致力于利用基因组学手段来破解这一谜题,并深刻认识到型变调控机制的阐释迫切需要系统生物学的深度介入。两个课题组决定开展跨学科协作研究,依托大连化物所的代谢组学平台,从血淋巴代谢物层次上......阅读全文

转录组学方介导的多效调控蛋白-SprA-作用机制研究

  Applied Microbiology and Biotechnology (AMB)为国际工业微生物领域著名杂 志。近期,浙江省微生物生化与代谢工程重点实验室研究人员在该期刊上发表了题 为"Transcriptome-guided identification of SprA as a pl

转录组学方介导的多效调控蛋白-SprA-作用机制研究

  Applied Microbiology and Biotechnology (AMB)为国际工业微生物领域著名杂 志。近期,浙江省微生物生化与代谢工程重点实验室研究人员在该期刊上发表了题 为"Transcriptome-guided identification of SprA as a pl

中药基础物质、代谢及代谢组学研究方案

  中药组成成分复杂、作用环节多样,中药药效物质基础以及临床疗效机理的阐明,已成为中医药现代化研究的重要内容。如何快速地从海量的质谱数据中获取有价值的信息,减轻繁重的数据处理工作量,成为广大中医药研究工作者的心声。  赛默飞的Compound Discoverer软件针对中药成分鉴定、体内代谢转化和

代谢组学-|-肿瘤治疗之靶向葡萄糖代谢

  能量代谢重编程是肿瘤的十大特征之一,其中葡萄糖代谢异常是肿瘤代谢最突出的特征。在氧气充足的情况下,肿瘤细胞依然倾向于进行糖酵解,将葡萄糖代谢为乳酸。肿瘤细胞有氧糖酵解能力是正常细胞的20 ~ 30倍,为肿瘤代谢提供 大量能量和中间产物。因此,靶向糖酵解等异常环节的代谢酶是抗肿瘤治疗的重点。一些研

代谢组学、脂质组学在病毒研究中的应用(二)

案例三基于代谢组学技术挖掘病毒感染宿主后代谢动态变化情况2019年发表在Viruses杂志上的另一篇文章,采用基于Orbitrap 的非靶标和靶标代谢组学方式研究了麻痹病毒(Cricket paralysis virus, CrPV)感染昆虫Bm5细胞后宿主代谢的动态变化情况。研究人员发现,CrPV

代谢组学、脂质组学在病毒研究中的应用(一)

在疫情逐步可控的情形下,一线的医务工作者和科研人员将有更多精力和时间对冠状病毒进行更深一步的研究和认识。我们此次调研了基于Orbitrap超高分辨的代谢组学,脂质组学,以及药物治疗在病毒学研究中的应用。致敬白衣天使和深耕医学研究的学者。 目前的研究显示,新型病毒进入细胞的路径与SARS冠状病毒一样,

实质等同性(代谢组学)实验

实验材料SIMCA - P 多变量统计软件试剂、试剂盒[ 1H ] - NMR 抽提剂仪器、耗材Eppendorf 聚丙稀管NMR 管NMR 波谱仪实验步骤本章描述的方法最适合于分析小麦精白面,但改进后也适用于全面粉、麦麸或其他组织,如叶和根。在开展实质等同性代谢组学实验前,如其他任何田间试验或温室

实质等同性(代谢组学)实验

实验材料 SIMCA - P 多变量统计软件试剂、试剂盒 [ 1H ] - NMR 抽提剂仪器、耗材 Eppendorf 聚丙稀管NMR 管NMR 波谱仪实验步骤 本章描述的方法最适合于分析小麦精白面,但改进后也适用于全面粉、麦麸或其他组织,如叶和根。在开展实质等同性代谢组学实验前,如其他任何田间试

合作成果丨靶向代谢组学

     本文内容非商业广告,仅供专业人士参考。关于岛津      岛津企业管理(中国)有限公司是(株)岛津制作所于1999年100%出资,在中国设立的现地法人公司,在中国全境拥有13个分公司,事业规模不断扩大。其下设有北京、上海、广州、沈阳、成都分析中心,并拥有覆盖全国30个省的销售代理     

实质等同性(代谢组学)实验

实验材料:SIMCA - P 多变量统计软件    试剂、试剂盒:[ 1H ] - NMR 抽提剂      仪器、耗材:Eppendorf 聚丙稀管                                                                  NMR 管    

代谢组学全流程解决方案

赛默飞基于其超高分辨的静电场轨道阱(Orbitrap)质谱平台结合其功能强大的软件平台,提供代谢组学全流程解决方案。该方案不仅覆盖从极性代谢物到非极性代谢物的全面检测、峰提取与定量、统计学分析与可视化作图、代谢产物的全面鉴定、代谢通路分析等全流程的要求,而且还整合了从非靶标生物标记物发现到靶标生物标

临床代谢组学研究常见问题

分享一些我们举办完第一期微信公开课——临床代谢组学研究策略后,所收集到的常见问题,供大家学习和参考。Q:如何设置验证集和测试集?A:按我理解你想问的问题是:training set训练集和test set测试集的设置问题。我们做分析化学、生物化学或者分子生物学的初学者通常会混淆这几个数据集概念,通常

我国获得星油藤遗传学数据信息及ALA合成代谢调控机制

  星油藤 (Plukenetia volubilis L.)又名美藤果、南美油藤,英文名称为Sacha Inchi或Inca peanut,为大戟科多年生木质藤本植物,种子含有41–54%的油以及25–27% 的蛋白质。星油藤种子油中的2种人体必需多元不饱和脂肪酸a-亚麻酸(ω-3类,简称ALA)

肿瘤代谢基因调控的新机制揭示

  中国科学技术大学生命科学学院高平课题组和张华凤课题组在肿瘤代谢基因调控研究领域取得重要进展,相关研究成果日前在线发表于《自然·通信》上。  众所周知,肿瘤通过对自身细胞代谢的重编程而获得增殖优势。因此,探索肿瘤代谢异常的机制已成为肿瘤研究的焦点。c-Myc是一个重要的癌基因,它的异常表达会导致3

Cell子刊:脂肪代谢的神经调控机制

  清华大学-北京大学生命中心,清华大学的研究人员发表了题为“Dense Intra-Adipose Sympathetic Arborizations Are Essential for Cold-Induced Beiging of Mouse White Adipose Tissue”的研究论

研究揭示尼古丁代谢调控的新机制

  近日,中国农业科学院烟草研究所烟草功能成分与综合利用创新团队揭示了烟草转录因子NtMYB305a参与尼古丁代谢调控的分子机制。相关研究结果在线发表于《植物生理学(Plant Physiology)》杂志。  据张洪博研究员介绍,尼古丁是一种重要的天然生物碱,在烟草中的含量最为丰富,约占烟草总生物

质谱仪在代谢组学和代谢研究中有着杰出表现

 质谱仪以离子源、质量分析器和离子检测器为核心。离子源是使试样分子在高真空条件下离子化的装置。电离后的分子因接受了过多的能量会进一步碎裂成较小质量的多种碎片离子和中性粒子。它们在加速电场作用下获取具有相同能量的平均动能而进入质量分析器。质量分析器是将同时进入其中的不同质量的离子,按质荷比m/e大小分

【JOAT刘虎威编者按】专题:代谢组学和脂质组学

  刘虎威教授担任《Journal of Analysis and Testing》第三期特刊的客座主编。     近日,刘虎威教授担任《Journal of Analysis and Testing》第三期特刊的客座主编进行了约稿审稿工作,并撰写了题为“专题:代谢组学和脂质组学”的编者按。  代谢

《细胞-代谢》-宋保亮小组-胆固醇代谢调控新机制

日前,国际著名学术期刊《细胞-代谢》(Cell Metabolism)发表了我国科学家关于胆固醇代谢调控机制的最新研究成果。中国科学院上海生命科学研究院生物化学与细胞生物学研究所宋保亮研究员领导的研究小组鉴定出一个新的gp78结合蛋白Ufd1,并发现:Ufd1蛋白与gp78蛋白结合,增强了gp78的

AFADESI空间代谢组学高级研修班

  为做好AFADESI空间代谢组学技术服务工作,由中国科学院高能物理研究所测试中心和中国科学院-香港大学金属组学与健康和环境联合实验室共同承办的“AFADESI空间代谢组学高级研修班”将于2023年4月26日-4月27日在京召开。在这里,我们将竭诚为您提供丰富的前沿应用信息和与专家零距离交流的平台

代谢组学:一项艰巨的任务

  学生化的孩子真是伤不起。糖代谢、脂代谢、核酸代谢,一系列代谢通路,一大堆代谢产物,简直让人头晕眼花。然而,这又不能跳过。毕竟,DNA编码蛋白质,而蛋白质在小分子上发挥其魔力。但很多时候,科学界对这些分子一无所知。  “如果你测定一滴血中的小分子,大约60% 所检测到的峰都无法与任何代谢物相匹配,

岛津非靶向代谢组学解决方案

     本文内容非商业广告,仅供专业人士参考。关于岛津      岛津企业管理(中国)有限公司是(株)岛津制作所于1999年100%出资,在中国设立的现地法人公司,在中国全境拥有13个分公司,事业规模不断扩大。其下设有北京、上海、广州、沈阳、成都分析中心,并拥有覆盖全国30个省的销售代理     

临床代谢组学研究常见问题(一)

  分享一些我们举办完第一期微信公开课——临床代谢组学研究策略后,所收集到的常见问题,供大家学习和参考。   Q:如何设置验证集和测试集?   A:按我理解你想问的问题是:training set训练集和test set测试集的设置问题。我们做分析化学、生物化学或者分子生物学的初学者通常会混淆这

综述:代谢组学在疾病中的应用

   代谢组学经历了迅猛的技术演化在过去二十年。尤其是广泛靶向代谢组学技术的新起,实现一次性检测坚定上千种物质,同时能够定量。整合了非靶向和靶向代谢物检测技术的优点,创造性实现了高通量、高灵敏度靶向代谢物检测,为定性、定量检测大批量、低丰度代谢物提供了高效的方法。   应用代谢组学的定义事件的预测生

临床代谢组学研究常见问题(一)

  分享一些我们举办完第一期微信公开课——临床代谢组学研究策略后,所收集到的常见问题,供大家学习和参考。   Q:如何设置验证集和测试集?   A:按我理解你想问的问题是:training set训练集和test set测试集的设置问题。我们做分析化学、生物化学或者分子生物学的初学者通常会混淆这

代谢组学常使用的数据库

  代谢组主要是对小分子代谢物(一般50-1500 Da)进行高通量定性和定量分析,代谢组分析产生了大量的生物信息数据。代谢组数据库的开发对于归纳总结这些大数据,方便后续的代谢组学数据分析,揭示隐藏在大数据背后的生物学机理具有十分重要的作用。  目前常用的代谢组学数据库有HMDB、NIST、LMSD

北京基因组所等揭示肥胖相关基因FTO调控能量代谢新机制

  肥胖相关基因(FTO)是第一个被发现在肥胖中发挥重要作用的基因,在调节体重和脂肪含量方面具有重要作用,但具体的分子机制以及是否能够利用小分子化合物抑制FTO活性来治疗肥胖相关的代谢类疾病一直以来并不清楚。  中国科学院北京基因组研究所杨运桂团队与北京生命科学研究所黄牛和张二荃团队合作发现,恩他卡

利用精确血浆代谢组学方法揭示衰老相关代谢特征

  过去二十年里,代谢(脂质)组学研究得到了迅速发展。液相色谱与高分辨质谱联用(LC-HRMS)技术是目前内源性代谢物最常用的手段,然而困扰LC-HRMS技术的分析精度和结构鉴定的瓶颈问题仍然存在。尤其是血浆样本,其组分化学性质各异,同时复杂的基质会显著减低代谢物定性与定量结果的准确性,导致生物学信

水生所揭示细菌RNA代谢调控新机制

  近日,中国科学院水生生物研究所张承才团队关于细菌中RNA代谢调控机制的研究取得了进展。相关研究成果以《蓝藻中RNase E受一个保守蛋白调控》(A conserved protein inhibitor brings under check the activity of RNase E in

揭示瘦素调控能量代谢平衡机制

11月17日,美国《国家科学院院刊》(PNAS)在线发表了中国科学院上海生命科学研究院营养科学研究所刘勇研究组和美国德州大学达拉斯西南医学中心的合作研究结果,揭示了瘦素受体介导的不同信号机制在能量平衡与葡萄糖代谢中的生理学调控功能。 全球处于流行之势的肥胖症是引发Ⅱ型糖尿病和心血管疾病的重要高危因