大化所动物所在代谢组学研究中取得新进展
近日,中科院大连化学物理研究所许国旺研究员领导的研究组(1808组)利用其构建的代谢组学技术平台取得重要科研成果。他们与中科院动物研究所康乐院士研究组合作,首次发现了肉碱类代谢物在飞蝗两型转变过程中的关键调控作用。相关论文已在线发表在《美国国家科学院院刊》(PNAS)上(doi: 10.1073/pnas.1119155109 PNAS February 10, 2012)。 代谢组学作为系统生物学的分支,在生命科学研究中具有广阔的应用空间与巨大的实用价值。飞蝗散居型和群居型之间的转变(型变)正是复杂生物现象的典型代表,是蝗灾爆发的关键生物学基础。揭示飞蝗型变背后隐藏的生物调控机制具有重要的现实意义。多年来,康乐研究组致力于利用基因组学手段来破解这一谜题,并深刻认识到型变调控机制的阐释迫切需要系统生物学的深度介入。两个课题组决定开展跨学科协作研究,依托大连化物所的代谢组学平台,从血淋巴代谢物层次上......阅读全文
揭示瘦素调控能量代谢平衡机制
11月17日,美国《国家科学院院刊》(PNAS)在线发表了中国科学院上海生命科学研究院营养科学研究所刘勇研究组和美国德州大学达拉斯西南医学中心的合作研究结果,揭示了瘦素受体介导的不同信号机制在能量平衡与葡萄糖代谢中的生理学调控功能。 全球处于流行之势的肥胖症是引发Ⅱ型糖尿病和心血管疾病的重要高危因
利用精确血浆代谢组学方法揭示衰老相关代谢特征
过去二十年里,代谢(脂质)组学研究得到了迅速发展。液相色谱与高分辨质谱联用(LC-HRMS)技术是目前内源性代谢物最常用的手段,然而困扰LC-HRMS技术的分析精度和结构鉴定的瓶颈问题仍然存在。尤其是血浆样本,其组分化学性质各异,同时复杂的基质会显著减低代谢物定性与定量结果的准确性,导致生物学信
我所基于空间多组学技术揭示MASLD中GPR35的脂代谢调控机制
近日,我所本草物质科学研究室(2800组群)梁鑫淼研究员和朴海龙研究员团队运用前沿空间代谢组学和空间转录组学技术,深入剖析了肝脏的区带化特性(Liver Zonation)。该团队结合肝脏区带化特性,揭示了G蛋白偶联受体——GPR35在调节代谢功能障碍相关脂肪肝病(MASLD)中的关键机制,有望为脂
基因组中“暗物质”关键调控机制
中国科学院广州生物医药与健康研究院陈捷凯课题组与南方科技大学Andrew P. Hutchins课题组合作,以小鼠胚胎干细胞为模型,揭示了基因组中转座元件的关键表观遗传调控机制,相关成果以Transposable elements are regulated by context-specif
Cell提出一个新“组学”:蛋白质代谢小分子互动组学
科学家们提出了一个新的“组学”——一个处理蛋白质和小分子之间相互作用的互动组学(protein-metabolite interactomics)。此前系统生物学家专注于基因组学或蛋白质组学,现在他们日益发现了蛋白质-代谢小分子之间相互作用的重要性。 基因组学针对的是生物体基因的系统分析,而蛋
大丽轮枝菌通过调控脂质代谢和次生代谢的机制
微生物,特别是土壤中的细菌和真菌,在生长发育过程中会分泌大量小分子化合物——次生代谢物,该物质和初生代谢物不同,其非微生物生长所必需,但对微生物适应外界环境具有重要意义,无论是应对非生物胁迫还是生物胁迫。大丽轮枝菌是棉花黄萎病的致病原,影响棉花纤维的产量和品质。在侵染宿主时,大丽轮枝菌会分泌大量
非靶向代谢组学中鉴定代谢产物适宜选用哪些分析方法
据相关科技要闻解读表明非靶向代谢组学已逐步成为研究生命活动的重要基础。它可高清呈现代谢产物的变化规律以及代谢种类,特别是那些评价高的非靶向代谢组学更是揭开了研究集体生命活动发生和发展的本质,现在就非靶向代谢组学中鉴定代谢产物更适宜选用哪些分析方法作简要阐述:1.主成分分析(PCA)非靶向代谢组学中鉴
LCMS8060助力广泛靶向代谢组学研究
mGWAS (metabolome Genome-Wide Association Study)指基于代谢组学的全基因组关联分析,是将代谢组数据作为表型,与基因型数据进行关联分析的一种方法。由于代谢组数据对表型鉴定更为精细,因此关联分析的精度比传统GWAS分析更高。 海南大学和华中农业大学的罗杰
代谢组学的优势、应用及研究内容介绍
我们知道细胞内的生命活动由众多基因、蛋白质、以及小分子代谢产物来共同承担,而上游的(核酸、蛋白质等)大分子的功能性变化最终会体现于代谢层面,如神经递质的变化、激素调控、受体作用效应、细胞信号释放、能量传递和细胞间通讯等,所以代谢组处于基因调控网络和蛋白质作用网络的下游,所提供的是生物学的终端信息
代谢组学的优势、应用及研究内容介绍
我们知道细胞内的生命活动由众多基因、蛋白质、以及小分子代谢产物来共同承担,而上游的(核酸、蛋白质等)大分子的功能性变化最终会体现于代谢层面,如神经递质的变化、激素调控、受体作用效应、细胞信号释放、能量传递和细胞间通讯等,所以代谢组处于基因调控网络和蛋白质作用网络的下游,所提供的是生物学的终端信息
Agilent与Stemina-宣布代谢组学领域的合作
Agilent与Stemina 生物标记物发现公司宣布共同促进 Stemina 的代谢组学研究 2010 年 5 月 24 日,北京——安捷伦科技公司(纽约证交所:A)与 Stemina 生物标记物发现公司(Stemina Biomarker Discovery, Inc.)今日宣布,两家公司
代谢组学的优势、应用及研究内容介绍
我们知道细胞内的生命活动由众多基因、蛋白质、以及小分子代谢产物来共同承担,而上游的(核酸、蛋白质等)大分子的功能性变化最终会体现于代谢层面,如神经递质的变化、激素调控、受体作用效应、细胞信号释放、能量传递和细胞间通讯等,所以代谢组处于基因调控网络和蛋白质作用网络的下游,所提供的是生物学的终端信息。如
Agilent与Stemina-宣布代谢组学领域的合作
Agilent与Stemina 生物标记物发现公司宣布共同促进 Stemina 的代谢组学研究 2010 年 5 月 24 日,北京——安捷伦科技公司(纽约证交所:A)与 Stemina 生物标记物发现公司(Stemina Biomarker Discovery, Inc.)今日宣布,两家公司
当代谢组学技术遇到单细胞测序技术
代谢组的状态是对遗传因素、外部环境和治疗干预等信息的综合反映,因此是一个跟踪和了解上述因素对表型影响的理想研究目标。代谢组可做多种样品类型、结果富含各种信息、可作为连接其他组学数据与表型之间的桥梁。过去20年,组学研究飞速发展,处于中心法则末端的代谢组学虽然起步较晚但是发展很快。很多组学研究目前已进
代谢组学在疾病诊断中的应用
代谢组学 (metabolomics)的出现是生命科学研究的必然。在20世纪90年代中期发展起来的代谢组学,是对某一生物或细胞中相对分子量小于1,000的小分子代谢产物进行定性和定量分析的一门新学科。代谢组作为系统生物学的重要组成部分,在临床医学领域具有广泛的应用前景。 代谢产物是基因表达的最终
大连化物所等肝癌代谢组学研究取得进展
近日,中科院大连化学物理研究所许国旺研究员领导的高分辨分离分析及代谢组学研究团队(1808组)与上海东方肝胆医院王红阳院士课题组合作,将基于液相色谱-质谱用于肝癌组织非靶标代谢组学研究并取得了重要进展,相关研究成果已经在线发表在Cancer Research杂志上。 原发性肝癌是全球最
探究转录因子对于hESC代谢调控新机制研究
ESC在体外可无限自我更新和分化为机体内任何种类的细胞,在器官再生和细胞替代治疗中具有广阔的应用前景。然而,hESC维持自我更新及发育多能性的分子调控机制还有很多问题尚不清楚,妨碍了将其分化的细胞安全有效地应用于临床。因此,对人ESC如何维持其自身特性的机制进行深入的研究尤为重要。 研究思
我学者首次揭示代谢调控成骨新机制
记者日前从中科院合肥物质科学研究院获悉,该院强磁场中心王俊峰研究组与中科院深圳先研院管敏研究组合作,研究代谢调控间充质干细胞成骨的机制获得最新进展。 该研究首次发现了骨微结构中柠檬酸盐的产生来源,揭示了代谢调控及代谢中间产物参与骨形成的新机制,同时为锌离子作为活性成分制备骨修复新材料提供了重要
酿酒酵母胞内代谢通量调控机制方面获进展
细胞内的代谢通量受胞内基因表达、转录调控、蛋白修饰、别构效应等调控体系共同作用。然而,目前关于细胞内代谢通量的详细调控机制存在较多未知,例如代谢通量的变化到底在多大程度上依赖基因表达以及有多大程度通过酶活力调控。酿酒酵母的Crabtree效应是重要的代谢调控表型,但该表型下各种调控因子对胞内代谢
科学家揭示脂质代谢调控新机制
趋化素是重要的脂肪因子,参与调控脂质代谢和胰岛素敏感性,与肥胖、糖尿病等代谢性疾病的发生发展密切相关。同时,趋化素可介导免疫细胞定向迁移至炎症部位,参与机体抵御病原入侵、维持稳态及修复组织损伤等重要生理过程,在炎症与代谢之间发挥“桥梁”作用。近日,中国科学院上海药物研究所研究团队等,在趋化素受体功能
中国科大揭示光感知调控血糖代谢的神经机制
对栖息于这颗蓝色星球上的生命而言,光是一切生命产生的源动力,也是生命体最重要的感知觉输入之一。同时生命体根据外界环境条件控制体内营养物质的代谢平衡是生存的必须,而代谢紊乱会产生严重疾病,哺乳动物已经进化出了精确和复杂的调控网络用于持续动态调控血糖代谢。大量公共卫生调查显示夜间过多光源暴露显著增加
探究转录因子对于hESC代谢调控新机制研究
ESC在体外可无限自我更新和分化为机体内任何种类的细胞,在器官再生和细胞替代治疗中具有广阔的应用前景。然而,hESC维持自我更新及发育多能性的分子调控机制还有很多问题尚不清楚,妨碍了将其分化的细胞安全有效地应用于临床。因此,对人ESC如何维持其自身特性的机制进行深入的研究尤为重要。 研究思
丛枝菌根真菌调控氮代谢增强植物耐旱机制
华南农业大学林学与风景园林学院教授唐明团队同合作者,研究揭示了丛枝菌根真菌异形根孢囊霉通过调控菌根氮转运途径关键基因RiCPSI和RiCARI,增强宿主植物养分供给和抗氧化作用,提高耐旱性的分子机制。相关成果近日发表于《植物生理》(Plant Physiology)。论文第一作者、华南农业大学林学与
中国科大等揭示肝癌酮体代谢调控新机制
中国科学技术大学张华凤课题组、高平课题组与中山大学宋立兵等课题组合作,发现营养缺乏条件下的肝癌细胞通过代谢重编程激活酮体产能而促进肿瘤的发生发展。研究成果于9月20日在线发表在《细胞研究》(Cell research)上。论文的共同第一作者为张华凤课题组的黄的和李婷婷。 众所周知,在人体饥饿时
上海交大JBC解析癌症代谢调控新机制
来自上海交通大学的研究人员在新研究中证实,在癌细胞中PIM2可直接磷酸化PKM2促进糖酵解,这一研究发现在线发表在10月18日的《生物化学杂志》(JBC)上。 上海交通大学的黄钢(Gang Huang)教授是这篇论文的通讯作者。其主要研究方向包括肿瘤代谢机理与分子影像评价,肿瘤疗效评价
第一届全国代谢组学及蛋白质组学双星峰会
继测序之后,基于质谱技术的代谢组学及蛋白组学于生命科学研究领域发展迅速。应用质谱技术从分子层面对生命体进行动态、精准的检测,可以了解生命体内代谢与蛋白整体水平的变化,为基础科学研究提供新方向。 为了贯彻 “两城一中心”的战略,江北新区继基因测序平台后,又重磅打造了质谱检测平台,旨在服务生命
大熊猫乳汁蛋白质组学和代谢组学国际合作获进展
国家国际科技合作专项项目“大熊猫乳蛋白的分析及人工乳的研制”承担单位成都大熊猫繁育研究基地联合英国格拉斯哥大学首次对大熊猫乳汁展开了蛋白质组学和代谢组学研究,取得了阶段性进展。双方研究人员通过非麻醉的方式采集驯化后的大熊猫母乳,连续采集至幼仔出生后180天,并对乳汁进行了蛋白组学和代谢组学的研
胡红雨课题组JBC解析蛋白调控机制
来自中科院上海生命科学研究院的研究人员,在新研究中证实NUB1L蛋白通过P97UFD1/NPL4复合物促进了将NEDD8运送到蛋白酶体进行降解。这一研究发现在线发表在9月9日的《生物化学杂志》(JBC)上。 领导这一研究的是中科院上海生命科学研究院生物化学与细胞生物学研究所的胡红雨(Hon
黄勋研究组PLoS揭示脂代谢与细胞生长发育协同调控新机制
多细胞生物的个体及器官大小是如何决定的是发育生物学领域一个基础的生物学问题。在细胞生长过程中,脂质扮演着重要的角色。例如,磷脂是各种膜结构 的主要组分,而脂肪则是生物体内能量的主要贮存形式。细胞的生长需要动员贮存在机体内的大量能量,同时也需要许多结构脂质来满足细胞各种膜组分扩张的需 要。
J-Proteome-Res:-代谢组学应用于微囊藻毒素代谢研究
微囊藻毒素(MCLR),作为一种肝毒素,正在威胁着人类的公共卫生安全。在体内,肝脏是MCLR主要攻击的器官,然而具体代谢变化目前任然未知。近日,中国科学院水生生物研究所谢平等研究人员在与上海敏芯信息科技公司的合作下,通过对灌服MCLR的大鼠模型进行代谢组学的研究,向我们揭示了MCLR扰乱肝脏代谢