HBV相关性HCC患者癌组织与癌旁组织的蛋白质组差异分析
【摘 要】目的: 应用双向凝胶电泳和质谱技术分析HBV相关性HCC癌组织与非癌肝组织蛋白质组之间的差异,鉴定肝组织蛋白质组中与HBV相关性HCC癌变相关的蛋白. 方法:收集HBV相关性HCC患者手术切除的癌组织和癌周组织标本,固相pH梯度22DE,凝胶银染、扫描图像、ImageMaster 22DE Elite4. 01软件分析差异表达的蛋白质;应用质谱仪得到相应的肽质指纹图谱( PMF) ,联网到ExPASY服务器查询相关数据库鉴定获得的差异蛋白质点. 结果: 癌组织、肝硬化组织和慢性肝炎组织平均每张蛋白斑点数为( 1281 ±51 ) ,(1188 ±41)和( 1235 ±31)个,重复性分析发现在等电聚焦( IEF)方向上平均偏差为( 2. 47 ±0. 25) mm,在垂直板SDS-PAGE电泳方向上的平均位置偏差为( 2. 86 ±0. 31) mm. 47个差异蛋白质点经质谱分析获得28张PMF,初步鉴定了其中的1......阅读全文
植物蛋白质组学中的双向电泳技术实验
试剂、试剂盒尿素裂解溶液IPG 干胶条水化液IPG 胶条平衡液SDS 凝胶缓冲液电极缓冲液储液丙烯酰胺 甲叉双丙烯酰胺溶液过硫酸铵溶液琼脂糖溶液仪器、耗材等电聚焦仪IPGphor多重垂直 SDS 电泳仪实验步骤3.1 第一向:在 IPG 胶条中进行等电聚焦( IPG-IEF)采用 IPG ( IPG
蛋白质组学研究中的核心技术——双向凝胶电泳
人类基因组计划与美国塞莱拉遗传信息公司于 2001 年在美国《科学》杂志和英国《自然》杂志联合宣布,他们绘制出了准确、清晰、完整的人类基因组图谱,至此,人类基因组计划已基本完成,随着后基因组时代的到来,蛋白质组学得到了空前的发展,蛋白质组研究旨在揭示基因表达的真正执行生命活动的全部蛋白质的表达规
蛋白质组学研究中的核心技术—双向凝胶电泳
人类基因组计划与美国塞莱拉遗传信息公司于 2001 年在美国《科学》杂志和英国《自然》杂志联合宣布,他们绘制出了准确、清晰、完整的人类基因组图谱,至此,人类基因组计划已基本完成,随着后基因组时代的到来,蛋白质组学得到了空前的发展,蛋白质组研究旨在揭示基因表达的真正执行生命活动的全部蛋白质的
AASLD发布多项病毒性肝炎最新研究数据
病毒性肝炎是全球面临的重大公共卫生问题之一,世界卫生组织提出到2030年要实现新发病毒性肝炎感染率降低90%,相关死亡率下降65%,并使90%感染者得到诊断,使90%符合条件的患者得到治疗。目前,我国约有8600万的乙肝病毒感染者,占全球总数的近三分之一,同时约有1000万人感染丙肝病毒,病毒性
多项病毒性肝炎最新研究数据公布
病毒性肝炎是全球面临的重大公共卫生问题之一,世界卫生组织提出到2030年要实现新发病毒性肝炎感染率降低90%,相关死亡率下降65%,并使90%感染者得到诊断,使90%符合条件的患者得到治疗。目前,我国约有8600万的乙肝病毒感染者,占全球总数的近三分之一,同时约有1000万人感染丙肝病毒,病毒性
骨组织的蛋白质组学研究成果
邹汉法近年来广泛开展了蛋白质组学和多肽组学新技术新方法的研究,近两年来相关研究成果已在Mol. Cel. Proteomics(IF 9.876),Angew. Chem. Int. Ed.(IF 9.596),Nucleic Acids Research(IF 7.
双向电泳操作步骤——组织来源的蛋白质样品的溶解和制备
实验材料蛋白质试剂、试剂盒SDS尿素仪器、耗材离心管转子实验步骤1. 称重后将样品加入Dounch匀浆器。每100 mg 组织加入1.5~2.0 ml SDS/或尿素/溶解缓冲液,用B号研棒冲击50次,然后以A号研棒冲击50次。2. 放置几分钟后,取一小份样品于200 ul 离心管100 000
蛋白质技术——双向电泳
实验概要蛋白质组研究的发展以双向电泳技术作为核心. 双向电泳由O’Farrell’s于1975年首次建立并成功地分离约1000个E.coli蛋白,并表明蛋白质谱不是稳定的,而是随环境而变化. 双向电泳原理简明,第一向进行等电聚焦,蛋白质沿pH梯度分离,至各自的等电点;随后,再沿垂直的方向进行分子
肝细胞癌形态学观察实验
实验材料大体标本组织切片实验步骤1. 大体标本(1)巨块型;肝脏显著肿大,切面见有一巨大肿块(多数在右叶)直径大于10cm,肿块灰白色,中央部有出血(红色)及坏死(灰黄色)。周围肝组织受压萎缩,但无明确包膜存在。巨块周围常可见多个小癌结节(肝内转移)。其余肝组织有肝硬化改变。(2)结节型:肝脏显著肿
肝细胞癌药物治疗现状与前景
日本卫材公司与默克公司于当地时间2018年8月16日发布消息称,FDA日前批准了此两家公司联合开发的激酶抑制剂类抗肿瘤药物乐伐替尼(Lenvatinib,商品名Lenvima,药用其甲磺酸盐胶囊剂)用于不可手术摘除的肝细胞癌的一线治疗,从而使乐伐替尼成为FDA近十年来批准的首个用于治疗这一适应证
肝细胞癌的诊断与筛查
诊断肝细胞癌诊断方法随着医学影像学的进步而发展。 无症状患者和具有肝病症状的患者的评估涉及血液检查和影像评估。 尽管历史上需要进行肿瘤的活组织检查以证明诊断,但影像学(尤其是MRI)的发现可能足以消除组织病理学确认。筛查由于肝细胞癌最常发生在慢性肝病(例如:病毒性肝炎)和肝硬化(约80%)的情况下,
肝细胞癌形态学观察实验
实验材料 大体标本组织切片实验步骤 1. 大体标本(1)巨块型;肝脏显著肿大,切面见有一巨大肿块(多数在右叶)直径大于10cm,肿块灰白色,中央部有出血(红色)及坏死(灰黄色)。周围肝组织受压萎缩,但无明确包膜存在。巨块周围常可见多个小癌结节(肝内转移)。其余肝组织有肝硬化改变。(2)结节型:肝脏显
Hepatology:武大学者发现乙肝病毒致癌新机制
乙型肝炎病毒感染是全球肝细胞癌(HCC)的主要原因之一。虽然已经鉴定出可能增加HCC发展风险的几种病毒因子,但导致正常肝细胞转化为癌细胞的分子机制仍然难以捉摸。中国是全世界感染乙肝人数最多的国家,全世界有3.5亿左右的慢性乙肝携带者,其中约1/3在中国。目前,中国每年约有50多万人死于慢性乙型肝
植物蛋白质组学中的双向电泳技术实验(二)
2. 在平板仪器上进行 IPG-IEF ( Multiphor ll Unit)满足下列条件时,水化后的 IPG 胶条可以直接放在 IEF 仪器的冷却板上:① 如果运行时间不超过 12 h ( 经常发生在宽的或中等 pH 范 围 IPG,如 IPG 3~10 或 4~7 ) 。② 如果 pH 梯
植物蛋白质组学中的双向电泳技术实验(四)
3.3 第二向:多重垂直 SDS-PAGESDS-PAGE 可以在水平或垂直系统上进行 [29] 。水平设备适用于预制胶(ExcelGel SDS;Amersham Biosciences/ GE Healthcare) 。而垂直系统则应用于多块胶平行进行的电泳中,尤其是大规模的蛋白质组分析
植物蛋白质组学中的双向电泳技术实验(三)
使用 IPGphor 进行 IEF 的典型工作条件见表13-2和 表 13-3 。正如前文指出的那样 ,为了使高分子质量的蛋白质更好地进入聚丙烯酰胺胶内,水化时应在胶条两端加低电压(30~50 V ) ,否则将给水化上样造成困难[ 15,28] 。然后电压逐步升高至 8000 V。如果 IP
植物蛋白质组学中的双向电泳技术实验(一)
试剂、试剂盒 尿素裂解溶液IPG 干胶条水化液IPG 胶条平衡液SDS 凝胶缓冲液电极缓冲液储液丙烯酰胺 甲叉双丙烯酰胺溶液过硫酸铵溶液琼脂糖溶液仪器、耗材 等电聚焦仪 IPGphor多重垂直 SDS 电泳仪实验步骤 3.1 第一向:在 IPG 胶条中进行等电聚焦( IPG-IEF)采用 IPG (
乙肝病毒基因组嵌入人类基因与癌变相关
日本理化学研究所和广岛大学近日宣布,他们的联合研究小组对肝脏感染乙型肝炎病毒(HBV)进行基因组分析,发现了乙肝病毒嵌入人类基因组的机制和病毒致癌的部分机制。 全世界约3.5亿人感染乙肝病毒,每年约88万人因乙肝病毒死亡。乙肝病毒感染治疗手段有限,主要使用干扰素和核酸模拟制剂,不但需要长期服药
大化所在组织工程肌腱组织的蛋白质组学方面取得进展
近日,中科院大连化学物理研究所生物分离分析新材料与新技术课题组(1809组)邹汉法研究员和上海交通大学刘伟教授合作,将差异蛋白质组学分析策略成功地应用于组织工程肌腱组织分子机制的研究中,在蛋白质水平上探索了机械应力对组织工程肌腱构建的影响。相关研究结果发表在Biomaterials杂志上(Bio
中国科学家团队开发筛查新技术,实现肝癌早发现早治疗
肝癌,是全球癌症死亡的第三大原因,2018年发病人数超过84万。其中,据《全球癌症负担报告》,50%以上的肝癌发生在我国。因乙肝病毒感染而发展的肝癌,是当前的一大负担,也是中国科学家的攻坚对象。前不久,我们刚刚报道过,中国科学家团队在肝细胞癌(HCC)的早期阶段找到富有治疗前景的新靶点。很快,我
Cell重磅:中国科学家揭示肝癌3种分型和发病机制
肝癌是我国最常见的恶性肿瘤之一,主要包括两种病理组织学类型,分别为肝细胞癌(hepatocellular carcinoma,HCC)和肝内胆管细胞癌(intrahepatic cholangiocarcinoma,iCCA),HCC占我国肝癌总数的83.9% ~ 92.3%。慢性乙肝病毒(hepa
顽拗性植物组织的蛋白质组学研究实验
顽拗性植物组织的蛋白质组学研究(苯酚法提取蛋白质)实验材料植物组织 试剂、试剂盒苯酚
小鼠心脏组织蛋白样品的蛋白质组学分析
实验步骤1. 蛋白质双向电泳1) 第一向固相pH梯度等电聚焦电泳a. 上样:第一向等电聚焦采用胶内加样的方法进行。精确吸取一定量的蛋白样品(银染样品的蛋白上样量为140 ug计,考染样品为1.3 mg)加入重泡涨液(8 mol/L尿素,2%CHAPS,痕量滨酚蓝,20 mmol/L DTT,0.
小鼠心脏组织蛋白样品的蛋白质组学分析
实验概要本实验提供了一个心脏组织2-DE蛋白样品制备及检测的流程,为蛋白质双向电泳实验做好准备。实验步骤1. 心脏组织2-DE蛋白样品的制备 1) 将冷冻的小鼠心脏组织在液氮条件下研磨成粉末; 2) 然后加入5 x体积蛋白裂解液(7 M Urea, 2 M Thiourea, 40 mM
HBcrAg:慢性乙型肝炎病毒感染的标志物
全世界大约2。4亿人感染了慢性乙型肝炎(CHB),其中约15%~40%的患者会进展为肝硬化、失代偿和/或肝细胞癌(HCC)。在HBV的生活周期中,共价闭合环状DNA(cccDNA)的形成是关键一步,它是HBV的原始复制模板,只要肝细胞中还存在cccDNA,HBV的复制就不会停止。图片来源于网络
蛋白质的双向电泳实验
等电聚焦法 实验方法原理 蛋白质的双向电泳的第一向为等电聚焦( Isoelect rofocusing ,IEF) , 根据蛋白质的等电点不同进行分离;
蛋白质的双向电泳实验
实验方法原理 蛋白质的双向电泳的第一向为等电聚焦( Isoelect rofocusing ,IEF) , 根据蛋白质的等电点不同进行分离; 第二向为SDS-聚丙烯酰胺凝胶电泳( SDS-PAGE ) , 按亚基分子量大小进行分离。经过电荷和分子量两次分离后, 可以得到蛋白质分子的等电点
双向凝胶电泳法在分离蛋白质组所有蛋白实验中的应用
分离蛋白质组所有蛋白的两个关键参数是其分辨率和可重复性。在目前情况下,双向凝胶电泳的一块胶板(16cm×20cm)可分出3~4千个,甚至1万个可检测的蛋白斑点,这与10万个基因可表达的蛋白数目相比还是太少了。80年代开始采用固定化pH梯度胶,克服了载体两性电解质阴极漂移等许多缺点而得以建立非常稳定的
复旦大学首揭干扰素抗病毒机制-引国际关注
尽管医学界早在上世纪五十年代就发现和证实了“干扰素”的抗病毒作用,但它究竟是如何发挥作用的具体机制,仍是不解之谜。复旦大学今日披露,上海医学专家已解开其中谜团。 据透露,该校上海医学院基础医学院教育部、卫生部医学分子病毒学重点实验室主任袁正宏研究员率领课题组,历经4年多潜心研究和探索,终于
中国首个肝细胞癌经动脉化疗栓塞
当日,中国医师协会介入医师分会会长、东南大学附属中大医院院长滕皋军以及来自全国各地的介入医学专家共同见证了TACE治疗临床实践指南的发布仪式。中山大学附属第一医院李家平教授还详细解读了该指南并深入探讨了肝癌介入治疗的未来趋势。“介入医学是一门年轻的学科,本次TACE术式指南的发布对于介入在一些肿瘤领