生化与细胞所建立鉴定内质网跨膜蛋白拓扑结构的新方法
4月18日,国际学术期刊PLoS One在线发表了中科院上海生命科学研究院生化与细胞所胡红雨课题组的研究论文A Redox-Sensitive Luciferase Assay for Determining the Localization and Topology of Endoplasmic Reticulum Proteins。该论文应用氧化还原敏感的Gaussia荧光素酶和绿色荧光蛋白GFP,报告融合蛋白所处的不同氧化还原环境,从而鉴定目标蛋白质在细胞内的亚定位及其拓扑结构。 真核细胞中约有三分之一的蛋白质进入内质网进行折叠、修饰、膜整合、转运和分泌,内质网内和跨膜蛋白在这些过程中发挥着重要的功能。但是,由于跨膜蛋白疏水区域与膜脂结合的复杂性,以及内质网蛋白质的动态性,现有的鉴定内质网蛋白的定位和跨膜拓扑结构的方法非常有限,且存在操作技术繁琐等问题。 Gaussia荧光素酶(Gluc)是近年报......阅读全文
AI设计新蛋白质再现突破,生成在拓扑结构
《自然》杂志11日发表的论文描述了一项结构生物学新突破:一种能设计新蛋白质的深度学习方法,名为RoseTTAFold Diffusion(RFdiffusion)。其能生成各种功能性蛋白质,包括在天然蛋白质中从未见过的拓扑结构。 研究示意图(部分) 深度学习推动了蛋白质结构的预测和设计,但仍
膜蛋白质的概念
膜蛋白质(英语:membrane protein)是指能够结合或整合到细胞或细胞器的膜上的蛋白质的总称。而细胞中一半以上的蛋白质可以与膜以不同形式结合。根据与膜结合强度的不同以及位置,膜蛋白可以被分为三类:外在膜蛋白(或称外周膜蛋白)、整合膜蛋白和脂锚定蛋白。
生化与细胞所建立鉴定内质网跨膜蛋白拓扑结构的新方法
4月18日,国际学术期刊PLoS One在线发表了中科院上海生命科学研究院生化与细胞所胡红雨课题组的研究论文A Redox-Sensitive Luciferase Assay for Determining the Localization and Topology of Endoplasmi
膜蛋白质的主要类型
整合膜蛋白是镶嵌在磷脂双分子层上的蛋白质,总是与膜结合在一起,往往可多次跨膜,形成多个α-螺旋构成的跨膜通道。可以定义为需要通过人工加入去垢剂(如SDS或Triton X-100)或其他非极性溶剂才能够从膜中分离出来的蛋白质。其跨膜结构域通常是由20-25个非极性氨基酸组成的α-螺旋结构,而亲水结构
细胞膜蛋白质提取方法
NRC Institute for Biological SciencesTriton X-114 extraction protocol (Hydrophobic protein preparation)Ressuspend cells in Solution A (dil 1/8) and ad
膜蛋白结构解析技术新进展
蛋白表达、溶解和结晶这一系列技术瓶颈的突破,使得研究膜蛋白的原子结构成为可能。细胞中有大约30%的蛋白质是膜蛋白,不过人们现在还不是很清楚这些膜蛋白的原子结构。到目前为止,在PDB(Protein Data Bank)的结构数据库中只有不到1%的资料是膜蛋白的结构数据。这不是说膜蛋白的结构不重要,相
膜蛋白的结构形成过程研究
1)膜蛋白的结构形成过程研究成孔毒素(Pore-forming toxin, PFT)能在靶细胞膜上寡聚化形成穿膜通道, 破坏细胞膜结构并使其渗透性增强而导致细胞渗透性溶解。 PFT寡聚体在细胞膜上可以连接形成密排六方结构(hcp)。Lysenin是来源于蚯蚓的一种PFT,可在鞘磷脂/胆固醇(SM/
冷冻电镜解决膜蛋白的结构
冷冻电子显微镜技术已经发展成为一个成熟的方法,应用于各种复杂的生物分子体系的高分辨结构研究。按照目前的发展势头,解决生物分子结构组(structural proteome)的问题已经不是遥不可及的了。在解决单一静态结构的基础上,冷冻电镜也展示了其研究多构象体系的潜力。下面对冷冻电镜在结构生物学研究领
细胞膜蛋白质的提取方法
1.热变性及酸碱变性沉淀法 用于选择性的除去某些不耐热及在一定PH值下易变性的杂蛋白。 2.有机溶剂沉淀法 多用于生物小分子、多糖及核酸产品的分离纯化,有时也用于蛋白质沉淀。 3.等电点沉淀法 用于氨基酸、蛋白质及其它两性物质的沉淀。但此法单独应用较少,多与其它方法结合使用。
共价有机框架拓扑结构研究取得进展
近日,中国科学院国家纳米科学中心韩宝航课题组和施兴华课题组,联合中国科学院大学何裕建课题组,开发出两种具有三叶草孔形状的共价有机框架,并揭示了新型kgd-v拓扑结构。这一材料表现出优异的大气集水能力。当前,水资源短缺问题日趋严重,利用多孔材料在空气中捕获水是缓解水资源短缺的方式之一。孔的大小和规整性
细胞膜蛋白质提取方法蛋白质沉淀法
1.热变性及酸碱变性沉淀法 用于选择性的除去某些不耐热及在一定PH值下易变性的杂蛋白。 2.有机溶剂沉淀法 多用于生物小分子、多糖及核酸产品的分离纯化,有时也用于蛋白质沉淀。3.等电点沉淀法 用于氨基酸、蛋白质及其它两性物质的沉淀。但此法单独应用较少,多与其它方法结合使用。4.非离子多聚体沉淀法
细胞膜蛋白质提取方法——蛋白质沉淀法(一)
1.热变性及酸碱变性沉淀法 用于选择性的除去某些不耐热及在一定PH值下易变性的杂蛋白。 2.有机溶剂沉淀法 多用于生物小分子、多糖及核酸产品的分离纯化,有时也用于蛋白质沉淀。3.等电点沉淀法 用于氨基酸、蛋白质及其它两性物质的沉淀。但此法单独应用较少,多与其它方法结合使用。4.非离子多聚体沉淀法
细胞膜蛋白质提取方法——蛋白质沉淀法(二)
第二节 有机溶剂沉淀法有机溶剂的沉淀机理是降低水的介电常数,导致具有表面水层的生物大分子脱水,相互聚集,最后析出。该法优点在于:1)分辨能力比盐析法高,即蛋白质或其它溶剂只在一个比较窄的有机溶剂浓度下沉淀;2)沉淀不用脱盐,过滤较为容易;3)在生化制备中应用比盐析法广泛。其缺点是对具有生物活性的大分
新材料兼具超导性和拓扑电子结构
美国莱斯大学科学家领衔的团队在材料领域取得一项突破性进展。他们通过向二硫化钽(TaS2)中掺入微量铟元素,制备出具有特殊电子结构的“克莱默节点线”金属。这项发表于最新一期《自然·通讯》杂志的研究,为开发新一代高性能电子器件开辟了新途径。研究团队发现,铟元素的加入犹如一把神奇的钥匙,改变了原有材料的晶
科学家设计制造出跨膜蛋白质
美国华盛顿大学一个科研团队借助计算机设计,制造出了跨膜蛋白质,它可像天然膜蛋白那样形成多蛋白复合体,可应用在疫苗设计等领域。图片来源于网络 膜蛋白是生物膜中所含的蛋白质,嵌在细胞和细胞器的膜中。有些膜蛋白的两端暴露于膜的内外表面,被称作跨膜蛋白质。它们可作为物质跨膜转运的通道,许多药物设计将其
科学家设计制造出跨膜蛋白质
据新华社电 美国华盛顿大学一个科研团队借助计算机设计,制造出了跨膜蛋白质,它可像天然膜蛋白那样形成多蛋白复合体,可应用在疫苗设计等领域。 膜蛋白是生物膜中所含的蛋白质,嵌在细胞和细胞器的膜中。有些膜蛋白的两端暴露于膜的内外表面,被称作跨膜蛋白质。它们可作为物质跨膜转运的通道,许多药物设计将
科学家解析膜蛋白DGGGPase结构与功能
膜脂是细胞膜的重要组成部分,主要由脂类分子以双分子层的形式构成的膜骨架。微生物在生长过程中,生物膜脂的合成与代谢调控具有重要作用。虽然微生物细胞膜脂质合成的主要机制已被阐明,但古细菌细胞膜的甘油磷脂生物合成机制,由于涉及膜内多个蛋白的参与,目前仍不完全清晰。 其中,古细菌膜脂关键合成酶CDP-
拓扑结构对其光动力杀菌性能的影响
江南大学严秀平教授课题组选择四种不同拓扑结构的卟啉金属有机骨架作为模型,揭示了拓扑结构对其光动力杀菌性能的影响。卟啉金属有机骨架结构中每个Zr6O8簇连接的卟啉分子数越多、孔径越大、卟啉活性位点距离越远,越有利于单线态氧产生,使光动力杀菌效果越显著。 光动力杀菌是光敏剂在合适波长的光照射下,通
王洪博士:膜蛋白质组学|WeOmics-O28
“Westlake Proteomics Series” (WeOmics)系列研讨会 由The Proteomic Navigator of the Human Body (π-HuB) Project,CN-HUPO,西湖大学Guomics实验室,西湖实验室iMarker实验室共同举办,并由西湖
优化蛋白质组学中膜蛋白的溶解性
据来自最近的研究,“在疾病的分子标志物和药物开发中,的组是至关重要的。然而,在这一领域的进展缓慢,主要来源于用分析膜蛋白非常困难。” 他说:“这项调查的目的是探讨和优化溶解膜蛋白的方法,用于CD14人单核的鸟枪法膜蛋白质组的研究。研究比较了几种体系: i)纯有机相(甲醇) ii)酸敏性洗
优化蛋白质组学中膜蛋白的溶解性
据来自美国最近的研究,“在疾病的分子生物标志物和药物开发中,膜蛋白的蛋白质组分析是至关重要的。然而,在这一领域的进展缓慢,主要来源于用质谱分析膜蛋白非常困难。” 他说:“这项调查的目的是探讨和优化溶解膜蛋白的方法,用于CD14人单核细胞的鸟枪法膜蛋白质组的研究。研究比较了
线粒体原位膜蛋白的高分辨结构解析首次实现
3日,记者从南京中医药大学获悉,该校医学院朱家鹏教授和耶鲁大学张凯教授联合研究团队突破了蛋白质纯化的传统概念,直接以线粒体成像,首次实现了线粒体原位膜蛋白的高分辨结构解析,得到呼吸链超级复合体的最真实最清晰的三维结构,为氧化磷酸化这一最基本的生命过程的研究提供了坚实的理论基础。相关科研成果发表在国际
线粒体呼吸链膜蛋白复合物Ⅰ的结构揭晓
德国科学家成功揭示细胞线粒体呼吸链膜蛋白复合物Ⅰ的结构,并发现了分子复合物中的全新能量转换机制,细胞可通过该机制使用储存在营养中的能量。相关研究成果发表在7月1日的《科学》杂志网络版上。 有氧呼吸是动植物进行呼吸作用的主要形式,细胞在氧的参与下,通过酶的催化作用将糖类等有机
线粒体原位膜蛋白的高分辨结构解析首次实现
3日,记者从南京中医药大学获悉,该校医学院朱家鹏教授和耶鲁大学张凯教授联合研究团队突破了蛋白质纯化的传统概念,直接以线粒体成像,首次实现了线粒体原位膜蛋白的高分辨结构解析,得到呼吸链超级复合体的最真实最清晰的三维结构,为氧化磷酸化这一最基本的生命过程的研究提供了坚实的理论基础。相关科研成果发表在
神经所发现胼胝体轴突拓扑结构的形成机制
6月28日,《美国科学院院报》(PNAS)在线发表了中科院上海生命科学研究院神经科学研究所蒲慕明研究组的最新研究论文《轴突在胼胝体中的位置决定其对侧投射》。该研究工作主要由博士研究生周静等在蒲慕明研究员的指导下完成。 哺乳动物脑内最大的纤维束是胼胝体,它连接大脑两个半球之间相对应的区域。然
新研究构筑三种不同分子拓扑结构
近日,华东师范大学化学与分子工程学院David A. Leigh(李大为)教授团队分子拓扑学研究获突破性进展。研究团队首次利用单一分子股线,通过模拟分子伴侣蛋白诱导蛋白折叠的过程,实现了三种不同分子拓扑结构的构筑,完全区别于此前该领域报道的一种合成方法对应一种拓扑结构的策略,大大拓展了分子拓扑学
解析不同类型磁性拓扑半金属的磁结构
近日,中国科学院合肥物质科学研究院强磁场科学中心副研究员朱文卡、研究员张蕾,与华中科技大学教授田召明、安徽大学博士刘威等合作,利用稳态强磁场实验装置,解析出不同类型磁性拓扑半金属的磁结构。相关高场实验数据借助高场磁性测量系统在水冷磁体WM5上完成。相关研究成果分别以Criticalbehavio
蛋白质易位之共翻译易位
大多数分泌蛋白和膜结合蛋白是共翻译易位的。驻留在内质网(ER)、高尔基体或内体中的蛋白质也使用共翻译易位途径。这个过程开始于蛋白质在核糖体上合成时,此时信号识别粒子(SRP)识别新生蛋白质的N端信号肽。SRP的结合会暂时停止合成,而核糖体-蛋白质复合物会转移到真核生物ER上的SRP受体和原核生物的质
准一维拓扑材料的电子结构研究中取得进展
维度的降低会显著影响材料的物理化学性质,同时也将引起一系列新奇的量子现象,例如二维材料石墨烯中发现的线性色散。维度对于拓扑材料则更为重要:拓扑材料具有受对称性保护的边缘态,从而使得由缺陷或杂质引起的电子背散射被禁止;进一步将拓扑材料的维度降低到一维则会显著增强电子的各向异性,使边缘态中自旋极化的
磁畴壁拓扑结构在实验上的发现与调控
兼具温度、电流、磁场等多物理场协同调控的高分辨洛伦兹透射电镜在实空间探索纳米尺度新型磁畴结构、原位揭示与磁性相关的新奇物理现象微观机制以及自旋原理性器件应用方面发挥着越来越重要的作用。中国科学院物理研究所/北京凝聚态物理国家研究中心磁学实验室张颖研究团队在沈保根院士总体组织下,近几年利用高分辨磁