上海药物所表观遗传分子机制合作研究取得新进展

中科院上海药物研究所蒋华良课题组与美国芝加哥大学化学系何川课题组合作,针对胸腺嘧啶DNA糖苷化酶及细菌转录因子AgrA在表观遗传与转录调控中的作用开展研究,取得了良好进展。研究论文分别于2012年2月及2012年5月在线发表在Nature Chemical Biology和PNAS上。 在针对胸腺嘧啶DNA糖苷酶(Thymine-DNA glycosylase, TDG)底物选择性机制的研究中,两个课题组研究人员综合运用化学生物学、理论模拟等手段,阐明了TDG选择性切除DNA分子中被修饰的嘧啶碱基的分子机制。TDG能选择性剪切由TET蛋白催化5-甲基胞嘧啶(5mC)氧化产生的5-醛基胞嘧啶(5fC)及5-羧基胞嘧啶(5caC),继而启动下游DNA剪切修复(BER,base-excision repair)通路,将5mC还原成未修饰的胞嘧啶。然而,TDG如何在众多正常的胞嘧啶及5-甲基胞嘧啶中选择性切除5ca......阅读全文

测量任一细胞因子转录因子的其他技术

虽然其他技术可以测量任一细胞因子,转录因子,或另外的磷酸化蛋白质,细胞内流式细胞仪可以测量多个细胞内标记同时上面的singlecell电平。这种方法提供了数据信号反应,分化状态,和其他细胞活动。特定的细胞表面和细胞内标记物的荧光抗体的结合使用使高分辨率的样本之间的多种细胞类型内的表型和功能的差异比较

分子遗传学词汇逆转录

中文名称:逆转录外文名称:reverse transcription定义:逆转录(reverse transcription)是以RNA为模板合成DNA的过程,即RNA指导下的DNA合成。此过程中,核酸合成与转录(DNA到RNA)过程与遗传信息的流动方向(RNA到DNA)相反,故称为逆转录。逆转录过

分子遗传学词汇转录保真性

中文名称:转录保真性英文名称:transcription fidelity定  义:转录产生的RNA与对应的模板基因碱基序列正确配对。由于RNA聚合酶缺乏核酸酶活性,转录保真性低于复制保真性。应用学科:生物化学与分子生物学(一级学科),基因表达与调控(二级学科)

分子遗传学词汇基础转录

中文名称:基础转录英文名称:basal transcription定  义:由通用转录因子与TATA框结合而起始的转录作用。应用学科:遗传学(一级学科),分子遗传学(二级学科)

分子遗传学词汇转录起始

中文名称:转录起始英文名称:transcription initiation定  义:RNA聚合酶与DNA结合并在转录起点启动基因转录的过程。应用学科:遗传学(一级学科),分子遗传学(二级学科)

分子遗传学词汇转录弱化子

中文名称:转录弱化子英文名称:transcriptional attenuator定  义:DNA中与转录提前终止有关的一段核苷酸序列。应用学科:遗传学(一级学科),分子遗传学(二级学科)

信使RNA反转录的生物学意义

  1.对分子生物学的中心法则进行了修正和补充,修正后的中心法则表示为:  2.在致癌病毒的研究中发现了癌基因,在人类一些癌细胞如膀胱癌、小细胞肺癌等细胞中,也分离出与病毒癌基因相同的碱基序列,称为细胞癌基因或原癌基因。癌基因的发现为肿瘤发病机理的研究提供了很有前途的线索。  3.在实际工作中有助于

生物学术语转录物组的功能

转录组也称“转录物组”。是一个基因组转录的所有RNA。

精神疾病转录组分析-Science揭示转录组变化的遗传基础

  大多数医学疾病在组织,器官和体液中都有明确的物理特征。但是,精神疾病并不是由这种病理所定义的,它们是由行为所决定的。这就造成了精神障碍如精神分裂症和自闭症的定义特征一直存在争议。  加州大学洛杉矶分校的一项研究通过分析来自患有自闭症,精神分裂症,双相性精神障碍,严重抑郁症或酒精中毒的已故受试者大

角朊细胞的其他转录因子介绍

  K17基因的上游启动子中有γ干扰素激活的STAT因子的结合位点,被称为γ干扰素活化序列(GAS),在皮肤发生迟发型接触性过敏时,STAT-91可转位至角朊细胞核内与启动子中的GAS元件结合而激活K17的表达[8]。兔K3基因的5’上游序列中则有NFκB的结合位点(5’GGGCTTTCC-3’),

依赖ρ因子的转录终止的功能介绍

依赖ρ因子的转录终止:在依赖ρ因子终止的转录中,产物RNA的3'-端会依照 DNA 模板,产生较丰富而且有规律的C碱基。ρ因子正是识别产物 RNA 上这些终止信号序列,并与之结合。结合 RNA后的ρ因子和 RNA pol都可发生构象变化,从而使RNA pol的移动停顿,ρ因子中的解旋酶活性使

靶向转录因子,阻止肺纤维化

  迄今为止,肺纤维化的分子机理还未能得到很好阐明。  本月一篇名为“男子喝百草枯经抢救,依然在后悔中痛苦离世”的新闻将几乎无药可救的肺纤维化疾病再次拉入大众视线。  12月7日,马克斯普朗克心肺研究所(Max Planck Institute for Heart and Lung Research

关于转录因子的基本信息介绍

  真核生物转录起始过程十分复杂,往往需要多种蛋白因子的协助,转录因子与RNA聚合酶Ⅱ形成转录起始复合体,共同参与转录起始的过程。根据转录因子的作用特点可分为二类;第一类为普遍转录因子,它们与RNA聚合酶Ⅱ共同组成转录起始复合体时,转录才能在正确的位置开始。除TFⅡD以外,还发现TFⅡA,TFⅡB,

RNA聚合酶Ⅱ的基本转录因子

RNA聚合酶Ⅱ的基本转录因子转录因子分子量(kD)功能TBP30与TATA盒结合TFⅡ-B33介导RNA聚合酶Ⅱ的结合TFⅡ-F30,74解旋酶TFⅡ-E34,37ATP酶TFⅡ-H62,89解旋酶TFⅡ-A12,19,35稳定TFⅡ-D的结合TFⅡ-I120促进TFⅡ-D的结合

RNA聚合酶Ⅱ的基本转录因子

RNA聚合酶Ⅱ的基本转录因子转录因子分子量(kD)功能TBP30与TATA盒结合TFⅡ-B33介导RNA聚合酶Ⅱ的结合TFⅡ-F30,74解旋酶TFⅡ-E34,37ATP酶TFⅡ-H62,89解旋酶TFⅡ-A12,19,35稳定TFⅡ-D的结合TFⅡ-I120促进TFⅡ-D的结合

转录因子的人工设计新方法

    人工设计转录因子来调控目标基因的表达已经不是梦想,基于锌指蛋白结构域的设计已经展开。锌指蛋白结构域能够结合于特定的三个碱基配对的DNA序列上。RNA干扰和反义核酸技术能够抑制基因的表达,而人工设计转录因子能够升高目标基因的表达,从而为疾病的新治疗方法开辟了新的思路。Nature Biotec

RNA聚合酶Ⅱ的基本转录因子

RNA聚合酶Ⅱ的基本转录因子转录因子分子量(kD)功能TBP30与TATA盒结合TFⅡ-B33介导RNA聚合酶Ⅱ的结合TFⅡ-F30,74解旋酶TFⅡ-E34,37ATP酶TFⅡ-H62,89解旋酶TFⅡ-A12,19,35稳定TFⅡ-D的结合TFⅡ-I120促进TFⅡ-D的结合

分子遗传学词汇转录阻遏物

中文名称:转录阻遏物英文名称:transcription repressor定  义:阻止基因转录或使基因转录活性下降的各种因子。应用学科:遗传学(一级学科),分子遗传学(二级学科)

分子遗传学词汇转录增强子

中文名称:转录增强子英文名称:transcriptional enhancer定  义:能提高基因转录效率的顺式调节序列。应用学科:遗传学(一级学科),分子遗传学(二级学科)

分子遗传学词汇非转录间隔区

中文名称:非转录间隔区定义:非转录间隔区是DNA分子中,不同基因(操纵子)之间的非转录序列。

分子遗传学词汇转录终止子

中文名称:转录终止子外文名称:transcription terminator定义:转录终止子(transcription terminator)是一种位于poly(A)位点下游,长度在数百碱基以内的结构。

分子遗传学词汇转录复合体

中文名称:转录复合体英文名称:transcription complex定  义:由启动子、RNA聚合酶和其他各种转录因子构成的复合物。应用学科:遗传学(一级学科),分子遗传学(二级学科)

分子遗传学词汇选择性转录

中文名称:选择性转录英文名称:alternative transcription定  义:同一基因在不同组织中转录时,由于起始位点不同而生成不同的mRNA,即在某种组织中只产生某种转录物。应用学科:遗传学(一级学科),分子遗传学(二级学科)

分子遗传学词汇反转录假基因

中文名称:反转录假基因英文名称:retropseudogene定  义:反转录形成的没有启动子而不能表达的cDNA片段。应用学科:遗传学(一级学科),分子遗传学(二级学科)

分子遗传学词汇逆转录元件

中文名称:逆转录元件英文名称:retroelement定  义:一类可移动基因元件,发挥作用时需要逆转录酶和整合酶的作用。首先被转录成RNA,逆转录酶以它作为模板合成互补的DNA,进而得到双链DNA(dsDNA)并被整合酶整合于染色体的其他位置。Alu就是一类逆转录元件。应用学科:生物化学与分子生物

分子遗传学词汇内部转录间隔区

中文名称:内部转录间隔区外文名称:internal transcribed spacer定义:内部转录间隔区(ITS),rRNA(ribosomalRNA)中存在于结构RNA的非功能性RNA序列,通常这段序列存在于转录前体RNA中(pre-RNA,precursor RNA)。

分子遗传学词汇抗转录终止[作用]

中文名称:抗转录终止[作用]英文名称:transcriptional antitermination定  义:使RNA聚合酶得以越过终止密码子而继续转录的过程。应用学科:遗传学(一级学科),分子遗传学(二级学科)

分子遗传学词汇ρ因子

中文名称:ρ因子外文名称:ρ factor定义:ρ因子(ρ factor)是一种与转录终止相关的蛋白质。1969年,Roberts J在T4噬菌体感染的大肠杆菌中发现了能控制转录终止的蛋白质,命名为ρ因子 [1]  。ρ因子是由相同亚基组成的六聚体蛋白质,亚基分子量为46kD [1]  。ρ因子能结

转录因子和调节蛋白是包含关系吗

调节蛋白是个很大的概念,其调节对象可以包括DNA、RNA以及蛋白质,而转录因子特指对基因转录水平进行调节的蛋白质,从这一角度上说,”调节蛋白“概念涵盖转录因子。调节蛋白还包括:各种修饰蛋白(例如对DNA进行甲基化乙酰化修饰的蛋白、蛋白磷酸化甲基化蛋白),RNA剪接蛋白、蛋白辅助蛋白(分子伴侣)等等。

能控制转录终止的蛋白质ρ因子

能控制转录终止的蛋白质ρ因子(ρ factor)是一种与转录终止相关的蛋白质。1969年,Roberts J在T4噬菌体感染的大肠杆菌中发现了能控制转录终止的蛋白质,命名为ρ因子。ρ因子是由相同亚基组成的六聚体蛋白质,亚基分子量为46kD  。ρ因子能结合RNA,又以对poly C的结合能力最强