上海药物所表观遗传分子机制合作研究取得新进展
中科院上海药物研究所蒋华良课题组与美国芝加哥大学化学系何川课题组合作，针对胸腺嘧啶DNA糖苷化酶及细菌转录因子AgrA在表观遗传与转录调控中的作用开展研究，取得了良好进展。研究论文分别于2012年2月及2012年5月在线发表在Nature Chemical Biology和PNAS上。 在针对胸腺嘧啶DNA糖苷酶（Thymine-DNA glycosylase， TDG）底物选择性机制的研究中，两个课题组研究人员综合运用化学生物学、理论模拟等手段，阐明了TDG选择性切除DNA分子中被修饰的嘧啶碱基的分子机制。TDG能选择性剪切由TET蛋白催化5-甲基胞嘧啶（5mC）氧化产生的5-醛基胞嘧啶（5fC）及5-羧基胞嘧啶（5caC），继而启动下游DNA剪切修复（BER，base-excision repair）通路，将5mC还原成未修饰的胞嘧啶。然而，TDG如何在众多正常的胞嘧啶及5-甲基胞嘧啶中选择性切除5ca......阅读全文
利用转录组学方法揭示南荻群体遗传
南荻是中国特有的亩产生物量最大的芒属能源植物。南荻原产于河滨地带，但其遗传变异丰富，生态适应强，移栽到黄土高原等半干旱地区后，生长良好；由于其根系较浅，种植后不会过度利用深层土壤水分，可以有效减少地表径流，有助于水土保持，发挥重要的生态修复功能。 近日，中国科学院武汉植物园闫娟博士在李建强和桑
分子遗传学词汇逆[转录]转座子
中文名称：逆[转录]转座子英文名称：retrotransposon;retroposon定 义：通过RNA中间物进行转座的可移动基因元件。应用学科：生物化学与分子生物学（一级学科），基因表达与调控（二级学科）
分子遗传学词汇转录起始位点
与新生RNA链第一个核苷酸相对应的DNA链上的碱基转录的起点是指与新生RNA链第一个核苷酸相对应的DNA链上的碱基，研究表明通常为一个嘌呤（A 或G），即5’UTR的上游第一个碱基。
分子遗传学词汇逆转录转座
中文名称：逆转录转座英文名称：retrotransposition;retroposition定 义：RNA介导的转座。转座子RNA中间物转变成DNA拷贝，并随后整合进入基因组的过程。应用学科：生物化学与分子生物学（一级学科），基因表达与调控（二级学科）
能控制转录终止的蛋白质ρ因子
能控制转录终止的蛋白质ρ因子(ρ factor)是一种与转录终止相关的蛋白质。1969年,Roberts J在T4噬菌体感染的大肠杆菌中发现了能控制转录终止的蛋白质,命名为ρ因子。ρ因子是由相同亚基组成的六聚体蛋白质,亚基分子量为46kD 。ρ因子能结合RNA,又以对poly C的结合能力最强
Nature：缺失重要转录因子让血管“疯长”
血管在动物整个生命过程中都扮演着重要角色。血管生长决定着器官是否能够在胚胎发育阶段及时得到营养供应，到了成年阶段，新血管的发育在血管修复和再生过程中发挥重要作用，血管生长过程的紊乱是癌症，糖尿病以及眼部疾病发展的重要因素。 最近来自德国的科学家发现血管内皮细胞的生长能够通过代谢机制进行调控，这
Sox2：从转录因子到免疫卫士
近日著名的免疫学杂志《自然免疫》发表了中科院生物物理所关于转录因子Sox2在固有免疫中的重要作用：Sox2在中性粒细胞中能够充当胞内DNA传感器的作用，当Sox2结合了细菌DNA后，Sox2会通过激酶TAK1和转接蛋白TAB2介导下游信号通路，开始转录翻译一系列的促炎因子。 检测到细胞中的外源
亮氨酸拉链的转录因子的介绍
酵母转录因子GCN4是通过亮氨酸拉链（bZIP）结构结合DNA的蛋白质之一，当GCN4二聚体与DNA结合时，亮氨酸拉链区的2个单体结合为平行的卷曲螺旋结构，而其基区由无规线团结构变为α螺旋.为探讨亮氨酸拉链蛋白与DNA的结合机理，设计了含有GCN4亮氨酸拉链蛋白基区结合DNA的必需氨基酸的折叠片
人工转录因子的部件——人类锌指结构1
Human zinc fingers as building blocks in the construction of artificial transcription factorsKwang-Hee Bae1, 4, Young Do Kwon1, 2, 4, Hyun-Chul Shin1,
Nature：T细胞功能调控的关键转录因子
T细胞是适应性免疫系统的主要组成部分, 它们在病菌感染中被功能活化, 参与宿主防御, 但是遇到自身抗原或者在慢性感染和肿瘤微环境中, 它们会发生命运改变, 进入功能失能命运, 但是调控T细胞功能失能的分子机制会不清楚。 来自清华大学医学院，陆军军医大学全军临床病理学研究所的研究人员发表了题为“
转录因子的结合位点的相关介绍
转录因子的结合位点（transcription factor binding site，TFBS）是转录因子调节基因表达时，与基因模板链结合的区域。按照常识，转录因子（transcription factor）的结合位点一般应该分布在基因的前端，但是，新的研究发现，人21和22号染色体上，只有2
信使RNA的启动子和转录因子
一定义：酶识别、结合、开始转录的一段DNA序列。强启动子2秒钟启动一次转录，弱启动子10分钟一次。 二原核生物：大肠杆菌在起点上游约－10碱基对处有保守序列TATAAT，称为pribnow box，有助于局部解链。在其上游还有TTGACA，称为－35序列，提供RNA聚合酶识别的信号。 三真核
人工转录因子的部件——人类锌指结构2
Table 2: Binding sites and identity of ZFPs used in VEGF activationWe then generated artificial transcription factors by fusing the three-finger domai
转录因子和调节蛋白是包含关系吗
调节蛋白是个很大的概念,其调节对象可以包括DNA、RNA以及蛋白质,而转录因子特指对基因转录水平进行调节的蛋白质,从这一角度上说,”调节蛋白“概念涵盖转录因子。调节蛋白还包括:各种修饰蛋白(例如对DNA进行甲基化乙酰化修饰的蛋白、蛋白磷酸化甲基化蛋白),RNA剪接蛋白、蛋白辅助蛋白(分子伴侣)等等。
细胞因子生物学活性检测
实验方法原理 白细胞介素1是一种重要的细胞因子，主要由单核-巨噬细胞产生，IL-1不仅对多种免疫活性细胞有重要的调节功能，而且与发热、炎症发生以及某些疾病的病理变化有关。目前对IL-1产生水平的检测主要应用生物学活性检测的方法。一、ConA刺激小鼠胸腺细胞检测IL-1生物学活性 小鼠胸腺细胞在丝裂原
细胞因子生物学检测法
生物学检测又称生物活性检测，是根据细胞因子特定的生物活性而设计的检测法。由于各种细胞因子具有不同的活性，例如IL-2促进淋巴细胞增殖，TNF杀伤肿瘤细胞，CSF刺激造血细胞集落形成，IFN保护细胞免受病毒攻击，因此选择某一细胞因子独特的生物活性，即可对其进行检测。生物活性检测法又可分为以下几类：
细胞因子的生物学作用
细胞因子还有其他的生物学作用,比如促进细胞凋亡和促进创伤组织修复。肿瘤坏死因子超家族中的一些细胞因子可以直接杀伤或者诱导靶细胞的凋亡,比如TNF-a和LT-α可以杀伤被病毒感染的靶细胞或肿瘤细胞。转化生长因子一B(TGF-B)可以刺激成纤维细胞和成骨细胞而促进损伤组织的修复,表皮生长因子可促进上皮细
细胞因子的生物学作用
细胞因子还有其他的生物学作用,比如促进细胞凋亡和促进创伤组织修复。肿瘤坏死因子超家族中的一些细胞因子可以直接杀伤或者诱导靶细胞的凋亡,比如TNF-a和LT-α可以杀伤被病毒感染的靶细胞或肿瘤细胞。转化生长因子一B(TGF-B)可以刺激成纤维细胞和成骨细胞而促进损伤组织的修复,表皮生长因子可促进上皮细
细胞因子的生物学活性
细胞因子具有非常广泛的生物学活性，包括促进靶细胞的增殖和分化，增强抗感染和细胞杀伤效应，促进或抑制其它细胞因子和膜表面分子的表达，促进炎症过程，影响细胞代谢等。 一、免疫细胞的调节剂 免疫细胞之间存在错综复杂的调节关系，细胞因子是传递这种调节信号必不可少的信息分子。例如在T-B细胞之间，T细
靶向表观遗传因子显奇效！
12月11日，研究人员《Journal of Cell Biology》上发表了该项研究成果，文章标题为“SUV420H2 Is an Epigenetic Regulator of Epithelial/Mesenchymal States in Pancreatic Cancer ”（“SU
分子遗传学词汇上调因子
中文名称：上调因子英文名称：up regulator定 义：直接结合或间接作用而引起激活或增强基因表达的调控因子。有些为调节基因的产物，可上调多个结构基因表达。应用学科：生物化学与分子生物学（一级学科），基因表达与调控（二级学科）
分子遗传学词汇复制因子
中文名称：复制因子英文名称：replicator定 义：有一个复制起始点并能促进DNA分子复制的DNA序列。应用学科：遗传学（一级学科），分子遗传学（二级学科）
一种罕见遗传病的最新遗传因子
威斯康星医学院和爱丁堡大学的研究者组成的合作研究团队，鉴定了一种称为Warburg Micro综合症的疾病的相关基因――一个称为TBC1D20的的基因。这项研究发表在11月14日的The American Journal of Human Genetics上。 Warburg Micro综合症
一种罕见遗传病的最新遗传因子
威斯康星医学院和爱丁堡大学的研究者组成的合作研究团队，鉴定了一种称为Warburg Micro综合症的疾病的相关基因——一个称为TBC1D20的的基因。这项研究发表在11月14日的The American Journal of Human Genetics上。 Warburg
分子遗传学词汇选择性转录起始
中文名称：选择性转录起始英文名称：alternative transcription initiation定 义：不同的启动子对RNA聚合酶有不同的亲和力，可在不同的启动子上有选择地启动基因转录。应用学科：遗传学（一级学科），分子遗传学（二级学科）
分子遗传学词汇转录起始复合体
中文名称：转录起始复合体定义：真核细胞中，启动子上的TATA框与转录因子TFIID结合形成稳定的复合物，然后由其他转录因子（TFIIA,TFIIB,TFIIF,TFIIE,TFIIH等）和RNA聚合酶按一定顺序与DNA结合形成转录起始复合体。
计算生物学所等建立识别汉族遗传结构的遗传标记
5月29日，《欧洲人类遗传学杂志》在线发表了中科院上海生命科学研究院计算生物学研究所徐书华研究组的研究成果A panel of ancestry informative markers to estimate and correct potential effects of populati
Cell：揭秘转录因子如何相互作用制造心脏
刊登于Cell杂志上的一项研究报告中，来自格莱斯顿研究所（Gladstone Institutes）的科学家们近日通过研究发现三种转录因子可以彼此相互作用，并且同基因组相互作用从而影响胚胎心脏的形成，如果没有这些蛋白质（转录因子）的相互作用就会引发新生儿出现严重的先天性心脏缺损；通过理解心脏发育
转录因子MdERF2调控苹果表皮蜡质合成
近日，山东理工大学农业工程与食品科学学院教授李富军团队完成的研究在《农业科学学报(英文)》 (Journal of Integrative Agriculture，JIA)正式发表。该研究发现了转录因子MdERF2调控苹果表皮蜡质合成的分子机制。表皮蜡质是影响果蔬品质形成与保持的重要因子。植物激素乙
Cell子刊发布首个植物转录因子文库
近日科学家们借助自动化平台，建立了首个植物遗传学开关的综合性文库，以帮助全球学者更好的理解植物对环境改变的适应，培育更好的植物品种。相关论文于七月十七日发表在Cell旗下的Cell Reports杂志上。 该文库的建立耗时八年，包含大约两千个植物转录因子的克隆。转录因子是天然的遗传学开关，研究