植生生态所揭示链霉菌抗生素生物合成调控的新机制

6月7日,国际微生物学权威期刊Molecular Microbiology在线发表了中科院上海生命科学研究院植生生态所姜卫红研究组的学术论文Differential regulation of antibiotic biosynthesis by DraR-K, a novel two-component system in Streptomyces coelicolor。该研究揭示了天蓝色链霉菌中新型双组分系统DraR-K参与抗生素生物合成差异调控的分子机制。 双组分系统(Two-component system,TCS)是生物体感受外界刺激,调节细胞生理代谢和行为的信号传导系统,由组氨酸激酶和应答调控蛋白组成。TCS广泛存在于微生物中,参与调控初级与次级代谢、形态分化、渗透压以及致病性等重要生理过程。链霉菌是自然界中最主要的抗生素产生菌,对其开展抗生素合成相关TCS的研究不仅有助于认识其复杂的调控网络,......阅读全文

南海海洋所环酯肽类抗生素生物合成研究取得重要进展

  环酯肽类抗生素是一类结构复杂、生物活性活性显著的抗生素,是创新药物的重要源泉。黑莫他丁(himastatin)是由链霉菌产生的,组成其分子的六个结构单元以DL交替方式排列并且形成结构对称的二聚体,自其发现以来,以其新颖、复杂的结构特征和良好的抗菌、抗肿瘤活性引起了有机合成、药物化学和药理学等领域

关于螺旋霉素胶囊的药理毒理介绍

  螺旋霉素为大环内酯类抗生素,其活性成分为链霉菌属产生的一组混合物。本品的抗菌活性与红霉素相似。体外试验表明,本品对革兰氏阳性菌和部分革兰氏阴性菌有较好的抗菌作用,如金黄色葡萄球菌、肺炎球菌、溶血性链球菌、奈瑟氏菌、白喉杆菌等。另外本品对弓形虫和解脲支原体、隐孢子虫也有一定作用。本品的作用机理是通

科学家从“旧”合成途径中发现新强效抗生素

每毫升1微克就能杀死耐药菌通过研究土壤细菌——天蓝色链霉菌合成抗生素次甲霉素A 的过程,研究人员发现了一种中间化合物——premethylenomycin C lactone,其抗菌活性是最终产物次甲霉素A的100倍。极小剂量的这种强效抗生素就能杀死导致难治疗感染的细菌菌株,有助于对抗耐药性感染。相

科学家化学合成“最新”抗生素

  近日,香港大学化学系副教授李学臣团队与美国中佛罗里达大学、香港理工大学研究者合作,在《自然—通讯》共同发表了有关新型抗生素Teixobactin的研究结果。Teixobactin是近30年来被发现的第一种新型抗生素,它的化学合成也为新一代抗生素的应用与发展奠定了化学基础。  过去7年来,李学臣团

简述抗生素干扰蛋白质的合成

  干扰蛋白质的合成意味着细胞存活所必需的酶不能被合成。以这种方式作用的抗生素包括福霉素(放线菌素)类、氨基糖苷类、四环素类和氯霉素。蛋白质的合成是在核糖体上进行的,其核糖体由由50S和30S两个亚基组成。其中,氨基糖苷类和四环素类抗生素作用于30S亚基,而氯霉素、大环内酯类、林可霉素类等主要作用于

抗生素抑制细胞壁的合成介绍

  细菌的细胞壁主要由多糖、蛋白质和类脂类构成,具有维持形态、抵抗渗透压变化的重要功能。 因此,抑制细胞壁的合成会导致细菌细胞破裂死亡;而哺乳动物的细胞因为没有细胞壁,所以不受这些药物的影响。这一作用的达成依赖于细菌细胞壁的一种蛋白,通常称为青霉素结合蛋白(PBPs),β内酰胺类抗生素能和这种蛋白结

链霉菌产的酶在食品工业中的应用介绍

目前在多种链霉菌中都发现了( transgulaminase, EC 2. 3. 2. 13 简称 TGase),如轮枝链霉菌产的谷氨酰胺转胺酶能够促使蛋白质分子内交联,蛋白质分子间交联以及蛋白质和氨基酸之间交联,可以在食品加工中应用。木聚糖酶是生产低聚木糖的关键酶。几丁质酶在制备几丁寡糖、处理海洋

通过串联删除吸水链霉菌5008的γ丁内脂受体基因...(二)

通过串联删除吸水链霉菌5008的γ丁内脂受体基因提高井冈霉素产量2. afsA及arpA同系物参与井冈霉素生物合成分别删除afsA以及arpA同系物。shbA1失活导致井冈霉素产量下降超过90%;ShbA2和shbA3失活分别导致产量下降77%和61%(Fig 3A)。ΔshbR1和Δshb

通过串联删除吸水链霉菌5008的γ丁内脂受体基因...(三)

通过串联删除吸水链霉菌5008的γ丁内脂受体基因提高井冈霉素产量以上结果表明同时删除shbR1/shbR3能够完全抑制adpA-H转录,增加井冈霉素产量。5. 同时突变后转录分析为了研究shbR1/shbR3缺失对细胞代谢的影响,本研究采用RNA测序对野生型以及shbR1/shbR3同时突变菌株进行

cDNA文库组标准流程三:cDNA双链合成

1. Superscipt II—RT合成第一链:1. 在一RNase-free的0.2ml PCR管中,加入         xul   mRNA(大约500ng)         1ul   Xho I Primer(1.4ug/ul)           (5’ GAGAGAGAGAGAGAG

关于cDNA第二链的合成方法介绍

  (1)自身引导法。合成的单链eDNA3’端能够形成一短的发夹结构,这就为第二链的合成提供了现成的引物。当第一链合成反应产物的DNA—RNA杂交链变性后利用大肠杆菌DNA聚合酶I Klenow片段或反转录酶合成eDNA第二链,最后用对单链特异性的S1核酸酶消化该环,即可进一步克隆。但自身引导合成法

互补DNA第二链的合成方法介绍

  (1)自身引导法。合成的单链eDNA3’端能够形成一短的发夹结构,这就为第二链的合成提供了现成的引物。当第一链合成反应产物的DNA—RNA杂交链变性后利用大肠杆菌DNA聚合酶I Klenow片段或反转录酶合成eDNA第二链,最后用对单链特异性的S1核酸酶消化该环,即可进一步克隆。但自身引导合成法

关于互补DNA的第一链的合成介绍

  所有合成cDNA第一条链的方法都要用依赖于RNA的DNA聚合酶(反转录酶)来催化反应,主要有两个关键因素,一个是mRNA模板,另一个是反转录酶。商品化反转录酶有从禽类成髓细胞瘤病毒纯化到的禽类成髓细胞病毒(AMV)逆转录酶和从表达克隆化的Moloney鼠白血病病毒反转录酶基因的大肠杆菌中分离到的

随机引物合成法双链DNA探针标记法

随机引物合成双链探针是使寡核苷酸引物与DNA模板结合,在Klenow酶的作用下,合成DNA探针。合成产物的大小、产量、比活性依赖于反应中模板、引物、dNTP和酶的量。通常,产物平均长度为400-600个核苷酸。利用随机引物进行反应的优点是:(1)Klenow片段没有5'→3'外切酶活

什么是稀有放线菌

线菌目 是抗生素的主要来源,已知的抗生素中有45%是放线菌产生的。其中主要集中在链霉菌属,其次是小单孢菌属和诺卡氏菌属。此外,近年来有许多新抗生素来源于这三个属以外,即所谓稀有放线菌属。对中国土壤嗜酸放线菌的种群分布和系统发育关系研究发现:其中的稀有放线菌占约10%,分别属于6个属,其中诺卡氏菌属

什么是稀有放线菌

线菌目 是抗生素的主要来源,已知的抗生素中有45%是放线菌产生的。其中主要集中在链霉菌属,其次是小单孢菌属和诺卡氏菌属。此外,近年来有许多新抗生素来源于这三个属以外,即所谓稀有放线菌属。对中国土壤嗜酸放线菌的种群分布和系统发育关系研究发现:其中的稀有放线菌占约10%,分别属于6个属,其中诺卡氏菌属

抗生素效价生物测定

实验方法原理 管碟法是扩散法中的一种,是将已知浓度的标准抗生素溶液与未知浓度的样品溶液分别加到一种标准的不锈钢小管(即牛津小杯)中,在含有敏感试验菌的琼脂表面进行扩散渗透。比较两者对被试菌的抑制作用,测量出抑菌圈的大小,以计算抗生素的浓度。在一定的浓度范围内,抗生素的浓度与抑菌圈直径在双周半对数表上

天然合成和生物合成聚合物的生物降解

 在CC骨干基于聚合物往往难以降解,而含杂原子的聚合物骨架赋予生物降解性。 因此,生物可降解性聚合物设计成通过明智的另外的化学品,如酸酐,酯或酰胺键,其中包括的联系。 降解的常见机制是通过水解或酶不稳定基的杂原子键的裂解,从而导致在聚合物主链中的断裂的。 底质可以吃,有时消化聚合物,并同时启动的机械

放线菌的种类介绍

  链霉菌属  链霉菌属(Streptomyces)共约1000多种,其中包括和很多不同的种别和变种。它们具有发育良好的菌丝体,菌丝体分枝,无隔膜,直径约0.4~1微米,长短不一,多核。菌丝体有营养菌丝、气生菌丝和孢子丝之分,孢子丝再形成分生孢子。孢子丝和孢子的形态因种而异,这是链霉菌属分种的主要识

链霉菌天然产物沉默基因簇激活方法开发获进展

近日,中国科学院南海海洋研究所研究员张长生团队在国家重点研发计划、国家自然科学基金等项目的资助下,在链霉菌天然产物沉默基因簇的激活方法开发中取得新进展。相关成果发表于《代谢工程》(Metabolic Engineering)。采用kasOp*-KCl协同策略激活海洋链霉菌中沉默天然产物生物合成基因簇

使用糖基转移酶产生菌作为细胞工厂

用产生糖苷化合物的微生物作为细胞工厂,在基因的编码区通过插入抗生素抗性标记或删除部分基因进行敲除产生突变体,引入外源糖基转移酶基因,使其利用细胞内活化的糖分子和微生物次生代谢的中间体合成新的抗生素。这种方法已经在很多生产菌株如红霉素(erythromycin)[29]、普卡霉素(plicamycin

科学家发现链霉菌、草莓和传粉蜜蜂的互惠互作

  近日,韩国庆尚国立大学等科研机构的研究人员在Nature Communications上发表了题为“A mutualistic interaction between Streptomyces bacteria, strawberry plants and pollinating bees”的文

上海生科院在放线菌天然产物的合成生物学方面取得进展

  1月11日,国际学术期刊《代谢工程》(Metabolic Engineering)在线发表了中国科学院上海生命科学研究院上海植物生理生态研究所姜卫红研究组题为Multiplexed site-specific genome engineering for overproducing bioact

英国研究人员合成抗生素杀灭“超级细菌”

   英国林肯大学研究人员合成一种抗生素,能够杀灭“超级细菌”,治愈实验鼠的细菌感染。研究论文刊载于最新一期《医学化学杂志》。  这种抗生素名为Teixobactin,由美国科学家2015年在土壤中发现,是近30年来第一种新型抗生素,可以杀死耐甲氧西林金黄色葡萄球菌(MRSA)和耐万古霉素肠球菌(V

俞飚小组首次实现系列抗生素全合成

  记者从中科院上海有机化学研究所获悉,该所生命有机化学国家重点实验室俞飚课题组在最新研究中,完成了抗生素A201A的首次全合成。相关研究成果已发表于《美国化学会志》。  自1928年英国科学家弗莱明发现青霉素以来,抗生素已成为人类发现抗菌、抗肿瘤和免疫抑制等药物的主要来源。不同来源的抗生素往往结构

合成化学作为新抗生素突破口

  当代新药研发的多数领域是生物学驱动的,优质靶点是寻找新药的主要瓶颈。但是也有个别领域合成技术是一个限制因素,抗生素是一个突出例子。只有少数经过进化高度优化的化学结构可以有效地通过细菌细胞膜并和靶标结合。事实上严格地讲只有细菌通过生存竞争产生的杀菌物质才叫抗生素(antibiotic),而人工合成

抗生素作用机制干扰蛋白质的合成

干扰蛋白质的合成意味着细胞存活所必需的酶不能被合成。以这种方式作用的抗生素包括福霉素(放线菌素)类、氨基糖苷类、四环素类和氯霉素。蛋白质的合成是在核糖体上进行的,其核糖体由由50S和30S两个亚基组成。其中,氨基糖苷类和四环素类抗生素作用于30S亚基,而氯霉素、大环内酯类、林可霉素类等主要作用于50

抗生素作用机制抑制细胞壁的合成

细菌的细胞壁主要由多糖、蛋白质和类脂类构成,具有维持形态、抵抗渗透压变化、允许物质通过的重要功能。因此,抑制细胞壁的合成会导致细菌细胞破裂死亡;而哺乳动物的细胞因为没有细胞壁,所以不受这些药物的影响。这一作用的达成依赖于细菌细胞壁的一种蛋白,通常称为青霉素结合蛋白(PBPs),β内酰胺类抗生素能和这

生物合成的生理意义

生物体内进行的同化反应的总称。生物合成具有如下几种不同的生理意义。(1)合成生长增值所必需的物质。(2)在稳定状态时,合成用于补充消耗掉的成的物质。(3)为长期和短期的贮藏,进行必要的合成。一般来说,生物合成是吸能反应,多数是朝向使分子结构复杂化的方向进行。能量供给最典型的是由ATP供给,也有通过G

叶绿素a的生物合成途径

叶绿素a的生物合成途径,是由琥珀酰辅酶A和甘氨酸缩合成δ-氨基乙酰丙酸,两个δ-氨基乙酰丙酸缩合成吡咯衍生物胆色素原,然后再由4个胆色素原聚合成一个卟啉环──原卟啉Ⅳ,原卟啉Ⅳ是形成叶绿素和亚铁血红素的共同前体,与亚铁结合就成亚铁血红素,与镁结合就成镁原卟啉。镁原卟啉再接受一个甲基,经环化后成为具有