链霉菌天然产物沉默基因簇激活方法开发获进展
近日,中国科学院南海海洋研究所研究员张长生团队在国家重点研发计划、国家自然科学基金等项目的资助下,在链霉菌天然产物沉默基因簇的激活方法开发中取得新进展。相关成果发表于《代谢工程》(Metabolic Engineering)。采用kasOp*-KCl协同策略激活海洋链霉菌中沉默天然产物生物合成基因簇。研究团队供图链霉菌天然产物是药物研发的重要资源。近年来,随着测序成本的降低和生物信息学工具的普及,大量未知天然产物的生物合成基因簇序列被解析公布,亟待深入挖掘。然而,当前基因组挖掘面临两大核心挑战:一是链霉菌生物合成基因簇在实验室条件下大多数呈沉默或低表达状态,其产物丰度极低;二是部分野生型链霉菌无法进行遗传操作,导致其天然产物生物合成途径挖掘受限。针对链霉菌基因组挖掘中的上述瓶颈问题,研究人员开发了一种基于盐响应启动子的新型挖掘策略。该策略可有效激活链霉菌天然产物沉默基因簇,并成功应用于三种活性天然产物的激活与高产。他们在对南海来......阅读全文
链霉菌天然产物沉默基因簇激活方法开发获进展
近日,中国科学院南海海洋研究所研究员张长生团队在国家重点研发计划、国家自然科学基金等项目的资助下,在链霉菌天然产物沉默基因簇的激活方法开发中取得新进展。相关成果发表于《代谢工程》(Metabolic Engineering)。采用kasOp*-KCl协同策略激活海洋链霉菌中沉默天然产物生物合成基因簇
蓝色链霉菌中筛选出活性基因簇
荷兰格罗宁根大学的研究人员利用基因挖掘法从蓝色链霉菌中发现了一组活性基因簇,通过该基因簇可制造出无耐药性的新型抗生素,该研究有望为链霉菌的药用开发提供一条新思路。相关研究发表在最新一期《微生物学》杂志上。 链霉菌是生活在土壤中的一种常见细菌,其家族包含多种细菌。不同于其他细
利用CRISPRCas9激活细菌中沉默的基因簇-有望发现新的药物
为了抵抗疾病,很多医药库中的武器是从细菌当中获得的。如今,利用CRISPR-Cas9基因编辑技术,研究人员揭示出沉默基因中隐藏着的更多潜在的宝藏。 作为一类常见的细菌,链霉菌被用来产生很多作为抗生素、抗癌试剂和其他药物的化合物。在一项新的研究中,来自美国伊利诺伊大学和新加坡科技研究局的研究人员
新方法揭秘微生物“生命暗物质”
微生物具有合成多种天然产物的能力。但在微生物合成天然产物时,大量合成基因仍处于“沉默”状态。它们的产物被称为微生物“生命暗物质”。 如何有效激活并挖掘这些“生命暗物质”? 近日,中国科学院深圳先进技术研究院合成生物学研究所(以下简称深圳先进院合成所)研究员罗小舟,与美国加州大学伯克利分
“唤醒”沉默的基因-新方法揭秘微生物“生命暗物质”
微生物具有合成多种天然产物的能力。但在微生物合成天然产物时,大量合成基因仍处于“沉默”状态。它们的产物被称为微生物“生命暗物质”。如何有效激活并挖掘这些“生命暗物质”?近日,中国科学院深圳先进技术研究院合成生物学研究所(以下简称深圳先进院合成所)研究员罗小舟,与美国加州大学伯克利分校教授杰·基斯林及
产量提升!新方法揭秘微生物“生命暗物质”
微生物具有合成多种天然产物的能力,成为人类药物开发的宝库。但在微生物合成天然产物时,大量合成基因仍处于“沉默”状态,它们的产物被称为微生物“生命暗物质”。如何有效激活并挖掘这些“生命暗物质”,是限制新天然产物发现的瓶颈。随着基因测序技术的普及和基因组分析方法的成熟,人们有望绕过繁冗的改造工序,突破菌
新研究构建深海链霉菌来源的高效底盘细胞
近日,中国科学院南海海洋研究所研究员马俊英团队构建了南海深海来源的链霉菌高效异源表达底盘细胞。相关研究以底封面论文的形式发表于ACS Synthetic Biology。硕士研究生杨志杰(现为丹麦技术大学博士生)为该论文第一作者,马俊英研究员、鞠建华研究员为共同通讯作者。 链霉菌次级代谢产物在生
链霉菌,你了解多少?
简介 链霉菌(Streptomycetaceae)是最高等的放线菌。放线菌目的一科。 有发育良好的分枝菌丝,菌丝无横隔,分化为营养菌丝、气生菌丝、65孢子丝。孢子丝再形成分生孢子。 孢子丝和孢子的形态、颜色因种而异,是分种的主要识别性状之一。已报道的有千余种,主要分布于土壤中。爱医培
链霉菌,你了解多少?
简介 链霉菌(Streptomycetaceae)是最高等的放线菌。放线菌目的一科。 有发育良好的分枝菌丝,菌丝无横隔,分化为营养菌丝、气生菌丝、65孢子丝。孢子丝再形成分生孢子。 孢子丝和孢子的形态、颜色因种而异,是分种的主要识别性状之一。已报道的有千余种,主要分布于土壤中。爱医培
什么是链霉菌属?
链霉菌属(Streptomyces)共约1000多种,其中包括和很多不同的种别和变种。它们具有发育良好的菌丝体,菌丝体分枝,无隔膜,直径约0.4~1微米,长短不一,多核。菌丝体有营养菌丝、气生菌丝和孢子丝之分,孢子丝再形成分生孢子。孢子丝和孢子的形态因种而异,这是链霉菌属分种的主要识别性状之一。
链霉菌,你了解多少?
放线菌目的一科。基内菌丝不断裂,气生菌丝通常发育良好,形成长(有时短)的孢子丝。孢子不能运动,外鞘上常有疣、刺或毛发等状饰物。简介链霉菌(Streptomycetaceae)是最高等的放线菌。放线菌目的一科。有发育良好的分枝菌丝,菌丝无横隔,分化为营养菌丝、气生菌丝、65孢子丝。孢子丝再形成分生孢子
链霉菌属的分类介绍
中科院微生物研究所根据气生菌丝(孢子堆)的颜色、基内菌丝的颜色、可溶性色素、孢子丝的形状、孢子的形状和表面结构等特征,将本属分为14个种组,每个种组又包括许多不同的种,以此做为链霉菌属各种的鉴定和寻找新的抗生素产生菌的依据。主要代表如产生链霉素的灰色链霉菌。
激活真菌中潜在的“沉默”基因簇-获得新颖结构化合物
天然产物是新药开发的重要来源之一,近年来从真菌中发现的新颖天然产物越来越困难,其主要原因是由于传统的提取分离方法导致的重复发现已知化合物,因此,亟需开发出一种新的方法或策略来挖掘新结构天然产物。 近年来基因组测序技术的迅速发展及分子遗传学操作技术的成熟为发掘新的真菌天然产物创造了条件。通过对真
链霉菌属的重要作用
链霉菌的次级代谢产物种类丰富,最重要的就是产生抗生素。现发现由链霉菌产生的抗生素有1000多种,已经应用于临床的近百种,如链霉素(streptomycin)、卡那霉素(kanamycin)、丝裂霉素(mitomycin),土霉素(oxytetmcycline)等。有的链霉菌能产生多种抗生素,还有
关于链霉菌属的分布介绍
链霉菌主要分布于含水量较低、有机质含量丰富的中性或微碱性土壤中,多数为腐生+好气性异养菌。由于能产生大量的孢子,故有较强的抗干燥能力。链霉菌孢子对热的抵抗力比细菌芽胞弱,但强于营养体细胞。对链霉菌的保藏一般利用沙土法,在4℃的冰箱中可存活1~3年。
链霉菌属的特征和培养介绍
放线菌目中的一个大属。菌丝纤细、无隔、多核、分枝,革兰氏阳性,菌丝体发达,分化成基内菌丝和气生菌丝,后者成熟后发育成孢子丝,其形态多样(直、波曲、螺旋、轮生),可裂生大量分生孢子进行散播、繁殖。菌落小而致密、干而不透明,幼时表面光滑、边缘整齐、颜色单调、不易挑起,继而发展成绒毛状、表面起粉、色泽
关于天蓝色链霉菌的简介
天蓝色链霉菌是生产三分之二用于医药的天然抗生素以及共9000余种具生物活性物质的链霉菌大家族中的一员。其为革兰氏阳性,土壤链霉菌。 用于分类学研究,以及作为异源表达的模式菌株。 属名:Streptomyces 种名:coelicolor 具体用途:分类学研究。 培养基:331 培养温
链霉菌属的基本信息介绍
链霉菌属(streptomyces),是最高等的放线菌。有发育良好的分枝菌丝,菌丝无横隔,分化为营养菌丝、气生菌丝、65孢子丝。营养菌丝又名基内菌丝,色浅,较细,具有吸收营养和排泄代谢废物的功能;气生菌丝是颜色较深,直径较粗的分枝菌丝;气生菌丝成熟分化成孢子丝,孢子丝再形成分生孢子。孢子丝和孢子
链霉菌属的致病性介绍
大部分(超过500种)链霉菌是非致病的污染菌或定植菌。但索马里链霉菌例外,该菌可引起足菌肿病,偶尔引起侵袭性感染。其他菌种很少引起疾病。灰色链霉菌(也称圆环链霉菌)是从人体标本中最常分离的菌种,但认为其是偶尔引起感染的病原菌;更为人熟知的,它是链霉素的原始来源。分离菌株通常只鉴定到属水平(如果要
关于弗氏链霉菌的基本介绍
弗氏链霉菌气丝落英淡粉色或粉色。基丝无色或微黄色。在大部分培养基内无可溶色素。克氏合成1号琼脂:气丝荷花白色。 蔗糖硝酸盐琼脂:基丝麦芽糖黄色。可溶色素无或微黄色。葡糖天冬素琼脂:气丝落英淡粉色。基丝微黄色。高氏合成1号琼脂:气丝荷花白色、浅粉色。基丝淡黄色。淀粉合成琼脂:气丝微白色。基丝无色
天蓝色链霉菌的基因特征
天蓝色链霉菌(Streptomyces coelicolor)基因组,也是迄今最大的微生物基因组的测序工作,该基因组中蕴藏着令人惊奇而又大有前途的基因组特征。科学家们力图将该细菌转化成更佳的药物开发工具。 天蓝色链霉菌是生产三分之二用于医药的天然抗生素以及共9000余种具生物活性物质的链霉菌大
Nature子刊:基因编辑揭开细菌基因组秘密
由美国伊利诺伊大学香槟分校化学和生物分子工程系的赵惠民教授(音译,Huimin Zhao)带领的一个研究团队指出,他们利用一种创新的DNA工程技术,发现了隐藏在细菌基因组中的潜在的、有价值的功能。这项研究成果发表在12月5日的Nature Communications杂志上。 每种
深海来源链霉菌次级代谢产物合成潜力挖掘研究获进展
高压、高盐及低温的深海环境曾被认为是生命的荒漠。随着海洋科学技术的发展,人们对深海的探索能力日益增强,发现了深海(甚至万米深的马里亚拉海沟)也有微生物的生命活动,并从深海沉积物样品中分离鉴定了多个种属的放线菌。基因组测序表明,一些深海来源的放线菌基因组中还蕴藏着许多次级代谢产物合成基因簇,但大部
链霉菌(放线菌)超声破碎条件是什么
放线菌属于原核生物系统进化树上的(G+C)摩尔百分含量(mol%)高的革兰氏阳性菌分枝类群,它虽然具有原核生物特有的分子生物学特性,但在其不同类群中,细胞壁的化学组分变化很大。 在做大肠杆菌超声时,采用的是400W,破碎5s停5s的方法,效果不错,但是用在链霉菌上,由于细胞壁组成差异一般没什么效果。
基因簇的定义
基因簇(gene cluster)指基因家族中的各成员紧密成簇排列成大串的重复单位,位于染色体的特殊区域。
基因簇的定义
基因簇(gene cluster)指基因家族中的各成员紧密成簇排列成大串的重复单位,位于染色体的特殊区域。
关于弗氏链霉菌的产品特性及特点介绍
1、本品是一种安全高效的微生物菌剂,制作工艺精湛,作用机理更加全面,纯度高,喷酒在作物叶片上,可在楂物根、茎、叶快速生长繁衍,分泌各种抗革兰氏阳性、阴性细菌作用的活性物质,能够排斥、阻断、抑制病菌的侵入。本品作用方式复杂,包括化学作用、抗生作用和寄生作用; 2、本品分泌多种植物必须生长酶,是普
放线菌的代表属链霉菌属的介绍
链霉菌属(Streptomyces)共约1000多种,其中包括和很多不同的种别和变种。它们具有发育良好的菌丝体,菌丝体分枝,无隔膜,直径约0.4~1微米,长短不一,多核。菌丝体有营养菌丝、气生菌丝和孢子丝之分,孢子丝再形成分生孢子。孢子丝和孢子的形态因种而异,这是链霉菌属分种的主要识别性状之一。
科学家解析链霉菌高产菌株高效绿色构建
华东理工大学生物工程学院生物反应器工程国家重点实验室张立新教授与中国科学院微生物研究所王为善研究员、中国农业科学院植物保护研究所向文胜研究员等合作,在链霉菌胞内三酰甘油(TAGs)降解机理研究中取得突破性进展。相关研究成果以长篇论文形式在线于《自然—生物技术》。 该论文国际审稿人评价:这是70
细胞化学词汇基因簇
中文名称:基因簇外文名称:gene cluster定 义:基因簇(gene cluster)指基因家族中的各成员紧密成簇排列成大串的重复单位,位于染色体的特殊区域。位 于:染色体的特殊区域含 义:基因家族中的各成员的重复单位