长期被误解非编码RNA存在“认知黑洞”
在人类基因组中95%的基因并不编码蛋白质,其他物种也有大量的非编码基因。这些DNA不会被编码成蛋白质,却又会转录出非编码RNA,它们对生命活动起什么作用?是进化的冗余还是神秘的缓存? 《细胞》杂志近日刊登中国工程院院士曹雪涛团队的研究论文,他们发现一种全新非编码RNA分子。该分子能够调控免疫系统的“进”与“退”,这是此前学术界从未认识和证明的。 “由于长链非编码RNA(lncRNA)丰度低,业界对其功能争议很大。”浙江大学生命科学研究院教授徐平龙在此前接受采访时评价道,但此次发表的研究严谨地鉴定了所发现的一种全新lncRNA是有功能的,即能够进行免疫调控,而曹雪涛院士正是这一机制的主要开拓者之一。 大海捞针 从浩淼细胞中层层筛选而出 细胞虽小,却瀚如乾坤。寻找一个不知道存不存在的RNA分子,如大海捞针。 到哪里找线索?病毒感染给了曹雪涛启示。谈到为什么会从病毒这个“敌人”的角度考虑。曹雪涛讲道:“我们中国......阅读全文
Nature子刊:长非编码RNA可模拟DNA起作用
长期以来,人们一直认为基因组的大部分区域属于“禁飞区”。这些区域不编码任何蛋白,因此细胞的基因读取机器很少接近。然而近年来科学家们发现,许多非编码序列其实能够转录成RNA,Gas5就是其中之一。 GAS5是一段基因间的长非编码RNA(lincRNA),它来自于非编码的“垃圾DNA”或“基因组的
长链非编码RNA测序服务助力揭开lncRNA神秘面纱
2012年12月18日,华大基因科技服务有限公司(简称“华大科技”)在国内推出长链非编码RNA测序(lncRNA-Seq)服务。该技术突破了常规研究方法效率低、研究范围受限的瓶颈,可一次性获得样本中几乎全部的lncRNA序列,不仅可以对已知lncRNA进行定量分析,还可对 novel lnc
长非编码RNA调控癌基因MYC表达的综述文章
8月7日,中国科学院上海生命科学研究院生物化学与细胞生物学研究所研究员陈玲玲受邀在国际学术期刊Current Opinion in Genetics & Development 发表题为The long noncoding RNA regulation at the MYC locus 的综述论
中国科大等在非编码RNA研究方面取得新成果
9月25日,国际学术期刊《自然—通讯》在线发表了中国科学技术大学生命科学学院单革教授实验室的研究论文Escherichia coli noncoding RNAs can affect gene expression and physiology of Caenorhabditis elegan
科学家发现长链非编码RNA作用新模式
中国工程院院士、中国医学科学院院长曹雪涛带领课题组发现,长链非编码RNA(lncRNA)可通过直接结合细胞浆中的信号转导蛋白分子并影响其磷酸化的新方式而调控免疫细胞的分化发育与功能。该成果为研究lncRNA发挥生物学效应的作用机制提出了新观点,并为免疫细胞分化发育与功能调控研究提出了新方向。相关
研究发现长非编码RNA调控学习记忆新机制
4月30日,《自然-通讯》(Nature Communications)杂志以研究论文形式发表了中国科学技术大学刘强研究组题为Activity dependent LoNA Regulates Translation by Coordinating rRNA Transcription and
上海交通大学权威期刊解析癌症与非编码RNA
来自上海交通大学附属瑞金医院的研究人员在新研究中证实,一种叫做ZFAS1的长链非编码RNA(lncRNA)编码基因发生扩增促进了肝细胞癌(HCC)转移。这一研究发现发表在6月11日的《癌症研究》(Cancer Research)杂志上。 文章的通讯作者是上海交通大学附属瑞金医院的祝哲诚(Zhu
研究发现非编码RNA控制高毒力超级细菌感染致病
8月13日,中国科学院上海免疫与感染研究所晁彦杰研究组在《自然-通讯》(Nature Communications)上发表了题为RNA interactome of hypervirulent Klebsiella pneumoniae reveals a small RNA inhibito
中科院Cell-Res发表非编码RNA研究新成果
来自中科院上海生命科学研究院的研究人员近日在新研究中证实,在精子发生后期粗线期piRNAs导致了大量的mRNA消失。这一研究发现发表在5月2日的《细胞研究》(Cell Research)杂志上。 中科院上海生命科学学院的刘默芳(Mo-Fang Liu)研究员是这篇论文的通讯作者,其研究方向是非
第二军医大Hepatology解析非编码RNA与癌症
来自第二军医大学的研究人员在新研究中揭示了一种与肝癌微血管浸润相关的长链非编码RNA,以及其促进血管生成的分子机制,这一RNA或可作为肝癌患者肝切除术后患者无复发的生存率不良的预测因子。相关论文发表在相关论文发表在国际著名肝脏疾病杂志Hepatology上(最新影响因子11.665)上。
曹雪涛研究组4月最新Cell文章:lncRNA与免疫的新关联
来自中国医学科学院/北京协会医学院等处的研究人员发表了题为“Self-Recognition of an Inducible Host lncRNA by RIG-I Feedback Restricts Innate Immune Response”的文章,受中国传统哲理启发,发现了多个新的长
云序生物最新m6A“RNA甲基化”研究汇总—非编码RNA篇
RNA甲基化是目前申请国自然项目热点,也是唯一能在短短3个月内发数十篇nature,cell级别高分文章领域,近期RNA甲基化研究引起了科研工作者的研究热潮。因mRNA参与蛋白编码,之前多数文章针对mRNA甲基化进行研究(详细见云序课堂之前往期回顾)。然而许多研究表明发生m6A甲基化的非编码RN
云序生物最新m6A“RNA甲基化”研究汇总—非编码RNA篇
RNA甲基化是目前申请国自然项目热点,也是唯一能在短短3个月内发数十篇nature,cell级别高分文章领域,近期RNA甲基化研究引起了科研工作者的研究热潮。因mRNA参与蛋白编码,之前多数文章针对mRNA甲基化进行研究(详细见云序课堂之前往期回顾)。然而许多研究表明发生m6A甲基化的非编码RN
我科学家发现一类新型长非编码RNA
国际著名学术期刊《分子细胞》近日以封面故事发表了中科院上海生命科学研究院生物化学与细胞生物学研究所陈玲玲研究组的最新研究论文,揭示了一类全新内含子来源的长非编码RNA的产生机制,及其参与剪接调控的重要功能。这将为进一步了解PWS综合征的病理机制提供新的研究思路。 几乎所有哺乳动物细胞的基因
长非编码RNA调控炎症小体组装激活研究中取得进展
4月3日,中国科学技术大学教授吴缅研究组在国际学术期刊《自然-通讯》(Nature Communications)上在线发表题为The lncRNA Neat1 promotes activation of inflammasomes in macrophages 的研究论文。 在固有免疫反
长链非编码RNA对脑生长起重要作用
“长非编码RNA通常被描述为‘基因组的暗物质’。在这里,我们系统地研究了它们对大脑发育、长期记忆储存、衰老和痴呆导致的记忆力下降的分子机制,”Puthanveettil说。 RNA是细胞的主要调节因子,是读取、转录和调节DNA表达以及构建蛋白质的小型核苷酸链,虽然科学家们已经掌握了脑细胞之间如
基因组所发表长非编码RNA分类问题综述文章
近日,中国科学院北京基因组研究所基因组科学与信息重点实验室的“百人计划”研究员章张及其团队,与沙特阿卜杜拉国王科技大学(King Abdullah University of Science and Technology)开展科研合作,对长非编码RNA的分类问题进行了系统综述,相关论文在RN
中科院Nature子刊发表非编码RNA研究重要发现
来自中科院动物研究所生物膜与膜生物功能国家重点实验室的研究人员在新研究中证实,CARL lncRNA通过破坏miR-539依赖性的PHB2下调,抑制了心肌细胞中缺氧诱导的线粒体分裂和凋亡。 领导这一研究的是中科院动物研究所细胞增殖与信号调控研究组组长李培峰(Pei-Feng Li)
研究发现空气污染诱发肺癌关键长链非编码RNA
中科院动物所周光飚研究组通过深入研究,发现了空气污染诱发肺癌的关键长链非编码RNA。相关成果日前发表于肿瘤学杂志Oncotarge。 据了解,肺癌已成为全球发病率最高、致死人数最多的癌症,其中90%的肺癌由吸烟、空气污染等环境因素引起。然而,空气污染诱发肺癌的分子机制目前尚不清楚。 此前研究
中国科大在动物长链非编码RNA研究中取得进展
中国科学技术大学生命科学学院非编码RNA功能及功能机理研究团队近日在国际期刊《基因组生物学》(Genome Biology)发表了题为Systematic evaluation of C. elegans lincRNAs with CRISPR knockout mutants 的文章,报道了
曹雪涛团队再发Nature——揭示新型非编码RNA调控网络
先天性免疫反应可保护宿主免受病原体感染,并向病原体施加进化压力,以减弱这些反应并确保其存活和复制的策略。这些不断变化的压力导致了跨宿主-病原体相互作用的先天性免疫稳态的复杂机制,但尚未得到全面了解。尤其是,更好地了解控制宿主与病原体相互作用并促进入侵病原体清除或逃逸的调节剂,可以确定传染病和慢性
仅需1个长非编码RNA变化足以逆转细胞衰老
随着时间推移,细胞慢慢老化,许多疾病发病都跟细胞衰老有关。诱导细胞再生是对抗细胞衰老相关疾病的核心策略之一。然而,老化细胞往往高度抵抗任何旨在诱导再生的操作。(老年成纤维细胞重编程效果低下) 虽然众所周知RNA负责细胞内蛋白质合成,但是一类被称为非编码RNA的特殊分子从来不会被转化为蛋白质,事
“非编码RNA调控作用”重大研究计划2015项目指南
国家自然科学基金委员会现发布重大研究计划“基因信息传递过程中非编码RNA的调控作用机制”2015年度项目指南,请申请人及依托单位按项目指南中所述的要求和注意事项申报。 附件:“基因信息传递过程中非编码RNA的调控作用机制”重大研究计划2015年度项目指南 国家自然科学基金委员会
中山大学RNA团队开发PolⅢ转录的非编码RNA功能网络信息库
中山大学生命科学学院RNA组学团队杨建华教授等开发了Pol3Base数据和信息库,系统鉴定RNA聚合酶III(PolⅢ)转录的非编码RNA(P3RNA),全面解析P3RNA的互作组、表达、进化、表观转录组、疾病变异及调控网络。 Pol3Base 网站整合了由不同转录因子调控的数千个 RNA 聚
分卓中心发现长非编码RNA对细胞核仁和RNA转录的调控机制
7月30日,《科学》(Science)以Research Article形式发表了中国科学院分子细胞科学卓越创新中心(生物化学与细胞生物学研究所)研究员陈玲玲研究组和研究员刘珈泉研究组的合作研究成果——lncRNA SLERT controls phase separation of FC/DF
新发现RNA分子可令免疫适时“退兵”
26日,《细胞》杂志发表了中国工程院院士、中国医学科学院原院长、南开大学校长曹雪涛团队的研究论文,报道了该团队在机体中发现识别“自我”和“非我(病毒)”的精巧辨别机关,能反馈性地触发消炎效应、控制抗病毒免疫炎性反应的高效适度适时,这个机关的“核心”是一种全新发现的RNA分子。 病毒潜入人体,触
从心脏病到癌症——长非编码RNA到底发挥了什么作用?
直到近几年才发现人类基因的70%是非编码RNA,非编码RNA不能翻译为蛋白质,但仍在人体中发挥重要作用。Stefanie Dimmeler是首批发现一个microRNA亚群在血管再生中发挥重要作用的研究人员之一,她最近获得了欧洲研究委员会(ERC)的ERC高级研究员资助,这使她能够对另一群非编码
中国科大长非编码RNA调控细胞周期研究取得新成果
12月4日,中国科学技术大学教授吴缅研究组的研究成果,以LAST, a c-Myc-inducible long noncoding RNA, cooperates with CNBP to promote CCND1 mRNA stability in human cells为题,在线发表在e
中科大揭示长片段非编码RNA促进肿瘤生长机制
记者从中国科学技术大学获悉,该校生命科学学院吴缅和梅一德教授研究组,揭示了长片段非编码RNA通过调控肿瘤细胞瓦伯格效应促进肿瘤生长的机制。相关研究近日在线发表在国际著名学术期刊《细胞》子刊《分子细胞》。 肿瘤细胞即使在有氧状态下也优先进行糖酵解,而不是通过产能效率更高的氧化磷酸化途径为细胞生长
中国科大长非编码RNA调控细胞周期研究取得成果
12月4日,中国科学技术大学教授吴缅研究组的研究成果,在线发表在eLife上。LAST调控CCND1 mRNA稳定性的示意图 细胞生长依赖于精确的细胞周期调控,一旦该体系中的某一环节出现问题,就有可能导致肿瘤的发生。细胞一旦通过G1/S检查点,只能进行分裂,G1/S期的转换点是细胞周期进程中的