Cell:不让基因沉默的RNAi途径
“这项研究的独特之处在于――之前,我们知道RNAi能用于调控基因,或者完全关闭基因。而这项研究中,我们发现的是一种通过piRNA途径,保护基因不被沉默的RNAi机制,这种机制能作为一种保护形式,让基因得以表达。” ――Darryl Conte Jr.博士 生物机体采用了多种战略方法来识别,阻击外来入侵DNA片段,像是病毒中带有DNA片段。比如许多病毒都会在其生命周期中生成双链RNA,而RNA干扰(RNAi)机制被认为是识别这种结构,启动沉默应答的方法之一。 来自麻省医学院的研究人员近期发现了一种与RNAi相关,能侦查到入侵者的新机制,这种机制与之前通过识别dsRNA,或者一些外来序列其他异常特征的方法不同,新方法是通过将外来序列和之前表达的RNA记忆进行比较,一旦识别出差异来,一种称为外来DNA片段的“表观记忆”就会产生,并且一代传给一代,永久沉默这一基因。 这种与RNAi相关的现象被称为RNAe(R......阅读全文
科学家鉴别出可抑制致死性脑瘤癌基因表达的小RNA分子
近日,刊登在国际杂志Genes & Development上的一篇研究论文中,来自美国西北大学的研究人员通过研究发现,一种名为miR-182的小RNA分子可以抑制多形性胶质母细胞瘤(GBM)小鼠机体中的促癌基因的表达,而GBM是一类致死性难以治愈的脑瘤。 目前标准疗法药物主要是通过损伤DNA来
研究称环境影响基因表达
随环境改变“脾气”的小蜜蜂 几年前,美国伊利诺斯大学阿巴纳香槟分校昆虫学系的吉恩·E·鲁滨逊教授,请墨西哥南部的伙伴帮他捕获了1000只新生的小蜜蜂——500只性情温和的意大利蜜蜂和500只生性凶猛的非洲蜜蜂。这两个蜜蜂亚种在基因上相似得几乎难以分辨,但后者却在领地防御上厉害很多。 鲁滨逊
Science开发创新基因表达研究方法
来自卡罗林斯卡学院和瑞典皇家理工学院(KTH)的科学家们,开发出了一种高分辨率的新方法来研究组织中活化的基因。这种方法可用于所有的组织类型,对于临床前研究和癌症诊断均具有价值。他们的研究结果发布在7月1日的《科学》(Science)杂志上。 疾病会改变组织中一些RNA分子和蛋白质的表达。在实验
原核生物基因表达调控模式及其分子机制
原核生物基因的表达调控最重要的特点是操纵子模式,从调控水平来看主要在转录水平,即对RNA合成的调控,翻译水平次之。通常有两种方式:①起始调控,即启动子调控;②终止调控,即衰减子调控。原核基因组的调控机制:通过负调控和正调控因子所进行的复合调控,阻遏蛋白与操纵基因结合,妨碍RNApol与P结合形成开放
PNAS:小分子让癌细胞停工研究
德克萨斯大学西南医学中心的科学家们,鉴定了一个能关闭前列腺癌细胞生长的重要步骤。 ERG蛋白会促使正常前列腺细胞转变为癌细胞,人们发现去除ERG会破坏一个关键的致癌转录回路,这一策略有望成为前列腺癌的新治疗方式。 助理教授Dr. Ralf Kittler对 ERG蛋白进行了深入研
Nature子刊:RNA测序鉴定小胶质细胞独特表达基因
马萨诸塞州综合医院(MGH)的研究者采用一种新的测序方法,鉴定了一组被脑免疫细胞——称为小胶质细胞—— 用来感知需要其做出反应的致病组织、毒素或损伤细胞的基因。这些基因的鉴定,能使我们更好地理解小胶质细胞在正常大脑和神经退行性疾病中的作用,为保护诸如阿尔茨海默氏病和帕金森氏综合症引起的损伤带
植物叶绿体基因组基因表达调控的研究
叶绿体基因组的特点是具相同或相关功能的基因组成复合操纵子结构。这一特点有利于叶绿体基因的表达与调控,例如rpoB-rpoC-rpoC 2操纵子是由编码RNA聚合酶各个亚基的基因聚合在一起而形成的,而psbI-psbK-psbD-psbC操纵子则编码PSⅡ的部分蛋白质。叶绿体基因组基因表达调控方式。转
植物叶绿体基因组基因表达调控的研究
叶绿体基因组的特点是具相同或相关功能的基因组成复合操纵子结构。这一特点有利于叶绿体基因的表达与调控,例如rpoB-rpoC-rpoC 2操纵子是由编码RNA聚合酶各个亚基的基因聚合在一起而形成的,而psbI-psbK-psbD-psbC操纵子则编码PSⅡ的部分蛋白质。叶绿体基因组基因表达调控方式。转
植物叶绿体基因组基因表达调控的研究
叶绿体基因组的特点是具相同或相关功能的基因组成复合操纵子结构。这一特点有利于叶绿体基因的表达与调控,例如rpoB-rpoC-rpoC 2操纵子是由编码RNA聚合酶各个亚基的基因聚合在一起而形成的,而psbI-psbK-psbD-psbC操纵子则编码PSⅡ的部分蛋白质。叶绿体基因组基因表达调控方式。转
植物叶绿体基因组基因表达调控的研究
叶绿体基因组的特点是具相同或相关功能的基因组成复合操纵子结构。这一特点有利于叶绿体基因的表达与调控,例如rpoB-rpoC-rpoC 2操纵子是由编码RNA聚合酶各个亚基的基因聚合在一起而形成的,而psbI-psbK-psbD-psbC操纵子则编码PSⅡ的部分蛋白质。叶绿体基因组基因表达调控方式
植物叶绿体基因组基因表达调控的研究
叶绿体基因组的特点是具相同或相关功能的基因组成复合操纵子结构。这一特点有利于叶绿体基因的表达与调控,例如rpoB-rpoC-rpoC 2操纵子是由编码RNA聚合酶各个亚基的基因聚合在一起而形成的,而psbI-psbK-psbD-psbC操纵子则编码PSⅡ的部分蛋白质。叶绿体基因组基因表达调控方式
专家指南:如何开展基因表达研究(二)
Q2:您采取哪些质量控制步骤? Gary Hardiman(加州大学圣地亚哥分校) 对于涉及RNA的应用,利用安捷伦的生物分析仪或类似产品对RNA样品进行质量控制是必需的,可确保RNA是完整的,没有降解。对于芯片,cRNA 的生物分析仪分析也很有用,可确保杂交之前均一的转录本扩增
专家指南:如何开展基因表达研究(三)
Q4:您在分析基因表达数据时通常借助哪些生物信息学工具? Gary Hardiman(加州大学圣地亚哥分校) • 利用内部脚本对读取进行QC • 定位到参考基因组(Bowtie 2) • 新的剪接检测(Cufflinks) • 转录本定量(FPKM) • 差异
专家指南:如何开展基因表达研究(一)
众所周知,在不同的情况下,在不同的组织中,基因表达的水平也不同。如今,研究人员可利用多种技术来追踪基因表达水平的差异,如定量 PCR、芯片或测序。《Genome Technology》杂志这一次请来了几位科学家,让他们分享一下应如何选择这些技术。此外,研究人员也谈到了解决质量控制和数据分
小分子RNA
RNA一度被认为仅仅是DNA和蛋白质之间的“过渡”,但越来越多的证据清楚的表明,RNA在生命的进程中扮演的角色远比我们早前设想的更为重要。RNA 干扰(RNA interference)的发现使得人们对RNA调控基因表达的功能有了全新的认识,更因为可以简化/替代基因敲除而成为研究基因功能的有力工具,
小分子疗法
小分子疗法 15日,PTC Therapeutics公布了一项针对DMD和贝克肌营养不良(BMD)患者的最新研究结果,显示从常规疗法转为Emflaza(deflazacort)治疗后6个月的平均随访期内,大部分患者显示病情改善。>>阅读更多 16日,罗氏(Roche)旗下基因泰克(Genet
细胞内的分子聚集有利于基因表达
活细胞内部是个拥挤的场所,各种及其他大分子紧紧挤在一起。据物理学家组织网7月14日报道,最近,美国卡内基·梅隆大学一个研究小组利用人造细胞系统,对这些聚集在一起的分子进行了近似研究,发现这种紧密聚集有利于基因表达过程,尤其是在其他条件不理想的情况下。这一发现有助于合成生物学家将来开发出人造细胞,
小桐子花芽中响应细胞分裂素的基因表达模式
能源植物小桐子(Jatropha curcas L.)为大戟科多年生木本植物,其种子含油量约40%,被认为是一种很有应用潜力的能源植物。然而,由于小桐子的雄花多、雌花少、产量低,生产成本高,阻碍了小桐子的产业化种植。因此,进行小桐子花发育调控机制的研究,有助于改良小桐子农艺性状、培育高产品种。
国外研究发现细胞基因表达新机制
捷克马萨里克大学中欧技术研究所的科研团队发现了一种新的细胞分化基因表达机制。该研究项目名为“植物减数分裂的调控及其操作技术的发展”,相关成果发表在《科学》上。 该团队开发了一种独特的方法,使用特殊显微镜实时连续成像观察植物细胞减数分裂,并掌握原生质体技术,成为目前全球仅有的两个可实时观察植物减
研究发现人类基因表达新机制
一项新研究有可能会改变科学家们对于人类蛋白质生成过程的认识。来自芝加哥大学的研究人员发现单基因可以借由同一条信使RNA序列,编码生成两种不同的蛋白质。他们的研究结果在线发布在7月3日的《细胞》(Cell)杂志上,阐明了从前未知的一种人类基因表达机制,并为开发出新的治疗策略来对抗迄今无法治愈的神经
数字PCR在基因表达差异研究的应用
数字PCR由于检测时完全不依赖传统的Ct值即可实现真正意义上的绝对定量,因而可以提供比实时荧光定量PCR更精确的基因差异表达研究,尤其对于那些靶基因表达差异微小的情况,如:mRNA、microRNA、lncRNAs等的表达分析;等位基因的不平衡表达;单细胞基因表达分析;外泌体核酸分子定量分析等。
rhpPC基因协同调节III型分泌系统基因表达的分子机制
III型分泌系统是大多数革兰氏阴性病原细菌(包括植物病原菌和动物病原菌)感染宿主的重要“武器”,是由蛋白复合体构成的跨膜分子装置。病原菌通过III型分泌系统将一系列效应蛋白注入宿主细胞内,从而逃避宿主细胞的免疫防御并建立感染。III型分泌系统基因的表达受各种环境因素和宿主因素的影响,在丰富培养基
抗原变异基因家族相互排斥性表达的分子机制
2月6日,国际学术期刊《美国国家科学院院刊》(PNAS)在线发表了中国科学院上海巴斯德研究所江陆斌课题组题为DNA helicase RecQ1 regulates mutually exclusive expression of virulence genes in Plasmodium fa
研究揭示基因表达调控核心复合物LDB1/SSBP2的分子机制
12月31日,《美国国家科学院院刊》(PNAS)在线发表了题为Crystal structure of human LDB1 in complex with SSBP2 的论文,该项工作由中国科学院生物物理研究所许文青/梁栋材课题组和美国国立卫生研究院Ann Dean课题组合作完成。 增强子是
分子植物卓越中心揭示细胞分裂素快速激活基因表达的分子机制
细胞分裂素(cytokinin)是一种重要的植物激素,在植物的生长发育中扮演着多种角色,包括维持分生组织、促进维管组织分化、调控叶片衰老和促进再生等。以往研究表明,细胞分裂素的信号传递类似于细菌的双组分系统,通过磷酸中转系统将信号从细胞膜传递到细胞核内,进而激活特定的下游基因表达。此磷酸中转系统
新研究揭示非小细胞肺癌发展分子机制
近日,暨南大学基础医学与公共卫生学院研究员范骏、暨南大学中医学院教授戴勇团队和南京市第一医院副主任医师周丹阳团队合作,研究探讨了非小细胞肺癌中,八聚体结合蛋白3(POU3F3)异常高表达通过促进非小细胞肺癌细胞三磷酸腺苷生成,进而推动非小细胞肺癌进展的具体分子机制。相关成果发表于《尖端科学》(Adv
基因改造后的酶能用多种糖基修饰小分子
经过基因工程的改造,酶能够用更多种类的糖基来修饰小分子,这是研究人员在9月号在线出版的《自然—化学生物学》(Nature Chemical Biology)期刊上报告的。 自然界的小分子是许多天然药物的基础,而许多天然小分子的活性会因附加其上的糖分子而改变。因此,如何改变糖分子是新药发现的关
分子遗传学词汇等位基因特异的寡核苷酸
中文名称:等位基因特异的寡核苷酸英文名称:allele specific oligonucleotide;ASO定 义:与基因点突变热点区互补的人工合成的寡核苷酸序列。应用学科:遗传学(一级学科),分子遗传学(二级学科)
什么是基因表达调控?基因表达调控有什么意义
意义:1.适应环境、维持生长和增殖:生物体赖以生存的外环境是在不断变化的,为了生存,所有活细胞都必须对外环境变化作出适当反应,调节代谢,以适应环境变化。生物体适应环境、调节代谢的能力与蛋白质分子的生物学功能有关。而蛋白质的水平又受基因表达的调控。2.维持个体发育与分化:多细胞生物调节基因的表达除为适
中科院植物所阐明重复基因表达分化分子机制
中国科学院植物研究所孔宏智研究组对重复基因表达分化的模式、过程和机制进行了研究,并取得重要突破。相关论文日前在线发表于《植物生理学》。 研究人员以拟南芥中的APETALA1(AP1)和CAULIFLOWER(CAL)基因为例进行了研究,这两种基因在表达的时、空、量上均有差异,且差异与其调控区一